PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420

  GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data
  Shoshi A, Hoppe T, Kormeier B, Ogultarhan V, Hofestädt R (2015)
  BMC Medical Informatics and Decision Making 15(1): 15.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [20]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397

  Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping
  Shoshi A, Ogultarhan V, Hoppe T, Kormeier B, Müller U, Hofestädt R (2015)
  Journal of Bioinformatics and Computational Biology 13(1): 1540007.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [19]
  

  2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704619

  Towards Pathway Prediction and Subcellular Localization by using FraMeTex (Workshop Abstract)
  Wallmeyer T, Sommer B, Kormeier B (2014)
  In: Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop. Sommer B (Ed); Bielefeld: Bielefeld University: 18-19.

  PUB | PDF | DOI
   
• [18]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732

  VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications
  Brinkrolf C, Janowski SJ, Kormeier B, Lewinski M, Hippe K, Borck D, Hofestädt R (2014)
  Journal of Integrative Bioinformatics 11(2): 239.

  PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
   
• [17]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817

  Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets
  Sommer B, Kormeier B, Demenkov PS, Arrigo P, Hippe K, Ates Ö, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R (2013)
  Journal of Bioinformatics and Computational Biology 11(01): 1340005.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [16]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699

  Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap
  Hofestädt R, Kormeier B, Lange M, Schreiber F, Sommer B, Weise S (2013)
  Journal of Integrative Bioinformatics 10(1): 226.

  PUB
   
• [15]
  

  2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374711

  Building Information Retrieval Portals using the lailaps search engine
  Lange M, Chen J, Borck D, Colmsee C, Hippe K, Kormeier B, Weise S, Scholz U (2011)
  In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. 90.

  PUB
   
• [14]
  

  2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374702

  The LAILAPS Information Retrieval Portal as Scalable and Integrative Database Query Endpoint
  Lange M, Chen J, Borck D, Colmsee C, Hippe K, Kormeier B, Weise S, Scholz U (2011)
  In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. 37.

  PUB
   
• [13]
  

  2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720

  DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data
  Hippe K, Kormeier B, Janowski SJ, Töpel T, Hofestädt R (2011)
  In: Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.

  PUB
   
• [12]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407

  Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks
  Chen M, Hariharaputran S, Hofestädt R, Kormeier B, Spangardt S (2011)
  Natural Computing 10(3): 1077-1097.

  PUB | DOI | WoS
   
• [11]
  

  2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156

  Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing
  Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, Hippe K, Hofestädt R, Willassen N, Friesen R, Rubert S, Borck D, Haugen P, Chen M (2011)
  In: Biological Petri Nets. Wingender E (Ed); Studies in health technology and informatics, 162. Amsterdam: IOS Press: 182-203.

  PUB | PubMed | Europe PMC
   
• [10]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602

  Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data
  Kormeier B, Hippe K, Hofestädt R (2011)
  it Information Technology 53(5): 241-249.

  PUB | DOI
   
• [9]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168

  CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases
  Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R (2010)
  Journal of Integrative Bioinformatics 7(1): 142.

  PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
   
• [8]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096

  Reconstruction of biological networks based on life science data integration
  Kormeier B, Hippe K, Arrigo P, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R (2010)
  Journal of Integrative Bioinformatics 7(2): 3-8.

  PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
   
• [7]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780

  DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data
  Hippe K, Kormeier B, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R (2010)
  In: Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. LNI, 176. Bonn: Ges. für Informatik: 720-725.

  PUB
   
• [6]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757

  Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches
  Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, et al. (2010)
  Journal of Integrative Bioinformatics 7(1): 148.

  PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
   
• [5]
  

  2010 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301537

  Semi-automated reconstruction of biological networks based on a life science data warehouse
  Kormeier B (2010)
  Bielefeld (Germany): Bielefeld University.

  PUB | PDF
   
• [4]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746

  Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing
  Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, Hippe K, Hofestädt R, Willassen N, Friesen R, Rubert S, Borck D, Haugen P, Chen M (2010)
  In Silico Biology 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology): 27-48.

  PUB
   
• [3]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2002601

  CELLMICROCOSMOS 4.1, An Interactive Approach to Integrating Spatially Localized Metabolic Networks into a Virtual 3D Cell Environment.
  Sommer B, Künsemöller J, Sand N, Husemann A, Rumming M, Kormeier B (2010)
  Presented at the BIOINFORMATICS 2010, Valencia, Spain.

  PUB
   
• [2]
  

  2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628

  CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases
  Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R (2009)
  In: Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. Fischer S, Maehle E, Reischuk R (Eds); Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI): 704-708.

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• [1]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955

  BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration
  Töpel T, Kormeier B, Klassen A, Hofestädt R (2008)
  Journal of Integrative Bioinformatics 5(2): 343-349.

  PUB | DOI | PubMed | Europe PMC