Marc Rehmsmeier

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11601931

20 Publikationen

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[20]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
Alves jun., L., et al., 2009. Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research, 37(12), p 4010-4021.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R., et al., 2009. mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics, 25(8), p 1084-1085.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G., et al., 2009. A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY, 11(6), p 705-716.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J., & Rehmsmeier, M., 2006. RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), p W451-W454.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J., & Rehmsmeier, M., 2006. RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), p W451-W454.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P., et al., 2006. RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics, 22(4), p 500-503.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B., Giegerich, R., & Rehmsmeier, M., 2006. Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology, 4(1): 5.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T., & Rehmsmeier, M., 2006. jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), p W546-W550.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J., et al., 2006. Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. In Journal of Biotechnology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. no.124 ELSEVIER SCIENCE BV, pp. 41-55.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I., et al., 2004. Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 101(38), p 13814-13819.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M., et al., 2004. Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY, 10(10), p 1507-1517.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R., Voss, B., & Rehmsmeier, M., 2004. Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research, 32(16), p 4843-4851.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L., et al., 2003. Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell, 5, p 759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R., Rehmsmeier, M., & Stoye, J., 2002. A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology, 9(5), p 747-760.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T., Rahmann, S., & Rehmsmeier, M., 2001. Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. In Bioinformatics. Bioinformatics. no.17 Oxford University Press, pp. S182-189.
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M., & Vingron, M.V., 2001. Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics, 45, p 360-371.
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M., & Vingron, M., 1999. Phylogeny meets sequence search. In Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. pp. 66-72.
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A., et al., 1999. WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics, 15, p 262-263.
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R., Haase, D., & Rehmsmeier, M., 1999. Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput, , p 126-137.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A., et al., 1998. Automatic clustering of large sequence databases. In Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.
PUB
 
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Alves jun., L., et al., 2009. Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research, 37(12), p 4010-4021.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R., et al., 2009. mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics, 25(8), p 1084-1085.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G., et al., 2009. A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY, 11(6), p 705-716.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J., & Rehmsmeier, M., 2006. RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), p W451-W454.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J., & Rehmsmeier, M., 2006. RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), p W451-W454.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P., et al., 2006. RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics, 22(4), p 500-503.
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[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B., Giegerich, R., & Rehmsmeier, M., 2006. Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology, 4(1): 5.
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[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T., & Rehmsmeier, M., 2006. jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), p W546-W550.
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J., et al., 2006. Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. In Journal of Biotechnology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. no.124 ELSEVIER SCIENCE BV, pp. 41-55.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I., et al., 2004. Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 101(38), p 13814-13819.
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[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M., et al., 2004. Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY, 10(10), p 1507-1517.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R., Voss, B., & Rehmsmeier, M., 2004. Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research, 32(16), p 4843-4851.
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[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L., et al., 2003. Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell, 5, p 759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R., Rehmsmeier, M., & Stoye, J., 2002. A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology, 9(5), p 747-760.
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[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T., Rahmann, S., & Rehmsmeier, M., 2001. Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. In Bioinformatics. Bioinformatics. no.17 Oxford University Press, pp. S182-189.
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[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M., & Vingron, M.V., 2001. Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics, 45, p 360-371.
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[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M., & Vingron, M., 1999. Phylogeny meets sequence search. In Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. pp. 66-72.
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[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A., et al., 1999. WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics, 15, p 262-263.
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[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R., Haase, D., & Rehmsmeier, M., 1999. Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput, , p 126-137.
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[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A., et al., 1998. Automatic clustering of large sequence databases. In Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.
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