PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2985152

  Schmidt, N.; Sielemann, K.; Breitenbach, S.; Fuchs, J.; Pucker, B.; Weisshaar, B.; Holtgräwe, D.; Heitkam, T. (2023): Repeat turnover meets stable chromosomes: repetitive DNA sequences mark speciation and gene pool boundaries in sugar beet and wild beets The Plant Journal,118:(1): 171-190.

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• [17]
  

  2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2980215

  Sielemann, K.; Pucker, B.; Orsini, E.; Elashry, A.; Schulte, L.; Viehöver, P.; Müller, A.; Schechert, A.; Weisshaar, B.; Holtgräwe, D. (2023): Genomic characterization of a nematode tolerance locus in sugar beet BMC Genomics,24:748

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• [16]
  

  2023 | Datenpublikation | PUB-ID: 2966927

  Sielemann, K.; Pucker, B.; Orsini, E.; Elashry, A.; Schulte, L.; Viehöver, P.; Müller, A. E.; Schechert, A.; Weisshaar, B.; Holtgräwe, D. (2023): Genome assembly, structural and functional annotation, and mRNA coverage/length files for KWS2320ONT_v1.0 and Strube U2BvONT_v1.0. Bielefeld University.

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• [15]
  

  2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2967319

  Sielemann, J.; Sielemann, K.; Brejová, B.; Vinař, T.; Chauve, C. (2023): plASgraph2: using graph neural networks to detect plasmid contigs from an assembly graph Frontiers in Microbiology ,14:1267695

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• [14]
  

  2023 | Dissertation | PUB-ID: 2981102

  Sielemann, K. (2023): Computational pangenomics and its application to sugar beet and crop wild relatives. Bielefeld: Universität Bielefeld.

  PUB
   
• [13]
  

  2023 | Datenpublikation | PUB-ID: 2966932

  Sielemann, K.; Schmidt, N.; Guzik, J.; Kalina, N.; Pucker, B.; Viehöver, P.; Breitenbach, S.; Weisshaar, B.; Heitkam, T.; Holtgräwe, D. (2023): Genome assembly and structural and functional annotation files for crop wild relatives of sugar beet. Bielefeld University.

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• [12]
  

  2023 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2980439

  Sielemann, K.; Schmidt, N.; Guzik, J.; Kalina, N.; Pucker, B.; Viehöver, P.; Breitenbach, S.; Weisshaar, B.; Heitkam, T.; Holtgräwe, D. (2023): Pangenome of cultivated beet and crop wild relatives reveals parental relationships of a tetraploid wild beet bioRxiv

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• [11]
  

  2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2958188

  Sielemann, K.; Pucker, B.; Schmidt, N.; Viehöver, P.; Weisshaar, B.; Heitkam, T.; Holtgräwe, D. (2022): Complete pan-plastome sequences enable high resolution phylogenetic classification of sugar beet and closely related crop wild relatives BMC Genomics,23:113

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• [10]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2943037

  Sielemann, K.; Weisshaar, B.; Pucker, B. (2021): Reference-based QUantification Of gene Dispensability (QUOD) Plant Methods,17:(1):18

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• [9]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2955789

  Gaertner, A.; Bloebaum, J.; Brodehl, A.; Klauke, B.; Sielemann, K.; Kassner, A.; Fox, H.; Morshuis, M.; Tiesmeier, J.; Schulz, U.; Knoell, R.; Gummert, J.; Milting, H. (2021): The Combined Human Genotype of Truncating TTN and RBM20 Mutations Is Associated with Severe and Early Onset of Dilated Cardiomyopathy Genes,12:(6):883

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• [8]
  

  2020 | Datenpublikation | PUB-ID: 2946079

  Sielemann, K.; Weisshaar, B.; Pucker, B. (2020): Reference-based QUantification Of gene Dispensability (QUOD) - test dataset. Bielefeld University.

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• [7]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935311

  Frey, K.; Pucker, B. (2020): Animal, fungi, and plant genome sequences harbour different non-canonical splice sites Cells,9:(2):458

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• [6]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2949125

  Höving, A. L.; Sielemann, K.; Greiner, J.; Kaltschmidt, B.; Knabbe, C.; Kaltschmidt, C. (2020): Transcriptome Analysis Reveals High Similarities between Adult Human Cardiac Stem Cells and Neural Crest-Derived Stem Cells Biology,9:(12):435

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• [5]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2949076

  Sielemann, K.; Elbeck, Z.; Gärtner, A.; Brodehl, A.; Stanasiuk, C.; Fox, H.; Paluszkiewicz, L.; Tiesmeier, J.; Wlost, S.; Gummert, J.; Albaum, S.; Sielemann, J.; Knöll, R.; Milting, H. (2020): Distinct Myocardial Transcriptomic Profiles of Cardiomyopathies Stratified by the Mutant Genes Genes,11:(12):1430

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• [4]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2946066

  Sielemann, K.; Hafner, A.; Pucker, B. (2020): The reuse of public datasets in the life sciences: potential risks and rewards PeerJ,8:e9954

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• [3]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935698

  Pucker, B.; Holtgräwe, D.; Stadermann, K. B.; Frey, K.; Huettel, B.; Reinhardt, R.; Weisshaar, B. (2019): Chromosome-level sequence assembly reveals the structure of the Arabidopsis thaliana Nd-1 genome and its gene set PLoS One,14:(5):e0216233

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• [2]
  

  2019 | Datenpublikation | PUB-ID: 2934220

  Pucker, B.; Frey, K. (2019): RNA-Seq read coverage depth of splice sites in fungi. Bielefeld University.

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• [1]
  

  2019 | Datenpublikation | PUB-ID: 2934226

  Pucker, B.; Frey, K. (2019): RNA-Seq read coverage depth of splice sites in animals. Bielefeld University.

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