PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420

  Shoshi A, Hoppe T, Kormeier B, Ogultarhan V, Hofestädt R. GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making. 2015;15(1): 15.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [20]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397

  Shoshi A, Ogultarhan V, Hoppe T, Kormeier B, Müller U, Hofestädt R. Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 2015;13(1): 1540007.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [19]
  

  2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704619

  Wallmeyer T, Sommer B, Kormeier B. Towards Pathway Prediction and Subcellular Localization by using FraMeTex (Workshop Abstract). In: Sommer B, ed. Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop. Bielefeld: Bielefeld University; 2014: 18-19.

  PUB | PDF | DOI
   
• [18]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732

  Brinkrolf C, Janowski SJ, Kormeier B, et al. VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics. 2014;11(2):239.

  PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
   
• [17]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817

  Sommer B, Kormeier B, Demenkov PS, et al. Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 2013;11(01): 1340005.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [16]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699

  Hofestädt R, Kormeier B, Lange M, Schreiber F, Sommer B, Weise S. Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics. 2013;10(1):226.

  PUB
   
• [15]
  

  2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374711

  Lange M, Chen J, Borck D, et al. Building Information Retrieval Portals using the lailaps search engine. In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. 2011: 90.

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• [14]
  

  2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374702

  Lange M, Chen J, Borck D, et al. The LAILAPS Information Retrieval Portal as Scalable and Integrative Database Query Endpoint. In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. 2011: 37.

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• [13]
  

  2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720

  Hippe K, Kormeier B, Janowski SJ, Töpel T, Hofestädt R. DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. In: Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics. 2011.

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• [12]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407

  Chen M, Hariharaputran S, Hofestädt R, Kormeier B, Spangardt S. Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks. Natural Computing. 2011;10(3):1077-1097.

  PUB | DOI | WoS
   
• [11]
  

  2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156

  Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, et al. Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing. In: Wingender E, ed. Biological Petri Nets. Studies in health technology and informatics. Vol 162. Amsterdam: IOS Press; 2011: 182-203.

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• [10]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602

  Kormeier B, Hippe K, Hofestädt R. Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data. it Information Technology. 2011;53(5):241-249.

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• [9]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168

  Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R. CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics. 2010;7(1): 142.

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• [8]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096

  Kormeier B, Hippe K, Arrigo P, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R. Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. 2010;7(2):3-8.

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• [7]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780

  Hippe K, Kormeier B, Töpel T, Janowski SJ, Hofestädt R. DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data. In: Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. LNI. Vol 176. Bonn: Ges. für Informatik; 2010: 720-725.

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• [6]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757

  Sommer B, Tiys ES, Kormeier B, et al. Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics. 2010;7(1):148.

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• [5]
  

  2010 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301537

  Kormeier B. Semi-automated reconstruction of biological networks based on a life science data warehouse. Bielefeld (Germany): Bielefeld University; 2010.

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• [4]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746

  Janowski SJ, Kormeier B, Töpel T, et al. Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology. 2010;10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology):27-48.

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• [3]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2002601

  Sommer B, Künsemöller J, Sand N, Husemann A, Rumming M, Kormeier B. CELLMICROCOSMOS 4.1, An Interactive Approach to Integrating Spatially Localized Metabolic Networks into a Virtual 3D Cell Environment. Presented at the BIOINFORMATICS 2010, Valencia, Spain.

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• [2]
  

  2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628

  Kormeier B, Hippe K, Töpel T, Hofestädt R. CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In: Fischer S, Maehle E, Reischuk R, eds. Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI); 2009: 704-708.

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• [1]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955

  Töpel T, Kormeier B, Klassen A, Hofestädt R. BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics. 2008;5(2):343-349.

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