23 Publikationen

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[23]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942001 OA
Lewinski, M.; Bramkamp, Y.; Köster, T.; Staiger, D. (2020): SEQing: web-based visualization of iCLIP and RNA-seq data in an interactive python framework. BMC bioinformatics,21:(1):113
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[22]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2937585
Köster, T.; Reichel, M.; Staiger, D. (2019): CLIP and RNA interactome studies to unravel genome-wide RNA-protein interactions in vivo in Arabidopsis thaliana. Methods (San Diego, Calif.)
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[21]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2936720
Reichel, M.; Köster, T.; Staiger, D. (2019): Marking RNA: m6A writers, readers and functions in Arabidopsis Journal of molecular cell biology,11:(10): 899-910.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[20]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934855
Lewinski, M.; Köster, T. (2018): Systems Approaches to Map In Vivo RNA–Protein Interactions in Arabidopsis thaliana. In: Nikolaus Rajewsky; Stefan Jurga; Jan Barciszewski (Hrsg.): Systems Biology. Cham: Springer International Publishing. (RNA Technologies, ). S. 77-95.
PUB | DOI
 
[19]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919118
Johansson, M.; Köster, T. (2018): On the move through time - a historical review of plant clock research Plant Biology,21:(S1): 13-20.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919455
Köster, T. (2018): miRNAs - der Hacker-Angriff der Parasiten Biologie in unserer Zeit,48:(2): 87-88.
PUB | DOI
 
[17]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918314
Köster, T.; Meyer, K. (2018): Plant Ribonomics: Proteins in Search of RNA Partners Trends in Plant Science,23:(4): 352-365.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914954 OA
Meyer, K.; Köster, T.; Nolte, C.; Weinholdt, C.; Lewinski, M.; Grosse, I.; Staiger, D. (2017): Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7 Genome Biology,18:(1):204
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914953
Köster, T. (2017): Volkszählung in der Zelle - wer bindet RNA? Biologie in unserer Zeit,47:(4): 226-227.
PUB | DOI
 
[14]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911046
Foley, S. W.; Gosai, S. J.; Wang, D.; Selamoglu, N.; Sollitti, A. C.; Köster, T.; Steffen, A.; Lyons, E.; Daldal, F.; Garcia, B. A.; Staiger, D.; Deal, R. B.; Gregory, B. D. (2017): A Global View of RNA-Protein Interactions Identifies Post-transcriptional Regulators of Root Hair Cell Fate Developmental Cell,41:(2): 204-220.e5.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911065
Köster, T.; Marondedze, C.; Meyer, K.; Staiger, D. (2017): RNA-Binding Proteins Revisited – The Emerging Arabidopsis mRNA Interactome Trends in Plant Science,22:(6): 512-526.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764695 OA
Meyer, K.; Köster, T.; Staiger, D. (2015): Pre-mRNA Splicing in Plants: In Vivo Functions of RNA-Binding Proteins Implicated in the Splicing Process Biomolecules,5:(3): 1717-1740.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629103
Köster, T.; Staiger, D. (2014): RNA-Binding Protein Immunoprecipitation from Whole-Cell Extracts Methods in molecular biology (Clifton, N.J.),1062: 679-695.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
Hackmann, C.; Korneli, C.; Kutyniok, M.; Köster, T.; Wiedenlübbert, M.; Müller, C.; Staiger, D. (2014): Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity Plant, Cell & Environment,37:(3): 696-706.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709993
Meyer, K.; Köster, T.; Staiger, D. (2014): Unraveling post-transcriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation Biotechnologia. Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology,95:(1): 43.
PUB | DOI
 
[8]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676604
Köster, T.; Haas, M.; Staiger, D. (2014): The RIPper Case: Identification of RNA-Binding Protein Targets by RNA Immunoprecipitation Methods in molecular biology (Clifton, N.J.),1158: 107-121.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694724
Köster, T.; Meyer, K.; Weinholdt, C.; Smith, L. M.; Lummer, M.; Speth, C.; Grosse, I.; Weigel, D.; Staiger, D. (2014): Regulation of pri-miRNA processing by the hnRNP-like protein AtGRP7 in Arabidopsis Nucleic acids research,42:(15): 9925-9936.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709933
Meyer, K.; Köster, T.; Staiger, D. (2014): Unraveling post-tramscriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation BioTechnologia,95:(1): 43-43.
PUB
 
[5]
2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717324
Köster, T. (2014): Funktion von Ribonukleoproteinkomplexen in der posttranskriptionellen Regulation und microRNA-Biogenese. Bielefeld.
PUB
 
[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709991
Köster, T.; Brown, J. W. S.; Staiger, D. (2014): Jenseits des Genoms – Alternatives Spleißen erhöht die Vielfalt des Transkriptoms Naturwissenschaftliche Rundschau,67:(11): 566-571.
PUB
 
[3]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548847
Streitner, C.; Köster, T.; Simpson, C. G.; Shaw, P.; Danisman, S.; Brown, J. W. S.; Staiger, D. (2012): An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with transcripts in Arabidopsis thaliana Nucleic acids research,40:(22): 11240-11255.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003474
Staiger, D.; Köster, T. (2011): Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system Cellular and Molecular Life Sciences,68:(1): 71-83.
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[1]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438856 OA
Staiger, D.; Köster, T. (2009): Timing is everything - Die Innere Uhr der Pflanzen Labor & More,5: 40-41.
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Lewinski, M.; Bramkamp, Y.; Köster, T.; Staiger, D. (2020): SEQing: web-based visualization of iCLIP and RNA-seq data in an interactive python framework. BMC bioinformatics,21:(1):113
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[22]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2937585
Köster, T.; Reichel, M.; Staiger, D. (2019): CLIP and RNA interactome studies to unravel genome-wide RNA-protein interactions in vivo in Arabidopsis thaliana. Methods (San Diego, Calif.)
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2936720
Reichel, M.; Köster, T.; Staiger, D. (2019): Marking RNA: m6A writers, readers and functions in Arabidopsis Journal of molecular cell biology,11:(10): 899-910.
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[20]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934855
Lewinski, M.; Köster, T. (2018): Systems Approaches to Map In Vivo RNA–Protein Interactions in Arabidopsis thaliana. In: Nikolaus Rajewsky; Stefan Jurga; Jan Barciszewski (Hrsg.): Systems Biology. Cham: Springer International Publishing. (RNA Technologies, ). S. 77-95.
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[19]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919118
Johansson, M.; Köster, T. (2018): On the move through time - a historical review of plant clock research Plant Biology,21:(S1): 13-20.
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[18]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919455
Köster, T. (2018): miRNAs - der Hacker-Angriff der Parasiten Biologie in unserer Zeit,48:(2): 87-88.
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[17]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918314
Köster, T.; Meyer, K. (2018): Plant Ribonomics: Proteins in Search of RNA Partners Trends in Plant Science,23:(4): 352-365.
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[16]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914954 OA
Meyer, K.; Köster, T.; Nolte, C.; Weinholdt, C.; Lewinski, M.; Grosse, I.; Staiger, D. (2017): Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7 Genome Biology,18:(1):204
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[15]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914953
Köster, T. (2017): Volkszählung in der Zelle - wer bindet RNA? Biologie in unserer Zeit,47:(4): 226-227.
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[14]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911046
Foley, S. W.; Gosai, S. J.; Wang, D.; Selamoglu, N.; Sollitti, A. C.; Köster, T.; Steffen, A.; Lyons, E.; Daldal, F.; Garcia, B. A.; Staiger, D.; Deal, R. B.; Gregory, B. D. (2017): A Global View of RNA-Protein Interactions Identifies Post-transcriptional Regulators of Root Hair Cell Fate Developmental Cell,41:(2): 204-220.e5.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911065
Köster, T.; Marondedze, C.; Meyer, K.; Staiger, D. (2017): RNA-Binding Proteins Revisited – The Emerging Arabidopsis mRNA Interactome Trends in Plant Science,22:(6): 512-526.
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[12]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764695 OA
Meyer, K.; Köster, T.; Staiger, D. (2015): Pre-mRNA Splicing in Plants: In Vivo Functions of RNA-Binding Proteins Implicated in the Splicing Process Biomolecules,5:(3): 1717-1740.
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[11]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629103
Köster, T.; Staiger, D. (2014): RNA-Binding Protein Immunoprecipitation from Whole-Cell Extracts Methods in molecular biology (Clifton, N.J.),1062: 679-695.
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[10]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
Hackmann, C.; Korneli, C.; Kutyniok, M.; Köster, T.; Wiedenlübbert, M.; Müller, C.; Staiger, D. (2014): Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity Plant, Cell & Environment,37:(3): 696-706.
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[9]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709993
Meyer, K.; Köster, T.; Staiger, D. (2014): Unraveling post-transcriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation Biotechnologia. Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology,95:(1): 43.
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[8]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676604
Köster, T.; Haas, M.; Staiger, D. (2014): The RIPper Case: Identification of RNA-Binding Protein Targets by RNA Immunoprecipitation Methods in molecular biology (Clifton, N.J.),1158: 107-121.
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Köster, T.; Meyer, K.; Weinholdt, C.; Smith, L. M.; Lummer, M.; Speth, C.; Grosse, I.; Weigel, D.; Staiger, D. (2014): Regulation of pri-miRNA processing by the hnRNP-like protein AtGRP7 in Arabidopsis Nucleic acids research,42:(15): 9925-9936.
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709933
Meyer, K.; Köster, T.; Staiger, D. (2014): Unraveling post-tramscriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation BioTechnologia,95:(1): 43-43.
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[5]
2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717324
Köster, T. (2014): Funktion von Ribonukleoproteinkomplexen in der posttranskriptionellen Regulation und microRNA-Biogenese. Bielefeld.
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[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709991
Köster, T.; Brown, J. W. S.; Staiger, D. (2014): Jenseits des Genoms – Alternatives Spleißen erhöht die Vielfalt des Transkriptoms Naturwissenschaftliche Rundschau,67:(11): 566-571.
PUB
 
[3]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548847
Streitner, C.; Köster, T.; Simpson, C. G.; Shaw, P.; Danisman, S.; Brown, J. W. S.; Staiger, D. (2012): An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with transcripts in Arabidopsis thaliana Nucleic acids research,40:(22): 11240-11255.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003474
Staiger, D.; Köster, T. (2011): Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system Cellular and Molecular Life Sciences,68:(1): 71-83.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438856 OA
Staiger, D.; Köster, T. (2009): Timing is everything - Die Innere Uhr der Pflanzen Labor & More,5: 40-41.
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