13 Publikationen

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[13]
2019 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2932883
Dörr D, Stoye J. A Perspective on Comparative and Functional Genomics. In: Warnow T, ed. Bioinformatics and Phylogenetics. Computational Biology. Vol 29. Cham: Springer ; 2019: 361-372.
PUB | DOI
 
[12]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005
Schulz T, Stoye J, Dörr D. GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data. BMC Genomics. 2018;19(Suppl. 5): 308.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
Dörr D, Feijão P, Stoye J. Family-Free Genome Comparison. In: Setubal JC, Stadler P, Stoye J, eds. Comparative Genomics: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology. Vol 1704. New York: Springer Verlag; 2018: 331-342.
PUB
 
[10]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912492
Luhmann N, Dörr D, Chauve C. Comparative scaffolding and gap filling of ancient bacterial genomes applied to two ancient Yersinia pestis genomes. Microbial Genomics. 2017;3(9).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911814
Dörr D, Balaban M, Feijão P, Chauve C. The gene family-free median of three. Algorithms for Molecular Biology. 2017;12: 14.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913016
Schulz T, Stoye J, Dörr D. Finding Teams in Graphs and its Application to Spatial Gene Cluster Discovery. In: Proceedings of RECOMB-CG 2017. Lecture Notes in Bioinformatics. Vol 1704. Berlin: Springer Verlag; 2017: 197-212.
PUB | DOI
 
[7]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909967
Dörr D, Kowada LAB, Soares de Araujo FE, et al. New Genome Similarity Measures based on Conserved Gene Adjacencies. Journal of Computational Biology. 2017;24(6):616-634.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2016 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2902049
Dörr D. Gene family-free genome comparison. Bielefeld: Universität Bielefeld; 2016.
PUB | PDF
 
[5]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2687033
Dörr D, Stoye J, Böcker S, Jahn K. Identifying Gene Clusters by Discovering Common Intervals in Indeterminate Strings. BMC Genomics. 2014;15(Suppl. 6: Proc. of RECOMB-CG 2014):S2.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685362
Lechner M, Hernandez-Rosales M, Dörr D, et al. Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Datasets. PLoS ONE. 2014;9(8):e105015.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[3]
2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611648
Dias Vieira Braga M, Chauve C, Dörr D, et al. The Potential of Family-Free Genome Comparison. In: Chauve C, El-Mabrouk N, Tannier E, eds. Models and Algorithms for Genome Evolution. Computational Biology Series. Vol 19. Springer Verlag; 2013: 287-307.
PUB | DOI
 
[2]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560353
Dörr D, Gronau I, Moran S, Yavneh I. Stochastic errors vs. modeling errors in distance based phylogenetic reconstructions. Algorithms for Molecular Biology. 2012;7(1):22.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2512642
Dörr D, Thévenin A, Stoye J. Gene family assignment-free comparative genomics. BMC Bioinformatics. 2012;13(Suppl 19: Proc. of RECOMB-CG 2012):S3.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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Dörr D, Stoye J. A Perspective on Comparative and Functional Genomics. In: Warnow T, ed. Bioinformatics and Phylogenetics. Computational Biology. Vol 29. Cham: Springer ; 2019: 361-372.
PUB | DOI
 
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005
Schulz T, Stoye J, Dörr D. GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data. BMC Genomics. 2018;19(Suppl. 5): 308.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913922
Dörr D, Feijão P, Stoye J. Family-Free Genome Comparison. In: Setubal JC, Stadler P, Stoye J, eds. Comparative Genomics: Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology. Vol 1704. New York: Springer Verlag; 2018: 331-342.
PUB
 
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912492
Luhmann N, Dörr D, Chauve C. Comparative scaffolding and gap filling of ancient bacterial genomes applied to two ancient Yersinia pestis genomes. Microbial Genomics. 2017;3(9).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911814
Dörr D, Balaban M, Feijão P, Chauve C. The gene family-free median of three. Algorithms for Molecular Biology. 2017;12: 14.
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[8]
2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913016
Schulz T, Stoye J, Dörr D. Finding Teams in Graphs and its Application to Spatial Gene Cluster Discovery. In: Proceedings of RECOMB-CG 2017. Lecture Notes in Bioinformatics. Vol 1704. Berlin: Springer Verlag; 2017: 197-212.
PUB | DOI
 
[7]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909967
Dörr D, Kowada LAB, Soares de Araujo FE, et al. New Genome Similarity Measures based on Conserved Gene Adjacencies. Journal of Computational Biology. 2017;24(6):616-634.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2016 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2902049
Dörr D. Gene family-free genome comparison. Bielefeld: Universität Bielefeld; 2016.
PUB | PDF
 
[5]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2687033
Dörr D, Stoye J, Böcker S, Jahn K. Identifying Gene Clusters by Discovering Common Intervals in Indeterminate Strings. BMC Genomics. 2014;15(Suppl. 6: Proc. of RECOMB-CG 2014):S2.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685362
Lechner M, Hernandez-Rosales M, Dörr D, et al. Orthology Detection Combining Clustering and Synteny for Very Large Datasets. PLoS ONE. 2014;9(8):e105015.
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[3]
2013 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2611648
Dias Vieira Braga M, Chauve C, Dörr D, et al. The Potential of Family-Free Genome Comparison. In: Chauve C, El-Mabrouk N, Tannier E, eds. Models and Algorithms for Genome Evolution. Computational Biology Series. Vol 19. Springer Verlag; 2013: 287-307.
PUB | DOI
 
[2]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560353
Dörr D, Gronau I, Moran S, Yavneh I. Stochastic errors vs. modeling errors in distance based phylogenetic reconstructions. Algorithms for Molecular Biology. 2012;7(1):22.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2512642
Dörr D, Thévenin A, Stoye J. Gene family assignment-free comparative genomics. BMC Bioinformatics. 2012;13(Suppl 19: Proc. of RECOMB-CG 2012):S3.
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