26 Publikationen

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  • [26]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934274
    Meyer F, Bremges A, Belmann P, Janssen S, McHardy AC, Koslicki D. Assessing taxonomic metagenome profilers with OPAL. Genome biology. 2019;20(1): 51.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | Preprint
     
  • [25]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941280
    Zhu Q, Mai U, Pfeiffer W, et al. Phylogenomics of 10,575 genomes reveals evolutionary proximity between domains Bacteria and Archaea. Nature Communications. 2019;10(1): 5477.
    PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [24]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941281
    Bouslimani A, da Silva R, Kosciolek T, et al. The impact of skin care products on skin chemistry and microbiome dynamics. BMC Biology. 2019;17(1): 47.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [23]
    2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2934328
    Iszatt N, Janssen S, Lenters V, et al. Environmental toxicants in breast milk of Norwegian mothers and gut bacteria composition and metabolites in their infants at 1 month. Microbiome. 2019;7(1): 34.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [22]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921267
    McDonald D, Hyde E, Debelius JW, et al. American Gut: an Open Platform for Citizen Science Microbiome Research. mSystems. 2018;3(3):e00031-18.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [21]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921270
    Minich JJ, Zhu Q, Janssen S, et al. KatharoSeq Enables High-Throughput Microbiome Analysis from Low-Biomass Samples. mSystems. 2018;3(3):e00218-17.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [20]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921268
    Janssen S, McDonald D, Gonzalez A, et al. Phylogenetic Placement of Exact Amplicon Sequences Improves Associations with Clinical Information. mSystems. 2018;3(3):e00021-18.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [19]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2921273
    Kapono CA, Morton JT, Bouslimani A, et al. Creating a 3D microbial and chemical snapshot of a human habitat. Scientific Reports. 2018;8(1): 3669.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [18]
    2018 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2931839
    Bolyen E, Rideout JR, Dillon MR, et al. QIIME 2: Reproducible, interactive, scalable, and extensible microbiome data science. PeerJ. 2018.
    PUB | DOI
     
  • [17]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2931438
    Gonzalez A, Navas-Molina JA, Kosciolek T, et al. Qiita: rapid, web-enabled microbiome meta-analysis. Nature Methods. 2018;15(10):796-798.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [16]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914868
    Thompson LR, Sanders JG, McDonald D, et al. A communal catalogue reveals Earth’s multiscale microbial diversity. Nature. 2017;551(7681):457-463.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [15]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2914367
    Sczyrba A, Hofmann P, Belmann P, et al. Critical Assessment of Metagenome Interpretation—a benchmark of metagenomics software. Nature Methods. 2017;14(11):1063-1071.
    PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [14]
    2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907305
    Sampson TR, Debelius JW, Thron T, et al. Gut Microbiota Regulate Motor Deficits and Neuroinflammation in a Model of Parkinson's Disease. Cell. 2016;167(6):1469-1480.e12.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [13]
    2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764888 OA
    Janssen S, Giegerich R. Ambivalent covariance models. BMC Bioinformatics. 2015;16(1): 178.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [12]
    2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700599
    Janssen S, Giegerich R. The RNA shapes studio. Bioinformatics. 2014;31(3):423-425.
    PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [11]
    2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2682131 OA
    Janssen S. Kisses, ambivalent models and more: Contributions to the analysis of RNA secondary structure. Bielefeld: Universitätsbibliothek; 2014.
    PUB | PDF
     
  • [10]
    2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551798
    Sauthoff G, Mohl M, Janssen S, Giegerich R. Bellman's GAP -- a Language and Compiler for Dynamic Programming in Sequence Analysis. Bioinformatics. 2013;29(5):551-560.
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [9]
    2012 | Sammelwerksbeitrag | PUB-ID: 2439665
    Janssen S, Giegerich R. Abstract Shape Analysis of RNA. In: Gorodkin J, Weinberg Z, eds. RNA Bioinformatics t.b.a. 2012: 1-35.
    PUB
     
  • [8]
    2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2410526 OA
    Janssen S, Schudoma C, Steger G, Giegerich R. Lost in folding space? Comparing four variants of the thermodynamic model for RNA secondary structure prediction. BMC Bioinformatics. 2011;12(1): 429.
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [7]
    2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2310489
    Sauthoff G, Janssen S, Giegerich R. Bellman's GAP: a declarative language for dynamic programming. In: Proceedings of the 13th international ACM SIGPLAN symposium on Principles and practices of declarative programming. New York, NY, USA: ACM; 2011: 29-40.
    PUB | DOI | Download (ext.)
     
  • [6]
    2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785497 OA
    Schlüter J-P, Reinkensmeier J, Daschkey S, et al. A genome-wide survey of sRNAs in the symbiotic nitrogen-fixing alpha-proteobacterium Sinorhizobium meliloti. BMC Genomics. 2010;11(1): 245.
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [5]
    2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893988 OA
    Grond F, Janssen S, Schirmer S, Hermann T. Browsing RNA Structures by Interactive Sonification. In: Bresin R, Hermann T, Hunt A, eds. Proceedings of the 3rd Interactive Sonification Workshop. KTH, Stockholm, Sweden: KTH School of Computer Science and Communication (CSC); 2010: 11-16.
    PUB | Datei | Download (ext.)
     
  • [4]
    2010 | Datenpublikation | PUB-ID: 2698354 OA
    Grond F, Janssen S, Schirmer S, Hermann T. Supplementary Material for "Browsing RNA Structures by Interactive Sonification". Bielefeld University; 2010.
    PUB | Dateien verfügbar | DOI
     
  • [3]
    2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1894008 OA
    Theis C, Janssen S, Giegerich R. Prediction of RNA Secondary Structure Including Kissing Hairpin Motifs. In: Moulton V, Singh M, eds. Algorithms in Bioinformatics. 10th international workshop (WABI 2010), proceedings. Lecture Notes in Bioinformatics. Vol 6293. Berlin: Springer; 2010: 52-64.
    PUB | Datei | DOI
     
  • [2]
    2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893946 OA
    Janssen S, Giegerich R. Faster computation of exact RNA shape probabilities. Bioinformatics. 2010;26(5):632-639.
    PUB | Datei | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [1]
    2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893917 OA
    Janssen S, Reeder J, Giegerich R. Shape based indexing for faster search of RNA family databases. BMC Bioinformatics. 2008;9(1):131.
    PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     

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