PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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• [55]
  

  2024 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2989114

  Baake, E.; Cordero, F.; Di Gaspero, E. (2024): The mutation process on the ancestral line under selection. Theoretical population biology

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• [54]
  

  2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2979037

  Baake, E.; Esercito, L.; Hummel, S. (2023): Lines of descent in a Moran model with frequency-dependent selection and mutation Stochastic Processes and their Applications,160: 409-457.

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• [53]
  

  2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965524

  Baake, E.; Cordero, F.; Hummel, S. (2022): Lines of descent in the deterministic mutation–selection model with pairwise interaction Annals of Applied Probability,32:(4): 2400-2447.

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• [52]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2953579

  Alberti, F.; Baake, E.; Letter, I.; Martinez, S. (2021): Solving the migration-recombination equation from a genealogical point of view Journal of mathematical biology,82:(5):41

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• [51]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Im Druck | PUB-ID: 2957507

  Alberti, F.; Herrmann, C.; Baake, E. (In Press): Selection, recombination, and the ancestral initiation graph Theoretical population biology

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• [50]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957017

  Alberti, F.; Baake, E. (2021): Solving the Selection-Recombination Equation: Ancestral Lines and Dual Processes Documenta Mathematica ,26: 743-793.

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• [49]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936339

  Baake, E.; Gonzalez Casanova, A.; Probst, S.; Wakolbinger, A. (2019): Modelling and simulating Lenski's long-term evolution experiment THEORETICAL POPULATION BIOLOGY,127: 58-74.

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• [48]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2931242

  Baake, E.; Cordero, F.; Hummel, S. (2018): A probabilistic view on the deterministic mutation-selection equation: dynamics, equilibria, and ancestry via individual lines of descent JOURNAL OF MATHEMATICAL BIOLOGY,77:(3): 795-820.

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• [47]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2920936

  Baake, E.; Wakolbinger, A. (2018): Lines of Descent Under Selection JOURNAL OF STATISTICAL PHYSICS,172:(1): 156-174.

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• [46]
  

  2017 | Preprint | PUB-ID: 2908549

  Baake, E.; Esser, M. (2017): Fragmentation process, pruning poset for rooted forests, and Möbius inversion arXiv:1702.03173

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• [45]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2780316

  Baake, E.; Baake, M.; Salamat, M. (2016): The general recombination equation in continuous time and its solution Discrete and Continuous Dynamical Systems,36:(1): 63-95.

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• [44]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908021

  Baake, E.; Baake, M. (2016): Haldane linearisation done right: Solving the nonlinear recombination equation the easy way Discrete and Continuous Dynamical Systems. A,36:(12): 6645-6656.

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• [43]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2908405

  Baake, E.; Lenz, U.; Wakolbinger, A. (2016): The common ancestor type distribution of a $\Lambda$-Wright-Fisher process with selection and mutation Electronic Communications in Probability,21:59

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• [42]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904686

  Esser, M.; Probst, S.; Baake, E. (2016): Partitioning, duality, and linkage disequilibria in the Moran model with recombination JOURNAL OF MATHEMATICAL BIOLOGY,73:(1): 161-197.

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• [41]
  

  2015 | Preprint | PUB-ID: 2908408

  Baake, E.; Wakolbinger, A. (2015): Feller's Contributions to Mathematical Biology arXiv:1501.05278

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• [40]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2766816

  Lenz, U.; Kluth, S.; Baake, E.; Wakolbinger, A. (2015): Looking down in the ancestral selection graph: A probabilistic approach to the common ancestor type distribution Theoretical Population Biology,103: 27-37.

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• [39]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2677355

  Baake, E.; von Wangenheim, U. (2014): Single-crossover recombination and ancestral recombination trees Journal of Mathematical Biology,68:(6): 1371-1402.

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• [38]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2635471

  Kluth, S.; Hustedt, T.; Baake, E. (2013): The Common Ancestor Process Revisited Bulletin Of Mathematical Biology,75:(11): 2003-2027.

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• [37]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2645211

  Kluth, S.; Baake, E. (2013): The Moran model with selection: Fixation probabilities, ancestral lines, and an alternative particle representation Theoretical Population Biology,90: 104-112.

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• [36]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2377270

  Baake, E.; Hustedt, T. (2011): Moment closure in a Moran model with recombination Markov Processes Relat. Fields,17:(3): 429-446.

