20 Publikationen

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[20]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
L. Alves jun., S. Niemeier, A. Hauenschild, M. Rehmsmeier, and T. Merkle, “Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana”, Nucleic Acids Research, 2009, 37, 4010-4021.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
R. Homann, D. Fleer, R. Giegerich, and M. Rehmsmeier, “mkESA: enhanced suffix array construction tool”, Bioinformatics, 2009, 25, 1084-1085.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
G. Siegel, G. Obernosterer, R. Fiore, M. Oehmen, S. Bicker, M. Christensen, S. Khudayberdiev, P. F. Leuschner, C. J. L. Busch, C. Kane, et al., “A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis”, NATURE CELL BIOLOGY, 2009, 11, 705-716.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
J. Krüger, and M. Rehmsmeier, “RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible”, Nucleic Acids Research, 2006, 34, W451-W454.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
J. Krüger, and M. Rehmsmeier, “RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible”, Nucleic Acids Research, 2006, 34, W451-W454.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
P. Steffen, B. Voss, M. Rehmsmeier, J. Reeder, and R. Giegerich, “RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes”, Bioinformatics, 2006, 22, 500-503.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
B. Voß, R. Giegerich, and M. Rehmsmeier, “Complete probabilistic analysis of RNA shapes”, BMC Biology, 2006, 4, 5.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
T. Fiedler, and M. Rehmsmeier, “jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements”, Nucleic Acids Research, 2006, 34, W546-W550.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
J. Reeder, M. Höchsmann, M. Rehmsmeier, B. Voss, and R. Giegerich, “Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics”, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2006, 124, 41-55.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
I. Alam, A. Dress, M. Rehmsmeier, and G. Fuellen, “Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods”, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2004, 101, 13814-13819.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
M. Rehmsmeier, P. Steffen, M. Höchsmann, and R. Giegerich, “Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes”, RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY, 2004, 10, 1507-1517.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
R. Giegerich, B. Voss, and M. Rehmsmeier, “Abstract shapes of RNA”, Nucleic Acids Research, 2004, 32, 4843-4851.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
L. Ringrose, M. Rehmsmeier, J. - M. Dura, and R. Paro, “Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster”, Developmental Cell, 2003, 5, 759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
R. Spang, M. Rehmsmeier, and J. Stoye, “A novel approach to remote homology detection: jumping alignments”, Journal of Computational Biology, 2002, 9, 747-760.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
T. Müller, S. Rahmann, and M. Rehmsmeier, “Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins”, Bioinformatics, 2001, 17, S182-189.
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
M. Rehmsmeier, and M. V. Vingron, “Phylogenetic Information Improves Homology Detection”, Proteins: Structure, Function, and Genetics, 2001, 45, 360-371.
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
M. Rehmsmeier, and M. Vingron, in Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB, 1999, p. 66-72.
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
A. Krause, P. Nicodeme, E. B. - B. Bornberg-Bauer, M. Rehmsmeier, and M. Vingron, “WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set”, Bioinformatics, 1999, 15, 262-263.
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
R. Giegerich, D. Haase, and M. Rehmsmeier, “Prediction and visualization of structural switches in RNA”, Pac Symp Biocomput, 1999.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
A. Krause, P. Nicodeme, M. Rehmsmeier, and M. Vingron, in Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB, 1998.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
L. Alves jun., S. Niemeier, A. Hauenschild, M. Rehmsmeier, and T. Merkle, “Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana”, Nucleic Acids Research, 2009, 37, 4010-4021.
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[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
R. Homann, D. Fleer, R. Giegerich, and M. Rehmsmeier, “mkESA: enhanced suffix array construction tool”, Bioinformatics, 2009, 25, 1084-1085.
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[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
G. Siegel, G. Obernosterer, R. Fiore, M. Oehmen, S. Bicker, M. Christensen, S. Khudayberdiev, P. F. Leuschner, C. J. L. Busch, C. Kane, et al., “A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis”, NATURE CELL BIOLOGY, 2009, 11, 705-716.
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[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
J. Krüger, and M. Rehmsmeier, “RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible”, Nucleic Acids Research, 2006, 34, W451-W454.
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[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
J. Krüger, and M. Rehmsmeier, “RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible”, Nucleic Acids Research, 2006, 34, W451-W454.
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[15]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
P. Steffen, B. Voss, M. Rehmsmeier, J. Reeder, and R. Giegerich, “RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes”, Bioinformatics, 2006, 22, 500-503.
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[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
B. Voß, R. Giegerich, and M. Rehmsmeier, “Complete probabilistic analysis of RNA shapes”, BMC Biology, 2006, 4, 5.
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[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
T. Fiedler, and M. Rehmsmeier, “jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements”, Nucleic Acids Research, 2006, 34, W546-W550.
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[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
J. Reeder, M. Höchsmann, M. Rehmsmeier, B. Voss, and R. Giegerich, “Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics”, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2006, 124, 41-55.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
I. Alam, A. Dress, M. Rehmsmeier, and G. Fuellen, “Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods”, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2004, 101, 13814-13819.
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[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
M. Rehmsmeier, P. Steffen, M. Höchsmann, and R. Giegerich, “Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes”, RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY, 2004, 10, 1507-1517.
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[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
R. Giegerich, B. Voss, and M. Rehmsmeier, “Abstract shapes of RNA”, Nucleic Acids Research, 2004, 32, 4843-4851.
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[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
L. Ringrose, M. Rehmsmeier, J. - M. Dura, and R. Paro, “Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster”, Developmental Cell, 2003, 5, 759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
R. Spang, M. Rehmsmeier, and J. Stoye, “A novel approach to remote homology detection: jumping alignments”, Journal of Computational Biology, 2002, 9, 747-760.
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[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
T. Müller, S. Rahmann, and M. Rehmsmeier, “Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins”, Bioinformatics, 2001, 17, S182-189.
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[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
M. Rehmsmeier, and M. V. Vingron, “Phylogenetic Information Improves Homology Detection”, Proteins: Structure, Function, and Genetics, 2001, 45, 360-371.
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[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
M. Rehmsmeier, and M. Vingron, in Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB, 1999, p. 66-72.
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1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
A. Krause, P. Nicodeme, E. B. - B. Bornberg-Bauer, M. Rehmsmeier, and M. Vingron, “WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set”, Bioinformatics, 1999, 15, 262-263.
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
R. Giegerich, D. Haase, and M. Rehmsmeier, “Prediction and visualization of structural switches in RNA”, Pac Symp Biocomput, 1999.
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1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
A. Krause, P. Nicodeme, M. Rehmsmeier, and M. Vingron, in Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB, 1998.
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