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[48]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2664976
Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Actinoplanes friuliensis HAG 010964, producer of the lipopeptide antibiotic friulimycin
Rückert C, Szczepanowski R, Albersmeier A, Goesmann A, Fischer N, Steinkämper A, Pühler A, Biener R, Schwartz D, Kalinowski J (2014)
Journal of biotechnology 178: 41-42.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[47]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2632946
Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain VLB120 a solvent tolerant, styrene degrading bacterium, isolated from forest soil
Köhler KAK, Rückert C, Schatschneider S, Vorhölter F-J, Szczepanowski R, Blank LM, Niehaus K, Goesmann A, Pühler A, Kalinowski J, Schmid A (2013)
Journal of Biotechnology 168(4): 729-730.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[46]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548286
Draft whole genome sequence of the cyanide-degrading bacterium Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344
Luque-Almagro VM, Acera F, Igeño MI, Wibberg D, Roldán MD, Sáez LP, Hennig M, Quesada A, Huertas MJ, Blom J, Merchán F, et al. (2013)
Environmental Microbiology 15(1): 253-270.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[45]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2648007
Genome sequence of the squalene-degrading bacterium Corynebacterium terpenotabidum type strain Y-11T (= DSM 44721T)
Rückert C, Albersmeier A, Al-Dilaimi A, Bednarz H, Niehaus K, Szczepanowski R, Kalinowski J (2013)
Standards in Genomic Sciences 9(3): 505-513.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[44]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (*Brassica napus* L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing
Bolzan de Campos S, Youn J-W, Farina R, Jaenicke S, Jünemann S, Szczepanowski R, Beneduzi A, Vargas LK, Wendisch VF, Passaglia L (2013)
Microbial Ecology 65(3): 593-601.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[43]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551038
Genome sequence of the halotolerant bacterium Corynebacterium halotolerans type strain YIM 70093T (= DSM 44683T)
Rückert C, Albersmeier A, Al-Dilaimi A, Niehaus K, Szczepanowski R, Kalinowski J (2012)
Standards in Genomic Sciences 7(2): 284-293.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[42]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing
Zakrzewski M, Goesmann A, Jaenicke S, Jünemann S, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Al-Soud WA, Sørensen S, Pühler A, Schlüter A (2012)
Journal of Biotechnology 158(4): 248-258.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[41]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530221
The genome sequence of the bacterium Streptomyces davawensis JCM 4913 and heterologous production of the unique antibiotic roseoflavin
Jankowitsch F, Schwarz J, Rückert C, Gust B, Szczepanowski R, Blom J, Pelzer S, Kalinowski J, Mack M (2012)
Journal of bacteriology 194(24): 6818-6827.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[40]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2472279
The complete genome sequences of four new IncN plasmids from wastewater treatment plant effluent provide new insights into IncN plasmid diversity and evolution
Eikmeyer FG, Hadiati A, Szczepanowski R, Wibberg D, Schneiker-Bekel S, Rogers LM, Brown CB, Top EM, Pühler A, Schlüter A (2012)
Plasmid 68(1): 13-24.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
[39]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490535
Insights into the completely annotated genome of Lactobacillus buchneri CD034, a strain isolated from stable grass silage
Heinl S, Wibberg D, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Blom J, Linke B, Goesmann A, Grabherr R, Schwab H, Pühler A, Schlüter A (2012)
Journal of Biotechnology 161(2): 153-166.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[38]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2471681
Characterization of microbial biofilms in a thermophilic biogas system by high-throughput metagenome sequencing
Rademacher A, Zakrzewski M, Schlüter A, Schonberg M, Szczepanowski R, Goesmann A, Pühler A, Klocke M (2012)
FEMS Microbiology Ecology 79(3): 785-799.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[37]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486060
The complete genome sequence of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110
Schwientek P, Szczepanowski R, Rückert C, Kalinowski J, Klein A, Selber K, Wehmeier UF, Stoye J, Pühler A (2012)
BMC Genomics 13(1): 112.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[36]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474305
Carbapenem-Hydrolyzing GES-5-Encoding Gene on Different Plasmid Types Recovered from a Bacterial Community in a Sewage Treatment Plant
Girlich D, Poirel L, Szczepanowski R, Schlüter A, Nordmann P (2012)
Applied and Environmental Microbiology 78(4): 1292-1295.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[35]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2544774
