Marc Rehmsmeier
PEVZ-ID
20 Publikationen
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539
PUB
| PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC

Alves jun., L., Niemeier, S., Hauenschild, A., Rehmsmeier, M. & Merkle, T. (2009). Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research, 37(12), 4010-4021. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkp272.
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Homann, R., Fleer, D., Giegerich, R. & Rehmsmeier, M. (2009). mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics, 25(8), 1084-1085. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btp112.
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Siegel, G., Obernosterer, G., Fiore, R., Oehmen, M., Bicker, S., Christensen, M., Khudayberdiev, S., Leuschner, P.F., Busch, C.J.L., Kane, C., Huebel, K., Dekker, F., Hedberg, C., Rengarajan, B., Drepper, C., Waldmann, H., Kauppinen, S., Greenberg, M.E., Draguhn, A., Rehmsmeier, M., Martinez, J. & Schratt, G.M. (2009). A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY, 11(6), 705-716. Nature Publishing Group. doi:10.1038/ncb1876.
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Krüger, J. & Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W451-W454. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkl243.
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878
PUB
| PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC

Krüger, J. & Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W451-W454. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkl243.
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J. & Giegerich, R. (2006). RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics, 22(4), 500-503. Oxford Univ. Press. doi:10.1093/bioinformatics/btk010.
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916
PUB
| PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC

Fiedler, T. & Rehmsmeier, M. (2006). jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W546-W550. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkl250.
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Reeder, J., Höchsmann, M., Rehmsmeier, M., Voss, B. & Giegerich, R. (2006). Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY). Journal of Biotechnology (S. 41-55). ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2006.01.034.
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Alam, I., Dress, A., Rehmsmeier, M. & Fuellen, G. (2004). Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 101(38), 13814-13819. NATL ACAD SCIENCES. doi:10.1073/pnas.0405612101.
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M. & Giegerich, R. (2004). Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY, 10(10), 1507-1517. COLD SPRING HARBOR LAB PRESS, PUBLICATIONS DEPT. doi:10.1021/rna.5248604.
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
PUB
Ringrose, L., Rehmsmeier, M., Dura, J.-M. & Paro, R. (2003). Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell, 5, 759-771. Elsevier.
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578
PUB
| PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC

Spang, R., Rehmsmeier, M. & Stoye, J. (2002). A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology, 9(5), 747-760. Mary Ann Liebert Inc. doi:10.1089/106652702761034172.
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
PUB | DOI
Müller, T., Rahmann, S. & Rehmsmeier, M. (2001). Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins (Bioinformatics). Bioinformatics (S. S182-189). Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/17.suppl_1.S182.
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
PUB
Rehmsmeier, M. & Vingron, M.V. (2001). Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics, 45, 360-371. Wiley-Blackwell.
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
PUB
Rehmsmeier, M. & Vingron, M. (1999). Phylogeny meets sequence search. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB (S. 66-72). Gehalten auf der Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
PUB
Krause, A., Nicodeme, P., Bornberg-Bauer, E.B.-B., Rehmsmeier, M. & Vingron, M. (1999). WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics, 15, 262-263. OXFORD UNIV PRESS.
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
PUB | PubMed | Europe PMC
Giegerich, R., Haase, D. & Rehmsmeier, M. (1999). Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput, 126-137.
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
PUB
Krause, A., Nicodeme, P., Rehmsmeier, M. & Vingron, M. (1998). Automatic clustering of large sequence databases. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591539
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| PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC

Alves jun., L., Niemeier, S., Hauenschild, A., Rehmsmeier, M. & Merkle, T. (2009). Comprehensive prediction of novel microRNA targets in Arabidopsis thaliana. Nucleic Acids Research, 37(12), 4010-4021. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkp272.
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
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Homann, R., Fleer, D., Giegerich, R. & Rehmsmeier, M. (2009). mkESA: enhanced suffix array construction tool. Bioinformatics, 25(8), 1084-1085. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/bioinformatics/btp112.
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1633720
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Siegel, G., Obernosterer, G., Fiore, R., Oehmen, M., Bicker, S., Christensen, M., Khudayberdiev, S., Leuschner, P.F., Busch, C.J.L., Kane, C., Huebel, K., Dekker, F., Hedberg, C., Rengarajan, B., Drepper, C., Waldmann, H., Kauppinen, S., Greenberg, M.E., Draguhn, A., Rehmsmeier, M., Martinez, J. & Schratt, G.M. (2009). A functional screen implicates microRNA-138-dependent regulation of the depalmitoylation enzyme APT1 in dendritic spine morphogenesis. NATURE CELL BIOLOGY, 11(6), 705-716. Nature Publishing Group. doi:10.1038/ncb1876.
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
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Krüger, J. & Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W451-W454. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkl243.
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878
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| PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC

Krüger, J. & Rehmsmeier, M. (2006). RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W451-W454. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkl243.
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
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Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J. & Giegerich, R. (2006). RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics, 22(4), 500-503. Oxford Univ. Press. doi:10.1093/bioinformatics/btk010.
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773916
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Fiedler, T. & Rehmsmeier, M. (2006). jPREdictor: a versatile tool for the prediction of cis-regulatory elements. Nucleic Acids Research, 34(Web Server), W546-W550. Oxford University Press (OUP). doi:10.1093/nar/gkl250.
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1598807
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Reeder, J., Höchsmann, M., Rehmsmeier, M., Voss, B. & Giegerich, R. (2006). Beyond Mfold: recent advances in RNA bioinformatics (JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY). Journal of Biotechnology (S. 41-55). ELSEVIER SCIENCE BV. doi:10.1016/j.jbiotec.2006.01.034.
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606383
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Alam, I., Dress, A., Rehmsmeier, M. & Fuellen, G. (2004). Comparative homology agreement search: An effective combination of homology-search methods. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 101(38), 13814-13819. NATL ACAD SCIENCES. doi:10.1073/pnas.0405612101.
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M. & Giegerich, R. (2004). Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY, 10(10), 1507-1517. COLD SPRING HARBOR LAB PRESS, PUBLICATIONS DEPT. doi:10.1021/rna.5248604.
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379512
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Ringrose, L., Rehmsmeier, M., Dura, J.-M. & Paro, R. (2003). Genome Wide Prediction of Polycomb/Trithorax Response Elements in Drosophila melanogaster. Developmental Cell, 5, 759-771. Elsevier.
2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773578
PUB
| PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC

Spang, R., Rehmsmeier, M. & Stoye, J. (2002). A novel approach to remote homology detection: jumping alignments. Journal of Computational Biology, 9(5), 747-760. Mary Ann Liebert Inc. doi:10.1089/106652702761034172.
2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378553
PUB | DOI
Müller, T., Rahmann, S. & Rehmsmeier, M. (2001). Non-symmetric Score Matrices and the Detection of Homologous Transmembrane Proteins (Bioinformatics). Bioinformatics (S. S182-189). Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/17.suppl_1.S182.
2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379442
PUB
Rehmsmeier, M. & Vingron, M.V. (2001). Phylogenetic Information Improves Homology Detection. Proteins: Structure, Function, and Genetics, 45, 360-371. Wiley-Blackwell.
1999 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379439
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Rehmsmeier, M. & Vingron, M. (1999). Phylogeny meets sequence search. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB (S. 66-72). Gehalten auf der Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2379431
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Krause, A., Nicodeme, P., Bornberg-Bauer, E.B.-B., Rehmsmeier, M. & Vingron, M. (1999). WWW-Access to the SYSTERS Protein Sequence Cluster Set. Bioinformatics, 15, 262-263. OXFORD UNIV PRESS.
1999 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1947682
PUB | PubMed | Europe PMC
Giegerich, R., Haase, D. & Rehmsmeier, M. (1999). Prediction and visualization of structural switches in RNA. Pac Symp Biocomput, 126-137.
1998 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2378670
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Krause, A., Nicodeme, P., Rehmsmeier, M. & Vingron, M. (1998). Automatic clustering of large sequence databases. Proceedings of the German Conference on Bioinformatics GCB.