Tino Köster

tino.koester@uni-bielefeld.de
ORCID logo https://orcid.org/0000-0003-3984-9813

PEVZ-ID
13028045

34 Publikationen

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  • [34]
    2024 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2988228
    Agrofoglio, Y. C., Iglesias, M. J., Perez-Santangelo, S., de Leone, M. J., Köster, T., Catala, R., Salinas, J., et al. (2024). Arginine methylation of SM-LIKE PROTEIN 4 antagonistically affects alternative splicing during Arabidopsis stress responses. Plant Cell, koae051. https://doi.org/10.1093/plcell/koae051
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [33]
    2024 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2986985
    Lewinski, M., Brüggemann, M., Köster, T., Reichel, M., Bergelt, T., Meyer, K., König, J., et al. (2024). Mapping protein-RNA binding in plants with individual-nucleotide-resolution UV cross-linking and immunoprecipitation (plant iCLIP2). Nature Protocols. https://doi.org/10.1038/s41596-023-00935-3
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [32]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2978193
    Köster, T., & Sitte, A. (2023). Plant iCLIP — auf Spurensuche im Transkriptom der Pflanze. BIOspektrum, 29(2), 174-176. https://doi.org/10.1007/s12268-023-1871-5
    PUB | DOI
     
  • [31]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2985598
    Lewinski, M., Steffen, A., Kachariya, N., Elgner, M., Schmal, C., Messini, N., Köster, T., et al. (2023). Arabidopsis thaliana GLYCINE RICH RNA-BINDING PROTEIN 7 interaction with its iCLIP target LHCB1.1 correlates with changes in RNA stability and circadian oscillation. Plant Journal. https://doi.org/10.1111/tpj.16601
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [30]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965202 OA
    Lüders, J., Winkel, A., Reichel, M., Bitterer, V., Scheibe, M., Widmann, C., Butter, F., et al. (2022). Identification of Pri-miRNA Stem-Loop Interacting Proteins in Plants Using a Modified Version of the Csy4 CRISPR Endonuclease. International Journal of Molecular Sciences, 23(16), 8961. https://doi.org/10.3390/ijms23168961
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [29]
    2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2964517
    Zhang, R., Kuo, R., Coulter, M., Calixto, C. P. G., Entizne, J. C., Guo, W., Marquez, Y., et al. (2022). A high-resolution single-molecule sequencing-based Arabidopsis transcriptome using novel methods of Iso-seq analysis. Genome biology, 23(1), 149. https://doi.org/10.1186/s13059-022-02711-0
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [28]
    2021 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2954082
    Arribas-Hernandez, L., Rennie, S., Köster, T., Schon, M., Porcelli, C., Lewinski, M., Enugutti, B., et al. (2021). Principles of mRNA targeting and regulation via the Arabidopsis m6A-binding proteins ECT2 and ECT3. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2021.04.18.440342
    PUB | DOI | Preprint
     
  • [27]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2959415
    Arribas-Hernández, L., Rennie, S., Köster, T., Porcelli, C., Lewinski, M., Staiger, D., Andersson, R., et al. (2021). Principles of mRNA targeting via the Arabidopsis m6A-binding protein ECT2. eLife, 10, e72375. https://doi.org/10.7554/eLife.72375
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [26]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2952670
    Hafner, M., Katsantoni, M., Köster, T., Marks, J., Mukherjee, J., Staiger, D., Ule, J., et al. (2021). CLIP and complementary methods. Nature Reviews Methods Primers, 1(1), 20. https://doi.org/10.1038/s43586-021-00018-1
    PUB | DOI | WoS
     
  • [25]
    2021 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2948744
    Köster, T., & Staiger, D. (2021). RNA-Binding Protein Immunoprecipitation and High-Throughput Sequencing. In J. J. Sanchez-Serrano & J. Salinas (Eds.), Methods in molecular biology : Vol. 2200. Arabidopsis Protocols (pp. 453-461). New York: Humana. doi:10.1007/978-1-0716-0880-7_23
    PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
     
  • [24]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942001 OA
    Lewinski, M., Bramkamp, Y., Köster, T., & Staiger, D. (2020). SEQing: web-based visualization of iCLIP and RNA-seq data in an interactive python framework. BMC bioinformatics, 21(1), 113. https://doi.org/10.1186/s12859-020-3434-9
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [23]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2945219
    Köster, T., & Staiger, D. (2020). Plant Individual Nucleotide Resolution Cross-Linking and Immunoprecipitation to Characterize RNA-Protein Complexes. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 2166, 255-267. doi:10.1007/978-1-0716-0712-1_15
    PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
     
  • [22]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2937585
    Köster, T., Reichel, M., & Staiger, D. (2019). CLIP and RNA interactome studies to unravel genome-wide RNA-protein interactions in vivo in Arabidopsis thaliana. Methods (San Diego, Calif.). doi:10.1016/j.ymeth.2019.09.005
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [21]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2936720
    Reichel, M., Köster, T., & Staiger, D. (2019). Marking RNA: m6A writers, readers and functions in Arabidopsis. Journal of molecular cell biology, 11(10), 899-910. doi:10.1093/jmcb/mjz085
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [20]
    2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934855
    Lewinski, M., & Köster, T. (2018). Systems Approaches to Map In Vivo RNA–Protein Interactions in Arabidopsis thaliana. In N. Rajewsky, S. Jurga, & J. Barciszewski (Eds.), RNA Technologies. Systems Biology (pp. 77-95). Cham: Springer International Publishing. https://doi.org/10.1007/978-3-319-92967-5_5
    PUB | DOI
     
