Marc Rehmsmeier

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11601931

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[20]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
Alves jun., L., Niemeier, S., Hauenschild, A., Rehmsmeier, M., and Merkle, T. (2009). Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research 37, 4010-4021.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R., Fleer, D., Giegerich, R., and Rehmsmeier, M. (2009). mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics 25, 1084-1085.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G., Obernosterer, G., Fiore, R., Oehmen, M., Bicker, S., Christensen, M., Khudayberdiev, S., Leuschner, P. F., Busch, C. J. L., Kane, C., et al. (2009). A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY 11, 705-716.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J., and Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research 34, W451-W454.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J., and Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research 34, W451-W454.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J., and Giegerich, R. (2006). RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics 22, 500-503.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B., Giegerich, R., and Rehmsmeier, M. (2006). Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology 4:5.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T., and Rehmsmeier, M. (2006). jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research 34, W546-W550.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J., Höchsmann, M., Rehmsmeier, M., Voss, B., and Giegerich, R. (2006). “Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics” in Journal of Biotechnology JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, vol. 124, (ELSEVIER SCIENCE BV), 41-55.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I., Dress, A., Rehmsmeier, M., and Fuellen, G. (2004). Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 101, 13814-13819.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M., and Giegerich, R. (2004). Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 10, 1507-1517.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R., Voss, B., and Rehmsmeier, M. (2004). Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research 32, 4843-4851.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L., Rehmsmeier, M., Dura, J. - M., and Paro, R. (2003). Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell 5, 759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R., Rehmsmeier, M., and Stoye, J. (2002). A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology 9, 747-760.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T., Rahmann, S., and Rehmsmeier, M. (2001). “Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins” in Bioinformatics Bioinformatics, vol. 17, (Oxford University Press), S182-189.
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M., and Vingron, M. V. (2001). Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics 45, 360-371.
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M., and Vingron, M. (1999). “Phylogeny meets sequence search” in Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB 66-72.
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A., Nicodeme, P., Bornberg-Bauer, E. B. - B., Rehmsmeier, M., and Vingron, M. (1999). WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics 15, 262-263.
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R., Haase, D., and Rehmsmeier, M. (1999). Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput, 126-137.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A., Nicodeme, P., Rehmsmeier, M., and Vingron, M. (1998). “Automatic clustering of large sequence databases” in Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.
PUB
 
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
Alves jun., L., Niemeier, S., Hauenschild, A., Rehmsmeier, M., and Merkle, T. (2009). Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research 37, 4010-4021.
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[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R., Fleer, D., Giegerich, R., and Rehmsmeier, M. (2009). mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics 25, 1084-1085.
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[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G., Obernosterer, G., Fiore, R., Oehmen, M., Bicker, S., Christensen, M., Khudayberdiev, S., Leuschner, P. F., Busch, C. J. L., Kane, C., et al. (2009). A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY 11, 705-716.
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[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J., and Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research 34, W451-W454.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J., and Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research 34, W451-W454.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J., and Giegerich, R. (2006). RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics 22, 500-503.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B., Giegerich, R., and Rehmsmeier, M. (2006). Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology 4:5.
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[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T., and Rehmsmeier, M. (2006). jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research 34, W546-W550.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J., Höchsmann, M., Rehmsmeier, M., Voss, B., and Giegerich, R. (2006). “Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics” in Journal of Biotechnology JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, vol. 124, (ELSEVIER SCIENCE BV), 41-55.
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[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I., Dress, A., Rehmsmeier, M., and Fuellen, G. (2004). Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 101, 13814-13819.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M., and Giegerich, R. (2004). Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 10, 1507-1517.
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[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R., Voss, B., and Rehmsmeier, M. (2004). Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research 32, 4843-4851.
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[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L., Rehmsmeier, M., Dura, J. - M., and Paro, R. (2003). Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell 5, 759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R., Rehmsmeier, M., and Stoye, J. (2002). A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology 9, 747-760.
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[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T., Rahmann, S., and Rehmsmeier, M. (2001). “Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins” in Bioinformatics Bioinformatics, vol. 17, (Oxford University Press), S182-189.
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M., and Vingron, M. V. (2001). Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics 45, 360-371.
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M., and Vingron, M. (1999). “Phylogeny meets sequence search” in Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB 66-72.
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A., Nicodeme, P., Bornberg-Bauer, E. B. - B., Rehmsmeier, M., and Vingron, M. (1999). WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics 15, 262-263.
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R., Haase, D., and Rehmsmeier, M. (1999). Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput, 126-137.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A., Nicodeme, P., Rehmsmeier, M., and Vingron, M. (1998). “Automatic clustering of large sequence databases” in Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.
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