PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

Alle markieren

• [26]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934274

  Meyer, F.; Bremges, A.; Belmann, P.; Janssen, S.; McHardy, A. C.; Koslicki, D. (2019): Assessing taxonomic metagenome profilers with OPAL Genome biology,20:(1):51

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | Preprint
   
• [25]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941280

  Zhu, Q.; Mai, U.; Pfeiffer, W.; Janssen, S.; Asnicar, F.; Sanders, J. G.; Belda-Ferre, P.; Al-Ghalith, G. A.; Kopylova, E.; McDonald, D.; Kosciolek, T.; Yin, J. B.; Huang, S.; Salam, N.; Jiao, J. - Y.; Wu, Z.; Xu, Z. Z.; Cantrell, K.; Yang, Y.; Sayyari, E.; Rabiee, M.; Morton, J. T.; Podell, S.; Knights, D.; Li, W. - J.; Huttenhower, C.; Segata, N.; Smarr, L.; Mirarab, S.; Knight, R. (2019): Phylogenomics of 10,575 genomes reveals evolutionary proximity between domains Bacteria and Archaea Nature Communications,10:(1):5477

  PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [24]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941281

  Bouslimani, A.; da Silva, R.; Kosciolek, T.; Janssen, S.; Callewaert, C.; Amir, A.; Dorrestein, K.; Melnik, A. V.; Zaramela, L. S.; Kim, J. - N.; Humphrey, G.; Schwartz, T.; Sanders, K.; Brennan, C.; Luzzatto-Knaan, T.; Ackermann, G.; McDonald, D.; Zengler, K.; Knight, R.; Dorrestein, P. C. (2019): The impact of skin care products on skin chemistry and microbiome dynamics BMC Biology,17:(1):47

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [23]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934328

  Iszatt, N.; Janssen, S.; Lenters, V.; Dahl, C.; Stigum, H.; Knight, R.; Mandal, S.; Peddada, S.; González, A.; Midtvedt, T.; Eggesbø, M. (2019): Environmental toxicants in breast milk of Norwegian mothers and gut bacteria composition and metabolites in their infants at 1 month Microbiome,7:(1):34

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [22]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921267

