PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420

  Shoshi, A.; Hoppe, T.; Kormeier, B.; Ogultarhan, V.; Hofestädt, R. (2015): GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data BMC Medical Informatics and Decision Making,15:(1):15

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• [20]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397

  Shoshi, A.; Ogultarhan, V.; Hoppe, T.; Kormeier, B.; Müller, U.; Hofestädt, R. (2015): Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping Journal of Bioinformatics and Computational Biology,13:(1):1540007

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  2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704619

  Wallmeyer, T.; Sommer, B.; Kormeier, B. (2014): Towards Pathway Prediction and Subcellular Localization by using FraMeTex (Workshop Abstract). In: Björn Sommer (Hrsg.): Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop. Bielefeld: Bielefeld University. S. 18-19.

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• [18]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732

  Brinkrolf, C.; Janowski, S. J.; Kormeier, B.; Lewinski, M.; Hippe, K.; Borck, D.; Hofestädt, R. (2014): VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications Journal of Integrative Bioinformatics,11:(2): 239.

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• [17]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817

  Sommer, B.; Kormeier, B.; Demenkov, P. S.; Arrigo, P.; Hippe, K.; Ates, Ö.; Kochetov, A. V.; Ivanisenko, V. A.; Kolchanov, N. A.; Hofestädt, R. (2013): Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets Journal of Bioinformatics and Computational Biology,11:(01):1340005

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  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699

  Hofestädt, R.; Kormeier, B.; Lange, M.; Schreiber, F.; Sommer, B.; Weise, S. (2013): Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap Journal of Integrative Bioinformatics,10:(1): 226.

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• [15]
  

  2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374711

  Lange, M.; Chen, J.; Borck, D.; Colmsee, C.; Hippe, K.; Kormeier, B.; Weise, S.; Scholz, U. (2011): Building Information Retrieval Portals using the lailaps search engine. In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. S. 90.

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• [14]
  

  2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374702

  Lange, M.; Chen, J.; Borck, D.; Colmsee, C.; Hippe, K.; Kormeier, B.; Weise, S.; Scholz, U. (2011): The LAILAPS Information Retrieval Portal as Scalable and Integrative Database Query Endpoint. In: Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics. S. 37.

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• [13]
  

  2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720

  Hippe, K.; Kormeier, B.; Janowski, S. J.; Töpel, T.; Hofestädt, R. (2011): DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. In: Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.

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• [12]
  

  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407

  Chen, M.; Hariharaputran, S.; Hofestädt, R.; Kormeier, B.; Spangardt, S. (2011): Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks Natural Computing,10:(3): 1077-1097.

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• [11]
  

  2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156

  Janowski, S. J.; Kormeier, B.; Töpel, T.; Hippe, K.; Hofestädt, R.; Willassen, N.; Friesen, R.; Rubert, S.; Borck, D.; Haugen, P.; Chen, M. (2011): Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing. In: Edgar Wingender (Hrsg.): Biological Petri Nets. Amsterdam: IOS Press. (Studies in health technology and informatics, 162). S. 182-203.

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  2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408602

  Kormeier, B.; Hippe, K.; Hofestädt, R. (2011): Data Warehouses in Bioinformatics: Integration of Molecular Biological Data it Information Technology,53:(5): 241-249.

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• [9]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168

  Kormeier, B.; Hippe, K.; Töpel, T.; Hofestädt, R. (2010): CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases Journal of Integrative Bioinformatics,7:(1):142

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• [8]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096

  Kormeier, B.; Hippe, K.; Arrigo, P.; Töpel, T.; Janowski, S. J.; Hofestädt, R. (2010): Reconstruction of biological networks based on life science data integration Journal of Integrative Bioinformatics,7:(2): 3-8.

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• [7]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780

  Hippe, K.; Kormeier, B.; Töpel, T.; Janowski, S. J.; Hofestädt, R. (2010): DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data. In: Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik. Bonn: Ges. für Informatik. (LNI, 176). S. 720-725.

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• [6]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757

  Sommer, B.; Tiys, E. S.; Kormeier, B.; Hippe, K.; Janowski, S. J.; Ivanisenko, T. V.; Bragin, A. O.; Arrigo, P.; Demenkov, P. S.; Kochetov, A. V.; Ivanisenko, V. A.; Kolchanov, N. A.; Hofestädt, R. (2010): Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches Journal of Integrative Bioinformatics,7:(1): 148.

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• [5]
  

  2010 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301537

  Kormeier, B. (2010): Semi-automated reconstruction of biological networks based on a life science data warehouse. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.

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• [4]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746

  Janowski, S. J.; Kormeier, B.; Töpel, T.; Hippe, K.; Hofestädt, R.; Willassen, N.; Friesen, R.; Rubert, S.; Borck, D.; Haugen, P.; Chen, M. (2010): Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing In Silico Biology,10:(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology): 27-48.

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• [3]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2002601

  Sommer, B.; Künsemöller, J.; Sand, N.; Husemann, A.; Rumming, M.; Kormeier, B. (2010): CELLMICROCOSMOS 4.1, An Interactive Approach to Integrating Spatially Localized Metabolic Networks into a Virtual 3D Cell Environment. INSTICC - Institute for Systems and Technologies of Information, Control and Communication.

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  2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628

  Kormeier, B.; Hippe, K.; Töpel, T.; Hofestädt, R. (2009): CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In: Stefan Fischer; Erik Maehle; Rüdiger Reischuk (Hrsg.): Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck. Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI). S. 704-708.

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• [1]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955

  Töpel, T.; Kormeier, B.; Klassen, A.; Hofestädt, R. (2008): BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration Journal of Integrative Bioinformatics,5:(2): 343-349.

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