PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2024 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2992200

  Schulz, T. (2024). Computational Methods in k-mer-based Pangenomics. Bielefeld: Universität Bielefeld. https://doi.org/10.4119/unibi/2992200

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  2024 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2989197

  Schulz, T., & Medvedev, P. (2024). Eskemap: exact sketch-based read mapping. Algorithms for Molecular Biology, 2024(19), 19. https://doi.org/10.1186/s13015-024-00261-7

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  2024 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2990271

  Schulz, T., Parmigiani, L., Rempel, A., & Stoye, J. (2024). Methods for Pangenomic Core Detection. In J. C. Setubal, P. F. Stadler, & J. Stoye (Eds.), Methods in Molecular Biology: Vol. 2802. Comparative Genomics. Methods and Protocols (pp. 73-106). New York, NY: Humana. https://doi.org/10.1007/978-1-0716-3838-5_4

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• [8]
  

  2023 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2982645

  Schulz, T., & Medvedev, P. (2023). Exact Sketch-Based Read Mapping. In D. Belazzougui, A. Ouangraoua, & Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik GmbH (Eds.), 23rd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics Dagstuhl: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik. https://doi.org/10.4230/LIPICS.WABI.2023.14

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• [7]
  

  2023 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2980232

  Schulz, T., & Medvedev, P. (2023). Exact Sketch-Based Read Mapping. bioRxiv. https://doi.org/10.1101/2023.06.21.545862

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• [6]
  

  2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2963659

  Schulz, T., Wittler, R., & Stoye, J. (2022). Sequence-based pangenomic core detection. iScience, 25(6), 104413. https://doi.org/10.1016/j.isci.2022.104413

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• [5]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957501

  Brandt, D., Simunovic, M., Busche, T., Haak, M., Belmann, P., Jünemann, S., Schulz, T., et al. (2021). Multiple Occurrences of a 168-Nucleotide Deletion in SARS-CoV-2 ORF8, Unnoticed by Standard Amplicon Sequencing and Variant Calling Pipelines. Viruses, 13(9), 1870. https://doi.org/10.3390/v13091870

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  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2950825

  Schulz, T., Wittler, R., Rahmann, S., Hach, F., & Stoye, J. (2021). Detecting High Scoring Local Alignments in Pangenome Graphs. Bioinformatics, 37(16), 2266-2274. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btab077

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  2020 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945720

  Schulz, T., Wittler, R., Rahmann, S., Hach, F., & Stoye, J. (2020). Detecting High Scoring Local Alignments in Pangenome Graphs. bioRxiv. doi:10.1101/2020.09.03.280958

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  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005

  Schulz, T., Stoye, J., & Dörr, D. (2018). GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data. BMC Genomics, 19(Suppl. 5), 308. doi:10.1186/s12864-018-4622-0

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  2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913016

  Schulz, T., Stoye, J., & Dörr, D. (2017). Finding Teams in Graphs and its Application to Spatial Gene Cluster Discovery. Proceedings of RECOMB-CG 2017, Lecture Notes in Bioinformatics, 1704, 197-212. Berlin: Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-319-67979-2_11

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