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[15]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Im Druck | PUB-ID: 2937712
Rubert, D., Martinez, F.H.V., Stoye, J. & Dörr, D. (In Press). Analysis of local genome rearrangement improves resolution of ancestral genomic maps in plants. BMC Genomics. BioMed Central.
PUB
 
[14]
2019 | Datenpublikation | PUB-ID: 2936848
Dörr, D. & Rubert, D. (2019). Supplementary Data for "Analysis of local genome rearrangement improves resolution of ancestral genomic maps in plants". Bielefeld University. doi:10.4119/unibi/2936848.
PUB | Dateien verfügbar | DOI
 
[13]
2019 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932883
Dörr, D. & Stoye, J. (2019). A Perspective on Comparative and Functional Genomics (Computational Biology). In T. Warnow (Hrsg.), Bioinformatics and Phylogenetics (S. 361-372). Cham: Springer . doi:10.1007/978-3-030-10837-3_14.
PUB | DOI
 
[12]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005
Schulz, T., Stoye, J. & Dörr, D. (2018). GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data. BMC Genomics, 19(Suppl. 5): 308. Springer Nature. doi:10.1186/s12864-018-4622-0.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
Dörr, D., Feijão, P. & Stoye, J. (2018). Family-Free Genome Comparison (Methods in Molecular Biology). In J.C. Setubal, P. Stadler & J. Stoye (Hrsg.), Comparative Genomics: Methods and Protocols (S. 331-342). New York: Springer Verlag.
PUB
 
[10]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912492
Luhmann, N., Dörr, D. & Chauve, C. (2017). Comparative scaffolding and gap filling of ancient bacterial genomes applied to two ancient Yersinia pestis genomes. Microbial Genomics, 3(9). Microbiology Society. doi:10.1099/mgen.0.000123.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911814
Dörr, D., Balaban, M., Feijão, P. & Chauve, C. (2017). The gene family-free median of three. Algorithms for Molecular Biology, 12: 14. Springer Nature. doi:10.1186/s13015-017-0106-z.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913016
Schulz, T., Stoye, J. & Dörr, D. (2017). Finding Teams in Graphs and its Application to Spatial Gene Cluster Discovery (Lecture Notes in Bioinformatics). Proceedings of RECOMB-CG 2017 (S. 197-212). Gehalten auf der RECOMB-CG 2017, Berlin: Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-319-67979-2_11.
PUB | DOI
 
[7]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909967
Dörr, D., Kowada, L.A.B., Soares de Araujo, F.E., Deshpande, S., Dantas, S., Moret, B.M.E. & Stoye, J. (2017). New Genome Similarity Measures based on Conserved Gene Adjacencies. Journal of Computational Biology, 24(6), 616-634. doi:10.1089/cmb.2017.0065.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2016 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2902049
Dörr, D. (2016). Gene family-free genome comparison. Bielefeld: Universität Bielefeld.
PUB | PDF
 
[5]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2687033
Dörr, D., Stoye, J., Böcker, S. & Jahn, K. (2014). Identifying Gene Clusters by Discovering Common Intervals in Indeterminate Strings. BMC Genomics, 15(Suppl. 6: Proc. of RECOMB-CG 2014), S2. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-15-S6-S2.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685362
Lechner, M., Hernandez-Rosales, M., Dörr, D., Wieseke, N., Thévenin, A., Stoye, J., Hartmann, R.K., Prohaska, S.J. & Stadler, P.F. (2014). Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Datasets. PLoS ONE, 9(8), e105015. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0105015.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[3]
2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611648
Dias Vieira Braga, M., Chauve, C., Dörr, D., Jahn, K., Stoye, J., Thévenin, A. & Wittler, R. (2013). The Potential of Family-Free Genome Comparison (Computational Biology Series). In C. Chauve, N. El-Mabrouk & E. Tannier (Hrsg.), Models and Algorithms for Genome Evolution (S. 287-307). Springer Verlag. doi:10.1007/978-1-4471-5298-9_13.
PUB | DOI
 
[2]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560353
Dörr, D., Gronau, I., Moran, S. & Yavneh, I. (2012). Stochastic errors vs. modeling errors in distance based phylogenetic reconstructions. Algorithms for Molecular Biology, 7(1), 22. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1748-7188-7-22.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2512642
Dörr, D., Thévenin, A. & Stoye, J. (2012). Gene family assignment-free comparative genomics. BMC Bioinformatics, 13(Suppl 19: Proc. of RECOMB-CG 2012), S3. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2105-13-S19-S3.
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2019 | Datenpublikation | PUB-ID: 2936848
Dörr, D. & Rubert, D. (2019). Supplementary Data for "Analysis of local genome rearrangement improves resolution of ancestral genomic maps in plants". Bielefeld University. doi:10.4119/unibi/2936848.
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2019 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932883
Dörr, D. & Stoye, J. (2019). A Perspective on Comparative and Functional Genomics (Computational Biology). In T. Warnow (Hrsg.), Bioinformatics and Phylogenetics (S. 361-372). Cham: Springer . doi:10.1007/978-3-030-10837-3_14.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005
Schulz, T., Stoye, J. & Dörr, D. (2018). GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data. BMC Genomics, 19(Suppl. 5): 308. Springer Nature. doi:10.1186/s12864-018-4622-0.
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2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
Dörr, D., Feijão, P. & Stoye, J. (2018). Family-Free Genome Comparison (Methods in Molecular Biology). In J.C. Setubal, P. Stadler & J. Stoye (Hrsg.), Comparative Genomics: Methods and Protocols (S. 331-342). New York: Springer Verlag.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912492
Luhmann, N., Dörr, D. & Chauve, C. (2017). Comparative scaffolding and gap filling of ancient bacterial genomes applied to two ancient Yersinia pestis genomes. Microbial Genomics, 3(9). Microbiology Society. doi:10.1099/mgen.0.000123.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911814
Dörr, D., Balaban, M., Feijão, P. & Chauve, C. (2017). The gene family-free median of three. Algorithms for Molecular Biology, 12: 14. Springer Nature. doi:10.1186/s13015-017-0106-z.
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2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913016
Schulz, T., Stoye, J. & Dörr, D. (2017). Finding Teams in Graphs and its Application to Spatial Gene Cluster Discovery (Lecture Notes in Bioinformatics). Proceedings of RECOMB-CG 2017 (S. 197-212). Gehalten auf der RECOMB-CG 2017, Berlin: Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-319-67979-2_11.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909967
Dörr, D., Kowada, L.A.B., Soares de Araujo, F.E., Deshpande, S., Dantas, S., Moret, B.M.E. & Stoye, J. (2017). New Genome Similarity Measures based on Conserved Gene Adjacencies. Journal of Computational Biology, 24(6), 616-634. doi:10.1089/cmb.2017.0065.
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2016 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2902049
Dörr, D. (2016). Gene family-free genome comparison. Bielefeld: Universität Bielefeld.
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[5]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2687033
Dörr, D., Stoye, J., Böcker, S. & Jahn, K. (2014). Identifying Gene Clusters by Discovering Common Intervals in Indeterminate Strings. BMC Genomics, 15(Suppl. 6: Proc. of RECOMB-CG 2014), S2. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2164-15-S6-S2.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685362
Lechner, M., Hernandez-Rosales, M., Dörr, D., Wieseke, N., Thévenin, A., Stoye, J., Hartmann, R.K., Prohaska, S.J. & Stadler, P.F. (2014). Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Datasets. PLoS ONE, 9(8), e105015. Public Library of Science (PLoS). doi:10.1371/journal.pone.0105015.
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2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611648
Dias Vieira Braga, M., Chauve, C., Dörr, D., Jahn, K., Stoye, J., Thévenin, A. & Wittler, R. (2013). The Potential of Family-Free Genome Comparison (Computational Biology Series). In C. Chauve, N. El-Mabrouk & E. Tannier (Hrsg.), Models and Algorithms for Genome Evolution (S. 287-307). Springer Verlag. doi:10.1007/978-1-4471-5298-9_13.
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[2]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560353
Dörr, D., Gronau, I., Moran, S. & Yavneh, I. (2012). Stochastic errors vs. modeling errors in distance based phylogenetic reconstructions. Algorithms for Molecular Biology, 7(1), 22. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1748-7188-7-22.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2512642
Dörr, D., Thévenin, A. & Stoye, J. (2012). Gene family assignment-free comparative genomics. BMC Bioinformatics, 13(Suppl 19: Proc. of RECOMB-CG 2012), S3. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/1471-2105-13-S19-S3.
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