PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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• [11]
  

  2009 | Konferenzbeitrag | Entwurf | PUB-ID: 2383425

  Steffen, P., Giegerich, R., Giraud, M.: GPU Parallization of Algebraic Dynamic Programming. Proceedings PPAM. (Unpublished).

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• [10]
  

  2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587974

  Reeder, J., Steffen, P., Giegerich, R.: pknotsRG: RNA pseudoknot folding including near-optimal structures and sliding windows. NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 35, W320-W324 (2007).

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [9]
  

  2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383464

  Giegerich, R., Steffen, P.: Challenges in the Compilation of a Domain Specific Language for Dynamic Programming. Proceedings of te 2006 ACM Symposium on Applied Computing. (2006).

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• [8]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773640

  Steffen, P., Giegerich, R.: Correction: Versatile and declarative dynamic programming using pair algebras. BMC Bioinformatics. 7, : 214 (2006).

  PUB | PDF | DOI | WoS
   
• [7]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597805

  Steffen, P., Giegerich, R.: Table design in dynamic programming. INFORMATION AND COMPUTATION. 204, 1325-1345 (2006).

  PUB | DOI | WoS
   
• [6]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421

  Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J., Giegerich, R.: RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics. 22, 500-503 (2006).

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [5]
  

  2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773595

  Reeder, J., Steffen, P., Giegerich, R.: Effective ambiguity checking in biosequence analysis. BMC Bioinformatics. 6, : 153 (2005).

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [4]
  

  2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773598

  Steffen, P., Giegerich, R.: Versatile and declarative dynamic programming using pair algebras. BMC Bioinformatics. 6, : 224 (2005).

  PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [3]
  

  2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606377

  Rehmsmeier, M., Steffen, P., Höchsmann, M., Giegerich, R.: Fast and effective prediction of microRNA/target duplexes. RNA-A PUBLICATION OF THE RNA SOCIETY. 10, 1507-1517 (2004).

  PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
   
• [2]
  

  2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607656

  Giegerich, R., Meyer, C., Steffen, P.: A discipline of dynamic programming over sequence data. SCIENCE OF COMPUTER PROGRAMMING. 51, 215-263 (2004).

  PUB | DOI | WoS
   
• [1]
  

  2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612812

  Giegerich, R., Steffen, P.: Implementing algebraic dynamic programming in the functional and the imperative programming paradigm. In: Boiten, E. (ed.) MATHEMATICS OF PROGRAM CONSTRUCTION. Lecture Notes in Computer Science. 2386, p. 1-20. SPRINGER-VERLAG BERLIN, Berlin ; Heidelberg ; New York ; Barcelona ; Hong Kong ; London ; Milan ; Paris ; Tokyo (2002).

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