Draft Genome Sequence of Wickerhamomyces ciferrii NRRL Y-1031 F-60-10
Schneider J, Andrea H, Blom J, Jaenicke S, Rückert C, Schorsch C, Szczepanowski R, Farwick M, Goesmann A, Pühler A, Schaffer S, et al. (2012)
Eukaryotic Cell 11(12): 1582-1583.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[34]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526269
Complete genome sequence of Saccharothrix espanaensis DSM 44229T and comparison to the other completely sequenced Pseudonocardiaceae
Strobel T, Al-Dilaimi A, Blom J, Gessner A, Kalinowski J, Luzhetska M, Pühler A, Szczepanowski R, Bechthold A, Rückert C (2012)
BMC Genomics 13(1): 465.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[33]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526298
Complete Genome Sequence of the Hydrogenotrophic, Methanogenic Archaeon Methanoculleus bourgensis Strain MS2T, Isolated from a Sewage Sludge Digester
Maus I, Wibberg D, Stantscheff R, Eikmeyer FG, Seffner A, Boelter J, Szczepanowski R, Blom J, Jaenicke S, König H, Pühler A, et al. (2012)
Journal of Bacteriology 194(19): 5487-5488.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[32]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230
Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing
Jünemann S, Prior K, Szczepanowski R, Harks I, Ehmke B, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2012)
PLoS ONE 7(8): e41606.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[31]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490286
Ion Torrent PGM sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information
Vogel U, Szczepanowski R, Claus H, Jünemann S, Prior K, Harmsen D (2012)
Journal of clinical microbiology 50(6): 1889-1894.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[30]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354746
Sequencing of high G + C microbial genomes using the ultrafast pyrosequencing technology
Schwientek P, Szczepanowski R, Rückert C, Stoye J, Pühler A (2011)
Journal of Biotechnology 155(1): 68-77.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[29]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354731
Complete genome sequencing of Agrobacterium sp. H13-3, the former Rhizobium lupini H13-3, reveals a tripartite genome consisting of a circular and a linear chromosome and an accessory plasmid but lacking a tumor-inducing Ti-plasmid
Wibberg D, Blom J, Jaenicke S, Kollin F, Rupp O, Scharf B, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Goesmann A, Setubal JC, Schmitt R, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 155(1): 50-62.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[28]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371
High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435
Küberl A, Schneider J, Thallinger GG, Anderl I, Wibberg D, Hajek T, Jaenicke S, Brinkrolf K, Goesmann A, Szczepanowski R, Pühler A, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 154(4): 312-320.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[27]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326465
First genomic analysis of the broad-host-range Rhizobium sp LPU83 strain, a member of the low-genetic diversity Oregon-like Rhizobium sp group
Torres Tejerizo G, Florencia Del Papa M, Draghi W, Lozano M, de los Angeles Giusti M, Martini C, Eugenia Salas M, Salto I, Wibberg D, Szczepanowski R, Weidner S, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 155(1): 3-10.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[26]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576
Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing
Becker J, Hackel M, Jakobi T, Rupp O, Schneider J, Szczepanowski R, Bekel T, Borth N, Goesmann A, Grillari J, Kaltschmidt C, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 156(3): 227-235.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[25]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326518
Sequencing and comparative analysis of IncP-1 alpha antibiotic resistance plasmids reveal a highly conserved backbone and differences within accessory regions
Szczepanowski R, Eikmeyer FG, Harfmann J, Blom J, Rogers LM, Top EM, Schlüter A (2011)
Journal of Biotechnology 155(1): 95-103.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[24]
2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768
Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome
Becker J, Timmermann C, Jakobi T, Rupp O, Szczepanowski R, Hackl M, Goesmann A, Tauch A, Borth N, Grillari J, Pühler A, et al. (2011)
BMC Proceedings 5(Suppl. 8): P6.
PUB | DOI
 
[23]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955
Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering
Hackl M, Jakobi T, Blom J, Doppmeier D, Brinkrolf K, Szczepanowski R, Bernhart SH, Höner zu Siederdissen C, Bort JAH, Wieser M, Kunert R, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 153(1-2): 62-75.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[22]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486400
Advanced Genomics and Transcriptomics of Industrial Microorganisms
Kalinowski J, Rückert C, Szczepanowski R, Pühler A (2010)
Chemie Ingenieur Technik 82(9): 1518-1519.
