Alexander Goesmann
alexander.goesmann@uni-bielefeld.dehttps://orcid.org/0000-0002-7086-2568
PEVZ-ID
158 Publikationen
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2024 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2986391Höhn, D., Masello, J., Kümmel, M.N., Griep, S., Goesmann, A. & Quillfeldt, P. (2024). Nestling Diet of Two Sympatric Insectivorous Passerines in Different Habitats—A Metabarcoding Study. Birds, 5(1), 67-89. MDPI AG. doi:10.3390/birds5010005.
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2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957996Wibberg, D., Genzel, F., Verwaaijen, B., Blom, J., Rupp, O., Goesmann, A., Zrenner, R., Grosch, R., Pühler, A. & Schlüter, A. (2021). Genome Analyses of the Less Aggressive Rhizoctonia solani AG1-IB Isolates 1/2/21 and O8/2 Compared to the Reference AG1-IB Isolate 7/3/14. Journal of Fungi, 7(10): 832. MDPI AG. doi:10.3390/jof7100832.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919320Cardoso, S.D., Goncalves, D., Goesmann, A., Canario, A.V.M. & Oliveira, R.F. (2018). Temporal variation in brain transcriptome is associated with the expression of female mimicry as a sequential male alternative reproductive tactic in fish. MOLECULAR ECOLOGY, 27(3), 789-803. Wiley. doi:10.1111/mec.14408.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2916526Golyshina, O.V., Tran, H., Reva, O.N., Lemak, S., Yakunin, A.F., Goesmann, A., Nechitaylo, T.Y., LaCono, V., Smedile, F., Slesarev, A., Rojo, D., Barbas, C., Ferrer, M., Yakimov, M.M. & Golyshin, P.N. (2017). Metabolic and evolutionary patterns in the extremely acidophilic archaeon Ferroplasma acidiphilum Y-T. SCIENTIFIC REPORTS, 7(1): 3682. Nature Publishing Group. doi:10.1038/s41598-017-03904-5.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904976Blifernez-Klassen, O., Wibberg, D., Winkler, A., Blom, J., Goesmann, A., Kalinowski, J. & Kruse, O. (2016). Complete Chloroplast and Mitochondrial Genome Sequences of the Hydrocarbon Oil-Producing Green MicroalgaBotryococcus brauniiRace B (Showa). Genome Announcements, 4(3): e00524-16. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomea.00524-16.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2731279Huja, S., Oren, Y., Trost, E., Brzuszkiewicz, E., Biran, D., Blom, J., Goesmann, A., Gottschalk, G., Hacker, J., Ron, E.Z. & Dobrindt, U. (2015). Genomic Avenue to Avian Colisepticemia. mBio, 6(1): e01681-14. American Society For Microbiology. doi:10.1128/mBio.01681-14.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2761035Arnold, M., Wibberg, D., Blom, J., Schatschneider, S., Winkler, A., Kutter, Y., Rückert, C., Albersmeier, A., Albaum, S., Goesmann, A., Zange, S., Heesemann, J., Pühler, A., Hogardt, M. & Vorhölter, F.-J. (2015). Draft Genome Sequence of Pseudomonas aeruginosa Strain WS136, a Highly Cytotoxic ExoS-Positive Wound Isolate Recovered from Pyoderma Gangrenosum. Genome announcements, 3(4): e00680-15. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomeA.00680-15.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900131Pauli, M., Chakarov, N., Rupp, O., Kalinowski, J., Goesmann, A., Sorenson, M., Krüger, O. & Hoffman, J. (2015). De novo assembly of the dual transcriptomes of a polymorphic raptor species and its malarial parasite. BMC Genomics, 16(1): 1038. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s12864-015-2254-1.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2782605Rupp, O., Brinkrolf, K., Buerth, C., Kunigo, M., Schneider, J., Jaenicke, S., Goesmann, A., Pühler, A., Jaeger, K.-E. & Ernst, J.F. (2015). The structure of the Cyberlindnera jadinii genome and its relation to Candida utilis analyzed by the occurrence of single nucleotide polymorphisms. Journal of Biotechnology, 211, 20-30. Elsevier. doi:10.1016/j.jbiotec.2015.06.423.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2730423Chakarov, N., Linke, B., Boerner, M., Goesmann, A., Krüger, O. & Hoffman, J. (2015). Apparent vector-mediated parent-to-offspring transmission in an avian malaria-like parasite. Molecular Ecology, 24(6), 1355-1363. Wiley. doi:10.1111/mec.13115.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2651944Tielen, P., Wibberg, D., Blom, J., Rosin, N., Meyer, A.-K., Bunk, B., Schobert, M., Tüpker, R., Schatschneider, S., Rückert, C., Albersmeier, A., Goesmann, A., Vorhölter, F.-J., Jahn, D. & Pühler, A. (2014). Genome Sequence of the Small-Colony Variant Pseudomonas aeruginosa MH27, Isolated from a Chronic Urethral Catheter Infection. Genome announcements, 2(1). American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomeA.01174-13.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643946Dohm, J.C., Minoche, A.E., Holtgräwe, D., Capella-Gutiérrez, S., Zakrzewski, F., Tafer, H., Rupp, O., Rosleff Sörensen, T., Stracke, R., Reinhardt, R., Goesmann, A., Kraft, T., Schulz, B., Stadler, P.F., Schmidt, T., Gabaldón, T., Lehrach, H., Weisshaar, B. & Himmelbauer, H. (2014). The genome of the recently domesticated crop plant sugar beet (Beta vulgaris). Nature, 505(7484), 546-549. Nature Publishing Group. doi:10.1038/nature12817.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2690174Christiansen, G., Goesmann, A. & Kurmayer, R. (2014). Elucidation of insertion elements carried on plasmids and in vitro construction of shuttle vectors from the toxic cyanobacterium planktothrix. Applied and environmental microbiology, 80(16), 4887-4897. American Society for Microbiology. doi:10.1128/AEM.01188-14.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694652Bonte, A., Neuweger, H., Goesmann, A., Thonar, C., Mäder, P., Langenkämper, G. & Niehaus, K. (2014). Metabolite profiling on wheat grain to enable a distinction of samples from organic and conventional farming systems. Journal of the science of food and agriculture, 94(13), 2605-2612. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/jsfa.6566.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676552Becker, J., Timmermann, C., Rupp, O., Albaum, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Pühler, A., Tauch, A. & Noll, T. (2014). Transcriptome analyses of CHO cells with the next-generation microarray CHO41K: Development and validation by analysing the influence of the growth stimulating substance IGF-1 substitute LongR(3.). Journal of biotechnology, 178, 23-31. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2014.02.021.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2656773Rupp, O., Becker, J., Brinkrolf, K., Timmermann, C., Borth, N., Pühler, A., Noll, T. & Goesmann, A. (2014). Construction of a Public CHO Cell Line Transcript Database Using Versatile Bioinformatics Analysis Pipelines. PLoS ONE, 9(1): e85568. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0085568.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694682Wegmann, U., Louis, P., Goesmann, A., Henrissat, B., Duncan, S.H. & Flint, H.J. (2014). Complete genome of a new Firmicutes species belonging to the dominant human colonic microbiota ('Ruminococcus bicirculans') reveals two chromosomes and a selective capacity to utilize plant glucans. Environmental microbiology, 16(9), 2879-2890. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/1462-2920.12217.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2691732Klippel, B., Sahm, K., Basner, A., Wiebusch, S., John, P., Lorenz, U., Peters, A., Abe, F., Takahashi, K., Kaiser, O., Goesmann, A., Jaenicke, S., Grote, R., Horikoshi, K. & Antranikian, G. (2014). Carbohydrate-active enzymes identified by metagenomic analysis of deep-sea sediment bacteria. Extremophiles, 18(5), 853-863. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s00792-014-0676-3.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2664976Rückert, C., Szczepanowski, R., Albersmeier, A., Goesmann, A., Fischer, N., Steinkämper, A., Pühler, A., Biener, R., Schwartz, D. & Kalinowski, J. (2014). Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Actinoplanes friuliensis HAG 010964, producer of the lipopeptide antibiotic friulimycin. Journal of biotechnology, 178, 41-42. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2014.03.011.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2554079Kuenne, C., Billion, A., Mraheil, M.A., Strittmatter, A., Daniel, R., Goesmann, A., Barbuddhe, S., Hain, T. & Chakraborty, T. (2013). Reassessment of the Listeria monocytogenes pan-genome reveals dynamic integration hotspots and mobile genetic elements as major components of the accessory genome. BMC Genomics, 14(1): 47. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-14-47.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560837Fritzenwanker, M., Kuenne, C., Billion, A., Hain, T., Zimmermann, K., Goesmann, A., Chakraborty, T. & Domann, E. (2013). Complete Genome Sequence of the Probiotic Enterococcus faecalis Symbioflor 1 Clone DSM 16431. Genome Announcements, 1(1), e00165-12. American Society for Microbiology. doi:10.1128/genomeA.00165-12.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2564601Riedel, T., Gómez-Consarnau, L., Tomasch, J., Martin, M., Jarek, M., González, J.M., Spring, S., Rohlfs, M., Brinkhoff, T., Cypionka, H., Göker, M., Fiebig, A., Klein, J., Goesmann, A., Fuhrman, J.A. & Wagner-Döbler, I. (2013). Genomics and Physiology of a Marine Flavobacterium Encoding a Proteorhodopsin and a Xanthorhodopsin-Like Protein. PLOS ONE, 8(3): e57487. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0057487.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309Bolzan de Campos, S., Youn, J.-W., Farina, R., Jaenicke, S., Jünemann, S., Szczepanowski, R., Beneduzi, A., Vargas, L.K., Goesmann, A., Wendisch, V.F. & Passagilia, L. (2013). Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (Brassica napus L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing. Microbial Ecology, 65(3), 593-601. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s00248-012-0132-9.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2549908Wibberg, D., Jelonek, L., Rupp, O., Kröber, M., Eikmeyer, F.G., Goesmann, A., Hartmann, A., Borriss, R., Grosch, R., Pühler, A. & Schlüter, A. (2013). Establishment and interpretation of the genome sequence of the phytopathogenic fungus Rhizoctonia solani AG1-IB isolate 7/3/14. Journal of Biotechnology, 167(2), 142-155. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2012.12.010.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2606943Vences, M., Hauswaldt, S., Steinfartz, S., Rupp, O., Goesmann, A., Künzel, S., Orozco-Terwengel, P., Vieites, D.R., Nieto-Roman, S., Haas, S., Laugsch, C., Gehara, M., Bruchmann, S., Pabijan, M., Ludewig, A.-K., Rudert, D., Angelini, C., Borkin, L.J., Crochet, P.-A., Crottini, A., Dubois, A., Ficetola, G.F., Galán, P., Geniez, P., Hachtel, M., Jovanovic, O., Litvinchuk, S.N., Lymberakis, P., Ohler, A. & Smirnov, N.A. (2013). Radically different phylogeographies and patterns of genetic variation in two European brown frogs, genus Rana. Molecular phylogenetics and evolution, 68(3), 657-670. Elsevier BV. doi:10.1016/j.ympev.2013.04.014.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2602756Smits, T.H.M., Rezzonico, F., López, M.M., Blom, J., Goesmann, A., Frey, J.E. & Duffy, B. (2013). Phylogenetic position and virulence apparatus of the pear flower necrosis pathogen Erwinia piriflorinigrans CFBP 5888(T) as assessed by comparative genomics. Systematic and applied microbiology, 36(7), 449-456. Elsevier BV. doi:10.1016/j.syapm.2013.04.003.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2641228Jünemann, S., Sedlazeck, F.J., Prior, K., Albersmeier, A., John, U., Kalinowski, J., Mellmann, A., Goesmann, A., von Haeseler, A., Stoye, J. & Harmsen, D. (2013). Corrigendum: Updating benchtop sequencing performance comparison. Nature biotechnology, 31(12), 1148. Nature Publishing Group. doi:10.1038/nbt1213-1148e.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2632946Köhler, K.A.K., Rückert, C., Schatschneider, S., Vorhölter, F.-J., Szczepanowski, R., Blank, L.M., Niehaus, K., Goesmann, A., Pühler, A., Kalinowski, J. & Schmid, A. (2013). Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain VLB120 a solvent tolerant, styrene degrading bacterium, isolated from forest soil. Journal of Biotechnology, 168(4), 729-730. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2013.10.016.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2622238Barbe, S., Llop, P., Blom, J., Cabrefiga, J., Goesmann, A., Duffy, B., Montesinos, E., Smits, T.H.M. & Lopez, M.M. (2013). Complete sequence of Erwinia piriflorinigrans plasmids pEPIR37 and pEPIR5 and role of pEPIR37 in pathogen virulence. Plant Pathology, 62(4), 786-798. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/ppa.12002.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2615581Brinkrolf, K., Rupp, O., Laux, H., Kollin, F., Ernst, W., Linke, B., Kofler, R., Romand, S., Hesse, F., Budach, W.E., Galosy, S., Müller, D., Noll, T., Wienberg, J., Jostock, T., Leonard, M., Grillari, J., Tauch, A., Goesmann, A., Helk, B., Mott, J.E., Pühler, A. & Borth, N. (2013). Chinese hamster genome sequenced from sorted chromosomes. Nature Biotechnology, 31(8), 694-695. Nature Publishing Group. doi:10.1038/nbt.2645.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2576080Toepel, J., Illmer-Kephalides, M., Jaenicke, S., Straube, J., May, P., Goesmann, A. & Kruse, O. (2013). New insights into Chlamydomonas reinhardtii hydrogen production processes by combined microarray/RNA-seq transcriptomics. Plant Biotechnology Journal, 11(6), 717-733. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/pbi.12062.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631956Rückert, C., Szczepanowski, R., Albersmeier, A., Goesmann, A., Iftime, D., Musiol, E.M., Blin, K., Wohlleben, W., Pühler, A., Kalinowski, J. & Weber, T. (2013). Complete genome sequence of the kirromycin producer Streptomyces collinus Tü 365 consisting of a linear chromosome and two linear plasmids. Journal of Biotechnology, 168(4), 739-740. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2013.10.004.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2566922Jünemann, S., Sedlazeck, F.J., Prior, K., Albersmeier, A., John, U., Kalinowski, J., Mellmann, A., Goesmann, A., von Haeseler, A., Stoye, J. & Harmsen, D. (2013). Updating benchtop sequencing performance comparison. Nature Biotechnology, 31(4), 294-296. Nature Publishing Group. doi:10.1038/nbt.2522.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2557938Mann, R.A., Smits, T.H.M., Bühlmann, A., Blom, J., Goesmann, A., Frey, J.E., Plummer, K.M., Beer, S.V., Luck, J., Duffy, B. & Rodoni, B. (2013). Comparative Genomics of 12 Strains of Erwinia amylovora Identifies a Pan-Genome with a Large Conserved Core. PLOS ONE, 8(2): e55644. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0055644.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2645668Bogen, C., Al-Dilaimi, A., Albersmeier, A., Wichmann, J., Grundmann, M., Rupp, O., Lauersen, K.J., Blifernez-Klassen, O., Kalinowski, J., Goesmann, A., Mussgnug, J.H. & Kruse, O. (2013). Reconstruction of the lipid metabolism for the microalga Monoraphidium neglectum from its genome sequence reveals characteristics suitable for biofuel production. BMC Genomics, 14(1): 926. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-14-926.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610129Kessler, N., Bonte, A., Langenkämper, G., Niehaus, K., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2013). MeltDB 2.0 - Advances of the metabolomics software system. Bioinformatics, 29(19), 2452-2459. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btt414.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529202Zakrzewski, M., Bekel, T., Ander, C., Pühler, A., Rupp, O., Stoye, J., Schlüter, A. & Goesmann, A. (2013). MetaSAMS - A novel software platform for taxonomic classification, functional annotation and comparative analysis of metagenome datasets. Journal of Biotechnology, 167(2), 156-165. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2012.09.013.
