21 Publikationen

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[21]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data
Shoshi A, Hoppe T, Kormeier B, Ogultarhan V, Hofestädt R (2015)
BMC Medical Informatics and Decision Making 15: 15.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[20]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping
Shoshi A, Ogultarhan V, Hoppe T, Kormeier B, Müller U, Hofestädt R (2015)
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 13(1): 1540007.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[19]
2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704619
Towards Pathway Prediction and Subcellular Localization by using FraMeTex (Workshop Abstract)
Wallmeyer T, Sommer B, Kormeier B (2014)
In: Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop. Sommer B (Ed); Bielefeld: Bielefeld University: 18-19.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.)
 
[18]
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications
Brinkrolf C, Janowski SJ, Kormeier B, Lewinski M, Hippe K, Borck D, Hofestädt R (2014)
Journal of Integrative Bioinformatics 11(2): 239.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[17]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets
Sommer B, Kormeier B, Demenkov PS, Arrigo P, Hippe K, Ates Ö, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R (2013)
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 11(01): 1340005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap
Hofestädt R, Kormeier B, Lange M, Schreiber F, Sommer B, Weise S (2013)
Journal of Integrative Bioinformatics 10(1): 226.
PUB
 
[15]
2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374711
Building Information Retrieval Portals using the lailaps search engine
Lange M, Chen J, Borck D, Colmsee C, Hippe K, Kormeier B, Weise S, Scholz U (2011)
In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. 90.
PUB
 
[14]
2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374702
The LAILAPS Information Retrieval Portal as Scalable and Integrative Database Query Endpoint
Lange M, Chen J, Borck D, Colmsee C, Hippe K, Kormeier B, Weise S, Scholz U (2011)
In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. 37.
PUB
 
[13]
2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data
Hippe K, Kormeier B, Janowski SJ, Töpel T, Hofestädt R (2011)
In: Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.
PUB
 
[12]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks
Chen M, Hariharaputran S, Hofestädt R, Kormeier B, Spangardt S (2011)
Natural Computing 10(3): 1077-1097.
PUB | DOI | WoS
 
[11]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing
Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, Hippe K, Hofestädt R, Willassen N, Friesen R, Rubert S, Borck D, Haugen P, Chen M (2011)
In: Biological Petri Nets. Wingender E (Ed); Studies in health technology and informatics, 162. Amsterdam: IOS Press: 182-203.
PUB | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data
Kormeier B, Hippe K, Hofestädt R (2011)
it Information Technology 53(5): 241-249.
PUB | DOI
 
[9]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data
Hippe K, Kormeier B, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R (2010)
In: Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. LNI, 176. Bonn: Ges. für Informatik: 720-725.
PUB
 
[8]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches
Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, et al. (2010)
Journal of Integrative Bioinformatics 7(1): 148.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2010 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301537
Semi-automated reconstruction of biological networks based on a life science data warehouse
Kormeier B (2010)
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
PUB | PDF
 
[6]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases
Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R (2010)
Journal of Integrative Bioinformatics 7(1): 142.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[5]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing
Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, Hippe K, Hofestädt R, Willassen N, Friesen R, Rubert S, Borck D, Haugen P, Chen M (2010)
In Silico Biology 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology): 27-48.
PUB
 
[4]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
Reconstruction of biological networks based on life science data integration
Kormeier B, Hippe K, Arrigo P, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R (2010)
Journal of Integrative Bioinformatics 7(2).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[3]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2002601
CELLMICROCOSMOS 4.1, An Interactive Approach to Integrating Spatially Localized Metabolic Networks into a Virtual 3D Cell Environment.
Sommer B, Künsemöller J, Sand N, Husemann A, Rumming M, Kormeier B (2010)
Presented at the BIOINFORMATICS 2010, Valencia, Spain.
PUB
 
[2]
2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases
Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R (2009)
In: Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. Fischer S, Maehle E, Reischuk R (Eds); Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI): 704-708.
PUB | Download (ext.)
 