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• [35]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1796454

  von Wangenheim, U.; Baake, E.; Baake, M. (2010): Single-crossover recombination in discrete time JOURNAL OF MATHEMATICAL BIOLOGY,60:(5): 727-760.

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• [34]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | PUB-ID: 2377283

  Baake, E. (2010): Deterministic and stochastic aspects of single-crossover recombination. In: Proceedings of the International Congress of Mathematicians, Hyderabad 2010, ed. R. Bhatia, Hindustan Book Agency, New Delhi, Vol. IV, pp. 3038--3053.

  PUB | arXiv
   
• [33]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 2378093

  Baake, E. (2009): Deterministic and stochastic aspects of recombination Oberwolfach Reports,6: 1366.

  PUB
   
• [32]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635450

  Lipsmeier, F.; Baake, E. (2009): Rare Event Simulation for T-cell Activation JOURNAL OF STATISTICAL PHYSICS,134:(3): 537-566.

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• [31]
  

  2008 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378061

  Baake, E.; Lipsmeier, F. (2008): Rare event simulation in immunobiology. In: Proceedings of the 7th International Workshop on Rare Event Simulation RESIM 2008, Rennes, France.

  PUB
   
• [30]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1630777

  Baake, E.; Herms, I. (2008): Single-crossover dynamics: Finite versus infinite populations BULLETIN OF MATHEMATICAL BIOLOGY,70:(2): 603-624.

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• [29]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 1927750

  Bialowons, R.; Baake, E. (2008): Ancestral processes with selection: Branching and Moran models Banach Center Publications,80: 33-52.

  PUB | DOI | arXiv
   
• [28]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586423

  Zint, N.; Baake, E.; den Hollander, F. (2008): How T-cells use large deviations to recognize foreign antigens JOURNAL OF MATHEMATICAL BIOLOGY,57:(6): 841-861.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [27]
  

  2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378105

  Baake, E. (2007): Are mutations spontaneous or directed Nieuw Archief voor Wiskunde,5/8:(3): 171-174.

  PUB
   
• [26]
  

  2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595869

  Baake, E.; Georgii, H. - O. (2007): Mutation, selection, and ancestry in branching models: a variational approach JOURNAL OF MATHEMATICAL BIOLOGY,54:(2): 257-303.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [25]
  

  2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604953

  Baake, E.; Baake, M.; Bovier, A.; Klein, M. (2005): An asymptotic maximum principle for essentially linear evolution models JOURNAL OF MATHEMATICAL BIOLOGY,50:(1): 83-114.

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• [24]
  

  2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2377274

  Georgii, H. - O.; Baake, E. (2003): Supercritical multitype branching processes: the ancestral types of typical individuals Adv. Appl. Prob. 35 (2003), 1090-1110

  PUB | arXiv
   
• [23]
  

  2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1927781

  Baake, M.; Baake, E. (2003): An exactly solved model for mutation, recombination and selection Canadian Journal of Mathematics,55:(1): 3-41.

  PUB | DOI | WoS | arXiv
   
• [22]
  

  2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1613803

  Hermisson, J.; Redner, O.; Wagner, H.; Baake, E. (2002): Mutation-selection balance: Ancestry, load, and maximum principle THEORETICAL POPULATION BIOLOGY,62:(1): 9-46.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [21]
  

  2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2377995

  Baake, E.; Wagner, H. (2001): Mutation-selection models solved exactly with methods of statistical mechanics GENETICS RESEARCH,78: 93-117.

  PUB
   
• [20]
  

  2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378040

  Baake, E. (2001): Mutation and recombination with tight linkage JOURNAL OF MATHEMATICAL BIOLOGY,42: 455-488.

  PUB
   
• [19]
  

  1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378046

  Baake, E.; von Haeseler, A. (1999): Distance measures in terms of substitution processes THEORETICAL POPULATION BIOLOGY,55: 166-175.

  PUB
   
• [18]
  

  1999 | Sammelwerksbeitrag | PUB-ID: 1927777

  Gabriel, W.; Baake, E. (1999): Biological evolution through mutation, selection, and drift: An introductory review. In: in: Ann. Rev. Comp. Phys. VII (D. Stauffer, ed.), pp. 203-264 (World Scientific, Singapore, 2000).