  • [19]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919118
    Johansson, M., & Köster, T. (2018). On the move through time - a historical review of plant clock research. Plant Biology, 21(S1), 13-20. doi:10.1111/plb.12729
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [18]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919455
    Köster, T. (2018). miRNAs - der Hacker-Angriff der Parasiten. Biologie in unserer Zeit, 48(2), 87-88. doi:10.1002/biuz.201870205
    PUB | DOI
     
  • [17]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918314
    Köster, T., & Meyer, K. (2018). Plant Ribonomics: Proteins in Search of RNA Partners. Trends in Plant Science, 23(4), 352-365. doi:10.1016/j.tplants.2018.01.004
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [16]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914954 OA
    Meyer, K., Köster, T., Nolte, C., Weinholdt, C., Lewinski, M., Grosse, I., & Staiger, D. (2017). Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7. Genome Biology, 18(1), 204. https://doi.org/10.1186/s13059-017-1332-x
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [15]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914953
    Köster, T. (2017). Volkszählung in der Zelle - wer bindet RNA? Biologie in unserer Zeit, 47(4), 226-227. doi:10.1002/biuz.201770413
    PUB | DOI
     
  • [14]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911065
    Köster, T., Marondedze, C., Meyer, K., & Staiger, D. (2017). RNA-Binding Proteins Revisited – The Emerging Arabidopsis mRNA Interactome. Trends in Plant Science, 22(6), 512-526. doi:10.1016/j.tplants.2017.03.009
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [13]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911046
    Foley, S. W., Gosai, S. J., Wang, D., Selamoglu, N., Sollitti, A. C., Köster, T., Steffen, A., et al. (2017). A Global View of RNA-Protein Interactions Identifies Post-transcriptional Regulators of Root Hair Cell Fate. Developmental Cell, 41(2), 204-220.e5. doi:10.1016/j.devcel.2017.03.018
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [12]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764695 OA
    Meyer, K., Köster, T., & Staiger, D. (2015). Pre-mRNA Splicing in Plants: In Vivo Functions of RNA-Binding Proteins Implicated in the Splicing Process. Biomolecules, 5(3), 1717-1740. doi:10.3390/biom5031717
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [11]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629103
    Köster, T., & Staiger, D. (2014). RNA-Binding Protein Immunoprecipitation from Whole-Cell Extracts. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1062, 679-695. doi:10.1007/978-1-62703-580-4_35
    PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
     
  • [10]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
    Hackmann, C., Korneli, C., Kutyniok, M., Köster, T., Wiedenlübbert, M., Müller, C., & Staiger, D. (2014). Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity. Plant, Cell & Environment, 37(3), 696-706. doi:10.1111/pce.12188
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [9]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709993
    Meyer, K., Köster, T., & Staiger, D. (2014). Unraveling post-transcriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation. Biotechnologia. Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology, 95(1), 43. doi:10.5114/bta.2014.46410
    PUB | DOI
     
  • [8]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694724
    Köster, T., Meyer, K., Weinholdt, C., Smith, L. M., Lummer, M., Speth, C., Grosse, I., et al. (2014). Regulation of pri-miRNA processing by the hnRNP-like protein AtGRP7 in Arabidopsis. Nucleic acids research, 42(15), 9925-9936. doi:10.1093/nar/gku716
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [7]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676604
    Köster, T., Haas, M., & Staiger, D. (2014). The RIPper Case: Identification of RNA-Binding Protein Targets by RNA Immunoprecipitation. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1158, 107-121. doi:10.1007/978-1-4939-0700-7_7
    PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
     
  • [6]
    2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709933
    Meyer, K., Köster, T., & Staiger, D. (2014). Unraveling post-tramscriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation. BioTechnologia, 95(1), 43-43.
    PUB
     
  • [5]
    2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717324
    Köster, T. (2014). Funktion von Ribonukleoproteinkomplexen in der posttranskriptionellen Regulation und microRNA-Biogenese. Bielefeld.
    PUB
     
  • [4]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709991
    Köster, T., Brown, J. W. S., & Staiger, D. (2014). Jenseits des Genoms – Alternatives Spleißen erhöht die Vielfalt des Transkriptoms. Naturwissenschaftliche Rundschau, 67(11), 566-571.
    PUB
     
  • [3]
    2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548847
    Streitner, C., Köster, T., Simpson, C. G., Shaw, P., Danisman, S., Brown, J. W. S., & Staiger, D. (2012). An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with transcripts in Arabidopsis thaliana. Nucleic acids research, 40(22), 11240-11255. doi:10.1093/nar/gks873
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [2]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003474
    Staiger, D., & Köster, T. (2011). Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system. Cellular and Molecular Life Sciences, 68(1), 71-83. https://doi.org/10.1007/s00018-010-0513-5
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [1]
    2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438856 OA
    Staiger, D., & Köster, T. (2009). Timing is everything - Die Innere Uhr der Pflanzen. Labor & More, 5, 40-41.
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