  McDonald, D.; Hyde, E.; Debelius, J. W.; Morton, J. T.; Gonzalez, A.; Ackermann, G.; Aksenov, A. A.; Behsaz, B.; Brennan, C.; Chen, Y.; DeRight Goldasich, L.; Dorrestein, P. C.; Dunn, R. R.; Fahimipour, A. K.; Gaffney, J.; Gilbert, J. A.; Gogul, G.; Green, J. L.; Hugenholtz, P.; Humphrey, G.; Huttenhower, C.; Jackson, M. A.; Janssen, S.; Jeste, D. V.; Jiang, L.; Kelley, S. T.; Knights, D.; Kosciolek, T.; Ladau, J.; Leach, J.; Marotz, C.; Meleshko, D.; Melnik, A. V.; Metcalf, J. L.; Mohimani, H.; Montassier, E.; Navas-Molina, J.; Nguyen, T. T.; Peddada, S.; Pevzner, P.; Pollard, K. S.; Rahnavard, G.; Robbins-Pianka, A.; Sangwan, N.; Shorenstein, J.; Smarr, L.; Song, S. J.; Spector, T.; Swafford, A. D.; Thackray, V. G.; Thompson, L. R.; Tripathi, A.; Vázquez-Baeza, Y.; Vrbanac, A.; Wischmeyer, P.; Wolfe, E.; Zhu, Q.; Knight, R.; Mann, A. E.; Amir, A.; Frazier, A.; Martino, C.; Lebrilla, C.; Lozupone, C.; Lewis, C. M.; Raison, C.; Zhang, C.; Lauber, C. L.; Warinner, C.; Lowry, C. A.; Callewaert, C.; Bloss, C.; Willner, D.; Galzerani, D. D.; Gonzalez, D. J.; Mills, D. A.; Chopra, D.; Gevers, D.; Berg-Lyons, D.; Sears, D. D.; Wendel, D.; Lovelace, E.; Pierce, E.; TerAvest, E.; Bolyen, E.; Bushman, F. D.; Wu, G. D.; Church, G. M.; Saxe, G.; Holscher, H. D.; Ugrina, I.; German, J. B.; Caporaso, J. G.; Wozniak, J. M.; Kerr, J.; Ravel, J.; Lewis, J. D.; Suchodolski, J. S.; Jansson, J. K.; Hampton-Marcell, J. T.; Bobe, J.; Raes, J.; Chase, J. H.; Eisen, J. A.; Monk, J.; Clemente, J. C.; Petrosino, J.; Goodrich, J.; Gauglitz, J.; Jacobs, J.; Zengler, K.; Swanson, K. S.; Lewis, K.; Mayer, K.; Bittinger, K.; Dillon, L.; Zaramela, L. S.; Schriml, L. M.; Dominguez-Bello, M. G.; Jankowska, M. M.; Blaser, M.; Pirrung, M.; Minson, M.; Kurisu, M.; Ajami, N.; Gottel, N. R.; Chia, N.; Fierer, N.; White, O.; Cani, P. D.; Gajer, P.; Strandwitz, P.; Kashyap, P.; Dutton, R.; Park, R. S.; Xavier, R. J.; Mills, R. H.; Krajmalnik-Brown, R.; Ley, R.; Owens, S. M.; Klemmer, S.; Matamoros, S.; Mirarab, S.; Moorman, S.; Holmes, S.; Schwartz, T.; Eshoo-Anton, T. W.; Vigers, T.; Pandey, V.; Treuren, W. V.; Fang, X.; Zech Xu, Z.; Jarmusch, A.; Geier, J.; Reeve, N.; Silva, R.; Kopylova, E.; Nguyen, D.; Sanders, K.; Salido Benitez, R. A.; Heale, A. C.; Abramson, M.; Waldispühl, J.; Butyaev, A.; Drogaris, C.; Nazarova, E.; Ball, M.; Gunderson, B. (2018): American Gut: an Open Platform for Citizen Science Microbiome Research mSystems,3:(3): e00031-18.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [21]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921270

  Minich, J. J.; Zhu, Q.; Janssen, S.; Hendrickson, R.; Amir, A.; Vetter, R.; Hyde, J.; Doty, M. M.; Stillwell, K.; Benardini, J.; Kim, J. H.; Allen, E. E.; Venkateswaran, K.; Knight, R. (2018): KatharoSeq Enables High-Throughput Microbiome Analysis from Low-Biomass Samples mSystems,3:(3): e00218-17.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [20]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921268

  Janssen, S.; McDonald, D.; Gonzalez, A.; Navas-Molina, J. A.; Jiang, L.; Xu, Z. Z.; Winker, K.; Kado, D. M.; Orwoll, E.; Manary, M.; Mirarab, S.; Knight, R. (2018): Phylogenetic Placement of Exact Amplicon Sequences Improves Associations with Clinical Information mSystems,3:(3): e00021-18.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [19]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921273

  Kapono, C. A.; Morton, J. T.; Bouslimani, A.; Melnik, A. V.; Orlinsky, K.; Knaan, T. L.; Garg, N.; Vázquez-Baeza, Y.; Protsyuk, I.; Janssen, S.; Zhu, Q.; Alexandrov, T.; Smarr, L.; Knight, R.; Dorrestein, P. C. (2018): Creating a 3D microbial and chemical snapshot of a human habitat Scientific Reports,8:(1):3669

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [18]
  

  2018 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2931839

  Bolyen, E.; Rideout, J. R.; Dillon, M. R.; Bokulich, N. A.; Abnet, C.; Al-Ghalith, G. A.; Alexander, H.; Alm, E. J.; Arumugam, M.; Asnicar, F.; Bai, Y.; Bisanz, J. E.; Bittinger, K.; Brejnrod, A.; Brislawn, C. J.; Brown, C. T.; Callahan, B. J.; Caraballo-Rodríguez, A. M.; Chase, J.; Cope, E.; Da Silva, R.; Dorrestein, P. C.; Douglas, G. M.; Durall, D. M.; Duvallet, C.; Edwardson, C. F.; Ernst, M.; Estaki, M.; Fouquier, J.; Gauglitz, J. M.; Gibson, D. L.; Gonzalez, A.; Gorlick, K.; Guo, J.; Hillmann, B.; Holmes, S.; Holste, H.; Huttenhower, C.; Huttley, G.; Janssen, S.; Jarmusch, A. K.; Jiang, L.; Kaehler, B.; Kang, K. B.; Keefe, C. R.; Keim, P.; Kelley, S. T.; Knights, D.; Koester, I.; Kosciolek, T.; Kreps, J.; Langille, M. G. I.; Lee, J.; Ley, R.; Liu, Y. - X.; Loftfield, E.; Lozupone, C.; Maher, M.; Marotz, C.; Martin, B.; McDonald, D.; McIver, L. J.; Melnik, A. V.; Metcalf, J. L.; Morgan, S. C.; Morton, J.; Naimey, A. T.; Navas-Molina, J. A.; Nothias, L. F.; Orchanian, S. B.; Pearson, T.; Peoples, S. L.; Petras, D.; Preuss, M. L.; Pruesse, E.; Rasmussen, L. B.; Rivers, A.; Robeson, II, M. S.; Rosenthal, P.; Segata, N.; Shaffer, M.; Shiffer, A.; Sinha, R.; Song, S. J.; Spear, J. R.; Swafford, A. D.; Thompson, L. R.; Torres, P. J.; Trinh, P.; Tripathi, A.; Turnbaugh, P. J.; Ul-Hasan, S.; van der Hooft, J. J. J.; Vargas, F.; Vázquez-Baeza, Y.; Vogtmann, E.; von Hippel, M.; Walters, W.; Wan, Y.; Wang, M.; Warren, J.; Weber, K. C.; Williamson, C. H. D.; Willis, A. D.; Xu, Z. Z.; Zaneveld, J. R.; Zhang, Y.; Knight, R.; Caporaso, J. G. (2018): QIIME 2: Reproducible, interactive, scalable, and extensible microbiome data science PeerJ

  PUB | DOI
   
• [17]
  

  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2931438

  Gonzalez, A.; Navas-Molina, J. A.; Kosciolek, T.; McDonald, D.; Vázquez-Baeza, Y.; Ackermann, G.; DeReus, J.; Janssen, S.; Swafford, A. D.; Orchanian, S. B.; Sanders, J. G.; Shorenstein, J.; Holste, H.; Petrus, S.; Robbins-Pianka, A.; Brislawn, C. J.; Wang, M.; Rideout, J. R.; Bolyen, E.; Dillon, M.; Caporaso, J. G.; Dorrestein, P. C.; Knight, R. (2018): Qiita: rapid, web-enabled microbiome meta-analysis Nature Methods,15:(10): 796-798.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [16]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914868

