23 Publikationen

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[23]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942001 OA
Lewinski, M., Bramkamp, Y., Köster, T., Staiger, D.: SEQing: web-based visualization of iCLIP and RNA-seq data in an interactive python framework. BMC bioinformatics. 21, : 113 (2020).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[22]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2937585
Köster, T., Reichel, M., Staiger, D.: CLIP and RNA interactome studies to unravel genome-wide RNA-protein interactions in vivo in Arabidopsis thaliana. Methods (San Diego, Calif.). (2019).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[21]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2936720
Reichel, M., Köster, T., Staiger, D.: Marking RNA: m6A writers, readers and functions in Arabidopsis. Journal of molecular cell biology. 11, 899-910 (2019).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[20]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934855
Lewinski, M., Köster, T.: Systems Approaches to Map In Vivo RNA–Protein Interactions in Arabidopsis thaliana. In: Rajewsky, N., Jurga, S., and Barciszewski, J. (eds.) Systems Biology. RNA Technologies. p. 77-95. Springer International Publishing, Cham (2018).
PUB | DOI
 
[19]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919118
Johansson, M., Köster, T.: On the move through time - a historical review of plant clock research. Plant Biology. 21, 13-20 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919455
Köster, T.: miRNAs - der Hacker-Angriff der Parasiten. Biologie in unserer Zeit. 48, 87-88 (2018).
PUB | DOI
 
[17]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918314
Köster, T., Meyer, K.: Plant Ribonomics: Proteins in Search of RNA Partners. Trends in Plant Science. 23, 352-365 (2018).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914954 OA
Meyer, K., Köster, T., Nolte, C., Weinholdt, C., Lewinski, M., Grosse, I., Staiger, D.: Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7. Genome Biology. 18, : 204 (2017).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914953
Köster, T.: Volkszählung in der Zelle - wer bindet RNA? Biologie in unserer Zeit. 47, 226-227 (2017).
PUB | DOI
 
[14]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911046
Foley, S.W., Gosai, S.J., Wang, D., Selamoglu, N., Sollitti, A.C., Köster, T., Steffen, A., Lyons, E., Daldal, F., Garcia, B.A., Staiger, D., Deal, R.B., Gregory, B.D.: A Global View of RNA-Protein Interactions Identifies Post-transcriptional Regulators of Root Hair Cell Fate. Developmental Cell. 41, 204-220.e5 (2017).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911065
Köster, T., Marondedze, C., Meyer, K., Staiger, D.: RNA-Binding Proteins Revisited – The Emerging Arabidopsis mRNA Interactome. Trends in Plant Science. 22, 512-526 (2017).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764695 OA
Meyer, K., Köster, T., Staiger, D.: Pre-mRNA Splicing in Plants: In Vivo Functions of RNA-Binding Proteins Implicated in the Splicing Process. Biomolecules. 5, 1717-1740 (2015).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629103
Köster, T., Staiger, D.: RNA-Binding Protein Immunoprecipitation from Whole-Cell Extracts. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1062, 679-695 (2014).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
Hackmann, C., Korneli, C., Kutyniok, M., Köster, T., Wiedenlübbert, M., Müller, C., Staiger, D.: Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity. Plant, Cell & Environment. 37, 696-706 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709993
Meyer, K., Köster, T., Staiger, D.: Unraveling post-transcriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation. Biotechnologia. Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology. 95, 43 (2014).
PUB | DOI
 
[8]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676604
Köster, T., Haas, M., Staiger, D.: The RIPper Case: Identification of RNA-Binding Protein Targets by RNA Immunoprecipitation. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1158, 107-121 (2014).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694724
Köster, T., Meyer, K., Weinholdt, C., Smith, L.M., Lummer, M., Speth, C., Grosse, I., Weigel, D., Staiger, D.: Regulation of pri-miRNA processing by the hnRNP-like protein AtGRP7 in Arabidopsis. Nucleic acids research. 42, 9925-9936 (2014).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709933
Meyer, K., Köster, T., Staiger, D.: Unraveling post-tramscriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation. BioTechnologia. 95, 43-43 (2014).
PUB
 
[5]
2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717324
Köster, T.: Funktion von Ribonukleoproteinkomplexen in der posttranskriptionellen Regulation und microRNA-Biogenese. Bielefeld (2014).
PUB
 
[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709991
Köster, T., Brown, J.W.S., Staiger, D.: Jenseits des Genoms – Alternatives Spleißen erhöht die Vielfalt des Transkriptoms. Naturwissenschaftliche Rundschau. 67, 566-571 (2014).
PUB
 
[3]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548847
Streitner, C., Köster, T., Simpson, C.G., Shaw, P., Danisman, S., Brown, J.W.S., Staiger, D.: An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with transcripts in Arabidopsis thaliana. Nucleic acids research. 40, 11240-11255 (2012).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003474
Staiger, D., Köster, T.: Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system. Cellular and Molecular Life Sciences. 68, 71-83 (2011).
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[1]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438856 OA
Staiger, D., Köster, T.: Timing is everything - Die Innere Uhr der Pflanzen. Labor & More. 5, 40-41 (2009).
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Lewinski, M., Bramkamp, Y., Köster, T., Staiger, D.: SEQing: web-based visualization of iCLIP and RNA-seq data in an interactive python framework. BMC bioinformatics. 21, : 113 (2020).
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Reichel, M., Köster, T., Staiger, D.: Marking RNA: m6A writers, readers and functions in Arabidopsis. Journal of molecular cell biology. 11, 899-910 (2019).
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[20]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934855
Lewinski, M., Köster, T.: Systems Approaches to Map In Vivo RNA–Protein Interactions in Arabidopsis thaliana. In: Rajewsky, N., Jurga, S., and Barciszewski, J. (eds.) Systems Biology. RNA Technologies. p. 77-95. Springer International Publishing, Cham (2018).
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[19]
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Johansson, M., Köster, T.: On the move through time - a historical review of plant clock research. Plant Biology. 21, 13-20 (2018).
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[18]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919455
Köster, T.: miRNAs - der Hacker-Angriff der Parasiten. Biologie in unserer Zeit. 48, 87-88 (2018).
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[17]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918314
Köster, T., Meyer, K.: Plant Ribonomics: Proteins in Search of RNA Partners. Trends in Plant Science. 23, 352-365 (2018).
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914954 OA
Meyer, K., Köster, T., Nolte, C., Weinholdt, C., Lewinski, M., Grosse, I., Staiger, D.: Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7. Genome Biology. 18, : 204 (2017).
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914953
Köster, T.: Volkszählung in der Zelle - wer bindet RNA? Biologie in unserer Zeit. 47, 226-227 (2017).
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Foley, S.W., Gosai, S.J., Wang, D., Selamoglu, N., Sollitti, A.C., Köster, T., Steffen, A., Lyons, E., Daldal, F., Garcia, B.A., Staiger, D., Deal, R.B., Gregory, B.D.: A Global View of RNA-Protein Interactions Identifies Post-transcriptional Regulators of Root Hair Cell Fate. Developmental Cell. 41, 204-220.e5 (2017).
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911065
Köster, T., Marondedze, C., Meyer, K., Staiger, D.: RNA-Binding Proteins Revisited – The Emerging Arabidopsis mRNA Interactome. Trends in Plant Science. 22, 512-526 (2017).
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764695 OA
Meyer, K., Köster, T., Staiger, D.: Pre-mRNA Splicing in Plants: In Vivo Functions of RNA-Binding Proteins Implicated in the Splicing Process. Biomolecules. 5, 1717-1740 (2015).
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629103
Köster, T., Staiger, D.: RNA-Binding Protein Immunoprecipitation from Whole-Cell Extracts. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1062, 679-695 (2014).
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[10]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
Hackmann, C., Korneli, C., Kutyniok, M., Köster, T., Wiedenlübbert, M., Müller, C., Staiger, D.: Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity. Plant, Cell & Environment. 37, 696-706 (2014).
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709993
Meyer, K., Köster, T., Staiger, D.: Unraveling post-transcriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation. Biotechnologia. Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology. 95, 43 (2014).
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676604
Köster, T., Haas, M., Staiger, D.: The RIPper Case: Identification of RNA-Binding Protein Targets by RNA Immunoprecipitation. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1158, 107-121 (2014).
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Köster, T., Meyer, K., Weinholdt, C., Smith, L.M., Lummer, M., Speth, C., Grosse, I., Weigel, D., Staiger, D.: Regulation of pri-miRNA processing by the hnRNP-like protein AtGRP7 in Arabidopsis. Nucleic acids research. 42, 9925-9936 (2014).
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709933
Meyer, K., Köster, T., Staiger, D.: Unraveling post-tramscriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation. BioTechnologia. 95, 43-43 (2014).
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2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717324
Köster, T.: Funktion von Ribonukleoproteinkomplexen in der posttranskriptionellen Regulation und microRNA-Biogenese. Bielefeld (2014).
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709991
Köster, T., Brown, J.W.S., Staiger, D.: Jenseits des Genoms – Alternatives Spleißen erhöht die Vielfalt des Transkriptoms. Naturwissenschaftliche Rundschau. 67, 566-571 (2014).
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548847
Streitner, C., Köster, T., Simpson, C.G., Shaw, P., Danisman, S., Brown, J.W.S., Staiger, D.: An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with transcripts in Arabidopsis thaliana. Nucleic acids research. 40, 11240-11255 (2012).
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003474
Staiger, D., Köster, T.: Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system. Cellular and Molecular Life Sciences. 68, 71-83 (2011).
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[1]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438856 OA
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