PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2023 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2982645

  Schulz, T. & Medvedev, P. (2023). Exact Sketch-Based Read Mapping. In D. Belazzougui, A. Ouangraoua & Schloss Dagstuhl – Leibniz-Zentrum für Informatik GmbH (Hrsg.), 23rd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics. Dagstuhl: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik. doi:10.4230/LIPICS.WABI.2023.14.

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• [7]
  

  2023 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2980232

  Schulz, T. & Medvedev, P. (2023). Exact Sketch-Based Read Mapping. bioRxiv. Cold Spring Harbor Laboratory. doi:10.1101/2023.06.21.545862.

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• [6]
  

  2022 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2963659

  Schulz, T., Wittler, R. & Stoye, J. (2022). Sequence-based pangenomic core detection. iScience, 25(6): 104413. Elsevier . doi:10.1016/j.isci.2022.104413.

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• [5]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2957501

  Brandt, D., Simunovic, M., Busche, T., Haak, M., Belmann, P., Jünemann, S., Schulz, T., Klages, L.J., Vinke, S., Beckstette, M., Pohl, E., Scherer, C., Sczyrba, A. & Kalinowski, J. (2021). Multiple Occurrences of a 168-Nucleotide Deletion in SARS-CoV-2 ORF8, Unnoticed by Standard Amplicon Sequencing and Variant Calling Pipelines. Viruses, 13(9): 1870. doi:10.3390/v13091870.

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• [4]
  

  2021 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2950825

  Schulz, T., Wittler, R., Rahmann, S., Hach, F. & Stoye, J. (2021). Detecting High Scoring Local Alignments in Pangenome Graphs. Bioinformatics, 37(16), 2266-2274. Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/btab077.

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  2020 | Preprint | Veröffentlicht | PUB-ID: 2945720

  Schulz, T., Wittler, R., Rahmann, S., Hach, F. & Stoye, J. (2020). Detecting High Scoring Local Alignments in Pangenome Graphs. bioRxiv. Cold Spring Harbor Laboratory. doi:10.1101/2020.09.03.280958.

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  2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919005

  Schulz, T., Stoye, J. & Dörr, D. (2018). GraphTeams. A method for discovering spatial gene clusters in Hi-C sequencing data. BMC Genomics, 19(Suppl. 5): 308. Springer Nature. doi:10.1186/s12864-018-4622-0.

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  2017 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2913016

  Schulz, T., Stoye, J. & Dörr, D. (2017). Finding Teams in Graphs and its Application to Spatial Gene Cluster Discovery (Lecture Notes in Bioinformatics). Proceedings of RECOMB-CG 2017 (S. 197-212). Gehalten auf der RECOMB-CG 2017, Berlin: Springer Verlag. doi:10.1007/978-3-319-67979-2_11.

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