PUB | DOI
 
[21]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275
Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion
Trost E, Götker S, Schneider J, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Arnold W, Bekel T, Blom J, Gartemann K-H, et al. (2010)
BMC Genomics 11(1): 91.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[20]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591546
Detection of 140 clinically relevant antibiotic-resistance genes in the plasmid metagenome of wastewater treatment plant bacteria showing reduced susceptibility to selected antibiotics
Szczepanowski R, Linke B, Krahn I, Gartemann K-H, Guetzkow T, Eichler W, Pühler A, Schlueter A (2009)
MICROBIOLOGY 155(7): 2306-2319.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585980
Genetic diversity and composition of a plasmid metagenome from a wastewater treatment plant
Schlueter A, Krause L, Szczepanowski R, Goesmann A, Pühler A (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 65-76.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585969
Insight into the plasmid metagenome of wastewater treatment plant bacteria showing reduced susceptibility to antimicrobial drugs analysed by the 454-pyrosequencing technology
Szczepanowski R, Bekel T, Goesmann A, Krause L, Kroemeke H, Kaiser O, Eichler W, Pühler A, Schlueter A (2008)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 136(1-2): 54-64.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586009
Taxonomic composition and gene content of a methane-producing microbial community isolated from a biogas reactor
Krause L, Diaz NN, Edwards RA, Gartemann K-H, Krömeke H, Neuweger H, Pühler A, Runte KJ, Schlüter A, Stoye J, Szczepanowski R, et al. (2008)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 136(1-2): 91-101.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585987
The metagenome of a biogas-producing microbial community of a production-scale biogas plant fermenter analysed by the 454-pyrosequencing technology
Schlüter A, Bekel T, Diaz NN, Dondrup M, Eichenlaub R, Gartemann K-H, Krahn I, Krause L, Kroemeke H, Kruse O, Mussgnug JH, et al. (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 77-90.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939
Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids
Tauch A, Schneider J, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Gartemann K-H, Arnold W, Blom J, Brinkrolf K, Brune I, Goetker S, et al. (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 22-30.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595908
Novel macrolide resistance module carried by the IncP-1 beta resistance plasmid pRSB111, isolated from a wastewater treatment plant
Szczepanowski R, Krahn I, Bohn N, Pühler A, Schlueter A (2007)
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY 51(2): 673-678.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593538 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595014 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946125
IncP-1-beta plasmid pGNB1 isolated from a bacterial community from a wastewater treatment plant mediates decolorization of triphenylmethane dyes
Schlüter A, Krahn I, Kollin F, Bonemann G, Stiens M, Szczepanowski R, Schneiker-Bekel S, Pühler A (2007)
Appl Environ Microbiol 73(20): 6345-6350.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
[10]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604328 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1864013
Genomics of resistance plasmids isolated from wastewater treatment plants
Tennstedt T, Heuer H, Top EM, Szczepanowski R, Pühler A, Schlüter A (2005)
Plasmid 53(1): 40-41.
PUB
 
[8]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602311 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603956 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
 
[5]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1605656 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
[4]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1605648
The complete sequences of plasmids pB2 and pB3 provide evidence for a recent ancestor of the IncP-1 beta group without any accessory genes
Heuer H, Szczepanowski R, Schneiker-Bekel S, Pühler A, Top EM, Schlüter A (2004)
Microbiology 150(11): 3591-3599.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[3]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1605701 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609647 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
[1]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610484
Occurrence of integron-associated resistance gene cassettes located on antibiotic resistance plasmids isolated from a wastewater treatment plant
Tennstedt T, Szczepanowski R, Braun S, Pühler A, Schluter A (2003)
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY 45(3): 239-252.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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[48]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2664976
Complete Genome Sequence of the Actinobacterium Actinoplanes friuliensis HAG 010964, producer of the lipopeptide antibiotic friulimycin
Rückert C, Szczepanowski R, Albersmeier A, Goesmann A, Fischer N, Steinkämper A, Pühler A, Biener R, Schwartz D, Kalinowski J (2014)
