PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

Alle markieren

• [46]
  

  2022 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2961446

  Two Flagellar mutants of Xanthomonas campestris are characterized by enhanced xanthan production and higher xanthan viscosity
  Steffens T, Vorhölter F-J, Teckentrup J, Hublik G, Walhorn V, Anselmetti D, Pühler A, Niehaus K, Ortseifen V (2022)
  Journal of Biotechnology 347: 9-17.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [45]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933337

  Regulatory associations between the metabolism of sulfur-containing amino acids and xanthan biosynthesis in Xanthomonas campestris pv. campestris B100.
  Schulte F, Leßmeier L, Voß J, Ortseifen V, Vorhölter F-J, Niehaus K (2019)
  FEMS microbiology letters 366(2): fnz005.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [44]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2930510

  Comparative transcription profiling of two fermentation cultures of Xanthomonas campestris pv. campestris B100 sampled in the growth and in the stationary phase
  Alkhateeb R, Vorhölter F-J, Steffens T, Rückert C, Ortseifen V, Hublik G, Niehaus K, Pühler A (2018)
  Applied Microbiology and Biotechnology 102(15): 6613-6625.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [43]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908531

  Comparative genomics of host adaptive traits in Xanthomonas translucens pv. graminis
  Hersemann L, Wibberg D, Blom J, Goesmann A, Widmer F, Vorhölter F-J, Koelliker R (2017)
  BMC GENOMICS 18(1): 35.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [42]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2910507

  The lipopolysaccharide of the crop pathogen Xanthomonas translucens pv. translucens: chemical characterization and determination of signaling events in plant cells
  Steffens T, Duda K, Lindner B, Vorhölter F-J, Bednarz H, Niehaus K, Holst O (2017)
  GLYCOBIOLOGY 27(3): 264-274.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [41]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914105

  Systems and synthetic biology perspective of the versatile plant-pathogenic and polysaccharide-producing bacterium Xanthomonas campestris
  Schatschneider S, Schneider J, Blom J, Letisse F, Niehaus K, Goesmann A, Vorhölter F-J (2017)
  MICROBIOLOGY-SGM 163(8): 1117-1144.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [40]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907676

  Complete Genome Sequence of the Barley Pathogen Xanthomonas translucens pv. translucens DSM 18974 T (ATCC 19319 T)
  Jaenicke S, Bunk B, Wibberg D, Spröer C, Hersemann L, Blom J, Winkler A, Schatschneider S, Albaum S, Kölliker R, Goesmann A, et al. (2016)
  Genome Announcements 4(6): e01334-16.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [39]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903660

  The influence of a modified lipopolysaccharide O-antigen on the biosynthesis of xanthan in Xanthomonas campestris pv. campestris B100
  Steffens T, Vorhölter F-J, Giampa M, Hublik G, Pühler A, Niehaus K (2016)
  BMC Microbiology 16(1): 93.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [38]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901808

  Genome wide transcription start sites analysis of the Xanthomonas campestris pv. campestris B100 with insights into the gum gene cluster directing the biosynthesis of the exopolysaccharide xanthan.
  Alkhateeb R, Vorhölter F-J, Rückert C, Mentz A, Wibberg D, Hublik G, Niehaus K, Pühler A (2016)
  J Biotechnol 225: 18-28.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [37]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905631

  Applying DNA affinity chromatography to specifically screen for sucrose-related DNA-binding transcriptional regulators of Xanthomonas campestris
  Leßmeier L, Alkhateeb R, Schulte F, Steffens T, Loka TP, Pühler A, Niehaus K, Vorhölter F-J (2016)
  Journal of Biotechnology 232: 89-98.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [36]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2761035

  Draft Genome Sequence of Pseudomonas aeruginosa Strain WS136, a Highly Cytotoxic ExoS-Positive Wound Isolate Recovered from Pyoderma Gangrenosum
  Arnold M, Wibberg D, Blom J, Schatschneider S, Winkler A, Kutter Y, Rückert C, Albersmeier A, Albaum S, Goesmann A, Zange S, et al. (2015)
  Genome announcements 3(4): e00680-15.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [35]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2758122