  PUB | arXiv
   
• [17]
  

  1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378116

  Baake, E. (1998): What can and what cannot be inferred from pairwise sequence comparisons? MATHEMATICAL BIOSCIENCES,154: 1-21.

  PUB
   
• [16]
  

  1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378123

  Wagner, H.; Baake, E.; Gerisch, T. (1998): Ising quantum chain and sequence evolution JOURNAL OF STATISTICAL PHYSICS,92:(5/6): 1017-1052.

  PUB
   
• [15]
  

  1998 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378127

  Baake, E.; Baake, M.; Wagner, H. (1998): Quantum mechanics versus classical probabilities in biological evolution PHYSICAL REVIEW E,57:(1): 1191-1192.

  PUB
   
• [14]
  

  1997 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378442

  Wagner, H.; Baake, E. (1997): Ising quantum chain and biological evolution. In: H.-D. Doebner; P. Nattermann; W. Scherer (Hrsg.): Physical Applications and Mathematical Aspects of Geometry, Groups and Algebras. Singapore: World Scientific. (II). S. 821-825.

  PUB
   
• [13]
  

  1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378376

  Baake, E.; Baake, M.; Wagner, H. (1997): Ising quantum chain is equivalent to a model of biological evolution PHYSICAL REVIEW LETTERS,78: 559-562.

  PUB
   
• [12]
  

  1997 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378438

  Baake, E. (1997): Diploid sequence space, dominance, and evolution. In: O. Arino; D. Axelrod; M. Kimmel (Hrsg.): Advances in Mathematical Population Dynamics - Molecules, Cells and Man. Singapore: World Scientific. S. 1-15.

  PUB
   
• [11]
  

  1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378139

  Baake, E.; Wiehe, T. (1997): Bifurcations in haploid and diploid sequence space models JOURNAL OF MATHEMATICAL BIOLOGY,35:(3): 321-343.

  PUB
   
• [10]
  

  1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378431

  Baake, E. (1995): Diploid models on sequence space JOURNAL OF BIOLOGICAL SYSTEMS,3: 343-349.

  PUB
   
• [9]
  

  1995 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378422

  Wiehe, T.; Baake, E.; Schuster, P. (1995): Error propagation in reproduction of diploid organisms. A case study on single peaked landscapes JOURNAL OF THEORETICAL BIOLOGY,177: 1-15.

  PUB
   
• [8]
  

  1993 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1775603

  Baake, M.; Baake, E.; Eich, E. (1993): On the role of invariants for the parameter estimation problem in Hamiltonian systems Physics letters,180:(1-2): 74-82.

  PUB | PDF | DOI | WoS
   
• [7]
  

  1992 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1775599

  Baake, E.; Baake, M.; Bock, H. G.; Briggs, K. M. (1992): Fitting ordinary differential equations to chaotic data Physical Review A,45:(8): 5524-5529.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [6]
  

  1992 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1775596

  Baake, E.; Schlöder, J. P. (1992): Modelling the fast fluorescence rise of photosynthesis Bulletin of mathematical biology,54:(6): 999-1021.

  PUB | PDF | DOI | WoS
   
• [5]
  

  1990 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378459

  Baake, E.; Strasser, R. J. (1990): A differential equation model for the description of the fast fluorescence rise (O-I-D-P-transient) in leaves. In: M. Baltscheffsky (Hrsg.): Current Research in Photosynthesis. Dordrecht: Kluwer. S. 443-449.

  PUB
   
• [4]
  

  1990 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1775593

  Pfündel, E.; Baake, E. (1990): A quantitative description of fluorescence excitation spectra in intact bean leaves greened under intermittent light Photosynthesis Research,26:(1): 19-28.

  PUB | PDF | DOI
   
• [3]
  

  1989 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378482

  Baake, E.; Strasser, R. J. (1989): A differential equation model for the description of the fast fluorescence rise (O-I-D-P-transient) in leaves PHYSIOLOGIA PLANTARUM,76

  PUB
   
• [2]
  

  1987 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785358

  Buff, E.; Baake, M.; Sievers, A. (1987): An Empirical Function for the Description of Root Growth Plant Physiology,83:(3): 685-690.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [1]
  

  1986 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785355

  Baake, M.; Buff, E. (1986): From cell growth to root growth Journal of Theoretical Biology,123:(3): 347-365.

  PUB | PDF | DOI | WoS