11 Publikationen

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[11]
2009 | Konferenzbeitrag | Entwurf | PUB-ID: 2383425
GPU Parallization of Algebraic Dynamic Programming
Steffen P, Giegerich R, Giraud M (Unpublished)
In: Proceedings PPAM.
PUB
 
[10]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587974
pknotsRG: RNA pseudoknot folding including near-optimal structures and sliding windows
Reeder J, Steffen P, Giegerich R (2007)
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 35(Web Server): W320-W324.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383464
Challenges in the Compilation of a Domain Specific Language for Dynamic Programming
Giegerich R, Steffen P (2006)
In: Proceedings of te 2006 ACM Symposium on Applied Computing.
PUB
 
[8]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773640
Correction: Versatile and declarative dynamic programming using pair algebras
Steffen P, Giegerich R (2006)
BMC Bioinformatics 7(1): 214.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
[7]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597805
Table design in dynamic programming
Steffen P, Giegerich R (2006)
INFORMATION AND COMPUTATION 204(9): 1325-1345.
PUB | DOI | WoS
 
[6]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes
Steffen P, Voss B, Rehmsmeier M, Reeder J, Giegerich R (2006)
Bioinformatics 22(4): 500-503.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[5]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773595
Effective ambiguity checking in biosequence analysis
Reeder J, Steffen P, Giegerich R (2005)
BMC Bioinformatics 6(1): 153.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773598
Versatile and declarative dynamic programming using pair algebras
Steffen P, Giegerich R (2005)
BMC Bioinformatics 6(1): 224.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[3]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes
Rehmsmeier M, Steffen P, Höchsmann M, Giegerich R (2004)
RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 10(10): 1507-1517.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[2]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607656
A discipline of dynamic programming over sequence data
Giegerich R, Meyer C, Steffen P (2004)
SCIENCE OF COMPUTER PROGRAMMING 51(3): 215-263.
PUB | DOI | WoS
 
[1]
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612812
Implementing algebraic dynamic programming in the functional and the imperative programming paradigm
Giegerich R, Steffen P (2002)
In: MATHEMATICS OF PROGRAM CONSTRUCTION. Lecture Notes in Computer Science, 2386. SPRINGER-VERLAG BERLIN: 1-20.
PUB | WoS
 

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GPU Parallization of Algebraic Dynamic Programming
Steffen P, Giegerich R, Giraud M (Unpublished)
In: Proceedings PPAM.
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[10]
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587974
pknotsRG: RNA pseudoknot folding including near-optimal structures and sliding windows
Reeder J, Steffen P, Giegerich R (2007)
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 35(Web Server): W320-W324.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[9]
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383464
Challenges in the Compilation of a Domain Specific Language for Dynamic Programming
Giegerich R, Steffen P (2006)
In: Proceedings of te 2006 ACM Symposium on Applied Computing.
PUB
 
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773640
Correction: Versatile and declarative dynamic programming using pair algebras
Steffen P, Giegerich R (2006)
BMC Bioinformatics 7(1): 214.
PUB | PDF | DOI | WoS
 
[7]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597805
Table design in dynamic programming
Steffen P, Giegerich R (2006)
INFORMATION AND COMPUTATION 204(9): 1325-1345.
PUB | DOI | WoS
 
[6]
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes
Steffen P, Voss B, Rehmsmeier M, Reeder J, Giegerich R (2006)
Bioinformatics 22(4): 500-503.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[5]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773595
Effective ambiguity checking in biosequence analysis
Reeder J, Steffen P, Giegerich R (2005)
BMC Bioinformatics 6(1): 153.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
[4]
2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773598
Versatile and declarative dynamic programming using pair algebras
Steffen P, Giegerich R (2005)
BMC Bioinformatics 6(1): 224.
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[3]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377
Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes
Rehmsmeier M, Steffen P, Höchsmann M, Giegerich R (2004)
RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY 10(10): 1507-1517.
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[2]
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607656
A discipline of dynamic programming over sequence data
Giegerich R, Meyer C, Steffen P (2004)
SCIENCE OF COMPUTER PROGRAMMING 51(3): 215-263.
PUB | DOI | WoS
 
[1]
2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612812
Implementing algebraic dynamic programming in the functional and the imperative programming paradigm
Giegerich R, Steffen P (2002)
In: MATHEMATICS OF PROGRAM CONSTRUCTION. Lecture Notes in Computer Science, 2386. SPRINGER-VERLAG BERLIN: 1-20.
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