13 Publikationen

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[13]
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2948401
ConCysFind: a pipeline tool to predict conserved amino acids of protein sequences across the plant kingdom
Moore M, Wesemann C, Gossmann N, Sahm A, Krüger J, Sczyrba A, Dietz K-J (2020)
BMC Bioinformatics 21(1): 490.
PUB | DOI | PubMed | Europe PMC
 
[12]
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936223 OA
de.NBI Cloud federation through ELIXIR AAI
Belmann P, Fischer B, Krüger J, Procházka M, Rasche H, Prinz M, Hanussek M, Lang M, Bartusch F, Gläßle B, Krüger J, et al. (2019)
F1000Research 8: 842.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | PubMed | Europe PMC
 
[11]
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915890
Analyzing large scale genomic data on the cloud with Sparkhit
Huang L, Krüger J, Sczyrba A (2018)
Bioinformatics 34(9): 1457-1465.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2017 | Datenpublikation | PUB-ID: 2914921 OA
Sparkhit evaluation data set
Huang L, Krüger J, Sczyrba A (2017)
Bielefeld University.
PUB | Dateien verfügbar | DOI
 
[9]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907633 OA
acdc – Automated Contamination Detection and Confidence estimation for single-cell genome data
Lux M, Krüger J, Rinke C, Maus I, Schlüter A, Woyke T, Sczyrba A, Hammer B (2016)
BMC Bioinformatics 17(1): 543.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547307
Personalized cloud-based bioinformatics services for research and education: use cases and the elasticHPC package
El-Kalioby M, Abouelhoda M, Krüger J, Giegerich R, Sczyrba A, Wall DP, Tonellato P (2012)
BMC Bioinformatics 13(Suppl 17): S22.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383462
Webservices and Workflows on the Bielefeld Bioinformatics Server: Practices and Problems
Hartmeier S, Krüger J, Giegerich R (2007)
In: Proceedings.
PUB
 
[6]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587979 OA
RNA Movies 2: sequential animation of RNA secondary structures
Kaiser A, Krüger J, Evers DJ (2007)
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 35(Web Server): W330-W334.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[5]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible
Krüger J, Rehmsmeier M (2006)
Nucleic Acids Research 34(Web Server): W451-W454.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773871 OA
XML schemas for common bioinformatic data types and their application in workflow systems
Seibel PN, Krüger J, Hartmeier S, Schwarzer K, Löwenthal K, Mersch H, Dandekar T, Giegerich R (2006)
BMC Bioinformatics 7(1): 490.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[3]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible
Krüger J, Rehmsmeier M (2006)
Nucleic Acids Research 34(Web Server): W451-W454.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607394 OA
e2g: an interactive web-based server for efficiently mapping large EST and cDNA sets to genomic sequences
Krüger J, Sczyrba A, Kurtz S, Giegerich R (2004)
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 32(Web Server): W301-W304.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773844 OA
RNA-related tools on the Bielefeld Bioinformatics Server
Sczyrba A, Krüger J, Mersch H, Kurtz S, Giegerich R (2003)
Nucleic Acids Research 31(13): 3767-3770.
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2948401
ConCysFind: a pipeline tool to predict conserved amino acids of protein sequences across the plant kingdom
Moore M, Wesemann C, Gossmann N, Sahm A, Krüger J, Sczyrba A, Dietz K-J (2020)
BMC Bioinformatics 21(1): 490.
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2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936223 OA
de.NBI Cloud federation through ELIXIR AAI
Belmann P, Fischer B, Krüger J, Procházka M, Rasche H, Prinz M, Hanussek M, Lang M, Bartusch F, Gläßle B, Krüger J, et al. (2019)
F1000Research 8: 842.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915890
Analyzing large scale genomic data on the cloud with Sparkhit
Huang L, Krüger J, Sczyrba A (2018)
Bioinformatics 34(9): 1457-1465.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[10]
2017 | Datenpublikation | PUB-ID: 2914921 OA
Sparkhit evaluation data set
Huang L, Krüger J, Sczyrba A (2017)
Bielefeld University.
PUB | Dateien verfügbar | DOI
 
[9]
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907633 OA
acdc – Automated Contamination Detection and Confidence estimation for single-cell genome data
Lux M, Krüger J, Rinke C, Maus I, Schlüter A, Woyke T, Sczyrba A, Hammer B (2016)
BMC Bioinformatics 17(1): 543.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[8]
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2547307
Personalized cloud-based bioinformatics services for research and education: use cases and the elasticHPC package
El-Kalioby M, Abouelhoda M, Krüger J, Giegerich R, Sczyrba A, Wall DP, Tonellato P (2012)
BMC Bioinformatics 13(Suppl 17): S22.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[7]
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383462
Webservices and Workflows on the Bielefeld Bioinformatics Server: Practices and Problems
Hartmeier S, Krüger J, Giegerich R (2007)
In: Proceedings.
PUB
 
[6]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587979 OA
RNA Movies 2: sequential animation of RNA secondary structures
Kaiser A, Krüger J, Evers DJ (2007)
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 35(Web Server): W330-W334.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[5]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383467
RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast, and flexible
Krüger J, Rehmsmeier M (2006)
Nucleic Acids Research 34(Web Server): W451-W454.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773871 OA
XML schemas for common bioinformatic data types and their application in workflow systems
Seibel PN, Krüger J, Hartmeier S, Schwarzer K, Löwenthal K, Mersch H, Dandekar T, Giegerich R (2006)
BMC Bioinformatics 7(1): 490.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[3]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773878 OA
RNAhybrid: microRNA target prediction easy, fast and flexible
Krüger J, Rehmsmeier M (2006)
Nucleic Acids Research 34(Web Server): W451-W454.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607394 OA
e2g: an interactive web-based server for efficiently mapping large EST and cDNA sets to genomic sequences
Krüger J, Sczyrba A, Kurtz S, Giegerich R (2004)
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 32(Web Server): W301-W304.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[1]
2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773844 OA
RNA-related tools on the Bielefeld Bioinformatics Server
Sczyrba A, Krüger J, Mersch H, Kurtz S, Giegerich R (2003)
Nucleic Acids Research 31(13): 3767-3770.
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