Diego Rubert

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PEVZ-ID
332097280

18 Publikationen

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  • [18]
    2023 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2983338 OA
    Rubert, D.; Dias Vieira Braga, M. (2023): Efficient gene orthology inference via large-scale rearrangements Algorithms for Molecular Biology ,18:(1):14
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [17]
    2022 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2968237 OA
    Rubert, D.; Dias Vieira Braga, M. (2022): Gene Orthology Inference via Large-Scale Rearrangements for Partially Assembled Genomes. In: Christina Boucher; Sven Rahmann (Hrsg.): 22nd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2022). Dagstuhl: Schloss Dagstuhl, Leibniz-Zentrum für Informatik. (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs), 242).
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
     
  • [16]
    2022 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965058 OA
    Silva, H. O. M.; Rubert, D.; Araujo, E.; Martinez, F. V. (2022): Algorithms for a Restricted Genome Median Problem. In: Manoel Bezerra Campêlo Neto; Cristina Gomes Fernandes; Vinicius Fernandes dos Santos (Hrsg.): Anais do VII Encontro de Teoria da Computação (ETC 2022) = Proceedings of the 7th Theory of Computation Meeting . Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação - SBC. S. 45-48.
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
     
  • [15]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2954832 OA
    Rubert, D.; Martinez, F. V.; Dias Vieira Braga, M. (2021): Natural family-free genomic distance. Algorithms for molecular biology : AMB,16:(1):4
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [14]
    2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2959611
    Rubert, D.; Doerr, D.; Dias Vieira Braga, M. (2021): The potential of family-free rearrangements towards gene orthology inference Journal of Bioinformatics and Computational Biology,19:(6):2140014
    PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [13]
    2021 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965069 OA
    Araujo, E.; Rozante, L. C.; Rubert, D.; Martinez, F. V. (2021): Algorithms for Normalized Multiple Sequence Alignments. In: Hee-Kap Ahn; Kunihiko Sadakane (Hrsg.): 32nd International Symposium on Algorithms and Computation (ISAAC 2021). Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik. (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs), 212). S. 40:1-40:16.
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
     
  • [12]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965062
    Stefanes, M. A.; Rubert, D.; Soares, J. (2020): Scalable parallel algorithms for maximum matching and Hamiltonian circuit in convex bipartite graphs Theoretical Computer Science,804: 58-71.
    PUB | DOI | Download (ext.) | WoS
     
  • [11]
    2020 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2943670
    Rubert, D.; Araujo, E.; Stefanes, M. A.; Stoye, J.; Martinez, F. V. (2020): On motifs in colored graphs arXiv:2005.13634
    PUB | Download (ext.) | arXiv
     
  • [10]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942995
    Rubert, D.; Araujo, E.; Stefanes, M. A.; Stoye, J.; Martinez, F. (2020): Searching and Inferring Colorful Topological Motifs in Vertex-Colored Graphs Journal of Combinatorial Optimization,40: 379–411.
    PUB | DOI | WoS
     
  • [9]
    2020 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965072 OA
    Rubert, D.; Martinez, F. V.; Dias Vieira Braga, M. (2020): Natural Family-Free Genomic Distance. In: Carl Kingsford; Nadia Pisanti (Hrsg.): 20th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2020). Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik. (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs), 172). S. 3:1-3:23.
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
     
  • [8]
    2020 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965061 OA
    Rubert, D.; Stoye, J.; Martinez, F. H. V. (2020): Distance and Similarity Measures in Comparative Genomics. In: Daniel Avila Vecchiato (Hrsg.): Anais do Concurso de Teses e Dissertações da SBC (CTD-SBC 2020) = Proceedings of the 33rd Thesis and Dissertation Contest . Porto Alegre, RS: Sociedade Brasileira de Computação - SBC. S. 7-12.
    PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
     
  • [7]
    2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937712 OA
    Rubert, D.; Martinez, F. H. V.; Stoye, J.; Dörr, D. (2020): Analysis of local genome rearrangement improves resolution of ancestral genomic maps in plants BMC Genomics,21:(Suppl. 2):273
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [6]
    2019 | Datenpublikation | PUB-ID: 2936848 OA
    Dörr, D.; Rubert, D. (2019): Supplementary Data for "Analysis of local genome rearrangement improves resolution of ancestral genomic maps in plants". Bielefeld University.
    PUB | Dateien verfügbar | DOI
     
  • [5]
    2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919006 OA
    Rubert, D.; Hoshino, E. A.; Dias Vieira Braga, M.; Stoye, J.; Martinez, F. H. V. (2018): Computing the family-free DCJ similarity BMC Bioinformatics,19:(Suppl. 6):152
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [4]
    2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913015
    Rubert, D.; Medeiros, G. L.; Hoshino, E. A.; Dias Vieira Braga, M.; Stoye, J.; Martinez, F. H. V. (2017): Algorithms for Computing the Family-Free Genomic Similarity under DCJ. In: Joao Meidanis; Luay Nakhleh (Hrsg.): Comparative Genomics. RECOMB-CG 2017. Cham: Springer Verlag. (Lecture Notes in Bioinformatics, 10562). S. 76-100.
    PUB | DOI
     
  • [3]
    2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909057 OA
    Rubert, D.; Feijão, P.; Dias Vieira Braga, M.; Stoye, J.; Martinez, F. H. V. (2017): Approximating the DCJ distance of balanced genomes in linear time Algorithms for Molecular Biology,12:(1):3
    PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
     
  • [2]
    2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903708
    Rubert, D.; Feijão, P.; Dias Vieira Braga, M.; Stoye, J.; Martinez, F. H. V. (2016): A Linear Time Approximation Algorithm for the DCJ Distance for Genomes with Bounded Number of Duplicates. In: Martin Frith; Christian Nørgaard Storm Pedersen (Hrsg.): Algorithms in Bioinformatics. WABI 2016. Cham: Springer. (Lecture Notes in Bioinformatics, 9838). S. 293-306.
    PUB | DOI
     
  • [1]
    2015 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2965063
    Rubert, D.; Araujo, E.; Stefanes, M. A. (2015): SIMBio: Searching and inferring colorful motifs in biological networks. In: 2015 IEEE 15th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE). IEEE. S. 1-6.
    PUB | DOI | Download (ext.)
     
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