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2013 | Konferenzbeitrag | Im Druck | PUB-ID: 2538625Bonte, A., Kessler, N., Nattkemper, T.W., Goesmann, A., Cecile, T., Mäder, P., Niehaus, K. & Langenkämper, G. (In Press). Einsatz von Protein- und Metabolit-Profiling-Methoden zur Unterscheidung von ökologischem und konventionellem Weizen. Gehalten auf der 12. Wissenschaftstagung Ökologischer Landbau „Ideal und Wirklichkeit – Perspektiven Ökologischer Landbewirtschaftung“.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230Jünemann, S., Prior, K., Szczepanowski, R., Harks, I., Ehmke, B., Goesmann, A., Stoye, J. & Harmsen, D. (2012). Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing. PLoS ONE, 7(8): e41606. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0041606.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2500959Kahlke, T., Goesmann, A., Hjerde, E., Willassen, N.P. & Haugen, P. (2012). Unique core genomes of the bacterial family vibrionaceae: Insights into niche adaptation and speciation. BMC genomics, 13(1): 179. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-13-179.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2500966Hain, T., Ghai, R., Billion, A., Kuenne, C.T., Steinweg, C., Izar, B., Mohamed, W., Mraheil, M., Domann, E., Schaffrath, S., Kärst, U., Goesmann, A., Oehm, S., Pühler, A., Merkl, R., Vorwerk, S., Glaser, P., Garrido, P., Rusniok, C., Buchrieser, C., Goebel, W. & Chakraborty, T. (2012). Comparative genomics and transcriptomics of lineages I, II, and III strains of Listeria monocytogenes. BMC Genomics, 13(1): 144. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-13-144.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618Zakrzewski, M., Goesmann, A., Jaenicke, S., Jünemann, S., Eikmeyer, F.G., Szczepanowski, R., Al-Soud, W.A., Sørensen, S., Pühler, A. & Schlüter, A. (2012). Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing. Journal of Biotechnology, 158(4), 248-258. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2012.01.020.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2500990Rose, M.T., Rose, T.J., Pariasca-Tanaka, J., Yoshihashi, T., Neuweger, H., Goesmann, A., Frei, M. & Wissuwa, M. (2012). Root metabolic response of rice (Oryza sativa L.) genotypes with contrasting tolerance to zinc deficiency and bicarbonate excess. Planta, 236(4), 959-973. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s00425-012-1648-4.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490949Zschuttig, A., Zimmermann, K., Blom, J., Goesmann, A., Pohlmann, C. & Gunzer, F. (2012). Identification and Characterization of Microcin S, a New Antibacterial Peptide Produced by Probiotic Escherichia coli G3/10. PLoS ONE, 7(3): e33351. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0033351.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2471858Ausec, L., Zakrzewski, M., Goesmann, A., Schlüter, A. & Mandic-Mulec, I. (2012). Correction: bioinformatic analysis reveals high diversity of bacterial genes for laccase-like enzymes. PLoS ONE, 7(1). Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/annotation/2c1232ba-94f0-4613-8486-0f430b1b47ed.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490535Heinl, S., Wibberg, D., Eikmeyer, F.G., Szczepanowski, R., Blom, J., Linke, B., Goesmann, A., Grabherr, R., Schwab, H., Pühler, A. & Schlüter, A. (2012). Insights into the completely annotated genome of Lactobacillus buchneri CD034, a strain isolated from stable grass silage. Journal of Biotechnology, 161(2), 153-166. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2012.03.007.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2471681Rademacher, A., Zakrzewski, M., Schlüter, A., Schonberg, M., Szczepanowski, R., Goesmann, A., Pühler, A. & Klocke, M. (2012). Characterization of microbial biofilms in a thermophilic biogas system by high-throughput metagenome sequencing. FEMS Microbiology Ecology, 79(3), 785-799. Oxford University Press (OUP). doi:10.1111/j.1574-6941.2011.01265.x.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2513256Filippini, M., Qi, W., Blom, J., Goesmann, A., Smits, T.H.M. & Bagheri, H.C. (2012). Genome Sequence of Fibrella aestuarina BUZ 2T, a Filamentous Marine Bacterium. Journal of bacteriology, 194(13), 3555. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.00550-12.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498232Trötschel, C., Albaum, S., Wolff, D., Schröder, S., Goesmann, A., Nattkemper, T.W. & Poetsch, A. (2012). Protein turnover quantification in a multi-labeling approach - from data calculation to evaluation. Molecular & Cellular Proteomics, 11(8), 512-526. American Society for Biochemistry & Molecular Biology (ASBMB). doi:10.1074/mcp.M111.014134.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2487853Brankatschk, K., Blom, J., Goesmann, A., Smits, T.H.M. & Duffy, B. (2012). Comparative genomic analysis of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden foodborne strains with other serovars. International journal of food microbiology, 155(3), 247-256. Elsevier BV. doi:10.1016/j.ijfoodmicro.2012.01.024.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474002Schneider, J., Rupp, O., Trost, E., Jaenicke, S., Passoth, V., Goesmann, A., Tauch, A. & Brinkrolf, K. (2012). Genome sequence of Wickerhamomyces anomalus DSM 6766 reveals genetic basis of biotechnologically important antimicrobial activities. FEMS Yeast Research, 12(3), 382-386. Oxford University Press (OUP). doi:10.1111/j.1567-1364.2012.00791.x.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2478526Hackl, M., Jadhav, V., Jakobi, T., Rupp, O., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Pühler, A., Noll, T., Borth, N. & Grillari, J. (2012). Computational identification of microRNA gene loci and precursor microRNA sequences in CHO cell lines. Journal of Biotechnology, 158(3), 151-155. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2012.01.019.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2405255Persicke, M., Rückert, C., Plassmeier, J., Stutz, L., Kessler, N., Kalinowski, J., Goesmann, A. & Neuweger, H. (2012). MSEA: metabolite set enrichment analysis in the MeltDB metabolomics software platform: metabolic profiling of Corynebacterium glutamicum as an example. Metabolomics, 8(2), 310-322. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s11306-011-0311-6.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2544774Schneider, J., Andrea, H., Blom, J., Jaenicke, S., Rückert, C., Schorsch, C., Szczepanowski, R., Farwick, M., Goesmann, A., Pühler, A., Schaffer, S., Tauch, A., Köhler, T. & Brinkrolf, K. (2012). Draft Genome Sequence of Wickerhamomyces ciferrii NRRL Y-1031 F-60-10. Eukaryotic Cell, 11(12), 1582-1583. American Society for Microbiology. doi:10.1128/EC.00258-12.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2500937Rezzonico, F., Braun-Kiewnick, A., Mann, R.A., Rodoni, B., Goesmann, A., Duffy, B. & Smits, T.H.M. (2012). Lipopolysaccharide biosynthesis genes discriminate between Rubus- and Spiraeoideae-infective genotypes of Erwinia amylovora. Molecular plant pathology, 13(8), 975-984. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/j.1364-3703.2012.00807.x.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2501081De Maayer, P., Chan, W.Y., Rezzonico, F., Bühlmann, A., Venter, S.N., Blom, J., Goesmann, A., Frey, J.E., Smits, T.H.M., Duffy, B. & Coutinho, T.A. (2012). Complete genome sequence of clinical isolate Pantoea ananatis LMG 5342. Journal of Bacteriology, 194(6), 1615-1616. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.06715-11.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529610Schork, S., Schlüter, A., Blom, J., Schneiker-Bekel, S., Pühler, A., Goesmann, A., Frosch, M. & Schoen, C. (2012). Genome Sequence of a Neisseria meningitidis Capsule Null Locus Strain from the Clonal Complex of Sequence Type 198. Journal of Bacteriology, 194(18), 5144-5145. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.01099-12.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526281Zischka, M., Kuenne, C., Blom, J., Dabrowski, P.W., Linke, B., Hain, T., Nitsche, A., Goesmann, A., Larsen, J., Jensen, L.B., Witte, W. & Werner, G. (2012). Complete Genome Sequence of the Porcine Isolate Enterococcus faecalis D32. Journal of Bacteriology, 194(19), 5490-5491. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.01298-12.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2500946Mann, R.A., Blom, J., Bühlmann, A., Plummer, K.M., Beer, S.V., Luck, J.E., Goesmann, A., Frey, J.E., Rodoni, B.C., Duffy, B. & Smits, T.H.M. (2012). Comparative analysis of the Hrp pathogenicity island of Rubus- and Spiraeoideae-infecting Erwinia amylovora strains identifies the IT region as a remnant of an integrative conjugative element. Gene, 504(1), 6-12. Elsevier BV. doi:10.1016/j.gene.2012.05.002.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768Becker, J., Timmermann, C., Jakobi, T., Rupp, O., Szczepanowski, R., Hackl, M., Goesmann, A., Tauch, A., Borth, N., Grillari, J., Pühler, A., Noll, T. & Brinkrolf, K. (2011). Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome (BMC Proceedings). (H. Hauser, Hrsg.), 5(Suppl. 8), P6. Gehalten auf der 22nd European Society for Animal Cell Technology (ESACT) Meeting on Cell Based Technologies, BioMed Central. doi:10.1186/1753-6561-5-S8-P6.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093398Brankatschk, K., Blom, J., Goesmann, A., Smits, T.H.M. & Duffy, B. (2011). Genome of a European Fresh-Vegetable Food Safety Outbreak Strain of Salmonella enterica subsp enterica Serovar Weltevreden. Journal of Bacteriology, 193(8), 2066. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.00123-11.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003276Jaenicke, S., Ander, C., Bekel, T., Bisdorf, R., Dröge, M., Gartemann, K.-H., Jünemann, S., Kaiser, O., Krause, L., Tille, F., Zakrzewski, M., Pühler, A., Schlüter, A. & Goesmann, A. (2011). Comparative and Joint Analysis of Two Metagenomic Datasets from a Biogas Fermenter Obtained by 454-Pyrosequencing. PLoS ONE, 6(1): e14519. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0014519.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2411830Ausec, L., Zakrzewski, M., Goesmann, A., Schlüter, A. & Mandic-Mulec, I. (2011). Bioinformatic analysis reveals high diversity of bacterial genes for laccase-like enzymes. PLoS ONE, 6(10): e25724. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0025724.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2300063Albaum, S., Hahne, H., Otto, A., Haußmann, U., Becher, D., Poetsch, A., Goesmann, A. & Nattkemper, T.W. (2011). A guide through the computational analysis of isotope-labeled mass spectrometry-based quantitative proteomics data: an application study. Proteome Science, 9(1): 30. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1477-5956-9-30.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2451800Toepel, J., Albaum, S., Arvidsson, S., Goesmann, A., La Russa, M., Rogge, K. & Kruse, O. (2011). Construction and evaluation of a whole genome microarray of Chlamydomonas reinhardtii. BMC Genomics, 12(1): 579. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-12-579.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375634Pothier, J.F., Vorhölter, F.-J., Blom, J., Goesmann, A., Pühler, A., Smits, T.H. & Duffy, B. (2011). The ubiquitous plasmid pXap41 in the invasive phytopathogen Xanthomonas arboricola pv. pruni: complete sequence and comparative genomic analysis. FEMS Microbiology Letters, 323(1), 52-60. Oxford University Press (OUP). doi:10.1111/j.1574-6968.2011.02352.x.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354731Wibberg, D., Blom, J., Jaenicke, S., Kollin, F., Rupp, O., Scharf, B., Schneiker-Bekel, S., Szczepanowski, R., Goesmann, A., Setubal, J.C., Schmitt, R., Pühler, A. & Schlüter, A. (2011). Complete genome sequencing of Agrobacterium sp. H13-3, the former Rhizobium lupini H13-3, reveals a tripartite genome consisting of a circular and a linear chromosome and an accessory plasmid but lacking a tumor-inducing Ti-plasmid. Journal of Biotechnology, 155(1), 50-62. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.01.010.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371Küberl, A., Schneider, J., Thallinger, G.G., Anderl, I., Wibberg, D., Hajek, T., Jaenicke, S., Brinkrolf, K., Goesmann, A., Szczepanowski, R., Pühler, A., Schwab, H., Glieder, A. & Pichler, H. (2011). High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435. Journal of Biotechnology, 154(4), 312-320. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.04.014.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576Becker, J., Hackel, M., Jakobi, T., Rupp, O., Schneider, J., Szczepanowski, R., Bekel, T., Borth, N., Goesmann, A., Grillari, J., Kaltschmidt, C., Noll, T., Pühler, A., Tauch, A. & Brinkrolf, K. (2011). Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing. Journal of Biotechnology, 156(3), 227-235. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.09.014.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289576Thomas, V., Bertelli, C., Collyn, F., Casson, N., Telenti, A., Goesmann, A., Croxatto, A. & Greub, G. (2011). Lausannevirus, a giant amoebal virus encoding histone doublets. Environmental Microbiology, 13(6), 1454-1466. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/j.1462-2920.2011.02446.x.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445Schneider, J., Blom, J., Jaenicke, S., Linke, B., Brinkrolf, K., Neuweger, H., Tauch, A. & Goesmann, A. (2011). RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data. Journal of Biotechnology, 155(1), 118-126. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.10.076.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447730Gonzalez, J.M., Pinhassi, J., Fernández-Gómez, B., Coll-Llado, M., Gonzalez-Velazquez, M., Puigbo, P., Jaenicke, S., Gomez-Consarnau, L., Fernandez-Guerra, A., Goesmann, A. & Pedros-Alio, C. (2011). Genomics of the proteorhodopsin-containing marine flavobacterium Dokdonia sp. MED134. Applied and Environmental Microbiology, 77(24), 8676-8686. Am Soc Microbiol. doi:10.1128/aem.06152-11.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2307104Smits, T.H.M., Rezzonico, F., Kamber, T., Blom, J., Goesmann, A., Ishimaru, C.A., Frey, J.E., Stockwell, V.O. & Duffy, B. (2011). Metabolic Versatility and Antibacterial Metabolite Biosynthesis Are Distinguishing Genomic Features of the Fire Blight Antagonist Pantoea vagans C9-1. PLoS ONE, 6(7): e22247. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0022247.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326455Krol, E., Blom, J., Winnebald, J., Berhoerster, A., Barnett, M.J., Goesmann, A., Baumbach, J. & Becker, A. (2011). RhizoRegNet-A database of rhizobial transcription factors and regulatory networks. Journal of Biotechnology, 155(1), 127-134. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.11.004.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2397780Doppmeier, D., Stracke, R., Lutter, P., Goesmann, A., Niehaus, K. & Weisshaar, B. (2011). Using the GUS Reporter Gene for Quantitative Studies of Promotor Activity in A.thaliana Seedlings (S. 218). Gehalten auf der ICSB 2011 Heidelberg/Mannheim.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2447751Jaenicke, S., Zakrzewski, M., Jünemann, S., Pühler, A., Goesmann, A. & Schlüter, A. (2011). Analysis of the Metagenome from a Biogas-Producing Microbial Community by Means of Bioinformatics Methods. In F.J. de Bruijn (Hrsg.), Handbook of Molecular Microbial Ecology II: Metagenomics in Different Habitats (S. 403-414). Hoboken, NJ, USA: Wiley-Blackwell. doi:10.1002/9781118010549.ch39.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290032Joseph, B., Schwarz, R.F., Linke, B., Blom, J., Becker, A., Claus, H., Goesmann, A., Frosch, M., Mueller, T., Vogel, U. & Schoen, C. (2011). Virulence Evolution of the Human Pathogen Neisseria meningitidis by Recombination in the Core and Accessory Genome. PLoS ONE, 6(4): e18441. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0018441.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093389Schoen, C., Weber-Lehmann, J., Blom, J., Joseph, B., Goesmann, A., Strittmatter, A. & Frosch, M. (2011). Whole-Genome Sequence of the Transformable Neisseria meningitidis Serogroup A Strain WUE2594. Journal of Bacteriology, 193(8), 2064-2065. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.00084-11.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289902De Gregoris, T.B., Rupp, O., Klages, S., Knaust, F., Bekel, T., Kube, M., Burgess, J.G., Arnone, M.I., Goesmann, A., Reinhardt, R. & Clare, A.S. (2011). Deep sequencing of naupliar-, cyprid- and adult-specific normalised Expressed Sequence Tag (EST) libraries of the acorn barnacle Balanus amphitrite. Biofouling, 27(4), 367-374. Informa UK Limited. doi:10.1080/08927014.2011.577211.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289952Blom, J., Jakobi, T., Doppmeier, D., Jaenicke, S., Kalinowski, J., Stoye, J. & Goesmann, A. (2011). Exact and complete short-read alignment to microbial genomes using Graphics Processing Unit programming. Bioinformatics, 27(10), 1351-1358. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr151.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Im Druck | PUB-ID: 2017892Schneiker-Bekel, S., Wibberg, D., Bekel, T., Blom, J., Linke, B., Neuweger, H., Stiens, M., Vorhölter, F.-J., Weidner, S., Goesmann, A., Pühler, A. & Schlüter, A. (In Press). The complete genome sequence of the dominant Sinorhizobium meliloti field isolate SM11 extends the S. meliloti pan-genome. Journal of Biotechnology, 155(1), 20-33. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2010.12.018.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955Hackl, M., Jakobi, T., Blom, J., Doppmeier, D., Brinkrolf, K., Szczepanowski, R., Bernhart, S.H., Höner zu Siederdissen, C., Bort, J.A.H., Wieser, M., Kunert, R., Jeffs, S., Hofacker, I.L., Goesmann, A., Pühler, A., Borth, N. & Grillari, J. (2011). Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering. Journal of Biotechnology, 153(1-2), 62-75. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.02.011.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2036058Margaret, I., Becker, A., Blom, J., Bonilla, I., Goesmann, A., Göttfert, M., Lloret, J., Mittard-Runte, V., Rückert, C., Ruiz-Sainz, J.-E., Vinardell, J.M. & Weidner, S. (2011). Symbiotic properties and first analyses of the genomic sequence of the fast growing model strain Sinorhizobium fredii HH103 nodulating soybean. Journal of Biotechnology, 155(1), 11-19. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2011.03.016.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093578Linke, B., Giegerich, R. & Goesmann, A. (2011). Conveyor: a workflow engine for bioinformatic analyses. Bioinformatics, 27(7), 903-911. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btr040.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1966439Trost, E., Ott, L., Schneider, J., Schröder, J., Jaenicke, S., Goesmann, A., Husemann, P., Stoye, J., Alves Dorella, F., Souza Rocha, F., de Castro Soares, S., D'Afonseca, V., Miyoshi, A., Ruiz, J., Silva, A., Azevedo, V., Burkovski, A., Guiso, N., Join-Lambert, O.F., Kayal, S. & Tauch, A. (2010). The complete genome sequence of Corynebacterium pseudotuberculosis FRC41 isolated from a 12-year-old girl with necrotizing lymphadenitis reveals insights into gene-regulatory networks contributing to virulence. BMC Genomics, 11(1): 728. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-11-728.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1794039Kuenne, C., Voget, S., Pischimarov, J., Oehm, S., Goesmann, A., Daniel, R., Hain, T. & Chakraborty, T. (2010). Comparative Analysis of Plasmids in the Genus Listeria. PLOS ONE, 5(9): e12511. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0012511.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1795508Bertelli, C., Collyn, F., Croxatto, A., Rückert, C., Polkinghorne, A., Kebbi-Beghdadi, C., Goesmann, A., Vaughan, L. & Greub, G. (2010). The Waddlia Genome: A Window into Chlamydial Biology. PLOS ONE, 5(5): e10890. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0010890.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1795628Smits, T.H.M., Rezzonico, F., Pelludat, C., Goesmann, A., Frey, J.E. & Duffy, B. (2010). Genomic and phenotypic characterization of a nonpigmented variant of Pantoea vagans biocontrol strain C9-1 lacking the 530-kb megaplasmid pPag3. FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 308(1), 48-54. Oxford University Press (OUP). doi:10.1111/j.1574-6968.2010.01994.x.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929692Schneider, J., Vorhölter, F.-J., Trost, E., Blom, J., Musa, Y.R., Neuweger, H., Niehaus, K., Schatschneider, S., Tauch, A. & Goesmann, A. (2010). CARMEN - Comparative Analysis and in silico Reconstruction of organism-specific MEtabolic Networks. Genetics and Molecular Research, 9(3), 1660-1672. Genetics and Molecular Research. doi:10.4238/vol9-3gmr901.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275Trost, E., Götker, S., Schneider, J., Schneiker-Bekel, S., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Arnold, W., Bekel, T., Blom, J., Gartemann, K.-H., Linke, B., Goesmann, A., Pühler, A., Shukla, S.K. & Tauch, A. (2010). Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion. BMC Genomics, 11(1): 91. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-11-91.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785504Yang, I., John, U., Beszteri, S., Glöckner, G., Krock, B., Goesmann, A. & Cembella, A.D. (2010). Comparative gene expression in toxic versus non-toxic strains of the marine dinoflagellate Alexandrium minutum. BMC Genomics, 11(1): 248. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-11-248.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1796445Smits, T.H.M., Rezzonico, F., Kamber, T., Blom, J., Goesmann, A., Frey, J.E. & Duffy, B. (2010). Complete Genome Sequence of the Fire Blight Pathogen Erwinia amylovora CFBP 1430 and Comparison to Other Erwinia spp. MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS, 23(4), 384-393. Scientific Societies. doi:10.1094/MPMI-23-4-0384.
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2010 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894907Mittard-Runte, V., Bekel, T., Blom, J., Dondrup, M., Henckel, K., Jaenicke, S., Krause, L., Linke, B., Neuweger, H., Schneiker-Bekel, S. & Goesmann, A. (2010). Practical Guide: Genomic Techniques and How to Apply Them to Marine Questions. In J.M. Cock, K. Tessmar-Raible, C. Boyen & F. Viard (Hrsg.), Introduction to Marine Genomics (Advances in Marine Genomics) (S. 315-396). Netherlands: Springer Netherlands. doi:10.1007/978-90-481-8639-6_9.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1796644Smits, T.H.M., Jaenicke, S., Rezzonico, F., Kamber, T., Goesmann, A., Frey, J.E. & Duffy, B. (2010). Complete genome sequence of the fire blight pathogen Erwinia pyrifoliae DSM 12163(T) and comparative genomic insights into plant pathogenicity. BMC Genomics, 11(1): 2. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-11-2.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785579Farnbacher, M., Jahns, T., Willrodt, D., Daniel, R., Haas, R., Goesmann, A., Kurtz, S. & Rieder, G. (2010). Sequencing, annotation, and comparative genome analysis of the gerbil-adapted Helicobacter pylori strain B8. BMC Genomics, 11(1): 335. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-11-335.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588692Steinweg, C., Kuenne, C.T., Billion, A., Mraheil, M.A., Domann, E., Ghai, R., Barbuddhe, S.B., Kaerst, U., Goesmann, A., Pühler, A., Weisshaar, B., Wehland, J., Lampidis, R., Kreft, J., Goebel, W., Chakraborty, T. & Hain, T. (2010). Complete Genome Sequence of Listeria seeligeri, a Nonpathogenic Member of the Genus Listeria. Journal of Bacteriology, 192(5), 1473-1474. American Society for Microbiology. doi:10.1128/JB.01415-09.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894319Henckel, K., Küster, H., Stutz, L. & Goesmann, A. (2010). MediPlEx - a tool to combine in silico and experimental gene expression profiles of the model legume Medicago truncatula. BMC Research Notes, 3(1): 262. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1756-0500-3-262.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321Dondrup, M., Albaum, S., Griebel, T., Henckel, K., Jünemann, S., Kahlke, T., Kleindt, C.K., Kuester, H., Linke, B., Mertens, D., Mittard-Runte, V., Neuweger, H., Runte, K.J., Tauch, A., Tille, F., Pühler, A. & Goesmann, A. (2009). EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data. BMC Bioinformatics, 10(1): 50. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2105-10-50.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589531Albaum, S., Neuweger, H., Fraenzel, B., Lange, S., Mertens, D., Troetschel, C., Wolters, D., Kalinowski, J., Nattkemper, T.W. & Goesmann, A. (2009). Qupe-a Rich Internet Application to take a step forward in the analysis of mass spectrometry-based quantitative proteomics experiments. Bioinformatics, 25(23), 3128-3134. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btp568.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634447Bekel, T., Henckel, K., Küster, H., Meyer, F., Mittard-Runte, V., Neuweger, H., Paarmann, D., Rupp, O., Zakrzewski, M., Pühler, A., Stoye, J. & Goesmann, A. (2009). The Sequence Analysis and Management System - SAMS-2.0: Data management and sequence analysis adapted to changing requirements from traditional sanger sequencing to ultrafast sequencing technologies. Journal of Biotechnology, 140(1-2), 3-12. Elsevier BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2009.01.006.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592257Schoen, C., Blom, J., Claus, H., Schramm-Glueck, A., Brandt, P., Mueller, T., Goesmann, A., Joseph, B., Konietzny, S., Kurzai, O., Schmitt, C., Friedrich, T., Linke, B., Vogel, U. & Frosch, M. (2008). Whole-genome comparison of disease and carriage strains provides insights into virulence evolution in Neisseria meningitidis. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 105(9), 3473-3478. NATL ACAD SCIENCES. doi:10.1073/pnas.0800151105.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586009Krause, L., Diaz, N.N., Edwards, R.A., Gartemann, K.-H., Krömeke, H., Neuweger, H., Pühler, A., Runte, K.J., Schlüter, A., Stoye, J., Szczepanowski, R., Tauch, A. & Goesmann, A. (2008). Taxonomic composition and gene content of a methane-producing microbial community isolated from a biogas reactor. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 136(1-2), 91-101. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.06.003.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585956Stiens, M., Becker, A., Bekel, T., Gödde, V., Goesmann, A., Niehaus, K., Schneiker-Bekel, S., Selbitschka, W., Weidner, S., Schlüter, A. & Pühler, A. (2008). Comparative genomic hybridisation and ultrafast pyrosequencing revealed remarkable differences between the Sinorhizobium meliloti genomes of the model strain Rm1021 and the field isolate SM11. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 31-37. Elsevier. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.04.014.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585987Schlüter, A., Bekel, T., Diaz, N.N., Dondrup, M., Eichenlaub, R., Gartemann, K.-H., Krahn, I., Krause, L., Kroemeke, H., Kruse, O., Mussgnug, J.H., Neuweger, H., Niehaus, K., Pühler, A., Runte, K.J., Szczepanowski, R., Tauch, A., Tilker, A., Viehöver, P. & Goesmann, A. (2008). The metagenome of a biogas-producing microbial community of a production-scale biogas plant fermenter analysed by the 454-pyrosequencing technology. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 77-90. Elsevier. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.05.008.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585918Tauch, A., Trost, E., Tilker, A., Ludewig, U., Schneiker-Bekel, S., Goesmann, A., Arnold, W., Bekel, T., Brinkrolf, K., Brune, I., Goetker, S., Kalinowski, J., Kamp, P.-B., Lobo, F.P., Viehöver, P., Weisshaar, B., Soriano, F., Droege, M. & Pühler, A. (2008). The lifestyle of Corynebacterium urealyticum derived from its complete genome sequence established by pyrosequencing. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 11-21. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.02.009.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939Tauch, A., Schneider, J., Szczepanowski, R., Tilker, A., Viehöver, P., Gartemann, K.-H., Arnold, W., Blom, J., Brinkrolf, K., Brune, I., Goetker, S., Weisshaar, B., Goesmann, A., Droege, M. & Pühler, A. (2008). Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids. Journal of Biotechnology, 136(1-2), 22-30. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2008.03.004.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783364Krause, L., Diaz, N.N., Goesmann, A., Kelley, S., Nattkemper, T.W., Rohwer, F., Edwards, R.A. & Stoye, J. (2008). Phylogenetic classification of short environmental DNA fragments. Nucleic Acids Research, 36(7), 2230-2239. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkn038.
