21 Publikationen
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2722420Shoshi, A., Hoppe, T., Kormeier, B., Ogultarhan, V. & Hofestädt, R. (2015). GraphSAW: A web-based system for graphical analysis of drug interactions and side effects using pharmaceutical and molecular data. BMC Medical Informatics and Decision Making, 15(1): 15. Springer Science + Business Media. doi:10.1186/s12911-015-0139-5.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2709397Shoshi, A., Ogultarhan, V., Hoppe, T., Kormeier, B., Müller, U. & Hofestädt, R. (2015). Identifying adverse drug reactions and drug-induced diseases using network-based drug mapping. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 13(1): 1540007. World Scientific Pub Co Pte Lt. doi:10.1142/S0219720015400077.
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2014 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2704619Wallmeyer, T., Sommer, B. & Kormeier, B. (2014). Towards Pathway Prediction and Subcellular Localization by using FraMeTex (Workshop Abstract). In B. Sommer (Hrsg.), Proceedings of the CELLmicrocosmos neXt workshop (S. 18-19). Gehalten auf der CELLmicrocosmos neXt workshop 2014, Bielefeld: Bielefeld University. doi:10.2390/biecoll-next2014-8.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2685732Brinkrolf, C., Janowski, S.J., Kormeier, B., Lewinski, M., Hippe, K., Borck, D. & Hofestädt, R. (2014). VANESA - A Software Application for the Visualization and Analysis of Networks in System Biology Applications. Journal of Integrative Bioinformatics, 11(2), 239. IMBio e.V. doi:10.2390/biecoll-jib-2014-239.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2560817Sommer, B., Kormeier, B., Demenkov, P.S., Arrigo, P., Hippe, K., Ates, Ö., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A. & Hofestädt, R. (2013). Subcellular localization charts: a new visual methodology for the semi-automatic localization of protein-related data sets. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 11(01): 1340005. World Scientific Pub Co Pte Lt. doi:10.1142/S0219720013400052.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901699Hofestädt, R., Kormeier, B., Lange, M., Schreiber, F., Sommer, B. & Weise, S. (2013). Editorial: JIBtools - a Strategy to Reduce the Bioinformatics Analysis Gap. Journal of Integrative Bioinformatics, 10(1), 226. Walter De Gruyter Gmbh.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374711Lange, M., Chen, J., Borck, D., Colmsee, C., Hippe, K., Kormeier, B., Weise, S. & Scholz, U. (2011). Building Information Retrieval Portals using the lailaps search engine. Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (S. 90). Gehalten auf der 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374702Lange, M., Chen, J., Borck, D., Colmsee, C., Hippe, K., Kormeier, B., Weise, S. & Scholz, U. (2011). The LAILAPS Information Retrieval Portal as Scalable and Integrative Database Query Endpoint. Proceedings of the 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (S. 37). Gehalten auf der 6th International Symposium on Health Informatics and Bioinformatics (HIBIT 2011).
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S.J., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2011). DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2326407Chen, M., Hariharaputran, S., Hofestädt, R., Kormeier, B. & Spangardt, S. (2011). Petri net models for the semi-automatic construction of large scale biological networks. Natural Computing, 10(3), 1077-1097. Springer Science + Business Media. doi:10.1007/s11047-009-9151-y.
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2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2011). Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (S. 182-203). Amsterdam: IOS Press.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2010). CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1): 142. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-142.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(2), 3-8. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-146.
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2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data (LNI). Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik (S. 720-725). Gehalten auf der Informatik 2010, Bonn: Ges. für Informatik.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374757Sommer, B., Tiys, E.S., Kormeier, B., Hippe, K., Janowski, S.J., Ivanisenko, T.V., Bragin, A.O., Arrigo, P., Demenkov, P.S., Kochetov, A.V., Ivanisenko, V.A., Kolchanov, N.A. & Hofestädt, R. (2010). Visualization and Analysis of a Cardio Vascular Disease-and MUPP1-related Biological Network combining Text Mining and Data Warehouse Approaches. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1), 148. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-148.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2010). Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology, 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology), 27-48. IOS Press.
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2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2002601Sommer, B., Künsemöller, J., Sand, N., Husemann, A., Rumming, M. & Kormeier, B. (2010). CELLMICROCOSMOS 4.1, An Interactive Approach to Integrating Spatially Localized Metabolic Networks into a Virtual 3D Cell Environment. Gehalten auf der BIOINFORMATICS 2010, INSTICC - Institute for Systems and Technologies of Information, Control and Communication.
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2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2009). CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In S. Fischer, E. Maehle & R. Reischuk (Hrsg.), Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck (S. 704-708). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI).
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A. & Hofestädt, R. (2008). BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 5(2), 343-349. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2008-93.