[1]
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955
BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration
Töpel T, Kormeier B, Klassen A, Hofestädt R (2008)
Journal of Integrative Bioinformatics 5(2).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 

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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420
GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data
Shoshi A, Hoppe T, Kormeier B, Ogultarhan V, Hofestädt R (2015)
BMC Medical Informatics and Decision Making 15: 15.
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[20]
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397
Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping
Shoshi A, Ogultarhan V, Hoppe T, Kormeier B, Müller U, Hofestädt R (2015)
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 13(1): 1540007.
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704619
Towards Pathway Prediction and Subcellular Localization by using FraMeTex (Workshop Abstract)
Wallmeyer T, Sommer B, Kormeier B (2014)
In: Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop. Sommer B (Ed); Bielefeld: Bielefeld University: 18-19.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732
VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications
Brinkrolf C, Janowski SJ, Kormeier B, Lewinski M, Hippe K, Borck D, Hofestädt R (2014)
Journal of Integrative Bioinformatics 11(2): 239.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817
Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets
Sommer B, Kormeier B, Demenkov PS, Arrigo P, Hippe K, Ates Ö, Kochetov AV, Ivanisenko VA, Kolchanov NA, Hofestädt R (2013)
Journal of Bioinformatics and Computational Biology 11(01): 1340005.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[16]
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699
Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap
Hofestädt R, Kormeier B, Lange M, Schreiber F, Sommer B, Weise S (2013)
Journal of Integrative Bioinformatics 10(1): 226.
PUB
 
[15]
2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374711
Building Information Retrieval Portals using the lailaps search engine
Lange M, Chen J, Borck D, Colmsee C, Hippe K, Kormeier B, Weise S, Scholz U (2011)
In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. 90.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374702
The LAILAPS Information Retrieval Portal as Scalable and Integrative Database Query Endpoint
Lange M, Chen J, Borck D, Colmsee C, Hippe K, Kormeier B, Weise S, Scholz U (2011)
In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. 37.
PUB
 
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720
DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data
Hippe K, Kormeier B, Janowski SJ, Töpel T, Hofestädt R (2011)
In: Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.
PUB
 
[12]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407
Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks
Chen M, Hariharaputran S, Hofestädt R, Kormeier B, Spangardt S (2011)
Natural Computing 10(3): 1077-1097.
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[11]
2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156
Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing
Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, Hippe K, Hofestädt R, Willassen N, Friesen R, Rubert S, Borck D, Haugen P, Chen M (2011)
In: Biological Petri Nets. Wingender E (Ed); Studies in health technology and informatics, 162. Amsterdam: IOS Press: 182-203.
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[10]
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602
Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data
Kormeier B, Hippe K, Hofestädt R (2011)
it Information Technology 53(5): 241-249.
PUB | DOI
 
[9]
2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780
DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data
Hippe K, Kormeier B, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R (2010)
In: Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. LNI, 176. Bonn: Ges. für Informatik: 720-725.
PUB
 
[8]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757
Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches
Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, Hippe K, Janowski SJ, Ivanisenko TV, Bragin AO, Arrigo P, Demenkov PS, Kochetov AV, Ivanisenko VA, et al. (2010)
Journal of Integrative Bioinformatics 7(1): 148.
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[7]
2010 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301537
Semi-automated reconstruction of biological networks based on a life science data warehouse
Kormeier B (2010)
Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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[6]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168
CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases
Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R (2010)
Journal of Integrative Bioinformatics 7(1): 142.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746
Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing
Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, Hippe K, Hofestädt R, Willassen N, Friesen R, Rubert S, Borck D, Haugen P, Chen M (2010)
In Silico Biology 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology): 27-48.
PUB
 
[4]
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096
Reconstruction of biological networks based on life science data integration
Kormeier B, Hippe K, Arrigo P, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R (2010)
Journal of Integrative Bioinformatics 7(2).
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
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2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2002601
CELLMICROCOSMOS 4.1, An Interactive Approach to Integrating Spatially Localized Metabolic Networks into a Virtual 3D Cell Environment.
Sommer B, Künsemöller J, Sand N, Husemann A, Rumming M, Kormeier B (2010)
Presented at the BIOINFORMATICS 2010, Valencia, Spain.
PUB
 
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2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628
CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases
Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R (2009)
In: Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. Fischer S, Maehle E, Reischuk R (Eds); Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI): 704-708.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955
BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration
Töpel T, Kormeier B, Klassen A, Hofestädt R (2008)
Journal of Integrative Bioinformatics 5(2).
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