20 Publikationen

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[20]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
Alves jun., L.; Niemeier, S.; Hauenschild, A.; Rehmsmeier, M.; Merkle, T. (2009): Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana Nucleic Acids Research,37:(12): 4010-4021.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R.; Fleer, D.; Giegerich, R.; Rehmsmeier, M. (2009): mkESA: enhanced suffix array construction tool Bioinformatics,25:(8): 1084-1085.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G.; Obernosterer, G.; Fiore, R.; Oehmen, M.; Bicker, S.; Christensen, M.; Khudayberdiev, S.; Leuschner, P. F.; Busch, C. J. L.; Kane, C.; Huebel, K.; Dekker, F.; Hedberg, C.; Rengarajan, B.; Drepper, C.; Waldmann, H.; Kauppinen, S.; Greenberg, M. E.; Draguhn, A.; Rehmsmeier, M.; Martinez, J.; Schratt, G. M. (2009): A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis NATURE CELL BIOLOGY,11:(6): 705-716.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J.; Rehmsmeier, M. (2006): RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible Nucleic Acids Research,34:(Web Server): W451-W454.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J.; Rehmsmeier, M. (2006): RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible Nucleic Acids Research,34:(Web Server): W451-W454.
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[15]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P.; Voss, B.; Rehmsmeier, M.; Reeder, J.; Giegerich, R. (2006): RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes Bioinformatics,22:(4): 500-503.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B.; Giegerich, R.; Rehmsmeier, M. (2006): Complete probabilistic analysis of RNA shapes BMC Biology,4:(1):5
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T.; Rehmsmeier, M. (2006): jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements Nucleic Acids Research,34:(Web Server): W546-W550.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J.; Höchsmann, M.; Rehmsmeier, M.; Voss, B.; Giegerich, R. (2006): Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. In: Journal of Biotechnology. ELSEVIER SCIENCE BV. (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 124). S. 41-55.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I.; Dress, A.; Rehmsmeier, M.; Fuellen, G. (2004): Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA,101:(38): 13814-13819.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M.; Steffen, P.; Höchsmann, M.; Giegerich, R. (2004): Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY,10:(10): 1507-1517.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R.; Voss, B.; Rehmsmeier, M. (2004): Abstract shapes of RNA Nucleic Acids Research,32:(16): 4843-4851.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L.; Rehmsmeier, M.; Dura, J. - M.; Paro, R. (2003): Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster Developmental Cell,5: 759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R.; Rehmsmeier, M.; Stoye, J. (2002): A novel approach to remote homology detection: jumping alignments Journal of Computational Biology,9:(5): 747-760.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T.; Rahmann, S.; Rehmsmeier, M. (2001): Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. In: Bioinformatics. Oxford University Press. (Bioinformatics, 17). S. S182-189.
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M.; Vingron, M. V. (2001): Phylogenetic Information Improves Homology Detection Proteins: Structure, Function, and Genetics,45: 360-371.
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M.; Vingron, M. (1999): Phylogeny meets sequence search. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. S. 66-72.
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A.; Nicodeme, P.; Bornberg-Bauer, E. B. - B.; Rehmsmeier, M.; Vingron, M. (1999): WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set Bioinformatics,15: 262-263.
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R.; Haase, D.; Rehmsmeier, M. (1999): Prediction and visualization of structural switches in RNA Pac Symp Biocomput, 126-137.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A.; Nicodeme, P.; Rehmsmeier, M.; Vingron, M. (1998): Automatic clustering of large sequence databases. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
Alves jun., L.; Niemeier, S.; Hauenschild, A.; Rehmsmeier, M.; Merkle, T. (2009): Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana Nucleic Acids Research,37:(12): 4010-4021.
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[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R.; Fleer, D.; Giegerich, R.; Rehmsmeier, M. (2009): mkESA: enhanced suffix array construction tool Bioinformatics,25:(8): 1084-1085.
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[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G.; Obernosterer, G.; Fiore, R.; Oehmen, M.; Bicker, S.; Christensen, M.; Khudayberdiev, S.; Leuschner, P. F.; Busch, C. J. L.; Kane, C.; Huebel, K.; Dekker, F.; Hedberg, C.; Rengarajan, B.; Drepper, C.; Waldmann, H.; Kauppinen, S.; Greenberg, M. E.; Draguhn, A.; Rehmsmeier, M.; Martinez, J.; Schratt, G. M. (2009): A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis NATURE CELL BIOLOGY,11:(6): 705-716.
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[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J.; Rehmsmeier, M. (2006): RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible Nucleic Acids Research,34:(Web Server): W451-W454.
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[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J.; Rehmsmeier, M. (2006): RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible Nucleic Acids Research,34:(Web Server): W451-W454.
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[15]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P.; Voss, B.; Rehmsmeier, M.; Reeder, J.; Giegerich, R. (2006): RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes Bioinformatics,22:(4): 500-503.
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[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B.; Giegerich, R.; Rehmsmeier, M. (2006): Complete probabilistic analysis of RNA shapes BMC Biology,4:(1):5
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[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T.; Rehmsmeier, M. (2006): jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements Nucleic Acids Research,34:(Web Server): W546-W550.
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[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J.; Höchsmann, M.; Rehmsmeier, M.; Voss, B.; Giegerich, R. (2006): Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. In: Journal of Biotechnology. ELSEVIER SCIENCE BV. (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 124). S. 41-55.
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[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I.; Dress, A.; Rehmsmeier, M.; Fuellen, G. (2004): Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA,101:(38): 13814-13819.
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[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M.; Steffen, P.; Höchsmann, M.; Giegerich, R. (2004): Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY,10:(10): 1507-1517.
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[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R.; Voss, B.; Rehmsmeier, M. (2004): Abstract shapes of RNA Nucleic Acids Research,32:(16): 4843-4851.
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[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L.; Rehmsmeier, M.; Dura, J. - M.; Paro, R. (2003): Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster Developmental Cell,5: 759-771.
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R.; Rehmsmeier, M.; Stoye, J. (2002): A novel approach to remote homology detection: jumping alignments Journal of Computational Biology,9:(5): 747-760.
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[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T.; Rahmann, S.; Rehmsmeier, M. (2001): Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. In: Bioinformatics. Oxford University Press. (Bioinformatics, 17). S. S182-189.
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M.; Vingron, M. V. (2001): Phylogenetic Information Improves Homology Detection Proteins: Structure, Function, and Genetics,45: 360-371.
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M.; Vingron, M. (1999): Phylogeny meets sequence search. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. S. 66-72.
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A.; Nicodeme, P.; Bornberg-Bauer, E. B. - B.; Rehmsmeier, M.; Vingron, M. (1999): WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set Bioinformatics,15: 262-263.
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[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R.; Haase, D.; Rehmsmeier, M. (1999): Prediction and visualization of structural switches in RNA Pac Symp Biocomput, 126-137.
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[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A.; Nicodeme, P.; Rehmsmeier, M.; Vingron, M. (1998): Automatic clustering of large sequence databases. In: Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.
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