Marc Rehmsmeier

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11601931

20 Publikationen

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[20]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
Alves jun., L., Niemeier, S., Hauenschild, A., Rehmsmeier, M., & Merkle, T. (2009). Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research, 37(12), 4010-4021. doi:10.1093/nar/gkp272
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R., Fleer, D., Giegerich, R., & Rehmsmeier, M. (2009). mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics, 25(8), 1084-1085. doi:10.1093/bioinformatics/btp112
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G., Obernosterer, G., Fiore, R., Oehmen, M., Bicker, S., Christensen, M., Khudayberdiev, S., et al. (2009). A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY, 11(6), 705-716. doi:10.1038/ncb1876
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J., & Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W451-W454. doi:10.1093/nar/gkl243
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J., & Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W451-W454. doi:10.1093/nar/gkl243
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[15]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J., & Giegerich, R. (2006). RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics, 22(4), 500-503. doi:10.1093/bioinformatics/btk010
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B., Giegerich, R., & Rehmsmeier, M. (2006). Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology, 4(1), 5. doi:10.1186/1741-7007-4-5
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T., & Rehmsmeier, M. (2006). jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W546-W550. doi:10.1093/nar/gkl250
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J., Höchsmann, M., Rehmsmeier, M., Voss, B., & Giegerich, R. (2006). Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. Journal of Biotechnology, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 124, 41-55. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2006.01.034
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I., Dress, A., Rehmsmeier, M., & Fuellen, G. (2004). Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 101(38), 13814-13819. doi:10.1073/pnas.0405612101
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M., & Giegerich, R. (2004). Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY, 10(10), 1507-1517. doi:10.1021/rna.5248604
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R., Voss, B., & Rehmsmeier, M. (2004). Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research, 32(16), 4843-4851. doi:10.1093/nar/gkh779
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L., Rehmsmeier, M., Dura, J. - M., & Paro, R. (2003). Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell, 5, 759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R., Rehmsmeier, M., & Stoye, J. (2002). A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology, 9(5), 747-760. doi:10.1089/106652702761034172
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T., Rahmann, S., & Rehmsmeier, M. (2001). Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. Bioinformatics, Bioinformatics, 17, S182-189. Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/17.suppl_1.S182
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M., & Vingron, M. V. (2001). Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics, 45, 360-371.
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M., & Vingron, M. (1999). Phylogeny meets sequence search. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB, 66-72
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A., Nicodeme, P., Bornberg-Bauer, E. B. - B., Rehmsmeier, M., & Vingron, M. (1999). WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics, 15, 262-263.
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R., Haase, D., & Rehmsmeier, M. (1999). Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput, 126-137.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A., Nicodeme, P., Rehmsmeier, M., & Vingron, M. (1998). Automatic clustering of large sequence databases. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB
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Alves jun., L., Niemeier, S., Hauenschild, A., Rehmsmeier, M., & Merkle, T. (2009). Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research, 37(12), 4010-4021. doi:10.1093/nar/gkp272
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[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R., Fleer, D., Giegerich, R., & Rehmsmeier, M. (2009). mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics, 25(8), 1084-1085. doi:10.1093/bioinformatics/btp112
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[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G., Obernosterer, G., Fiore, R., Oehmen, M., Bicker, S., Christensen, M., Khudayberdiev, S., et al. (2009). A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY, 11(6), 705-716. doi:10.1038/ncb1876
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[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J., & Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W451-W454. doi:10.1093/nar/gkl243
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[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J., & Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W451-W454. doi:10.1093/nar/gkl243
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J., & Giegerich, R. (2006). RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics, 22(4), 500-503. doi:10.1093/bioinformatics/btk010
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B., Giegerich, R., & Rehmsmeier, M. (2006). Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology, 4(1), 5. doi:10.1186/1741-7007-4-5
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T., & Rehmsmeier, M. (2006). jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W546-W550. doi:10.1093/nar/gkl250
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2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J., Höchsmann, M., Rehmsmeier, M., Voss, B., & Giegerich, R. (2006). Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. Journal of Biotechnology, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 124, 41-55. ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2006.01.034
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I., Dress, A., Rehmsmeier, M., & Fuellen, G. (2004). Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 101(38), 13814-13819. doi:10.1073/pnas.0405612101
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M., & Giegerich, R. (2004). Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY, 10(10), 1507-1517. doi:10.1021/rna.5248604
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R., Voss, B., & Rehmsmeier, M. (2004). Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research, 32(16), 4843-4851. doi:10.1093/nar/gkh779
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L., Rehmsmeier, M., Dura, J. - M., & Paro, R. (2003). Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell, 5, 759-771.
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[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R., Rehmsmeier, M., & Stoye, J. (2002). A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology, 9(5), 747-760. doi:10.1089/106652702761034172
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[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T., Rahmann, S., & Rehmsmeier, M. (2001). Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. Bioinformatics, Bioinformatics, 17, S182-189. Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/17.suppl_1.S182
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[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M., & Vingron, M. V. (2001). Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics, 45, 360-371.
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[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M., & Vingron, M. (1999). Phylogeny meets sequence search. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB, 66-72
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A., Nicodeme, P., Bornberg-Bauer, E. B. - B., Rehmsmeier, M., & Vingron, M. (1999). WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics, 15, 262-263.
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[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R., Haase, D., & Rehmsmeier, M. (1999). Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput, 126-137.
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A., Nicodeme, P., Rehmsmeier, M., & Vingron, M. (1998). Automatic clustering of large sequence databases. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB
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