Journal of biotechnology 178: 41-42.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[47]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2632946
Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain VLB120 a solvent tolerant, styrene degrading bacterium, isolated from forest soil
Köhler KAK, Rückert C, Schatschneider S, Vorhölter F-J, Szczepanowski R, Blank LM, Niehaus K, Goesmann A, Pühler A, Kalinowski J, Schmid A (2013)
Journal of Biotechnology 168(4): 729-730.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[46]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548286
Draft whole genome sequence of the cyanide-degrading bacterium Pseudomonas pseudoalcaligenes CECT5344
Luque-Almagro VM, Acera F, Igeño MI, Wibberg D, Roldán MD, Sáez LP, Hennig M, Quesada A, Huertas MJ, Blom J, Merchán F, et al. (2013)
Environmental Microbiology 15(1): 253-270.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[45]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2648007
Genome sequence of the squalene-degrading bacterium Corynebacterium terpenotabidum type strain Y-11T (= DSM 44721T)
Rückert C, Albersmeier A, Al-Dilaimi A, Bednarz H, Niehaus K, Szczepanowski R, Kalinowski J (2013)
Standards in Genomic Sciences 9(3): 505-513.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[44]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2529309
Changes in Root Bacterial Communities Associated to Two Different Development Stages of Canola (*Brassica napus* L. var oleifera) Evaluated through Next-Generation Sequencing
Bolzan de Campos S, Youn J-W, Farina R, Jaenicke S, Jünemann S, Szczepanowski R, Beneduzi A, Vargas LK, Wendisch VF, Passaglia L (2013)
Microbial Ecology 65(3): 593-601.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[43]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551038
Genome sequence of the halotolerant bacterium Corynebacterium halotolerans type strain YIM 70093T (= DSM 44683T)
Rückert C, Albersmeier A, Al-Dilaimi A, Niehaus K, Szczepanowski R, Kalinowski J (2012)
Standards in Genomic Sciences 7(2): 284-293.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[42]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2484618
Profiling of the metabolically active community from a production-scale biogas plant by means of high-throughput metatranscriptome sequencing
Zakrzewski M, Goesmann A, Jaenicke S, Jünemann S, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Al-Soud WA, Sørensen S, Pühler A, Schlüter A (2012)
Journal of Biotechnology 158(4): 248-258.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[41]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2530221
The genome sequence of the bacterium Streptomyces davawensis JCM 4913 and heterologous production of the unique antibiotic roseoflavin
Jankowitsch F, Schwarz J, Rückert C, Gust B, Szczepanowski R, Blom J, Pelzer S, Kalinowski J, Mack M (2012)
Journal of bacteriology 194(24): 6818-6827.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[40]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2472279
The complete genome sequences of four new IncN plasmids from wastewater treatment plant effluent provide new insights into IncN plasmid diversity and evolution
Eikmeyer FG, Hadiati A, Szczepanowski R, Wibberg D, Schneiker-Bekel S, Rogers LM, Brown CB, Top EM, Pühler A, Schlüter A (2012)
Plasmid 68(1): 13-24.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
[39]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490535
Insights into the completely annotated genome of Lactobacillus buchneri CD034, a strain isolated from stable grass silage
Heinl S, Wibberg D, Eikmeyer FG, Szczepanowski R, Blom J, Linke B, Goesmann A, Grabherr R, Schwab H, Pühler A, Schlüter A (2012)
Journal of Biotechnology 161(2): 153-166.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[38]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2471681
Characterization of microbial biofilms in a thermophilic biogas system by high-throughput metagenome sequencing
Rademacher A, Zakrzewski M, Schlüter A, Schonberg M, Szczepanowski R, Goesmann A, Pühler A, Klocke M (2012)
FEMS Microbiology Ecology 79(3): 785-799.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[37]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486060
The complete genome sequence of the acarbose producer Actinoplanes sp. SE50/110
Schwientek P, Szczepanowski R, Rückert C, Kalinowski J, Klein A, Selber K, Wehmeier UF, Stoye J, Pühler A (2012)
BMC Genomics 13(1): 112.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[36]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2474305
Carbapenem-Hydrolyzing GES-5-Encoding Gene on Different Plasmid Types Recovered from a Bacterial Community in a Sewage Treatment Plant
Girlich D, Poirel L, Szczepanowski R, Schlüter A, Nordmann P (2012)
Applied and Environmental Microbiology 78(4): 1292-1295.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[35]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2544774
Draft Genome Sequence of Wickerhamomyces ciferrii NRRL Y-1031 F-60-10
Schneider J, Andrea H, Blom J, Jaenicke S, Rückert C, Schorsch C, Szczepanowski R, Farwick M, Goesmann A, Pühler A, Schaffer S, et al. (2012)