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2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2018381Albaum, S., Neuweger, H., Lange, S., Mertens, D., Runte, K., Kalinowski, J., Nattkemper, T.W. & Goesmann, A. (2008). ProSE - "Software as a Service" for Quantitative Proteomics (Poster abstract). HUPO 7th Annual World Congress.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1990198Strauch, E., Hammerl, J.A., Konietzny, A., Schneiker-Bekel, S., Arnold, W., Goesmann, A., Pühler, A. & Beutin, L. (2008). Bacteriophage 2851 is a prototype phage for dissemination of the Shiga toxin variant gene 2c in Escherichia coli O157:H7. Infection and Immunity, 76(12), 5466-5477. American Society for Microbiology. doi:10.1128/IAI.00875-08.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631327Schneiker-Bekel, S., Perlova, O., Kaiser, O., Gerth, K., Alici, A., Altmeyer, M.O., Bartels, D., Bekel, T., Beyer, S., Bode, E., Bode, H.B., Bolten, C.J., Choudhuri, J.V., Doss, S., Elnakady, Y.A., Frank, B., Gaigalat, L., Goesmann, A., Groeger, C., Gross, F., Jelsbak, L., Jelsbak, L., Kalinowski, J., Kegler, C., Knauber, T., Konietzny, S., Kopp, M., Krause, L., Krug, D., Linke, B., Mahmud, T., Martinez-Arias, R., McHardy, A.C., Merai, M., Meyer, F., Mormann, S., Munoz-Dorado, J., Perez, J., Pradella, S., Rachid, S., Raddatz, G., Rosenau, F., Rückert, C., Sasse, F., Scharfe, M., Schuster, S.C., Suen, G., Treuner-Lange, A., Velicer, G.J., Vorhölter, F.-J., Weissman, K.J., Welch, R.D., Wenzel, S.C., Whitworth, D.E., Wilhelm, S., Wittmann, C., Bloecker, H., Pühler, A. & Mueller, R. (2007). Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosum. Nature Biotechnology, 25(11), 1281-1289. Nature Publ. Group. doi:10.1038/nbt1354.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631047Meisinger-Henschel, C., Schmidt, M., Lukassen, S., Linke, B., Krause, L., Konietzny, S., Goesmann, A., Howley, P., Chaplin, P., Suter, M. & Hausmann, J. (2007). Genomic sequence of chorioallantois vaccinia virus Ankara, the ancestor of modified vaccinia virus Ankara. JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY, 88(12), 3249-3259. SOC GENERAL MICROBIOLOGY. doi:10.1099/vir.0.83156-0.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783754Neuweger, H., Baumbach, J., Albaum, S., Bekel, T., Dondrup, M., Hüser, A.T., Kalinowski, J., Oehm, S., Pühler, A., Rahmann, S., Weile, J. & Goesmann, A. (2007). CoryneCenter: an online resource for the integrated analysis of corynebacterial genome and transcriptome data. BMC Systems Biology, 1(1): 55. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1186/1752-0509-1-55.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593149Moran, M.A., Belas, R., Schell, M.A., Gonzalez, J.M., Sun, F., Sun, S., Binder, B.J., Edmonds, J., Ye, W., Orcutt, B., Howard, E.C., Meile, C., Palefsky, W., Goesmann, A., Ren, Q., Paulsen, I., Ulrich, L.E., Thompson, L.S., Saunders, E. & Buchan, A. (2007). Ecological genomics of marine roseobacters. APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 73(14), 4559-4569. AMER SOC MICROBIOLOGY. doi:10.1128/AEM.02580-06.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594098Wegmann, U., O'Connell-Motherwy, M., Zomer, A., Buist, G., Shearman, C., Canchaya, C., Ventura, M., Goesmann, A., Gasson, M.J., Kuipers, O.P., van Sinderen, D. & Kok, J. (2007). Complete genome sequence of the prototype lactic acid bacterium Lactococcus lactis subsp cremoris MG1363. JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 189(8), 3256-3270. AMER SOC MICROBIOLOGY. doi:10.1128/JB.01768-06.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593268Bahl, M.I., Hansen, L.H., Goesmann, A. & Sorensen, S.J. (2007). The multiple antibiotic resistance IncP-1 plasmid pKJK5 isolated from a soil environment is phylogenetically divergent from members of the previously established alpha, beta and delta sub-groups. PLASMID, 58(1), 31-43. ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE. doi:10.1016/j.plasmid.2006.11.007.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894739Küster, H., Becker, A., Firnhaber, C., Hohnjec, N., Manthey, K., Perlick, A.M., Bekel, T., Dondrup, M., Henckel, K., Goesmann, A., Meyer, F., Wipf, D., Requena, N., Hildebrandt, U., Hampp, R., Nehls, U., Krajinski, F., Franken, P. & Pühler, A. (2007). Development of bioinformatic tools to support EST-sequencing, in silico- and microarray-based transcriptome profiling in mycorrhizal symbioses. Phytochemistry, 68(1), 19-32. Elsevier BV. doi:10.1016/j.phytochem.2006.09.026.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596976Krause, A., Ramakumar, A., Bartels, D., Battistoni, F., Bekel, T., Boch, J., Boehm, M., Friedrich, F., Hurek, T., Krause, L., Linke, B., McHardy, A.C., Sarkar, A., Schneiker-Bekel, S., Syed, A.A., Thauer, R., Vorhölter, F.-J., Weidner, S., Pühler, A., Reinhold-Hurek, B., Kaiser, O. & Goesmann, A. (2006). Complete genome of the mutualistic, N-2-fixing grass endophyte Azoarcus sp strain BH72. Nature Biotechnology, 24(11), 1385-1391. Nature Publ. Group. doi:10.1038/nbt1243.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598182Schneiker-Bekel, S., dos Santos, V.A.P.M., Bartels, D., Bekel, T., Brecht, M., Buhrmester, J., Chernikova, T.N., Denaro, R., Ferrer, M., Gertler, C., Goesmann, A., Golyshina, O.V., Kaminski, F., Khachane, A.N., Lang, S., Linke, B., McHardy, A.C., Meyer, F., Nechitaylo, T., Pühler, A., Regenhardt, D., Rupp, O., Sabirova, J.S., Selbitschka, W., Yakimov, M.M., Timmis, K.N., Vorhölter, F.-J., Weidner, S., Kaiser, O. & Golyshin, P.N. (2006). Genome sequence of the ubiquitous hydrocarbon-degrading marine bacterium Alcanivorax borkumensis. Nature Biotechnology, 24(8), 997-1004. Nature Publ. Group. doi:10.1038/nbt1232.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598354Hohnjec, N., Henckel, K., Bekel, T., Gouzy, J., Dondrup, M., Goesmann, A. & Küster, H. (2006). Transcriptional snapshots provide insights into the molecular basis of arbuscular mycorrhiza in the model legume Medicago truncatula. FUNCTIONAL PLANT BIOLOGY, 33(8), 737-748. CSIRO PUBLISHING. doi:10.1071/FP06079.
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2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596017Schoen, C., Claus, H., Goesmann, A., Mueller, T., Brandt, P., Otto-Karg, I., Schramm-Glueck, A., Vogel, U. & Frosch, M. (2006). Genome comparison of non-pathogenic and pathogenic meningococci (INTERNATIONAL JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY), 296(Suppl. 42), 134. ELSEVIER GMBH, URBAN & FISCHER VERLAG.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1868701Tauch, A., Trost, E., Bekel, T., Goesmann, A., Ludewig, U. & Pühler, A. (2006). Ultrafast de novo sequencing of Corynebacterium urealyticum using the Genome Sequencer 20 System. Biochemica, 4, 4-6.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597316Hain, T., Steinweg, C., Kuenne, C.T., Billion, A., Ghai, R., Chatterjee, S.S., Domann, E., Kaerst, U., Goesmann, A., Bekel, T., Bartels, D., Kaiser, O., Meyer, F., Pühler, A., Weisshaar, B., Wehland, J., Liang, C., Dandekar, T., Lampidis, R., Kreft, J., Goebel, W. & Chakraborty, T. (2006). Whole-genome sequence of Listeria welshimeri reveals common steps in genome reduction with Listeria innocua as compared to Listeria monocytogenes. Journal of Bacteriology, 188(23), 8299-8302. AMER SOC MICROBIOLOGY. doi:10.1128/JB.00758-06.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773302Bartels, D., Kespohl, S., Albaum, S., Drüke, T., Goesmann, A., Herold, J., Kaiser, O., Pühler, A., Pfeiffer, F., Raddatz, G., Stoye, J., Meyer, F. & Schuster, S.C. (2005). BACCardI - a tool for the validation of genomic assemblies, assisting genome finishing and intergenome comparison. Bioinformatics, 21(7), 853-859. Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/bti091.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773652Overbeek, R., Begley, T., Butler, R.M., Choudhuri, J.V., Chuang, H.-Y., Cohoon, M., Crécy-Lagard, V. de, Diaz, N.N., Disz, T., Edwards, R., Fonstein, M., Frank, E.D., Gerdes, S., Glass, E.M., Goesmann, A., Hanson, A., Iwata-Reuyl, D., Jensen, R., Jamshidi, N., Krause, L., Kubal, M., Larsen, N., Linke, B., McHardy, A.C., Meyer, F., Neuweger, H., Olsen, G., Olson, R., Osterman, A., Portnoy, V., Pusch, G.D., Rodionov, D.A., Rückert, C., Steiner, J., Stevens, R., Thiele, I., Vassieva, O., Ye, Y., Zagnitko, O. & Vonstein, V. (2005). The subsystems approach to genome annotation and its use in the Project to Annotate 1000 Genomes. Nucleic Acids Research, 33(17), 5691-5702. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gki866.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773644Goesmann, A., Linke, B., Bartels, D., Dondrup, M., Krause, L., Neuweger, H., Oehm, S., Paczian, T., Wilke, A. & Meyer, F. (2005). BRIGEP - the BRIDGE-based genome-transcriptome-proteome browser. Nucleic Acids Research, 33(Web Server), W710-W716. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gki400.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1608953Rendulic, S., Jagtap, P., Rosinus, A., Eppinger, M., Baar, C., Lanz, C., Keller, H., Lambert, C., Evans, K.J., Goesmann, A., Meyer, F., Sockett, R.E. & Schuster, S.C. (2004). A predator unmasked: Life cycle of Bdellovibrio bacteriovorus from a genomic perspective. SCIENCE, 303(5658), 689-692. AMER ASSOC ADVANCEMENT SCIENCE. doi:10.1126/science.1093027.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1605656Szczepanowski, R., Krahn, I., Linke, B., Goesmann, A., Pühler, A. & Schlüter, A. (2004). Antibiotic multiresistance plasmid pRSB101 isolated from a wastewater treatment plant is related to plasmids residing in phytopathogenic bacteria and carries eight different resistance determinants including a multidrug transport system. Microbiology, 150(11), 3613-3630. SOC GENERAL MICROBIOLOGY. doi:10.1099/mic.0.27317-0.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609260Dondrup, M., Goesmann, A., Bartels, D., Kalinowski, J., Krause, L., Linke, B., Rupp, O., Sczyrba, A., Pühler, A. & Meyer, F. (2003). EMMA: a platform for consistent storage and efficient analysis of microarray data. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 106(2-3), 135-146. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2003.08.010.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609286Goesmann, A., Linke, B., Rupp, O., Krause, L., Bartels, D., Dondrup, M., McHardy, A.C., Wilke, A., Pühler, A. & Meyer, F. (2003). Building a BRIDGE for the integration of heterogeneous data from functional genomics into a platform for systems biology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 106(2-3), 157-167. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2003.08.007.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609251Kaiser, O., Bartels, D., Bekel, T., Goesmann, A., Kespohl, S., Pühler, A. & Meyer, F. (2003). Whole genome shotgun sequencing guided-by bioinformatics pipelines - An optimized approach for an established technique. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 106(2-3), 121-133. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2003.08.008.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609272Wilke, A., Rückert, C., Bartels, D., Dondrup, M., Goesmann, A., Hüser, A.T., Kespohl, S., Linke, B., Mahne, M., McHardy, A., Pühler, A. & Meyer, F. (2003). Bioinformatics support for high-throughput proteomics. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 106(2-3), 147-156. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2003.08.009.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612324Tauch, A., Schlüter, A., Bischoff, N., Goesmann, A., Meyer, F. & Pühler, A. (2003). The 79,370-bp conjugative plasmid pB4 consists of an IncP-1 beta backbone loaded with a chromate resistance transposon, the strA-strB streptomycin resistance gene pair, the oxacillinase gene bla(NPS-1), and a tripartite antibiotic efflux system of the resistance-nodulation-division family. Molecular Genetics and Genomics, 268(5), 570-584. SPRINGER-VERLAG. doi:10.1007/s00438-002-0785-z.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773880Meyer, F., Goesmann, A., McHardy, A.C., Bartels, D., Bekel, T., Clausen, J., Kalinowski, J., Linke, B., Rupp, O., Giegerich, R. & Pühler, A. (2003). GenDB - an open source genome annotation system for prokaryote genomes. Nucleic Acids Research, 31(8), 2187-2195. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkg312.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1895035Kalinowski, J., Bathe, B., Bartels, D., Bischoff, N., Bott, M., Burkovski, A., Dusch, N., Eggeling, L., Eikmanns, B.J., Gaigalat, L., Goesmann, A., Hartmann, M., Huthmacher, K., Kramer, R., Linke, B., McHardy, A.C., Meyer, F., Mockel, B., Pfefferle, W., Pühler, A., Rey, D.A., Rückert, C., Rupp, O., Sahm, H., Wendisch, V.F., Wiegrabe, I. & Tauch, A. (2003). The complete Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 genome sequence and its impact on the production of L-aspartate-derived amino acids and vitamins. Journal of Biotechnology, 104(1-3), 5-25. Elsevier BV. doi:10.1016/S0168-1656(03)00154-8.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615366Goesmann, A., Haubrock, M., Meyer, F., Kalinowski, J. & Giegerich, R. (2002). PathFinder: reconstruction and dynamic visualization of metabolic pathways. BIOINFORMATICS, 18(1), 124-129. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/18.1.124.