  Thompson, L. R.; Sanders, J. G.; McDonald, D.; Amir, A.; Ladau, J.; Locey, K. J.; Prill, R. J.; Tripathi, A.; Gibbons, S. M.; Ackermann, G.; Navas-Molina, J. A.; Janssen, S.; Kopylova, E.; Vázquez-Baeza, Y.; González, A.; Morton, J. T.; Mirarab, S.; Zech Xu, Z.; Jiang, L.; Haroon, M. F.; Kanbar, J.; Zhu, Q.; Jin Song, S.; Kosciolek, T.; Bokulich, N. A.; Lefler, J.; Brislawn, C. J.; Humphrey, G.; Owens, S. M.; Hampton-Marcell, J.; Berg-Lyons, D.; McKenzie, V.; Fierer, N.; Fuhrman, J. A.; Clauset, A.; Stevens, R. L.; Shade, A.; Pollard, K. S.; Goodwin, K. D.; Jansson, J. K.; Gilbert, J. A.; Knight, R.; Rivera, J. L. A.; Al-Moosawi, L.; Alverdy, J.; Amato, K. R.; Andras, J.; Angenent, L. T.; Antonopoulos, D. A.; Apprill, A.; Armitage, D.; Ballantine, K.; Bárta, J. ˇí; Baum, J. K.; Berry, A.; Bhatnagar, A.; Bhatnagar, M.; Biddle, J. F.; Bittner, L.; Boldgiv, B.; Bottos, E.; Boyer, D. M.; Braun, J.; Brazelton, W.; Brearley, F. Q.; Campbell, A. H.; Caporaso, J. G.; Cardona, C.; Carroll, J. L.; Cary, S. C.; Casper, B. B.; Charles, T. C.; Chu, H.; Claar, D. C.; Clark, R. G.; Clayton, J. B.; Clemente, J. C.; Cochran, A.; Coleman, M. L.; Collins, G.; Colwell, R. R.; Contreras, M.; Crary, B. B.; Creer, S.; Cristol, D. A.; Crump, B. C.; Cui, D.; Daly, S. E.; Davalos, L.; Dawson, R. D.; Defazio, J.; Delsuc, F.; Dionisi, H. M.; Dominguez-Bello, M. G.; Dowell, R.; Dubinsky, E. A.; Dunn, P. O.; Ercolini, D.; Espinoza, R. E.; Ezenwa, V.; Fenner, N.; Findlay, H. S.; Fleming, I. D.; Fogliano, V.; Forsman, A.; Freeman, C.; Friedman, E. S.; Galindo, G.; Garcia, L.; Garcia-Amado, M. A.; Garshelis, D.; Gasser, R. B.; Gerdts, G.; Gibson, M. K.; Gifford, I.; Gill, R. T.; Giray, T.; Gittel, A.; Golyshin, P.; Gong, D.; Grossart, H. - P.; Guyton, K.; Haig, S. - J.; Hale, V.; Hall, R. S.; Hallam, S. J.; Handley, K. M.; Hasan, N. A.; Haydon, S. R.; Hickman, J. E.; Hidalgo, G.; Hofmockel, K. S.; Hooker, J.; Hulth, S.; Hultman, J.; Hyde, E.; Ibáñez-Álamo, J. D.; Jastrow, J. D.; Jex, A. R.; Johnson, L. S.; Johnston, E. R.; Joseph, S.; Jurburg, S. D.; Jurelevicius, D.; Karlsson, A.; Karlsson, R.; Kauppinen, S.; Kellogg, C. T. E.; Kennedy, S. J.; Kerkhof, L. J.; King, G. M.; Kling, G. W.; Koehler, A. V.; Krezalek, M.; Kueneman, J.; Lamendella, R.; Landon, E. M.; Lane-deGraaf, K.; LaRoche, J.; Larsen, P.; Laverock, B.; Lax, S.; Lentino, M.; Levin, I. I.; Liancourt, P.; Liang, W.; Linz, A. M.; Lipson, D. A.; Liu, Y.; Lladser, M. E.; Lozada, M.; Spirito, C. M.; MacCormack, W. P.; MacRae-Crerar, A.; Magris, M.; Martín-Platero, A. M.; Martín-Vivaldi, M.; Martínez, L. M.; Martínez-Bueno, M.; Marzinelli, E. M.; Mason, O. U.; Mayer, G. D.; McDevitt-Irwin, J. M.; McDonald, J. E.; McGuire, K. L.; McMahon, K. D.; McMinds, R.; Medina, M.; Mendelson, J. R.; Metcalf, J. L.; Meyer, F.; Michelangeli, F.; Miller, K.; Mills, D. A.; Minich, J.; Mocali, S.; Moitinho-Silva, L.; Moore, A.; Morgan-Kiss, R. M.; Munroe, P.; Myrold, D.; Neufeld, J. D.; Ni, Y.; Nicol, G. W.; Nielsen, S.; Nissimov, J. I.; Niu, K.; Nolan, M. J.; Noyce, K.; O'Brien, S. L.; Okamoto, N.; Orlando, L.; Castellano, Y. O.; Osuolale, O.; Oswald, W.; Parnell, J.; Peralta-Sánchez, J. M.; Petraitis, P.; Pfister, C.; Pilon-Smits, E.; Piombino, P.; Pointing, S. B.; Pollock, F. J.; Potter, C.; Prithiviraj, B.; Quince, C.; Rani, A.; Ranjan, R.; Rao, S.; Rees, A. P.; Richardson, M.; Riebesell, U.; Robinson, C.; Rockne, K. J.; Rodriguezl, S. M.; Rohwer, F.; Roundstone, W.; Safran, R. J.; Sangwan, N.; Sanz, V.; Schrenk, M.; Schrenzel, M. D.; Scott, N. M.; Seger, R. L.; Seguin-Orlando, A.; Seldin, L.; Seyler, L. M.; Shakhsheer, B.; Sheets, G. M.; Shen, C.; Shi, Y.; Shin, H.; Shogan, B. D.; Shutler, D.; Siegel, J.; Simmons, S.; Sjöling, S.; Smith, D. P.; Soler, J. J.; Sperling, M.; Steinberg, P. D.; Stephens, B.; Stevens, M. A.; Taghavi, S.; Tai, V.; Tait, K.; Tan, C. L.; Tas, N.; Taylor, D. L.; Thomas, T.; Timling, I.; Turner, B. L.; Urich, T.; Ursell, L. K.; van der Lelie, D.; Van Treuren, W.; van Zwieten, L.; Vargas-Robles, D.; Thurber, R. V.; Vitaglione, P.; Walker, D. A.; Walters, W. A.; Wang, S.; Wang, T.; Weaver, T.; Webster, N. S.; Wehrle, B.; Weisenhorn, P.; Weiss, S.; Werner, J. J.; West, K.; Whitehead, A.; Whitehead, S. R.; Whittingham, L. A.; Willerslev, E.; Williams, A. E.; Wood, S. A.; Woodhams, D. C.; Yang, Y.; Zaneveld, J.; Zarraonaindia, I.; Zhang, Q.; Zhao, H. (2017): A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity Nature,551:(7681): 457-463.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [15]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914367

