Marc Rehmsmeier

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11601931

20 Publikationen

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[20]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539 OA
Alves jun., L., Niemeier, S., Hauenschild, A., Rehmsmeier, M., Merkle, T.: Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research. 37, 4010-4021 (2009).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R., Fleer, D., Giegerich, R., Rehmsmeier, M.: mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics. 25, 1084-1085 (2009).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[18]
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G., Obernosterer, G., Fiore, R., Oehmen, M., Bicker, S., Christensen, M., Khudayberdiev, S., Leuschner, P.F., Busch, C.J.L., Kane, C., Huebel, K., Dekker, F., Hedberg, C., Rengarajan, B., Drepper, C., Waldmann, H., Kauppinen, S., Greenberg, M.E., Draguhn, A., Rehmsmeier, M., Martinez, J., Schratt, G.M.: A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY. 11, 705-716 (2009).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J., Rehmsmeier, M.: RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research. 34, W451-W454 (2006).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J., Rehmsmeier, M.: RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research. 34, W451-W454 (2006).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[15]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J., Giegerich, R.: RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics. 22, 500-503 (2006).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[14]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B., Giegerich, R., Rehmsmeier, M.: Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology. 4, : 5 (2006).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T., Rehmsmeier, M.: jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research. 34, W546-W550 (2006).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J., Höchsmann, M., Rehmsmeier, M., Voss, B., Giegerich, R.: Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. Journal of Biotechnology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. 124, p. 41-55. ELSEVIER SCIENCE BV (2006).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I., Dress, A., Rehmsmeier, M., Fuellen, G.: Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 101, 13814-13819 (2004).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M., Giegerich, R.: Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY. 10, 1507-1517 (2004).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R., Voss, B., Rehmsmeier, M.: Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research. 32, 4843-4851 (2004).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L., Rehmsmeier, M., Dura, J.-M., Paro, R.: Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell. 5, 759-771 (2003).
PUB
 
[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R., Rehmsmeier, M., Stoye, J.: A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology. 9, 747-760 (2002).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T., Rahmann, S., Rehmsmeier, M.: Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. Bioinformatics. Bioinformatics. 17, p. S182-189. Oxford University Press (2001).
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M., Vingron, M.V.: Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics. 45, 360-371 (2001).
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M., Vingron, M.: Phylogeny meets sequence search. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. p. 66-72. (1999).
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A., Nicodeme, P., Bornberg-Bauer, E.B.-B., Rehmsmeier, M., Vingron, M.: WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics. 15, 262-263 (1999).
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R., Haase, D., Rehmsmeier, M.: Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput. 126-137 (1999).
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A., Nicodeme, P., Rehmsmeier, M., Vingron, M.: Automatic clustering of large sequence databases. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. (1998).
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Alves jun., L., Niemeier, S., Hauenschild, A., Rehmsmeier, M., Merkle, T.: Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research. 37, 4010-4021 (2009).
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
Homann, R., Fleer, D., Giegerich, R., Rehmsmeier, M.: mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics. 25, 1084-1085 (2009).
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
Siegel, G., Obernosterer, G., Fiore, R., Oehmen, M., Bicker, S., Christensen, M., Khudayberdiev, S., Leuschner, P.F., Busch, C.J.L., Kane, C., Huebel, K., Dekker, F., Hedberg, C., Rengarajan, B., Drepper, C., Waldmann, H., Kauppinen, S., Greenberg, M.E., Draguhn, A., Rehmsmeier, M., Martinez, J., Schratt, G.M.: A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY. 11, 705-716 (2009).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
Krüger, J., Rehmsmeier, M.: RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research. 34, W451-W454 (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
Krüger, J., Rehmsmeier, M.: RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research. 34, W451-W454 (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J., Giegerich, R.: RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics. 22, 500-503 (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773637 OA
Voß, B., Giegerich, R., Rehmsmeier, M.: Complete probabilistic analysis of RNA shapes. BMC Biology. 4, : 5 (2006).
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[13]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916 OA
Fiedler, T., Rehmsmeier, M.: jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research. 34, W546-W550 (2006).
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[12]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
Reeder, J., Höchsmann, M., Rehmsmeier, M., Voss, B., Giegerich, R.: Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics. Journal of Biotechnology. JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY. 124, p. 41-55. ELSEVIER SCIENCE BV (2006).
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[11]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
Alam, I., Dress, A., Rehmsmeier, M., Fuellen, G.: Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA. 101, 13814-13819 (2004).
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[10]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M., Giegerich, R.: Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY. 10, 1507-1517 (2004).
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606393 OA
Giegerich, R., Voss, B., Rehmsmeier, M.: Abstract shapes of RNA. Nucleic Acids Research. 32, 4843-4851 (2004).
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
Ringrose, L., Rehmsmeier, M., Dura, J.-M., Paro, R.: Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell. 5, 759-771 (2003).
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[7]
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578 OA
Spang, R., Rehmsmeier, M., Stoye, J.: A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology. 9, 747-760 (2002).
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[6]
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
Müller, T., Rahmann, S., Rehmsmeier, M.: Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins. Bioinformatics. Bioinformatics. 17, p. S182-189. Oxford University Press (2001).
PUB | DOI
 
[5]
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
Rehmsmeier, M., Vingron, M.V.: Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics. 45, 360-371 (2001).
PUB
 
[4]
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
Rehmsmeier, M., Vingron, M.: Phylogeny meets sequence search. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. p. 66-72. (1999).
PUB
 
[3]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
Krause, A., Nicodeme, P., Bornberg-Bauer, E.B.-B., Rehmsmeier, M., Vingron, M.: WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics. 15, 262-263 (1999).
PUB
 
[2]
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
Giegerich, R., Haase, D., Rehmsmeier, M.: Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput. 126-137 (1999).
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[1]
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
Krause, A., Nicodeme, P., Rehmsmeier, M., Vingron, M.: Automatic clustering of large sequence databases. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB. (1998).
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