PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2961707

  Schenk J, Höss S, Kleinbölting N, Traunspurger W. Suitability of molecular taxonomy for assessing polluted sediments using the NemaSPEAR[%] index. Ecological Indicators. 2022;137: 108761.

  PUB | DOI | WoS
   
• [17]
  

  2021 | Datenpublikation | PUB-ID: 2956654

  Schilbert H, Kleinbölting N, Weisshaar B, Pucker B. Arabidopsis thaliana methylation pattern analysis based on ONT sequence reads. Bielefeld University; 2021.

  PUB | Dateien verfügbar | DOI
   
• [16]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2952434

  Pucker B, Kleinbölting N, Weisshaar B. Large scale genomic rearrangements in selected Arabidopsis thaliana T-DNA lines are caused by T-DNA insertion mutagenesis. BMC Genomics. 2021;22: 599.

  PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC | Preprint | EBI - ENA Project
   
• [15]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945007

  Schenk J, Höss S, Brinke M, Kleinbölting N, Brüchner-Hüttemann H, Traunspurger W. Dataset supporting the use of nematodes as bioindicators of polluted sediments. Data in Brief. 2020;32: 106087.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [14]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2944633

  Schenk J, Höss S, Brinke M, Kleinbölting N, Brüchner-Hüttemann H, Traunspurger W. Nematodes as bioindicators of polluted sediments using metabarcoding and microscopic taxonomy. Environment International. 2020;143: 105922.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [13]
  

  2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941261

  Schenk J, Kleinbölting N, Traunspurger W. Comparison of morphological, DNA barcoding, and metabarcoding characterizations of freshwater nematode communities. Ecology and Evolution. 2020;10(6): ece3.6104.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [12]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2956709

  Wibberg D, Batut B, Belmann P, et al. The de.NBI / ELIXIR-DE training platform - Bioinformatics training in Germany and across Europe within ELIXIR. F1000Research. 2019;8: 1877.

  PUB | DOI
   
• [11]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941263

  Schenk J, Geisen S, Kleinbölting N, Traunspurger W. Metabarcoding data allow for reliable biomass estimates in the most abundant animals on earth. Metabarcoding and Metagenomics. 2019;3: e46704.

  PUB | PDF | DOI
   
• [10]
  

  2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2948766

  Wibberg D, Batut B, Belmann P, et al. The de.NBI / ELIXIR-DE training platform - Bioinformatics training in Germany and across Europe within ELIXIR. F1000Research. 2019;8: 1877 .

  PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
   
• [9]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907696

  Kleinbölting N, Huep G, Weisshaar B. Enhancing the GABI-Kat Arabidopsis thaliana T-DNA insertion mutant database by incorporating Araport11 annotation. Plant and Cell Physiology. 2017;58(1): e7.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [8]
  

  2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913556

  Jünemann S, Kleinbölting N, Jaenicke S, et al. Bioinformatics for NGS-based metagenomics and the application to biogas research. Journal of Biotechnology. 2017;261(SI):10-23.

  PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [7]
  

  2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907705

  Brink B, Seidel A, Kleinbölting N, Nattkemper TW, Albaum S. Omics Fusion - A Platform for Integrative Analysis of Omics Data. Journal of Integrative Bioinformatics. 2016;13(4: SI): 296.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [6]
  

  2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2770216

  Kleinbölting N, Huep G, Appelhagen I, Viehöver P, Li Y, Weisshaar B. The structural features of thousands of T-DNA insertion sites are consistent with a double-strand break repair based insertion mechanism. Molecular Plant. 2015;8(11):1651-1664.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
   
• [5]
  

  2015 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2762959

  Kleinbölting N. Charakterisierung und Sequenzanalyse von T-DNA Insertionsstrukturen und paralogen Bereichen im Genom von Arabidopsis thaliana basierend auf Optimierungen der Daten-Erfassung und -Auswertung fur die GABI-Kat-Kollektion. Bielefeld: Universitätsbibliothek; 2015.

  PUB | PDF
   
• [4]
  

  2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700166

  Huep G, Kleinbölting N, Weisshaar B. An easy-to-use primer design tool to address paralogous loci and T-DNA insertion sites in the genome of Arabidopsis thaliana. Plant Methods. 2014;10(1): 28.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [3]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2629570

  Huep G, Kleinbölting N, Appelhagen I, Viehöver P, Weisshaar B. Insertionslinien als Werkzeuge für funktionelle Genomforschung. BIOspektrum. 2013;19(6):639-641.

  PUB | DOI
   
• [2]
  

  2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2579749

  Bolle C, Huep G, Kleinbölting N, et al. GABI-DUPLO: a collection of double mutants to overcome genetic redundancy in Arabidopsis thaliana. The Plant Journal. 2013;75(1):157-171.

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [1]
  

  2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2448791

  Kleinbölting N, Huep G, Klotgen A, Viehöver P, Weisshaar B. GABI-Kat SimpleSearch: new features of the Arabidopsis thaliana T-DNA mutant database. Nucleic Acids Research. 2012;40(D1):D1211-D1215.

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC