13 Publikationen

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[13]
2019 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932883
Dörr, D.; Stoye, J. (2019): A Perspective on Comparative and Functional Genomics. In: Tandy Warnow (Hrsg.): Bioinformatics and Phylogenetics. Cham: Springer . (Computational Biology, 29). S. 361-372.
PUB | DOI
 
[12]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005
Schulz, T.; Stoye, J.; Dörr, D. (2018): GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data BMC Genomics,19:(Suppl. 5):308
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
Dörr, D.; Feijão, P.; Stoye, J. (2018): Family-Free Genome Comparison. In: João C. Setubal; Peter Stadler; Jens Stoye (Hrsg.): Comparative Genomics: Methods and Protocols. New York: Springer Verlag. (Methods in Molecular Biology, 1704). S. 331-342.
PUB
 
[10]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912492
Luhmann, N.; Dörr, D.; Chauve, C. (2017): Comparative scaffolding and gap filling of ancient bacterial genomes applied to two ancient Yersinia pestis genomes Microbial Genomics,3:(9)
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911814
Dörr, D.; Balaban, M.; Feijão, P.; Chauve, C. (2017): The gene family-free median of three Algorithms for Molecular Biology,12:14
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913016
Schulz, T.; Stoye, J.; Dörr, D. (2017): Finding Teams in Graphs and its Application to Spatial Gene Cluster Discovery. In: Proceedings of RECOMB-CG 2017. Berlin: Springer Verlag. (Lecture Notes in Bioinformatics, 1704). S. 197-212.
PUB | DOI
 
[7]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909967
Dörr, D.; Kowada, L. A. B.; Soares de Araujo, F. E.; Deshpande, S.; Dantas, S.; Moret, B. M. E.; Stoye, J. (2017): New Genome Similarity Measures based on Conserved Gene Adjacencies Journal of Computational Biology,24:(6): 616-634.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2016 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2902049
Dörr, D. (2016): Gene family-free genome comparison. Bielefeld: Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
[5]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2687033
Dörr, D.; Stoye, J.; Böcker, S.; Jahn, K. (2014): Identifying Gene Clusters by Discovering Common Intervals in Indeterminate Strings BMC Genomics,15:(Suppl. 6: Proc. of RECOMB-CG 2014): S2.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685362
Lechner, M.; Hernandez-Rosales, M.; Dörr, D.; Wieseke, N.; Thévenin, A.; Stoye, J.; Hartmann, R. K.; Prohaska, S. J.; Stadler, P. F. (2014): Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Datasets PLoS ONE,9:(8): e105015.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[3]
2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611648
Dias Vieira Braga, M.; Chauve, C.; Dörr, D.; Jahn, K.; Stoye, J.; Thévenin, A.; Wittler, R. (2013): The Potential of Family-Free Genome Comparison. In: Cedric Chauve; Nadia El-Mabrouk; Eric Tannier (Hrsg.): Models and Algorithms for Genome Evolution. Springer Verlag. (Computational Biology Series, 19). S. 287-307.
PUB | DOI
 
[2]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560353
Dörr, D.; Gronau, I.; Moran, S.; Yavneh, I. (2012): Stochastic errors vs. modeling errors in distance based phylogenetic reconstructions Algorithms for Molecular Biology,7:(1): 22.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2512642
Dörr, D.; Thévenin, A.; Stoye, J. (2012): Gene family assignment-free comparative genomics BMC Bioinformatics,13:(Suppl 19: Proc. of RECOMB-CG 2012): S3.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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2019 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932883
Dörr, D.; Stoye, J. (2019): A Perspective on Comparative and Functional Genomics. In: Tandy Warnow (Hrsg.): Bioinformatics and Phylogenetics. Cham: Springer . (Computational Biology, 29). S. 361-372.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005
Schulz, T.; Stoye, J.; Dörr, D. (2018): GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data BMC Genomics,19:(Suppl. 5):308
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2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
Dörr, D.; Feijão, P.; Stoye, J. (2018): Family-Free Genome Comparison. In: João C. Setubal; Peter Stadler; Jens Stoye (Hrsg.): Comparative Genomics: Methods and Protocols. New York: Springer Verlag. (Methods in Molecular Biology, 1704). S. 331-342.
PUB
 
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912492
Luhmann, N.; Dörr, D.; Chauve, C. (2017): Comparative scaffolding and gap filling of ancient bacterial genomes applied to two ancient Yersinia pestis genomes Microbial Genomics,3:(9)
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911814
Dörr, D.; Balaban, M.; Feijão, P.; Chauve, C. (2017): The gene family-free median of three Algorithms for Molecular Biology,12:14
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913016
Schulz, T.; Stoye, J.; Dörr, D. (2017): Finding Teams in Graphs and its Application to Spatial Gene Cluster Discovery. In: Proceedings of RECOMB-CG 2017. Berlin: Springer Verlag. (Lecture Notes in Bioinformatics, 1704). S. 197-212.
PUB | DOI
 
[7]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909967
Dörr, D.; Kowada, L. A. B.; Soares de Araujo, F. E.; Deshpande, S.; Dantas, S.; Moret, B. M. E.; Stoye, J. (2017): New Genome Similarity Measures based on Conserved Gene Adjacencies Journal of Computational Biology,24:(6): 616-634.
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[6]
2016 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2902049
Dörr, D. (2016): Gene family-free genome comparison. Bielefeld: Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
[5]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2687033
Dörr, D.; Stoye, J.; Böcker, S.; Jahn, K. (2014): Identifying Gene Clusters by Discovering Common Intervals in Indeterminate Strings BMC Genomics,15:(Suppl. 6: Proc. of RECOMB-CG 2014): S2.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685362
Lechner, M.; Hernandez-Rosales, M.; Dörr, D.; Wieseke, N.; Thévenin, A.; Stoye, J.; Hartmann, R. K.; Prohaska, S. J.; Stadler, P. F. (2014): Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Datasets PLoS ONE,9:(8): e105015.
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2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611648
Dias Vieira Braga, M.; Chauve, C.; Dörr, D.; Jahn, K.; Stoye, J.; Thévenin, A.; Wittler, R. (2013): The Potential of Family-Free Genome Comparison. In: Cedric Chauve; Nadia El-Mabrouk; Eric Tannier (Hrsg.): Models and Algorithms for Genome Evolution. Springer Verlag. (Computational Biology Series, 19). S. 287-307.
PUB | DOI
 
[2]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560353
Dörr, D.; Gronau, I.; Moran, S.; Yavneh, I. (2012): Stochastic errors vs. modeling errors in distance based phylogenetic reconstructions Algorithms for Molecular Biology,7:(1): 22.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2512642
Dörr, D.; Thévenin, A.; Stoye, J. (2012): Gene family assignment-free comparative genomics BMC Bioinformatics,13:(Suppl 19: Proc. of RECOMB-CG 2012): S3.
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