23 Publikationen

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[23]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942001 OA
M. Lewinski, Y. Bramkamp, T. Köster, and D. Staiger, “SEQing: web-based visualization of iCLIP and RNA-seq data in an interactive python framework.”, BMC bioinformatics, 2020, 21, : 113.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[22]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2937585
T. Köster, M. Reichel, and D. Staiger, “CLIP and RNA interactome studies to unravel genome-wide RNA-protein interactions in vivo in Arabidopsis thaliana.”, Methods (San Diego, Calif.), 2019.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[21]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2936720
M. Reichel, T. Köster, and D. Staiger, “Marking RNA: m6A writers, readers and functions in Arabidopsis”, Journal of molecular cell biology, 2019, 11, 899-910.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[20]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934855
M. Lewinski, and T. Köster, in Systems Biology (Eds.: N. Rajewsky, S. Jurga, J. Barciszewski), Springer International Publishing, Cham, 2018, p. 77-95.
PUB | DOI
 
[19]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919118
M. Johansson, and T. Köster, “On the move through time - a historical review of plant clock research”, Plant Biology, 2018, 21, 13-20.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919455
T. Köster, “miRNAs - der Hacker-Angriff der Parasiten”, Biologie in unserer Zeit, 2018, 48, 87-88.
PUB | DOI
 
[17]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918314
T. Köster, and K. Meyer, “Plant Ribonomics: Proteins in Search of RNA Partners”, Trends in Plant Science, 2018, 23, 352-365.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914954 OA
K. Meyer, T. Köster, C. Nolte, C. Weinholdt, M. Lewinski, I. Grosse, and D. Staiger, “Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7”, Genome Biology, 2017, 18, : 204.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914953
T. Köster, “Volkszählung in der Zelle - wer bindet RNA?”, Biologie in unserer Zeit, 2017, 47, 226-227.
PUB | DOI
 
[14]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911046
S. W. Foley, S. J. Gosai, D. Wang, N. Selamoglu, A. C. Sollitti, T. Köster, A. Steffen, E. Lyons, F. Daldal, B. A. Garcia, et al., “A Global View of RNA-Protein Interactions Identifies Post-transcriptional Regulators of Root Hair Cell Fate”, Developmental Cell, 2017, 41, 204-220.e5.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911065
T. Köster, C. Marondedze, K. Meyer, and D. Staiger, “RNA-Binding Proteins Revisited – The Emerging Arabidopsis mRNA Interactome”, Trends in Plant Science, 2017, 22, 512-526.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764695 OA
K. Meyer, T. Köster, and D. Staiger, “Pre-mRNA Splicing in Plants: In Vivo Functions of RNA-Binding Proteins Implicated in the Splicing Process”, Biomolecules, 2015, 5, 1717-1740.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629103
T. Köster, and D. Staiger, “RNA-Binding Protein Immunoprecipitation from Whole-Cell Extracts”, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2014, 1062, 679-695.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
C. Hackmann, C. Korneli, M. Kutyniok, T. Köster, M. Wiedenlübbert, C. Müller, and D. Staiger, “Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity”, Plant, Cell & Environment, 2014, 37, 696-706.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709993
K. Meyer, T. Köster, and D. Staiger, “Unraveling post-transcriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation”, Biotechnologia. Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology, 2014, 95, 43.
PUB | DOI
 
[8]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676604
T. Köster, M. Haas, and D. Staiger, “The RIPper Case: Identification of RNA-Binding Protein Targets by RNA Immunoprecipitation”, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2014, 1158, 107-121.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694724
T. Köster, K. Meyer, C. Weinholdt, L. M. Smith, M. Lummer, C. Speth, I. Grosse, D. Weigel, and D. Staiger, “Regulation of pri-miRNA processing by the hnRNP-like protein AtGRP7 in Arabidopsis”, Nucleic acids research, 2014, 42, 9925-9936.
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[6]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709933
K. Meyer, T. Köster, and D. Staiger, “Unraveling post-tramscriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation”, BioTechnologia, 2014, 95, 43-43.
PUB
 
[5]
2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717324
T. Köster, Funktion von Ribonukleoproteinkomplexen in der posttranskriptionellen Regulation und microRNA-Biogenese, Bielefeld, 2014.
PUB
 
[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709991
T. Köster, J. W. S. Brown, and D. Staiger, “Jenseits des Genoms – Alternatives Spleißen erhöht die Vielfalt des Transkriptoms”, Naturwissenschaftliche Rundschau, 2014, 67, 566-571.
PUB
 
[3]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548847
C. Streitner, T. Köster, C. G. Simpson, P. Shaw, S. Danisman, J. W. S. Brown, and D. Staiger, “An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with transcripts in Arabidopsis thaliana”, Nucleic acids research, 2012, 40, 11240-11255.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003474
D. Staiger, and T. Köster, “Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system”, Cellular and Molecular Life Sciences, 2011, 68, 71-83.
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[1]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438856 OA
D. Staiger, and T. Köster, “Timing is everything - Die Innere Uhr der Pflanzen”, Labor & More, 2009, 5, 40-41.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942001 OA
M. Lewinski, Y. Bramkamp, T. Köster, and D. Staiger, “SEQing: web-based visualization of iCLIP and RNA-seq data in an interactive python framework.”, BMC bioinformatics, 2020, 21, : 113.
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[22]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2937585
T. Köster, M. Reichel, and D. Staiger, “CLIP and RNA interactome studies to unravel genome-wide RNA-protein interactions in vivo in Arabidopsis thaliana.”, Methods (San Diego, Calif.), 2019.
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[21]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2936720
M. Reichel, T. Köster, and D. Staiger, “Marking RNA: m6A writers, readers and functions in Arabidopsis”, Journal of molecular cell biology, 2019, 11, 899-910.
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[20]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934855
M. Lewinski, and T. Köster, in Systems Biology (Eds.: N. Rajewsky, S. Jurga, J. Barciszewski), Springer International Publishing, Cham, 2018, p. 77-95.
PUB | DOI
 
[19]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919118
M. Johansson, and T. Köster, “On the move through time - a historical review of plant clock research”, Plant Biology, 2018, 21, 13-20.
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[18]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919455
T. Köster, “miRNAs - der Hacker-Angriff der Parasiten”, Biologie in unserer Zeit, 2018, 48, 87-88.
PUB | DOI
 
[17]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918314
T. Köster, and K. Meyer, “Plant Ribonomics: Proteins in Search of RNA Partners”, Trends in Plant Science, 2018, 23, 352-365.
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[16]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914954 OA
K. Meyer, T. Köster, C. Nolte, C. Weinholdt, M. Lewinski, I. Grosse, and D. Staiger, “Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7”, Genome Biology, 2017, 18, : 204.
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[15]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914953
T. Köster, “Volkszählung in der Zelle - wer bindet RNA?”, Biologie in unserer Zeit, 2017, 47, 226-227.
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[14]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911046
S. W. Foley, S. J. Gosai, D. Wang, N. Selamoglu, A. C. Sollitti, T. Köster, A. Steffen, E. Lyons, F. Daldal, B. A. Garcia, et al., “A Global View of RNA-Protein Interactions Identifies Post-transcriptional Regulators of Root Hair Cell Fate”, Developmental Cell, 2017, 41, 204-220.e5.
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[13]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911065
T. Köster, C. Marondedze, K. Meyer, and D. Staiger, “RNA-Binding Proteins Revisited – The Emerging Arabidopsis mRNA Interactome”, Trends in Plant Science, 2017, 22, 512-526.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764695 OA
K. Meyer, T. Köster, and D. Staiger, “Pre-mRNA Splicing in Plants: In Vivo Functions of RNA-Binding Proteins Implicated in the Splicing Process”, Biomolecules, 2015, 5, 1717-1740.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629103
T. Köster, and D. Staiger, “RNA-Binding Protein Immunoprecipitation from Whole-Cell Extracts”, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2014, 1062, 679-695.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
C. Hackmann, C. Korneli, M. Kutyniok, T. Köster, M. Wiedenlübbert, C. Müller, and D. Staiger, “Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity”, Plant, Cell & Environment, 2014, 37, 696-706.
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[9]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709993
K. Meyer, T. Köster, and D. Staiger, “Unraveling post-transcriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation”, Biotechnologia. Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology, 2014, 95, 43.
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[8]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676604
T. Köster, M. Haas, and D. Staiger, “The RIPper Case: Identification of RNA-Binding Protein Targets by RNA Immunoprecipitation”, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2014, 1158, 107-121.
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T. Köster, K. Meyer, C. Weinholdt, L. M. Smith, M. Lummer, C. Speth, I. Grosse, D. Weigel, and D. Staiger, “Regulation of pri-miRNA processing by the hnRNP-like protein AtGRP7 in Arabidopsis”, Nucleic acids research, 2014, 42, 9925-9936.
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709933
K. Meyer, T. Köster, and D. Staiger, “Unraveling post-tramscriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation”, BioTechnologia, 2014, 95, 43-43.
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[5]
2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717324
T. Köster, Funktion von Ribonukleoproteinkomplexen in der posttranskriptionellen Regulation und microRNA-Biogenese, Bielefeld, 2014.
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[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709991
T. Köster, J. W. S. Brown, and D. Staiger, “Jenseits des Genoms – Alternatives Spleißen erhöht die Vielfalt des Transkriptoms”, Naturwissenschaftliche Rundschau, 2014, 67, 566-571.
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[3]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548847
C. Streitner, T. Köster, C. G. Simpson, P. Shaw, S. Danisman, J. W. S. Brown, and D. Staiger, “An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with transcripts in Arabidopsis thaliana”, Nucleic acids research, 2012, 40, 11240-11255.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003474
D. Staiger, and T. Köster, “Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system”, Cellular and Molecular Life Sciences, 2011, 68, 71-83.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438856 OA
D. Staiger, and T. Köster, “Timing is everything - Die Innere Uhr der Pflanzen”, Labor & More, 2009, 5, 40-41.
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