PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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• [20]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539

  Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana
  Alves jun. L, Niemeier S, Hauenschild A, Rehmsmeier M, Merkle T (2009)
  Nucleic Acids Research 37(12): 4010-4021.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [19]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374

  mkESA: enhanced suffix array construction tool
  Homann R, Fleer D, Giegerich R, Rehmsmeier M (2009)
  Bioinformatics 25(8): 1084-1085.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [18]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720

  A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis
  Siegel G, Obernosterer G, Fiore R, Oehmen M, Bicker S, Christensen M, Khudayberdiev S, Leuschner PF, Busch CJL, Kane C, Huebel K, et al. (2009)
  NATURE CELL BIOLOGY 11(6): 705-716.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [17]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467

  RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible
  Krüger J, Rehmsmeier M (2006)
  Nucleic Acids Research 34(Web Server): W451-W454.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [16]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878

  RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible
  Krüger J, Rehmsmeier M (2006)
  Nucleic Acids Research 34(Web Server): W451-W454.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [15]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421

  RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes
  Steffen P, Voss B, Rehmsmeier M, Reeder J, Giegerich R (2006)
  Bioinformatics 22(4): 500-503.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [14]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637

  Complete probabilistic analysis of RNA shapes
  Voß B, Giegerich R, Rehmsmeier M (2006)
  BMC Biology 4(1): 5.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [13]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916

  jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements
  Fiedler T, Rehmsmeier M (2006)
  Nucleic Acids Research 34(Web Server): W546-W550.

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• [12]
  

  2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807

  Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics
  Reeder J, Höchsmann M, Rehmsmeier M, Voss B, Giegerich R (2006)
  In: Journal of Biotechnology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 124(1). ELSEVIER SCIENCE BV: 41-55.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [11]
  

  2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383

  Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods
  Alam I, Dress A, Rehmsmeier M, Fuellen G (2004)
  PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 101(38): 13814-13819.

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• [10]
  

  2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377

  Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes
  Rehmsmeier M, Steffen P, Höchsmann M, Giegerich R (2004)
  RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 10(10): 1507-1517.

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• [9]
  

  2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393

  Abstract shapes of RNA
  Giegerich R, Voss B, Rehmsmeier M (2004)
  Nucleic Acids Research 32(16): 4843-4851.

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• [8]
  

  2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512

  Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster
  Ringrose L, Rehmsmeier M, Dura J-M, Paro R (2003)
  Developmental Cell 5: 759-771.

  PUB
   
• [7]
  

  2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578

  A novel approach to remote homology detection: jumping alignments
  Spang R, Rehmsmeier M, Stoye J (2002)
  Journal of Computational Biology 9(5): 747-760.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [6]
  

  2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553

  Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins
  Müller T, Rahmann S, Rehmsmeier M (2001)
  In: Bioinformatics. Bioinformatics, 17(Suppl. 1). Oxford University Press: S182-189.

  PUB | DOI
   
• [5]
  

  2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442

  Phylogenetic Information Improves Homology Detection
  Rehmsmeier M, Vingron MV (2001)
  Proteins: Structure, Function, and Genetics 45: 360-371.

  PUB
   
• [4]
  

  1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439

  Phylogeny meets sequence search
  Rehmsmeier M, Vingron M (1999)
  In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. 66-72.

  PUB
   
• [3]
  

  1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431

  WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set
  Krause A, Nicodeme P, Bornberg-Bauer EB-B, Rehmsmeier M, Vingron M (1999)
  Bioinformatics 15: 262-263.

  PUB
   
• [2]
  

  1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682

  Prediction and visualization of structural switches in RNA
  Giegerich R, Haase D, Rehmsmeier M (1999)
  Pac Symp Biocomput: 126-137.

  PUB | PubMed | Europe PMC
   
• [1]
  

  1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670

  Automatic clustering of large sequence databases
  Krause A, Nicodeme P, Rehmsmeier M, Vingron M (1998)
  In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.

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