  Sczyrba, A.; Hofmann, P.; Belmann, P.; Koslicki, D.; Janssen, S.; Dröge, J.; Gregor, I.; Majda, S.; Fiedler, J.; Dahms, E.; Bremges, A.; Fritz, A.; Garrido-Oter, R.; Jørgensen, T. S.; Shapiro, N.; Blood, P. D.; Gurevich, A.; Bai, Y.; Turaev, D.; DeMaere, M. Z.; Chikhi, R.; Nagarajan, N.; Quince, C.; Meyer, F.; Balvočiūtė, M.; Hansen, L. H.; Sørensen, S. J.; Chia, B. K. H.; Denis, B.; Froula, J. L.; Wang, Z.; Egan, R.; Don Kang, D.; Cook, J. J.; Deltel, C.; Beckstette, M.; Lemaitre, C.; Peterlongo, P.; Rizk, G.; Lavenier, D.; Wu, Y. - W.; Singer, S. W.; Jain, C.; Strous, M.; Klingenberg, H.; Meinicke, P.; Barton, M. D.; Lingner, T.; Lin, H. - H.; Liao, Y. - C.; Silva, G. G. Z.; Cuevas, D. A.; Edwards, R. A.; Saha, S.; Piro, V. C.; Renard, B. Y.; Pop, M.; Klenk, H. - P.; Göker, M.; Kyrpides, N. C.; Woyke, T.; Vorholt, J. A.; Schulze-Lefert, P.; Rubin, E. M.; Darling, A. E.; Rattei, T.; McHardy, A. C. (2017): Critical Assessment of Metagenome Interpretation—a benchmark of metagenomics software Nature Methods,14:(11): 1063-1071.

  PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [14]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907305

  Sampson, T. R.; Debelius, J. W.; Thron, T.; Janssen, S.; Shastri, G. G.; Ilhan, Z. E.; Challis, C.; Schretter, C. E.; Rocha, S.; Gradinaru, V.; Chesselet, M. - F.; Keshavarzian, A.; Shannon, K. M.; Krajmalnik-Brown, R.; Wittung-Stafshede, P.; Knight, R.; Mazmanian, S. K. (2016): Gut Microbiota Regulate Motor Deficits and Neuroinflammation in a Model of Parkinson's Disease Cell,167:(6): 1469-1480.e12.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [13]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764888

  Janssen, S.; Giegerich, R. (2015): Ambivalent covariance models BMC Bioinformatics,16:(1):178

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [12]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700599

  Janssen, S.; Giegerich, R. (2014): The RNA shapes studio Bioinformatics,31:(3): 423-425.

  PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [11]
  

  2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2682131

  Janssen, S. (2014): Kisses, ambivalent models and more: Contributions to the analysis of RNA secondary structure. Bielefeld: Universitätsbibliothek.

  PUB | PDF
   
• [10]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551798

  Sauthoff, G.; Mohl, M.; Janssen, S.; Giegerich, R. (2013): Bellman's GAP -- a Language and Compiler for Dynamic Programming in Sequence Analysis Bioinformatics,29:(5): 551-560.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [9]
  

  2012 | Sammelwerksbeitrag | PUB-ID: 2439665

  Janssen, S.; Giegerich, R. (2012): Abstract Shape Analysis of RNA. In: Jan Gorodkin; Zasha Weinberg (Hrsg.): RNA Bioinformatics t.b.a.. S. 1-35.

  PUB
   
• [8]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2410526

  Janssen, S.; Schudoma, C.; Steger, G.; Giegerich, R. (2011): Lost in folding space? Comparing four variants of the thermodynamic model for RNA secondary structure prediction BMC Bioinformatics,12:(1):429

  PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [7]
  

  2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2310489

  Sauthoff, G.; Janssen, S.; Giegerich, R. (2011): Bellman's GAP: a declarative language for dynamic programming. In: Proceedings of the 13th international ACM SIGPLAN symposium on Principles and practices of declarative programming. New York, NY, USA: ACM. S. 29-40.

  PUB | DOI | Download (ext.)
   
• [6]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785497

  Schlüter, J. - P.; Reinkensmeier, J.; Daschkey, S.; Evguenieva-Hackenberg, E.; Janssen, S.; Jaenicke, S.; Becker, J. D.; Giegerich, R.; Becker, A. (2010): A genome-wide survey of sRNAs in the symbiotic nitrogen-fixing alpha-proteobacterium Sinorhizobium meliloti BMC Genomics,11:(1):245

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [5]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893988

  Grond, F.; Janssen, S.; Schirmer, S.; Hermann, T. (2010): Browsing RNA Structures by Interactive Sonification. In: Roberto Bresin; Thomas Hermann; Andy Hunt (Hrsg.): Proceedings of the 3rd Interactive Sonification Workshop. KTH, Stockholm, Sweden: KTH School of Computer Science and Communication (CSC). S. 11-16.

  PUB | Datei | Download (ext.)
   
• [4]
  

  2010 | Datenpublikation | PUB-ID: 2698354

  Grond, F.; Janssen, S.; Schirmer, S.; Hermann, T. (2010): Supplementary Material for "Browsing RNA Structures by Interactive Sonification". Bielefeld University.

  PUB | Dateien verfügbar | DOI
   
• [3]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894008

  Theis, C.; Janssen, S.; Giegerich, R. (2010): Prediction of RNA Secondary Structure Including Kissing Hairpin Motifs. In: Vincent Moulton; Mona Singh (Hrsg.): Algorithms in Bioinformatics. 10th international workshop (WABI 2010), proceedings. Berlin: Springer. (Lecture Notes in Bioinformatics, 6293). S. 52-64.

  PUB | Datei | DOI
   
• [2]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893946

  Janssen, S.; Giegerich, R. (2010): Faster computation of exact RNA shape probabilities Bioinformatics,26:(5): 632-639.

  PUB | Datei | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [1]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893917

  Janssen, S.; Reeder, J.; Giegerich, R. (2008): Shape based indexing for faster search of RNA family databases BMC Bioinformatics,9:(1): 131.

  PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC