Burkhard Linke
PEVZ-ID
33 Publikationen
-
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2730423Apparent vector-mediated parent-to-offspring transmission in an avian malaria-like parasitePUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Chakarov N, Linke B, Boerner M, Goesmann A, Krüger O, Hoffman J (2015)
Molecular Ecology 24(6): 1355-1363. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2615581Chinese hamster genome sequenced from sorted chromosomesPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Brinkrolf K, Rupp O, Laux H, Kollin F, Ernst W, Linke B, Kofler R, Romand S, Hesse F, Budach WE, Galosy S, et al. (2013)
Nature Biotechnology 31(8): 694-695. -
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490535Insights into the completely annotated genome of Lactobacillus buchneri CD034, a strain isolated from stable grass silagePUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Heinl S, Wibberg D, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Blom J, Linke B, Goesmann A, Grabherr R, Schwab H, Pühler A, Schlüter A (2012)
Journal of Biotechnology 161(2): 153-166. -
-
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526281Complete Genome Sequence of the Porcine Isolate Enterococcus faecalis D32PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Zischka M, Kuenne C, Blom J, Dabrowski PW, Linke B, Hain T, Nitsche A, Goesmann A, Larsen J, Jensen LB, Witte W, et al. (2012)
Journal of Bacteriology 194(19): 5490-5491. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast DataPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Schneider J, Blom J, Jaenicke S, Linke B, Brinkrolf K, Neuweger H, Tauch A, Goesmann A (2011)
Journal of Biotechnology 155(1): 118-126. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290032Virulence Evolution of the Human Pathogen Neisseria meningitidis by Recombination in the Core and Accessory GenomePUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Joseph B, Schwarz RF, Linke B, Blom J, Becker A, Claus H, Goesmann A, Frosch M, Mueller T, Vogel U, Schoen C (2011)
PLoS ONE 6(4): e18441. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Im Druck | PUB-ID: 2017892The complete genome sequence of the dominant Sinorhizobium meliloti field isolate SM11 extends the S. meliloti pan-genomePUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Schneiker-Bekel S, Wibberg D, Bekel T, Blom J, Linke B, Neuweger H, Stiens M, Vorhölter F-J, Weidner S, Goesmann A, Pühler A, et al. (In Press)
Journal of Biotechnology 155(1): 20-33. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093578Conveyor: a workflow engine for bioinformatic analysesPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Linke B, Giegerich R, Goesmann A (2011)
Bioinformatics 27(7): 903-911. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275
Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortionPUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Trost E, Götker S, Schneider J, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Arnold W, Bekel T, Blom J, Gartemann K-H, et al. (2010)
BMC Genomics 11(1): 91. -
2010 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894907Practical Guide: Genomic Techniques and How to Apply Them to Marine QuestionsPUB | DOI
Mittard-Runte V, Bekel T, Blom J, Dondrup M, Henckel K, Jaenicke S, Krause L, Linke B, Neuweger H, Schneiker-Bekel S, Goesmann A (2010)
In: Introduction to Marine Genomics (Advances in Marine Genomics). Cock JM, Tessmar-Raible K, Boyen C, Viard F (Eds); , 1. Netherlands: Springer Netherlands: 315-396. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1930110Comparative Genome Biology of a Serogroup B Carriage and Disease Strain Supports a Polygenic Nature of Meningococcal VirulencePUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Joseph B, Schneiker-Bekel S, Schramm-Glueck A, Blom J, Claus H, Linke B, Schwarz RF, Becker A, Goesmann A, Frosch M, Schoen C (2010)
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 192(20): 5363-5377. -
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray dataPUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Dondrup M, Albaum S, Griebel T, Henckel K, Jünemann S, Kahlke T, Kleindt CK, Kuester H, Linke B, Mertens D, Mittard-Runte V, et al. (2009)
BMC Bioinformatics 10(1): 50. -
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634467A portal for rhizobial genomes: RhizoGATE integrates a Sinorhizobium meliloti genome annotation update with postgenome dataPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Becker A, Barnett MJ, Capela D, Dondrup M, Kamp P-B, Krol E, Linke B, Rüberg S, Runte K, Schroeder BK, Weidner S, et al. (2009)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 140(1-2): 45-50. -
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783292
The missing link: Bordetella petrii is endowed with both the metabolic versatility of environmental bacteria and virulence traits of pathogenic BordetellaePUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Gross R, Guzman CA, Sebaihia M, Martins dos Santos VAP, Pieper DH, Koebnik R, Lechner M, Bartels D, Buhrmester J, Choudhuri JV, Ebensen T, et al. (2008)
BMC Genomics 9(1): 449. -
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592024The genome of Xanthomonas campestris pv. campestris B 100 and its use for the reconstruction of metabolic pathways involved in xanthan biosynthesisPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Vorhölter F-J, Schneiker-Bekel S, Goesmann A, Krause L, Bekel T, Kaiser O, Linke B, Patschkowski T, Rückert C, Schmid J, Sidhu VK, et al. (2008)
Journal of Biotechnology 134(1-2): 33-45. -
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592257Whole-genome comparison of disease and carriage strains provides insights into virulence evolution in Neisseria meningitidisPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
Schoen C, Blom J, Claus H, Schramm-Glueck A, Brandt P, Mueller T, Goesmann A, Joseph B, Konietzny S, Kurzai O, Schmitt C, et al. (2008)
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 105(9): 3473-3478. -
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631327Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosumPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Schneiker-Bekel S, Perlova O, Kaiser O, Gerth K, Alici A, Altmeyer MO, Bartels D, Bekel T, Beyer S, Bode E, Bode HB, et al. (2007)
Nature Biotechnology 25(11): 1281-1289. -
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631047Genomic sequence of chorioallantois vaccinia virus Ankara, the ancestor of modified vaccinia virus AnkaraPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Meisinger-Henschel C, Schmidt M, Lukassen S, Linke B, Krause L, Konietzny S, Goesmann A, Howley P, Chaplin P, Suter M, Hausmann J (2007)
JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY 88(12): 3249-3259. -
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632609A prototype taxonomic microarray targeting the rpsA housekeeping gene permits species identification within the rhizobial genus EnsiferPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Martens M, Weidner S, Linke B, de Vos P, Gillis M, Willems A (2007)
SYSTEMATIC AND APPLIED MICROBIOLOGY 30(5): 390-400. -
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596976Complete genome of the mutualistic, N-2-fixing grass endophyte Azoarcus sp strain BH72PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Krause A, Ramakumar A, Bartels D, Battistoni F, Bekel T, Boch J, Boehm M, Friedrich F, Hurek T, Krause L, Linke B, et al. (2006)
Nature Biotechnology 24(11): 1385-1391. -
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598182Genome sequence of the ubiquitous hydrocarbon-degrading marine bacterium Alcanivorax borkumensisPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Schneiker-Bekel S, dos Santos VAPM, Bartels D, Bekel T, Brecht M, Buhrmester J, Chernikova TN, Denaro R, Ferrer M, Gertler C, Goesmann A, et al. (2006)
Nature Biotechnology 24(8): 997-1004. -
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2382786The REGANOR gene prediction server for prokaryotic genomes and a database of high quality gene predictions for prokaryotesPUB | DOI
Linke B, McHardy AC, Neuweger H, Krause L, Meyer F (2006)
Applied Bioinformatics 5(3): 193-198. -
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773652
The subsystems approach to genome annotation and its use in the Project to Annotate 1000 GenomesPUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Overbeek R, Begley T, Butler RM, Choudhuri JV, Chuang H-Y, Cohoon M, Crécy-Lagard V de, Diaz NN, Disz T, Edwards R, Fonstein M, et al. (2005)
Nucleic Acids Research 33(17): 5691-5702. -
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773644
BRIGEP - the BRIDGE-based genome-transcriptome-proteome browserPUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Goesmann A, Linke B, Bartels D, Dondrup M, Krause L, Neuweger H, Oehm S, Paczian T, Wilke A, Meyer F (2005)
Nucleic Acids Research 33(Web Server): W710-W716. -
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1605656Antibiotic multiresistance plasmid pRSB101 isolated from a wastewater treatment plant is related to plasmids residing in phytopathogenic bacteria and carries eight different resistance determinants including a multidrug transport systemPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
Szczepanowski R, Krahn I, Linke B, Goesmann A, Pühler A, Schlüter A (2004)
Microbiology 150(11): 3613-3630. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609260EMMA: a platform for consistent storage and efficient analysis of microarray dataPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Dondrup M, Goesmann A, Bartels D, Kalinowski J, Krause L, Linke B, Rupp O, Sczyrba A, Pühler A, Meyer F (2003)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 106(2-3): 135-146. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609286Building a BRIDGE for the integration of heterogeneous data from functional genomics into a platform for systems biologyPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Goesmann A, Linke B, Rupp O, Krause L, Bartels D, Dondrup M, McHardy AC, Wilke A, Pühler A, Meyer F (2003)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 106(2-3): 157-167. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610023Complete genome sequence and analysis of Wolinella succinogenesPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
Baar C, Eppinger M, Raddatz G, Simon J, Lanz C, Klimmek O, Nandakumar R, Gross R, Rosinus A, Keller H, Jagtap P, et al. (2003)
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 100(20): 11690-11695. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609328Construction and validation of a Sinorhizobium meliloti whole genome DNA microarray: genome-wide profiling of osmoadaptive gene expressionPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Rüberg S, Tian ZX, Krol E, Linke B, Meyer F, Wang YP, Pühler A, Weidner S, Becker A (2003)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 106(2-3): 255-268. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773880
GenDB - an open source genome annotation system for prokaryote genomesPUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Meyer F, Goesmann A, McHardy AC, Bartels D, Bekel T, Clausen J, Kalinowski J, Linke B, Rupp O, Giegerich R, Pühler A (2003)
Nucleic Acids Research 31(8): 2187-2195. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612236Transcriptional changes in response to arbuscular mycorrhiza development in the model plant Medicago truncatulaPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
Wulf A, Manthey K, Doll J, Perlick AM, Linke B, Bekel T, Meyer F, Franken P, Küster H, Krajinski F (2003)
Mol Plant Microbe Interact 16(4): 306-314. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1895035The complete Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 genome sequence and its impact on the production of L-aspartate-derived amino acids and vitaminsPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
Kalinowski J, Bathe B, Bartels D, Bischoff N, Bott M, Burkovski A, Dusch N, Eggeling L, Eikmanns BJ, Gaigalat L, Goesmann A, et al. (2003)
Journal of Biotechnology 104(1-3): 5-25.