Eukaryotic Cell 11(12): 1582-1583.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[34]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526269
Complete genome sequence of Saccharothrix espanaensis DSM 44229T and comparison to the other completely sequenced Pseudonocardiaceae
Strobel T, Al-Dilaimi A, Blom J, Gessner A, Kalinowski J, Luzhetska M, Pühler A, Szczepanowski R, Bechthold A, Rückert C (2012)
BMC Genomics 13(1): 465.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[33]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2526298
Complete Genome Sequence of the Hydrogenotrophic, Methanogenic Archaeon Methanoculleus bourgensis Strain MS2T, Isolated from a Sewage Sludge Digester
Maus I, Wibberg D, Stantscheff R, Eikmeyer FG, Seffner A, Boelter J, Szczepanowski R, Blom J, Jaenicke S, König H, Pühler A, et al. (2012)
Journal of Bacteriology 194(19): 5487-5488.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[32]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517230
Bacterial Community Shift in Treated Periodontitis Patients Revealed by Ion Torrent 16S rRNA Gene Amplicon Sequencing
Jünemann S, Prior K, Szczepanowski R, Harks I, Ehmke B, Goesmann A, Stoye J, Harmsen D (2012)
PLoS ONE 7(8): e41606.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[31]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2490286
Ion Torrent PGM sequencing for genomic typing of Neisseria meningitidis for rapid determination of multiple layers of typing information
Vogel U, Szczepanowski R, Claus H, Jünemann S, Prior K, Harmsen D (2012)
Journal of clinical microbiology 50(6): 1889-1894.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[30]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354746
Sequencing of high G + C microbial genomes using the ultrafast pyrosequencing technology
Schwientek P, Szczepanowski R, Rückert C, Stoye J, Pühler A (2011)
Journal of Biotechnology 155(1): 68-77.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[29]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2354731
Complete genome sequencing of Agrobacterium sp. H13-3, the former Rhizobium lupini H13-3, reveals a tripartite genome consisting of a circular and a linear chromosome and an accessory plasmid but lacking a tumor-inducing Ti-plasmid
Wibberg D, Blom J, Jaenicke S, Kollin F, Rupp O, Scharf B, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Goesmann A, Setubal JC, Schmitt R, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 155(1): 50-62.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[28]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317371
High-quality genome sequence of Pichia pastoris CBS7435
Küberl A, Schneider J, Thallinger GG, Anderl I, Wibberg D, Hajek T, Jaenicke S, Brinkrolf K, Goesmann A, Szczepanowski R, Pühler A, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 154(4): 312-320.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[27]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326465
First genomic analysis of the broad-host-range Rhizobium sp LPU83 strain, a member of the low-genetic diversity Oregon-like Rhizobium sp group
Torres Tejerizo G, Florencia Del Papa M, Draghi W, Lozano M, de los Angeles Giusti M, Martini C, Eugenia Salas M, Salto I, Wibberg D, Szczepanowski R, Weidner S, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 155(1): 3-10.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[26]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2396576
Unraveling the Chinese hamster ovary cell line transcriptome by next-generation sequencing
Becker J, Hackel M, Jakobi T, Rupp O, Schneider J, Szczepanowski R, Bekel T, Borth N, Goesmann A, Grillari J, Kaltschmidt C, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 156(3): 227-235.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[25]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326518
Sequencing and comparative analysis of IncP-1 alpha antibiotic resistance plasmids reveal a highly conserved backbone and differences within accessory regions
Szczepanowski R, Eikmeyer FG, Harfmann J, Blom J, Rogers LM, Top EM, Schlüter A (2011)
Journal of Biotechnology 155(1): 95-103.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[24]
2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2453768
Next-generation sequencing of the CHO cell transcriptome
Becker J, Timmermann C, Jakobi T, Rupp O, Szczepanowski R, Hackl M, Goesmann A, Tauch A, Borth N, Grillari J, Pühler A, et al. (2011)
BMC Proceedings 5(Suppl. 8): P6.
PUB | DOI
 
[23]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2087955
Next-generation sequencing of the Chinese hamster ovary microRNA transcriptome: Identification, annotation and profiling of microRNAs as targets for cellular engineering
Hackl M, Jakobi T, Blom J, Doppmeier D, Brinkrolf K, Szczepanowski R, Bernhart SH, Höner zu Siederdissen C, Bort JAH, Wieser M, Kunert R, et al. (2011)
Journal of Biotechnology 153(1-2): 62-75.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[22]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486400
Advanced Genomics and Transcriptomics of Industrial Microorganisms
Kalinowski J, Rückert C, Szczepanowski R, Pühler A (2010)
Chemie Ingenieur Technik 82(9): 1518-1519.
PUB | DOI
 
[21]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785275
Complete genome sequence and lifestyle of black-pigmented Corynebacterium aurimucosum ATCC 700975 (formerly C. nigricans CN-1) isolated from a vaginal swab of a woman with spontaneous abortion
Trost E, Götker S, Schneider J, Schneiker-Bekel S, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Arnold W, Bekel T, Blom J, Gartemann K-H, et al. (2010)
BMC Genomics 11(1): 91.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[20]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591546
Detection of 140 clinically relevant antibiotic-resistance genes in the plasmid metagenome of wastewater treatment plant bacteria showing reduced susceptibility to selected antibiotics
Szczepanowski R, Linke B, Krahn I, Gartemann K-H, Guetzkow T, Eichler W, Pühler A, Schlueter A (2009)
MICROBIOLOGY 155(7): 2306-2319.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585980
Genetic diversity and composition of a plasmid metagenome from a wastewater treatment plant
Schlueter A, Krause L, Szczepanowski R, Goesmann A, Pühler A (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 65-76.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585969
Insight into the plasmid metagenome of wastewater treatment plant bacteria showing reduced susceptibility to antimicrobial drugs analysed by the 454-pyrosequencing technology
Szczepanowski R, Bekel T, Goesmann A, Krause L, Kroemeke H, Kaiser O, Eichler W, Pühler A, Schlueter A (2008)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 136(1-2): 54-64.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1586009
Taxonomic composition and gene content of a methane-producing microbial community isolated from a biogas reactor
Krause L, Diaz NN, Edwards RA, Gartemann K-H, Krömeke H, Neuweger H, Pühler A, Runte KJ, Schlüter A, Stoye J, Szczepanowski R, et al. (2008)
JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 136(1-2): 91-101.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585987
The metagenome of a biogas-producing microbial community of a production-scale biogas plant fermenter analysed by the 454-pyrosequencing technology
Schlüter A, Bekel T, Diaz NN, Dondrup M, Eichenlaub R, Gartemann K-H, Krahn I, Krause L, Kroemeke H, Kruse O, Mussgnug JH, et al. (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 77-90.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585939
Ultrafast pyrosequencing of Corynebacterium kroppenstedtii DSM44385 revealed insights into the physiology of a lipophilic corynebacterium that lacks mycolic acids
Tauch A, Schneider J, Szczepanowski R, Tilker A, Viehöver P, Gartemann K-H, Arnold W, Blom J, Brinkrolf K, Brune I, Goetker S, et al. (2008)
Journal of Biotechnology 136(1-2): 22-30.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595908
Novel macrolide resistance module carried by the IncP-1 beta resistance plasmid pRSB111, isolated from a wastewater treatment plant
Szczepanowski R, Krahn I, Bohn N, Pühler A, Schlueter A (2007)
ANTIMICROBIAL AGENTS AND CHEMOTHERAPY 51(2): 673-678.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593538 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1595014 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1946125
IncP-1-beta plasmid pGNB1 isolated from a bacterial community from a wastewater treatment plant mediates decolorization of triphenylmethane dyes
Schlüter A, Krahn I, Kollin F, Bonemann G, Stiens M, Szczepanowski R, Schneiker-Bekel S, Pühler A (2007)
Appl Environ Microbiol 73(20): 6345-6350.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
[10]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604328 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1864013
Genomics of resistance plasmids isolated from wastewater treatment plants
Tennstedt T, Heuer H, Top EM, Szczepanowski R, Pühler A, Schlüter A (2005)
Plasmid 53(1): 40-41.
PUB
 
[8]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1602311 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1603956 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
 
[5]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1605656 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
[4]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1605648
The complete sequences of plasmids pB2 and pB3 provide evidence for a recent ancestor of the IncP-1 beta group without any accessory genes
Heuer H, Szczepanowski R, Schneiker-Bekel S, Pühler A, Top EM, Schlüter A (2004)
Microbiology 150(11): 3591-3599.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[3]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1605701 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609647 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
[1]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610484
Occurrence of integron-associated resistance gene cassettes located on antibiotic resistance plasmids isolated from a wastewater treatment plant
Tennstedt T, Szczepanowski R, Braun S, Pühler A, Schluter A (2003)
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY 45(3): 239-252.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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