Marc Rehmsmeier

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[20]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
Alves jun. L, Niemeier S, Hauenschild A, Rehmsmeier M, Merkle T. Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research. 2009;37(12):4010-4021.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann R, Fleer D, Giegerich R, Rehmsmeier M. mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics. 2009;25(8):1084-1085.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel G, Obernosterer G, Fiore R, et al. A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY. 2009;11(6):705-716.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger J, Rehmsmeier M. RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research. 2006;34(Web Server):W451-W454.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger J, Rehmsmeier M. RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research. 2006;34(Web Server):W451-W454.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen P, Voss B, Rehmsmeier M, Reeder J, Giegerich R. RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics. 2006;22(4):500-503.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß B, Giegerich R, Rehmsmeier M. Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology. 2006;4(1): 5.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler T, Rehmsmeier M. jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research. 2006;34(Web Server):W546-W550.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder J, Höchsmann M, Rehmsmeier M, Voss B, Giegerich R. Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. In: Journal of Biotechnology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. Vol 124. ELSEVIER SCIENCE BV; 2006: 41-55.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam I, Dress A, Rehmsmeier M, Fuellen G. Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 2004;101(38):13814-13819.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier M, Steffen P, Höchsmann M, Giegerich R. Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY. 2004;10(10):1507-1517.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich R, Voss B, Rehmsmeier M. Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research. 2004;32(16):4843-4851.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose L, Rehmsmeier M, Dura J-M, Paro R. Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell. 2003;5:759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang R, Rehmsmeier M, Stoye J. A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology. 2002;9(5):747-760.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller T, Rahmann S, Rehmsmeier M. Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. In: Bioinformatics. Bioinformatics. Vol 17. Oxford University Press; 2001: S182-189.
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier M, Vingron MV. Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics. 2001;45:360-371.
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier M, Vingron M. Phylogeny meets sequence search. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. 1999: 66-72.
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause A, Nicodeme P, Bornberg-Bauer EB-B, Rehmsmeier M, Vingron M. WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics. 1999;15:262-263.
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich R, Haase D, Rehmsmeier M. Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput. 1999:126-137.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause A, Nicodeme P, Rehmsmeier M, Vingron M. Automatic clustering of large sequence databases. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. 1998.
PUB
 
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
Alves jun. L, Niemeier S, Hauenschild A, Rehmsmeier M, Merkle T. Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research. 2009;37(12):4010-4021.
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[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann R, Fleer D, Giegerich R, Rehmsmeier M. mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics. 2009;25(8):1084-1085.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel G, Obernosterer G, Fiore R, et al. A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY. 2009;11(6):705-716.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger J, Rehmsmeier M. RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research. 2006;34(Web Server):W451-W454.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger J, Rehmsmeier M. RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research. 2006;34(Web Server):W451-W454.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen P, Voss B, Rehmsmeier M, Reeder J, Giegerich R. RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics. 2006;22(4):500-503.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß B, Giegerich R, Rehmsmeier M. Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology. 2006;4(1): 5.
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[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler T, Rehmsmeier M. jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research. 2006;34(Web Server):W546-W550.
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[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder J, Höchsmann M, Rehmsmeier M, Voss B, Giegerich R. Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. In: Journal of Biotechnology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. Vol 124. ELSEVIER SCIENCE BV; 2006: 41-55.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam I, Dress A, Rehmsmeier M, Fuellen G. Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 2004;101(38):13814-13819.
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[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier M, Steffen P, Höchsmann M, Giegerich R. Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY. 2004;10(10):1507-1517.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich R, Voss B, Rehmsmeier M. Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research. 2004;32(16):4843-4851.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose L, Rehmsmeier M, Dura J-M, Paro R. Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell. 2003;5:759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang R, Rehmsmeier M, Stoye J. A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology. 2002;9(5):747-760.
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[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller T, Rahmann S, Rehmsmeier M. Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. In: Bioinformatics. Bioinformatics. Vol 17. Oxford University Press; 2001: S182-189.
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier M, Vingron MV. Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics. 2001;45:360-371.
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier M, Vingron M. Phylogeny meets sequence search. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. 1999: 66-72.
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause A, Nicodeme P, Bornberg-Bauer EB-B, Rehmsmeier M, Vingron M. WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics. 1999;15:262-263.
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich R, Haase D, Rehmsmeier M. Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput. 1999:126-137.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause A, Nicodeme P, Rehmsmeier M, Vingron M. Automatic clustering of large sequence databases. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. 1998.
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