  Draft genome of the xanthan producer Xanthomonas campestris NRRL B-1459 (ATCC 13951)
  Wibberg D, Alkhateeb R, Winkler A, Albersmeier A, Schatschneider S, Albaum S, Niehaus K, Hublik G, Pühler A, Vorhölter F-J (2015)
  Journal of Biotechnology 204: 45-46.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [34]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2651944

  Genome Sequence of the Small-Colony Variant Pseudomonas aeruginosa MH27, Isolated from a Chronic Urethral Catheter Infection
  Tielen P, Wibberg D, Blom J, Rosin N, Meyer A-K, Bunk B, Schobert M, Tüpker R, Schatschneider S, Rückert C, Albersmeier A, et al. (2014)
  Genome announcements 2(1).

  PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
   
• [33]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2672926

  Genome Sequence of the Acute Urethral Catheter Isolate Pseudomonas aeruginosa MH38
  Wibberg D, Tielen P, Blom J, Rosin N, Schobert M, Tüpker R, Schatschneider S, Spilker D, Albersmeier A, Goesmann A, Vorhölter F-J, et al. (2014)
  Genome announcements 2(2): e00161-14.

  PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
   
• [32]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2673663

  Characterization of the pyrophosphate-dependent 6-phosphofructokinase from Xanthomonas campestris pv. campestris
  Frese M, Schatschneider S, Voss J, Vorhölter F-J, Niehaus K (2014)
  Archives of Biochemistry and Biophysics 546: 53-63.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [31]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699819

  Metabolic flux pattern of glucose utilization by Xanthomonas campestris pv. campestris: prevalent role of the Entner-Doudoroff pathway and minor fluxes through the pentose phosphate pathway and glycolysis
  Schatschneider S, Huber C, Neuweger H, Watt T, Pühler A, Eisenreich W, Wittmann C, Niehaus K, Vorhölter F-J (2014)
  Molecular BioSystems 10(10): 2663-2676.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [30]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560194

  Bacterial wilt - a puzzling disease of forage grasses
  Kölliker R, Wichmann F, Vorhölter F-J, Conradin C, Reinhard S, Boller B, Widmer F (2013)
  Agrarforschung Schweiz 40(1): 32-39.

  PUB | WoS
   
• [29]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2632946

  Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain VLB120 a solvent tolerant, styrene degrading bacterium, isolated from forest soil
  Köhler KAK, Rückert C, Schatschneider S, Vorhölter F-J, Szczepanowski R, Blank LM, Niehaus K, Goesmann A, Pühler A, Kalinowski J, Schmid A (2013)
  Journal of Biotechnology 168(4): 729-730.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [28]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2605244

  Establishment, in silico analysis, and experimental verification of a large-scale metabolic network of the xanthan producing Xanthomonas campestris pv. campestris strain B100
  Schatschneider S, Persicke M, Watt T, Hublik G, Pühler A, Niehaus K, Vorhölter F-J (2013)
  Journal of Biotechnology 167(2): 123-134.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [27]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2612924

  RNA-Seq facilitates a new perspective on signal transduction and gene regulation in important plant pathogens
  Vorhölter F-J (2013)
  Molecular Microbiology 88(6): 1041-1046.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [26]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2576539

  The noncanonical type III secretion system of Xanthomonas translucens pv. graminis is essential for forage grass infection
  Wichmann F, Vorhölter F-J, Hersemann L, Widmer F, Blom J, Niehaus K, Reinhard S, Conradin C, Kölliker R (2013)
  Molecular plant pathology 14(6): 576-588.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [25]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2625790

  Dynamic protein phosphorylation during the growth of Xanthomonas campestris pv. campestris B100 revealed by a gel-based proteomics approach
  Musa YR, Baesell K, Schatschneider S, Vorhölter F-J, Becher D, Niehaus K (2013)
  Journal of Biotechnology 167(2): 111-122.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [24]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2537690

  Involvement of bacterial TonB-dependent signaling in the generation of an oligogalacturonide damage-associated molecular pattern from plant cell walls exposed to Xanthomonas campestris pv. campestris pectate lyases
  Vorhölter F-J, Wiggerich H-G, Scheidle H, Sidhu VK, Mrozek K, Küster H, Pühler A, Niehaus K (2012)
  BMC Microbiology 12(1): 239.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [23]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317680

