20 Publikationen
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2022 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2968524Guiding the choice of informatics software and tools for lipidomics research applicationsPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Ni Z, Wolk M, Jukes G, Espinosa KM, Ahrends R, Aimo L, Alvarez-Jarreta J, Andrews S, Andrews R, Bridge A, Clair GC, et al. (2022)
Nature Methods . -
2022 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2966976Update on guidelines for lipidomics analysis and reportingPUB | DOI | WoS
Ekroos K, Ejsing C, Liebisch G, Koefeler H, McDonald J, Holcapek M, Hoffmann N, Ahrends R (2022)
Journal of the American Oil Chemists' Society 99(Suppl. 1): 13-14. -
2022 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2965107Introducing the Lipidomics Minimal Reporting ChecklistPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
McDonald JG, Ejsing CS, Kopczynski D, Holcapek M, Aoki J, Arita M, Arita M, Baker ES, Bertrand-Michel J, Bowden JA, Brugger B, et al. (2022)
Nature Metabolism . -
2022 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2962357Goslin 2.0 Implements the Recent Lipid Shorthand Nomenclature for MS-Derived Lipid StructuresPUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
Kopczynski D, Hoffmann N, Peng B, Liebisch G, Spener F, Ahrends R (2022)
Analytical Chemistry: acs.analchem.1c05430. -
2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2959919Multiomics of synaptic junctions reveals altered lipid metabolism and signaling following environmental enrichmentPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Borgmeyer M, Coman C, Has C, Schött H-F, Li T, Westhoff P, Cheung YFH, Hoffmann N, Yuanxiang PA, Behnisch T, Gomes GM, et al. (2021)
Cell Reports 37(1): 109797. -
2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2958747Recommendations for Good Practice in Mass Spectrometry-Based LipidomicsPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Kofeler HC, Ahrends R, Baker ES, Ekroos K, Han X, Hoffmann N, Holcapek M, Wenk MR, Liebisch G (2021)
Journal of Lipid Research 62: 100138. -
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956707LipidCreator workbench to probe the lipidomic landscapePUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Peng B, Kopczynski D, Pratt BS, Ejsing CS, Burla B, Hermansson M, Benke PI, Tan SH, Chan MY, Torta F, Schwudke D, et al. (2020)
Nature Communications 11(1): 2057. -
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956705Goslin: A Grammar of Succinct Lipid NomenclaturePUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | Preprint
Kopczynski D, Hoffmann N, Peng B, Ahrends R (2020)
Analytical Chemistry 92(16): 10957-10960. -
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956709The de.NBI / ELIXIR-DE training platform - Bioinformatics training in Germany and across Europe within ELIXIRPUB | DOI
Wibberg D, Batut B, Belmann P, Blom J, Glöckner FO, Grüning B, Hoffmann N, Kleinbölting N, Rahn R, Rey M, Scholz U, et al. (2019)
F1000Research 8: 1877. -
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956712mzTab-M: A Data Standard for Sharing Quantitative Results in Mass Spectrometry MetabolomicsPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Hoffmann N, Rein J, Sachsenberg T, Hartler J, Haug K, Mayer G, Alka O, Dayalan S, Pearce JTM, Rocca-Serra P, Qi D, et al. (2019)
Analytical Chemistry 91(5): 3302-3310. -
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956711jmzTab-M: A Reference Parser, Writer, and Validator for the Proteomics Standards Initiative mzTab 2.0 Metabolomics StandardPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Hoffmann N, Hartler J, Ahrends R (2019)
Analytical Chemistry 91(20): 12615-12618. -
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956710The metaRbolomics Toolbox in Bioconductor and beyondPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Stanstrup J, Broeckling C, Helmus R, Hoffmann N, Mathé E, Naake T, Nicolotti L, Peters K, Rainer J, Salek R, Schulze T, et al. (2019)
Metabolites 9(10): 200. -
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956713Identification of key lipids critical for platelet activation by comprehensive analysis of the platelet lipidomePUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Peng B, Geue S, Coman C, Münzer P, Kopczynski D, Has C, Hoffmann N, Manke M-C, Lang F, Sickmann A, Gawaz M, et al. (2018)
Blood 132(5): e1-e12. -
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956714Lipidomics informatics for life-sciencePUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Schwudke D, Shevchenko A, Hoffmann N, Ahrends R (2017)
Journal of Biotechnology 261: 131-136. -
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2715682Maui-VIA: a user-friendly software for visual identification, alignment, correction, and quantification of gas chromatography–mass spectrometry dataPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Henning P, Kuich JL, Hoffmann N, Stefan K (2015)
Frontiers in Bioengineering and Biotechnology 2(84): 84. -
2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2677466
Computational methods for high-throughput metabolomicsPUB | PDF
Hoffmann N (2014)
Bielefeld: Universität Bielefeld. -
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643941BiPACE 2D – Graph-based multiple alignment for comprehensive two-dimensional gas chromatography–mass spectrometryPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Hoffmann N, Wilhelm M, Doebbe A, Niehaus K, Stoye J (2014)
Bioinformatics 30(7): 988-995. -
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2517239
Combining peak- and chromatogram-based retention time alignment algorithms for multiple chromatography-mass spectrometry datasetsPUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Hoffmann N, Keck M, Neuweger H, Wilhelm M, Högy P, Niehaus K, Stoye J (2012)
BMC Bioinformatics 13(1): 21. -
2012 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2468382
Generic Software Frameworks for GC-MS Based MetabolomicsPUB | PDF | DOI | Download (ext.)
Hoffmann N, Stoye J (2012)
In: Metabolomics. Roessner U (Ed); InTech: 73-98. -
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591319ChromA: signal-based retention time alignment for chromatography-mass spectrometry dataPUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
Hoffmann N, Stoye J (2009)
Bioinformatics 25(16): 2080-2081.