Burkhard Linke
PEVZ-ID
33 Publikationen
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2730423Chakarov N, Linke B, Boerner M, Goesmann A, Krüger O, Hoffman J (2015)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Apparent vector-mediated parent-to-offspring transmission in an avian malaria-like parasite.
Molecular Ecology 24(6): 1355-1363. -
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2615581Brinkrolf K, Rupp O, Laux H, Kollin F, Ernst W, Linke B, Kofler R, Romand S, Hesse F, Budach WE, Galosy S, Müller D, Noll T, Wienberg J, Jostock T, Leonard M, Grillari J, Tauch A, Goesmann A, Helk B, Mott JE, Pühler A, Borth N (2013)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Chinese hamster genome sequenced from sorted chromosomes.
Nature Biotechnology 31(8): 694-695. -
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490535Heinl S, Wibberg D, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Blom J, Linke B, Goesmann A, Grabherr R, Schwab H, Pühler A, Schlüter A (2012)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Insights into the completely annotated genome of Lactobacillus buchneri CD034, a strain isolated from stable grass silage.
Journal of Biotechnology 161(2): 153-166. -
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526281Zischka M, Kuenne C, Blom J, Dabrowski PW, Linke B, Hain T, Nitsche A, Goesmann A, Larsen J, Jensen LB, Witte W, Werner G (2012)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Complete Genome Sequence of the Porcine Isolate Enterococcus faecalis D32.
Journal of Bacteriology 194(19): 5490-5491. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326445Schneider J, Blom J, Jaenicke S, Linke B, Brinkrolf K, Neuweger H, Tauch A, Goesmann A (2011)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
RAPYD - Rapid Annotation Platform for Yeast Data.
Journal of Biotechnology 155(1): 118-126. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290032Joseph B, Schwarz RF, Linke B, Blom J, Becker A, Claus H, Goesmann A, Frosch M, Mueller T, Vogel U, Schoen C (2011)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Virulence Evolution of the Human Pathogen Neisseria meningitidis by Recombination in the Core and Accessory Genome.
PLoS ONE 6(4): e18441. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Im Druck | PUB-ID: 2017892Schneiker-Bekel S, Wibberg D, Bekel T, Blom J, Linke B, Neuweger H, Stiens M, Vorhölter F-J, Weidner S, Goesmann A, Pühler A, Schlüter A (In Press)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
The complete genome sequence of the dominant Sinorhizobium meliloti field isolate SM11 extends the S. meliloti pan-genome.
Journal of Biotechnology 155(1): 20-33. -
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093578Linke B, Giegerich R, Goesmann A (2011)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Conveyor: a workflow engine for bioinformatic analyses.
Bioinformatics 27(7): 903-911. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275Trost E, Götker S, Schneider J, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Arnold W, Bekel T, Blom J, Gartemann K-H, Linke B, Goesmann A, Pühler A, Shukla SK, Tauch A (2010)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion.
BMC Genomics 11(1): 91. -
2010 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894907Mittard-Runte V, Bekel T, Blom J, Dondrup M, Henckel K, Jaenicke S, Krause L, Linke B, Neuweger H, Schneiker-Bekel S, Goesmann A (2010)PUB | DOI
Practical Guide: Genomic Techniques and How to Apply Them to Marine Questions.
In: Introduction to Marine Genomics (Advances in Marine Genomics). Cock JM, Tessmar-Raible K, Boyen C, Viard F (Eds);1. Netherlands: Springer Netherlands: 315-396. -
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1930110Joseph B, Schneiker-Bekel S, Schramm-Glueck A, Blom J, Claus H, Linke B, Schwarz RF, Becker A, Goesmann A, Frosch M, Schoen C (2010)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Comparative Genome Biology of a Serogroup B Carriage and Disease Strain Supports a Polygenic Nature of Meningococcal Virulence.
JOURNAL OF BACTERIOLOGY 192(20): 5363-5377. -
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634467Becker A, Barnett MJ, Capela D, Dondrup M, Kamp P-B, Krol E, Linke B, Rüberg S, Runte K, Schroeder BK, Weidner S, Yurgel SN, Batut J, Long SR, Pühler A, Goesmann A (2009)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
A portal for rhizobial genomes: RhizoGATE integrates a Sinorhizobium meliloti genome annotation update with postgenome data.
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 140(1-2): 45-50. -
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321Dondrup M, Albaum S, Griebel T, Henckel K, Jünemann S, Kahlke T, Kleindt CK, Kuester H, Linke B, Mertens D, Mittard-Runte V, Neuweger H, Runte KJ, Tauch A, Tille F, Pühler A, Goesmann A (2009)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data.
BMC Bioinformatics 10(1): 50. -
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783292Gross R, Guzman CA, Sebaihia M, Martins dos Santos VAP, Pieper DH, Koebnik R, Lechner M, Bartels D, Buhrmester J, Choudhuri JV, Ebensen T, Gaigalat L, Herrmann S, Khachane AN, Larisch C, Link S, Linke B, Meyer F, Mormann S, Nakunst D, Rückert C, Schneiker-Bekel S, Schulze K, Vorhölter F-J, Yevsa T, Engle JT, Goldman WE, Pühler A, Göbel UB, Goesmann A, Blöcker H, Kaiser O, Martinez-Arias R (2008)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
The missing link: Bordetella petrii is endowed with both the metabolic versatility of environmental bacteria and virulence traits of pathogenic Bordetellae.
BMC Genomics 9(1): 449. -
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592024Vorhölter F-J, Schneiker-Bekel S, Goesmann A, Krause L, Bekel T, Kaiser O, Linke B, Patschkowski T, Rückert C, Schmid J, Sidhu VK, Sieber V, Tauch A, Watt SA, Weisshaar B, Becker A, Niehaus K, Pühler A (2008)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
The genome of Xanthomonas campestris pv. campestris B 100 and its use for the reconstruction of metabolic pathways involved in xanthan biosynthesis.
Journal of Biotechnology 134(1-2): 33-45. -
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592257Schoen C, Blom J, Claus H, Schramm-Glueck A, Brandt P, Mueller T, Goesmann A, Joseph B, Konietzny S, Kurzai O, Schmitt C, Friedrich T, Linke B, Vogel U, Frosch M (2008)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
Whole-genome comparison of disease and carriage strains provides insights into virulence evolution in Neisseria meningitidis.
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 105(9): 3473-3478. -
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631327Schneiker-Bekel S, Perlova O, Kaiser O, Gerth K, Alici A, Altmeyer MO, Bartels D, Bekel T, Beyer S, Bode E, Bode HB, Bolten CJ, Choudhuri JV, Doss S, Elnakady YA, Frank B, Gaigalat L, Goesmann A, Groeger C, Gross F, Jelsbak L, Jelsbak L, Kalinowski J, Kegler C, Knauber T, Konietzny S, Kopp M, Krause L, Krug D, Linke B, Mahmud T, Martinez-Arias R, McHardy AC, Merai M, Meyer F, Mormann S, Munoz-Dorado J, Perez J, Pradella S, Rachid S, Raddatz G, Rosenau F, Rückert C, Sasse F, Scharfe M, Schuster SC, Suen G, Treuner-Lange A, Velicer GJ, Vorhölter F-J, Weissman KJ, Welch RD, Wenzel SC, Whitworth DE, Wilhelm S, Wittmann C, Bloecker H, Pühler A, Mueller R (2007)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Complete genome sequence of the myxobacterium Sorangium cellulosum.
Nature Biotechnology 25(11): 1281-1289. -
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631047Meisinger-Henschel C, Schmidt M, Lukassen S, Linke B, Krause L, Konietzny S, Goesmann A, Howley P, Chaplin P, Suter M, Hausmann J (2007)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Genomic sequence of chorioallantois vaccinia virus Ankara, the ancestor of modified vaccinia virus Ankara.
JOURNAL OF GENERAL VIROLOGY 88(12): 3249-3259. -
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632609Martens M, Weidner S, Linke B, de Vos P, Gillis M, Willems A (2007)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
A prototype taxonomic microarray targeting the rpsA housekeeping gene permits species identification within the rhizobial genus Ensifer.
SYSTEMATIC AND APPLIED MICROBIOLOGY 30(5): 390-400. -
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596976Krause A, Ramakumar A, Bartels D, Battistoni F, Bekel T, Boch J, Boehm M, Friedrich F, Hurek T, Krause L, Linke B, McHardy AC, Sarkar A, Schneiker-Bekel S, Syed AA, Thauer R, Vorhölter F-J, Weidner S, Pühler A, Reinhold-Hurek B, Kaiser O, Goesmann A (2006)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Complete genome of the mutualistic, N-2-fixing grass endophyte Azoarcus sp strain BH72.
Nature Biotechnology 24(11): 1385-1391. -
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598182Schneiker-Bekel S, dos Santos VAPM, Bartels D, Bekel T, Brecht M, Buhrmester J, Chernikova TN, Denaro R, Ferrer M, Gertler C, Goesmann A, Golyshina OV, Kaminski F, Khachane AN, Lang S, Linke B, McHardy AC, Meyer F, Nechitaylo T, Pühler A, Regenhardt D, Rupp O, Sabirova JS, Selbitschka W, Yakimov MM, Timmis KN, Vorhölter F-J, Weidner S, Kaiser O, Golyshin PN (2006)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Genome sequence of the ubiquitous hydrocarbon-degrading marine bacterium Alcanivorax borkumensis.
Nature Biotechnology 24(8): 997-1004. -
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773652Overbeek R, Begley T, Butler RM, Choudhuri JV, Chuang H-Y, Cohoon M, Crécy-Lagard V de, Diaz NN, Disz T, Edwards R, Fonstein M, Frank ED, Gerdes S, Glass EM, Goesmann A, Hanson A, Iwata-Reuyl D, Jensen R, Jamshidi N, Krause L, Kubal M, Larsen N, Linke B, McHardy AC, Meyer F, Neuweger H, Olsen G, Olson R, Osterman A, Portnoy V, Pusch GD, Rodionov DA, Rückert C, Steiner J, Stevens R, Thiele I, Vassieva O, Ye Y, Zagnitko O, Vonstein V (2005)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
The subsystems approach to genome annotation and its use in the Project to Annotate 1000 Genomes.
Nucleic Acids Research 33(17): 5691-5702. -
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773644Goesmann A, Linke B, Bartels D, Dondrup M, Krause L, Neuweger H, Oehm S, Paczian T, Wilke A, Meyer F (2005)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
BRIGEP - the BRIDGE-based genome-transcriptome-proteome browser.
Nucleic Acids Research 33(Web Server): W710-W716. -
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1605656Szczepanowski R, Krahn I, Linke B, Goesmann A, Pühler A, Schlüter A (2004)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
Antibiotic multiresistance plasmid pRSB101 isolated from a wastewater treatment plant is related to plasmids residing in phytopathogenic bacteria and carries eight different resistance determinants including a multidrug transport system.
Microbiology 150(11): 3613-3630. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609260Dondrup M, Goesmann A, Bartels D, Kalinowski J, Krause L, Linke B, Rupp O, Sczyrba A, Pühler A, Meyer F (2003)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
EMMA: a platform for consistent storage and efficient analysis of microarray data.
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 106(2-3): 135-146. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609286Goesmann A, Linke B, Rupp O, Krause L, Bartels D, Dondrup M, McHardy AC, Wilke A, Pühler A, Meyer F (2003)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Building a BRIDGE for the integration of heterogeneous data from functional genomics into a platform for systems biology.
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 106(2-3): 157-167. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610023Baar C, Eppinger M, Raddatz G, Simon J, Lanz C, Klimmek O, Nandakumar R, Gross R, Rosinus A, Keller H, Jagtap P, Linke B, Meyer F, Lederer H, Schuster SC (2003)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
Complete genome sequence and analysis of Wolinella succinogenes.
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 100(20): 11690-11695. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609328Rüberg S, Tian ZX, Krol E, Linke B, Meyer F, Wang YP, Pühler A, Weidner S, Becker A (2003)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Construction and validation of a Sinorhizobium meliloti whole genome DNA microarray: genome-wide profiling of osmoadaptive gene expression.
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 106(2-3): 255-268. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773880Meyer F, Goesmann A, McHardy AC, Bartels D, Bekel T, Clausen J, Kalinowski J, Linke B, Rupp O, Giegerich R, Pühler A (2003)PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
GenDB - an open source genome annotation system for prokaryote genomes.
Nucleic Acids Research 31(8): 2187-2195. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612236Wulf A, Manthey K, Doll J, Perlick AM, Linke B, Bekel T, Meyer F, Franken P, Küster H, Krajinski F (2003)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
Transcriptional changes in response to arbuscular mycorrhiza development in the model plant Medicago truncatula.
Mol Plant Microbe Interact 16(4): 306-314. -
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1895035Kalinowski J, Bathe B, Bartels D, Bischoff N, Bott M, Burkovski A, Dusch N, Eggeling L, Eikmanns BJ, Gaigalat L, Goesmann A, Hartmann M, Huthmacher K, Kramer R, Linke B, McHardy AC, Meyer F, Mockel B, Pfefferle W, Pühler A, Rey DA, Rückert C, Rupp O, Sahm H, Wendisch VF, Wiegrabe I, Tauch A (2003)PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
The complete Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 genome sequence and its impact on the production of L-aspartate-derived amino acids and vitamins.
Journal of Biotechnology 104(1-3): 5-25.