  Gene discovery by genome-wide CDS re-prediction and microarray-based transcriptional analysis in phytopathogen Xanthomonas campestris
  Zhou L, Vorhölter F-J, He Y-Q, Jiang B-L, Tang J-L, Xu Y, Pühler A, He Y-W (2011)
  BMC Genomics 12(1): 359.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [22]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2375634

  The ubiquitous plasmid pXap41 in the invasive phytopathogen Xanthomonas arboricola pv. pruni: complete sequence and comparative genomic analysis
  Pothier JF, Vorhölter F-J, Blom J, Goesmann A, Pühler A, Smits TH, Duffy B (2011)
  FEMS Microbiology Letters 323(1): 52-60.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [21]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326481

  Insights into the genome of the xanthan-producing phytopathogen Xanthomonas arboricola pv. pruni 109 by comparative genomic hybridization
  Mayer L, Vendruscolo CT, da Silva WP, Vorhölter F-J, Becker A, Pühler A (2011)
  Journal of Biotechnology 155(1): 40-49.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [20]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2404874

  Genome-enabled determination of amino acid biosynthesis in Xanthomonas campestris pv. campestris and identification of biosynthetic pathways for alanine, glycine, and isoleucine by 13C-isotopologue profiling
  Schatschneider S, Vorhölter F-J, Rückert C, Becker A, Eisenreich W, Pühler A, Niehaus K (2011)
  Molecular Genetics and Genomics 286(3-4): 247-259.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [19]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093276

  Unusual Outer Membrane Lipid Composition of the Gram-negative, Lipopolysaccharide-lacking Myxobacterium Sorangium cellulosum So ce56
  Keck M, Gisch N, Moll H, Vorhölter F-J, Gerth K, Kahmann U, Lissel M, Lindner B, Niehaus K, Hoist O (2011)
  Journal of Biological Chemistry 286(15): 12850-12859.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [18]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093360

  Pathogenomics of Xanthomonas: understanding bacterium-plant interactions
  Ryan RP, Vorhölter F-J, Potnis N, Jones JB, Van Sluys M-A, Bogdanove AJ, Dow JM (2011)
  Nature Reviews Microbiology 9(5): 344-355.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [17]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Im Druck | PUB-ID: 2017892

  The complete genome sequence of the dominant Sinorhizobium meliloti field isolate SM11 extends the S. meliloti pan-genome
  Schneiker-Bekel S, Wibberg D, Bekel T, Blom J, Linke B, Neuweger H, Stiens M, Vorhölter F-J, Weidner S, Goesmann A, Pühler A, et al. (In Press)
  Journal of Biotechnology 155(1): 20-33.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [16]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1929692

  CARMEN - Comparative Analysis and in silico Reconstruction of organism-specific MEtabolic Networks
  Schneider J, Vorhölter F-J, Trost E, Blom J, Musa YR, Neuweger H, Niehaus K, Schatschneider S, Tauch A, Goesmann A (2010)
  Genetics and Molecular Research 9(3): 1660-1672.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [15]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783187

  EDGAR: a software framework for the comparative analysis of prokaryotic genomes
  Blom J, Albaum S, Doppmeier D, Pühler A, Vorhölter F-J, Zakrzewski M, Goesmann A (2009)
  BMC Bioinformatics 10(1): 154.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [14]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783292

  The missing link: Bordetella petrii is endowed with both the metabolic versatility of environmental bacteria and virulence traits of pathogenic Bordetellae
  Gross R, Guzman CA, Sebaihia M, Martins dos Santos VAP, Pieper DH, Koebnik R, Lechner M, Bartels D, Buhrmester J, Choudhuri JV, Ebensen T, et al. (2008)
  BMC Genomics 9(1): 449.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [13]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592024

  The genome of Xanthomonas campestris pv. campestris B 100 and its use for the reconstruction of metabolic pathways involved in xanthan biosynthesis
  Vorhölter F-J, Schneiker-Bekel S, Goesmann A, Krause L, Bekel T, Kaiser O, Linke B, Patschkowski T, Rückert C, Schmid J, Sidhu VK, et al. (2008)
  Journal of Biotechnology 134(1-2): 33-45.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [12]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586869

  Identification of Xanthomonas campestris pv. campestris galactose utilization genes from transcriptome data
  Serrania J, Vorhölter F-J, Niehaus K, Pühler A, Becker A (2008)
  Journal of Biotechnology 135(3): 309-317.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [11]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587298

  Analysis of outer membrane vesicle associated proteins isolated from the plant pathogenic bacterium Xanthomonas campestris pv. campestris
  Sidhu VK, Vorhölter F-J, Niehaus K, Watt SA (2008)
  BMC Microbiology 8(1): 87.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [10]
  

  2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631327

  Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosum
  Schneiker-Bekel S, Perlova O, Kaiser O, Gerth K, Alici A, Altmeyer MO, Bartels D, Bekel T, Beyer S, Bode E, Bode HB, et al. (2007)
  Nature Biotechnology 25(11): 1281-1289.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [9]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596976

  Complete genome of the mutualistic, N-2-fixing grass endophyte Azoarcus sp strain BH72
  Krause A, Ramakumar A, Bartels D, Battistoni F, Bekel T, Boch J, Boehm M, Friedrich F, Hurek T, Krause L, Linke B, et al. (2006)
  Nature Biotechnology 24(11): 1385-1391.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [8]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598182

  Genome sequence of the ubiquitous hydrocarbon-degrading marine bacterium Alcanivorax borkumensis
  Schneiker-Bekel S, dos Santos VAPM, Bartels D, Bekel T, Brecht M, Buhrmester J, Chernikova TN, Denaro R, Ferrer M, Gertler C, Goesmann A, et al. (2006)
  Nature Biotechnology 24(8): 997-1004.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [7]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600185

  The clc element of Pseudomonas sp strain B13, a genomic island with various catabolic properties
  Gaillard M, Vallaeys T, Vorhölter F-J, Minoia M, Werlen C, Sentchilo V, Pühler A, van der Meer JR (2006)
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY 188(5): 1999-2013.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [6]
  

  2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1601712

  Insights into genome plasticity and pathogenicity of the plant pathogenic bacterium Xanthomonas campestris pv. vesicatoria revealed by the complete genome sequence
  Thieme F, Koebnik R, Bekel T, Berger C, Boch J, Buttner D, Caldana C, Gaigalat L, Goesmann A, Kay S, Kirchner O, et al. (2005)
  JOURNAL OF BACTERIOLOGY 187(21): 7254-7266.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [5]
  

  2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609306

  Comparison of two Xanthomonas campestris pathovar campestris genomes revealed differences in their gene composition
  Vorhölter F-J, Thias T, Meyer F, Bekel T, Kaiser O, Pühler A, Niehaus K (2003)
  Journal of Biotechnology 106(2-3): 193-202.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [4]
  

  2001 | Dissertation | PUB-ID: 2434536

  Analyse und Charakterisierung einer 35 Kilobasen großen Genregion aus Xanthomonas campestris pathovar campestris, deren Gene vorwiegend an der Biosynthese des Lipopolysaccharids beteiligt sind
  Vorhölter F-J (2001)
  Bielefeld.

  PUB
   
• [3]
  

  2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1616190

  Lipopolysaccharide biosynthesis in Xanthomonas campestris pv. campestris: a cluster of 15 genes is involved in the biosynthesis of the LPS O-antigen and the LPS core
  Vorhölter F-J, Niehaus K, Pühler A (2001)
  MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS 266(1): 79-95.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [2]
  

  2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1616469

  The complete sequence of the 1,683-kb pSymB megaplasmid from the N-2-fixing endosymbiont Sinorhizobium meliloti
  Finan TM, Weidner S, Wong K, Buhrmester J, Chain P, Vorhölter F-J, Hernandez-Lucas I, Becker A, Cowie A, Gouzy J, Golding B, et al. (2001)
  PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 98(17): 9889-9894.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
   
• [1]
  

  2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1616678

  The composite genome of the legume symbiont Sinorhizobium meliloti
  Galibert F, Finan TM, Long SR, Pühler A, Abola P, Ampe F, Barloy-Hubler F, Barnett MJ, Becker A, Boistard P, Bothe G, et al. (2001)
  SCIENCE 293(5530): 668-672.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC