23 Publikationen

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[23]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942001 OA
Lewinski, M., Bramkamp, Y., Köster, T. & Staiger, D. (2020). SEQing: web-based visualization of iCLIP and RNA-seq data in an interactive python framework. BMC bioinformatics, 21(1): 113. BMC. doi:10.1186/s12859-020-3434-9.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[22]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2937585
Köster, T., Reichel, M. & Staiger, D. (2019). CLIP and RNA interactome studies to unravel genome-wide RNA-protein interactions in vivo in Arabidopsis thaliana. Methods (San Diego, Calif.). Elsevier. doi:10.1016/j.ymeth.2019.09.005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[21]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2936720
Reichel, M., Köster, T. & Staiger, D. (2019). Marking RNA: m6A writers, readers and functions in Arabidopsis. Journal of molecular cell biology, 11(10), 899-910. Oxford University Press. doi:10.1093/jmcb/mjz085.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[20]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934855
Lewinski, M. & Köster, T. (2018). Systems Approaches to Map In Vivo RNA–Protein Interactions in Arabidopsis thaliana (RNA Technologies). In N. Rajewsky, S. Jurga & J. Barciszewski (Hrsg.), Systems Biology (S. 77-95). Cham: Springer International Publishing. doi:10.1007/978-3-319-92967-5_5.
PUB | DOI
 
[19]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919118
Johansson, M. & Köster, T. (2018). On the move through time - a historical review of plant clock research. Plant Biology, 21(S1), 13-20. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/plb.12729.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919455
Köster, T. (2018). miRNAs - der Hacker-Angriff der Parasiten. Biologie in unserer Zeit, 48(2), 87-88. Wiley. doi:10.1002/biuz.201870205.
PUB | DOI
 
[17]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918314
Köster, T. & Meyer, K. (2018). Plant Ribonomics: Proteins in Search of RNA Partners. Trends in Plant Science, 23(4), 352-365. Elsevier BV. doi:10.1016/j.tplants.2018.01.004.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914954 OA
Meyer, K., Köster, T., Nolte, C., Weinholdt, C., Lewinski, M., Grosse, I. & Staiger, D. (2017). Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7. Genome Biology, 18(1): 204. Springer Nature. doi:10.1186/s13059-017-1332-x.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914953
Köster, T. (2017). Volkszählung in der Zelle - wer bindet RNA? Biologie in unserer Zeit, 47(4), 226-227. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/biuz.201770413.
PUB | DOI
 
[14]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911046
Foley, S.W., Gosai, S.J., Wang, D., Selamoglu, N., Sollitti, A.C., Köster, T., Steffen, A., Lyons, E., Daldal, F., Garcia, B.A., Staiger, D., Deal, R.B. & Gregory, B.D. (2017). A Global View of RNA-Protein Interactions Identifies Post-transcriptional Regulators of Root Hair Cell Fate. Developmental Cell, 41(2), 204-220.e5. Elsevier. doi:10.1016/j.devcel.2017.03.018.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911065
Köster, T., Marondedze, C., Meyer, K. & Staiger, D. (2017). RNA-Binding Proteins Revisited – The Emerging Arabidopsis mRNA Interactome. Trends in Plant Science, 22(6), 512-526. Elsevier BV. doi:10.1016/j.tplants.2017.03.009.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764695 OA
Meyer, K., Köster, T. & Staiger, D. (2015). Pre-mRNA Splicing in Plants: In Vivo Functions of RNA-Binding Proteins Implicated in the Splicing Process. Biomolecules, 5(3), 1717-1740. MDPI AG. doi:10.3390/biom5031717.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629103
Köster, T. & Staiger, D. (2014). RNA-Binding Protein Immunoprecipitation from Whole-Cell Extracts. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1062, 679-695. Totowa, NJ: Springer Science + Business Media. doi:10.1007/978-1-62703-580-4_35.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
Hackmann, C., Korneli, C., Kutyniok, M., Köster, T., Wiedenlübbert, M., Müller, C. & Staiger, D. (2014). Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity. Plant, Cell & Environment, 37(3), 696-706. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/pce.12188.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709993
Meyer, K., Köster, T. & Staiger, D. (2014). Unraveling post-transcriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation. Biotechnologia. Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology, 95(1), 43. Termedia Publishing House. doi:10.5114/bta.2014.46410.
PUB | DOI
 
[8]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676604
Köster, T., Haas, M. & Staiger, D. (2014). The RIPper Case: Identification of RNA-Binding Protein Targets by RNA Immunoprecipitation. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1158, 107-121. New York, NY: Springer Science + Business Media. doi:10.1007/978-1-4939-0700-7_7.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694724
Köster, T., Meyer, K., Weinholdt, C., Smith, L.M., Lummer, M., Speth, C., Grosse, I., Weigel, D. & Staiger, D. (2014). Regulation of pri-miRNA processing by the hnRNP-like protein AtGRP7 in Arabidopsis. Nucleic acids research, 42(15), 9925-9936. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gku716.
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[6]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709933
Meyer, K., Köster, T. & Staiger, D. (2014). Unraveling post-tramscriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation (BioTechnologia), 95(1), 43-43. Gehalten auf der Post-transcriptional Gene Expression Regulation in Plants.
PUB
 
[5]
2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717324
Köster, T. (2014). Funktion von Ribonukleoproteinkomplexen in der posttranskriptionellen Regulation und microRNA-Biogenese. Bielefeld.
PUB
 
[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709991
Köster, T., Brown, J.W.S. & Staiger, D. (2014). Jenseits des Genoms – Alternatives Spleißen erhöht die Vielfalt des Transkriptoms. Naturwissenschaftliche Rundschau, 67(11), 566-571. Wiss. Verl.-Ges.
PUB
 
[3]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548847
Streitner, C., Köster, T., Simpson, C.G., Shaw, P., Danisman, S., Brown, J.W.S. & Staiger, D. (2012). An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with transcripts in Arabidopsis thaliana. Nucleic acids research, 40(22), 11240-11255. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gks873.
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[2]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003474
Staiger, D. & Köster, T. (2011). Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system. Cellular and Molecular Life Sciences, 68(1), 71-83. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s00018-010-0513-5.
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[1]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438856 OA
Staiger, D. & Köster, T. (2009). Timing is everything - Die Innere Uhr der Pflanzen. Labor & More, 5, 40-41. Succidia Verl. & Kommunikation.
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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942001 OA
Lewinski, M., Bramkamp, Y., Köster, T. & Staiger, D. (2020). SEQing: web-based visualization of iCLIP and RNA-seq data in an interactive python framework. BMC bioinformatics, 21(1): 113. BMC. doi:10.1186/s12859-020-3434-9.
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[22]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2937585
Köster, T., Reichel, M. & Staiger, D. (2019). CLIP and RNA interactome studies to unravel genome-wide RNA-protein interactions in vivo in Arabidopsis thaliana. Methods (San Diego, Calif.). Elsevier. doi:10.1016/j.ymeth.2019.09.005.
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[21]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2936720
Reichel, M., Köster, T. & Staiger, D. (2019). Marking RNA: m6A writers, readers and functions in Arabidopsis. Journal of molecular cell biology, 11(10), 899-910. Oxford University Press. doi:10.1093/jmcb/mjz085.
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[20]
2018 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934855
Lewinski, M. & Köster, T. (2018). Systems Approaches to Map In Vivo RNA–Protein Interactions in Arabidopsis thaliana (RNA Technologies). In N. Rajewsky, S. Jurga & J. Barciszewski (Hrsg.), Systems Biology (S. 77-95). Cham: Springer International Publishing. doi:10.1007/978-3-319-92967-5_5.
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[19]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919118
Johansson, M. & Köster, T. (2018). On the move through time - a historical review of plant clock research. Plant Biology, 21(S1), 13-20. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/plb.12729.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919455
Köster, T. (2018). miRNAs - der Hacker-Angriff der Parasiten. Biologie in unserer Zeit, 48(2), 87-88. Wiley. doi:10.1002/biuz.201870205.
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[17]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918314
Köster, T. & Meyer, K. (2018). Plant Ribonomics: Proteins in Search of RNA Partners. Trends in Plant Science, 23(4), 352-365. Elsevier BV. doi:10.1016/j.tplants.2018.01.004.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914954 OA
Meyer, K., Köster, T., Nolte, C., Weinholdt, C., Lewinski, M., Grosse, I. & Staiger, D. (2017). Adaptation of iCLIP to plants determines the binding landscape of the clock-regulated RNA-binding protein AtGRP7. Genome Biology, 18(1): 204. Springer Nature. doi:10.1186/s13059-017-1332-x.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914953
Köster, T. (2017). Volkszählung in der Zelle - wer bindet RNA? Biologie in unserer Zeit, 47(4), 226-227. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/biuz.201770413.
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[14]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911046
Foley, S.W., Gosai, S.J., Wang, D., Selamoglu, N., Sollitti, A.C., Köster, T., Steffen, A., Lyons, E., Daldal, F., Garcia, B.A., Staiger, D., Deal, R.B. & Gregory, B.D. (2017). A Global View of RNA-Protein Interactions Identifies Post-transcriptional Regulators of Root Hair Cell Fate. Developmental Cell, 41(2), 204-220.e5. Elsevier. doi:10.1016/j.devcel.2017.03.018.
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[13]
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911065
Köster, T., Marondedze, C., Meyer, K. & Staiger, D. (2017). RNA-Binding Proteins Revisited – The Emerging Arabidopsis mRNA Interactome. Trends in Plant Science, 22(6), 512-526. Elsevier BV. doi:10.1016/j.tplants.2017.03.009.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764695 OA
Meyer, K., Köster, T. & Staiger, D. (2015). Pre-mRNA Splicing in Plants: In Vivo Functions of RNA-Binding Proteins Implicated in the Splicing Process. Biomolecules, 5(3), 1717-1740. MDPI AG. doi:10.3390/biom5031717.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629103
Köster, T. & Staiger, D. (2014). RNA-Binding Protein Immunoprecipitation from Whole-Cell Extracts. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1062, 679-695. Totowa, NJ: Springer Science + Business Media. doi:10.1007/978-1-62703-580-4_35.
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[10]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2631517
Hackmann, C., Korneli, C., Kutyniok, M., Köster, T., Wiedenlübbert, M., Müller, C. & Staiger, D. (2014). Salicylic acid-dependent and -independent impact of an RNA-binding protein on plant immunity. Plant, Cell & Environment, 37(3), 696-706. Wiley-Blackwell. doi:10.1111/pce.12188.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709993
Meyer, K., Köster, T. & Staiger, D. (2014). Unraveling post-transcriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation. Biotechnologia. Journal of Biotechnology, Computational Biology and Bionanotechnology, 95(1), 43. Termedia Publishing House. doi:10.5114/bta.2014.46410.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2676604
Köster, T., Haas, M. & Staiger, D. (2014). The RIPper Case: Identification of RNA-Binding Protein Targets by RNA Immunoprecipitation. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), 1158, 107-121. New York, NY: Springer Science + Business Media. doi:10.1007/978-1-4939-0700-7_7.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2694724
Köster, T., Meyer, K., Weinholdt, C., Smith, L.M., Lummer, M., Speth, C., Grosse, I., Weigel, D. & Staiger, D. (2014). Regulation of pri-miRNA processing by the hnRNP-like protein AtGRP7 in Arabidopsis. Nucleic acids research, 42(15), 9925-9936. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gku716.
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[6]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709933
Meyer, K., Köster, T. & Staiger, D. (2014). Unraveling post-tramscriptional networks: Analysis of RNA-protein interactions with RNA immunoprecipitation (BioTechnologia), 95(1), 43-43. Gehalten auf der Post-transcriptional Gene Expression Regulation in Plants.
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[5]
2014 | Dissertation | PUB-ID: 2717324
Köster, T. (2014). Funktion von Ribonukleoproteinkomplexen in der posttranskriptionellen Regulation und microRNA-Biogenese. Bielefeld.
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[4]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709991
Köster, T., Brown, J.W.S. & Staiger, D. (2014). Jenseits des Genoms – Alternatives Spleißen erhöht die Vielfalt des Transkriptoms. Naturwissenschaftliche Rundschau, 67(11), 566-571. Wiss. Verl.-Ges.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2548847
Streitner, C., Köster, T., Simpson, C.G., Shaw, P., Danisman, S., Brown, J.W.S. & Staiger, D. (2012). An hnRNP-like RNA-binding protein affects alternative splicing by in vivo interaction with transcripts in Arabidopsis thaliana. Nucleic acids research, 40(22), 11240-11255. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gks873.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2003474
Staiger, D. & Köster, T. (2011). Spotlight on post-transcriptional control in the circadian system. Cellular and Molecular Life Sciences, 68(1), 71-83. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s00018-010-0513-5.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2438856 OA
Staiger, D. & Köster, T. (2009). Timing is everything - Die Innere Uhr der Pflanzen. Labor & More, 5, 40-41. Succidia Verl. & Kommunikation.
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