PUB - Publikationen an der Universität Bielefeld

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  2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2374720

  Hippe, K., Kormeier, B., Janowski, S.J., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2011). DAWIS-M.D. 2.0 - A Data Warehouse Information System for Metabolic Data. Proceedings of the 7th International Symposium on Integrative Bioinformatics.

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  2011 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2290156

  Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2011). Modeling of Cell-to-Cell Communication Processes with Petri Nets Using the Example of Quorum Sensing (Studies in health technology and informatics). In E. Wingender (Hrsg.), Biological Petri Nets (S. 182-203). Amsterdam: IOS Press.

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  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2406168

  Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2010). CardioVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science data in cardiovascular diseases. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(1): 142. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-142.

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• [26]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945096

  Kormeier, B., Hippe, K., Arrigo, P., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). Reconstruction of biological networks based on life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 7(2), 3-8. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2010-146.

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• [25]
  

  2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901780

  Hippe, K., Kormeier, B., Töpel, T., Janowski, S.J. & Hofestädt, R. (2010). DAWIS-M.D. - A Data Warehouse System for Metabolic Data (LNI). Informatik 2010: Service Science - neue Perspektiven für die Informatik (S. 720-725). Gehalten auf der Informatik 2010, Bonn: Ges. für Informatik.

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  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409400

  Töpel, T., Scheible, D., Trefz, F. & Hofestädt, R. (2010). RAMEDIS: a comprehensive information system for variations and corresponding phenotypes of rare metabolic diseases. Human Mutation, 31(1), E1081-E1088. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/humu.21169.

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• [23]
  

  2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1960746

  Janowski, S.J., Kormeier, B., Töpel, T., Hippe, K., Hofestädt, R., Willassen, N., Friesen, R., Rubert, S., Borck, D., Haugen, P. & Chen, M. (2010). Modeling of cell-cell communication processes with Petri nets using the example of quorum sensing. In Silico Biology, 10(Special Issue: Petri Net Applications in Molecular Biology), 27-48. IOS Press.

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• [22]
  

  2009 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408628

  Kormeier, B., Hippe, K., Töpel, T. & Hofestädt, R. (2009). CARDIOVINEdb: a data warehouse approach for integration of life science in cardiovascular diseases. In S. Fischer, E. Maehle & R. Reischuk (Hrsg.), Im Focus das Leben. 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 28.9. bis 2.10.2009, Universität zu Lübeck (S. 704-708). Gehalten auf der 39. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), Bonn: Gesellschaft für Informatik (GI).

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• [21]
  

  2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634511

  Kaput, J., Cotton, R.G.H., Hardman, L., Watson, M., Al Aqeel, A.I., Al-Aama, J.Y., Al-Mulla, F., Alonso, S., Aretz, S., Auerbach, A.D., Bapat, B., Bernstein, I.T., Bhak, J., Bleoo, S.L., Bloecker, H., Brenner, S.E., Burn, J., Bustamante, M., Calone, R., Cambon-Thomsen, A., Cargill, M., Carrera, P., Cavedon, L., Cho, Y.S., Chung, Y.-J., Claustres, M., Cutting, G., Dalgleish, R., den Dunnen, J.T., Diaz, C., Dobrowolski, S., dos Santos, M.R.N., Ekong, R., Flanagan, S.B., Flicek, P., Furukawa, Y., Genuardi, M., Ghang, H., Golubenko, M.V., Greenblatt, M.S., Hamosh, A., Hancock, J.M., Hardison, R., Harrison, T.M., Hoffmann, R., Horaitis, R., Howard, H.J., Barash, C.I., Izagirre, N., Jung, J., Kojima, T., Laradi, S., Lee, Y.-S., Lee, J.-Y., Gil-da-Silva-Lopes, V.L., Macrae, F.A., Maglott, D., Marafie, M.J., Marsh, S.G.E., Matsubara, Y., Messiaen, L.M., Moeslein, G., Netea, M.G., Norton, M.L., Oefner, P.J., Oetting, W.S., O'Leary, J.C., Oller de Ramirez, A.M., Paalman, M.H., Parboosingh, J., Patrinos, G.P., Perozzi, G., Phillips, I.R., Povey, S., Prasad, S., Qi, M., Quin, D.J., Ramesar, R.S., Richards, C.S., Savige, J., Scheible, D.G., Scott, R.J., Seminara, D., Shephard, E.A., Sijmons, R.H., Smith, T.D., Sobrido, M.-J., Tanaka, T., Tavtigian, S.V., Taylor, G.R., Teague, J., Töpel, T., Ullman-Cullere, M., Utsunomiya, J., van Kranen, H.J., Vihinen, M., Webb, E., Weber, T.K., Yeager, M., Yeom, Y.I., Yim, S.-H. & Yoo, H.-S. (2009). Planning the Human Variome Project: The Spain Report. HUMAN MUTATION, 30(4), 496-510. Wiley-Blackwell. doi:10.1002/humu.20972.

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• [20]
  

  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1945955

  Töpel, T., Kormeier, B., Klassen, A. & Hofestädt, R. (2008). BioDWH: a data warehouse kit for life science data integration. Journal of Integrative Bioinformatics, 5(2), 343-349. Walter De Gruyter Gmbh. doi:10.2390/biecoll-jib-2008-93.

  PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
   
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  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408678

  Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B. & Hofestädt, R. (2008). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Integrative Bioinformatics Yearbook 2007, 4, 63-74. Shaker Verlag Aachen.

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  2008 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2383295

  Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. (2008). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2007. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.

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  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408654

  Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T. & Hofestädt, R. (2008). Alignment of Linear Biochemical Pathways Using Protein Structural Classification. Nature Precedings. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.1038/npre.2008.1943.1.

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  2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408666

  Trefz, F., Scheible, D., Götz, H., Töpel, T., Hofestädt, R. & Frauendienst-Egger, G. (2008). METAGENE and RAMEDIS: databases for metabolic diseases and patients with inborn errors on metabolism. Journal of Inherited Metabolic Disease, 31, 289. Springer.

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  2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409274

  Hariharaputran, S., Töpel, T., Brockschmidt, B. & Hofestädt, R. (2007). VINEdb: a data warehouse for integration and interactive exploration of life science data. Proceedings of the 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07). Gehalten auf der 4th Integrative Bioinformatics Workshop (IB 07).

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  2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2409265

  Hariharaputran, S., Töpel, T., Oberwahrenbrock, T. & Hofestädt, R. (2007). SignAlign: prediction and alignment of biochemical pathways using protein structural information. Proceedings of 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems. Gehalten auf der 5th International Conference on Pathways, Networks, and Systems.

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  2007 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394320

  Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. (2007). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2006. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.

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  2007 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1632474

  Scheible, D., Töpel, T., Frauendienst-Egger, G., Hofestädt, R., Wallner, S. & Trefz, F.K. (2007). Expanded newborn screening: Long-term follow up of 63 patients screened by tandem mass spectrometry (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 30(Suppl. 1), 3. SPRINGER.

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• [11]
  

  2006 | Herausgeber*in Sammelwerk | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394343

  Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. (2006). Integrative Bioinformatics. Yearbook 2005. (R. Hofestädt & T. Töpel, Hrsg.). Aachen: Shaker.

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• [10]
  

  2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394354

  Töpel, T., Hofestädt, R., Scheible, D. & Trefz, F. (2006). RAMEDIS, the rare metabolic diseases database. Applied Bioinformatics, 5(2), 115-118. Springer Science and Business Media LLC. doi:10.2165/00822942-200605020-00006.

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  2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596367

  Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G. & Hofestädt, R. (2006). www.ramedis.de: Database for long term follow up of patients with rare metabolic diseases (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 29(Suppl. 1), 84. SPRINGER.

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  2006 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1596361

  Trefz, F.K., Töpel, T., Scheible, D., Frauendienst-Egger, G. & Hofestädt, R. (2006). Expanded newborn screening: Long term follow up of 25 patients with organic acidemias and urea cycle disorders (JOURNAL OF INHERITED METABOLIC DISEASE), 29(Suppl. 1), 84. SPRINGER.

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• [7]
  

  2005 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376856

  Hofestädt, R. & Töpel, T. (2005). Medical Bioinformatics: Detecting Molecular Diseases with Case-Based Reasoning (Studies in Fuzziness and Soft Computing). In U. Seiffert, L. Jain & P. Schweizer (Hrsg.), Bioinformatics Using Computational Intelligence Paradigms (1. Edition., S. 1-24). Berlin: Springer.

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• [6]
  

  2004 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2302849

  Töpel, T. (2004). Untersuchung von Life-Science-Datenbeständen zur Identifikation von Genotyp-Phänotyp-Korrelationen. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.

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• [5]
  

  2002 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394845

  Hofestädt, R. & Töpel, T. (2002). Case-based Support of Information Retrieval and Analysis of Molecular Data. In P. Kokol (Hrsg.), Proceedings of the 15th IEEE Symposium on Computer-Based Medical Systems (CBMS 2002) (S. 129-133). Gehalten auf der CBMS 2002, Los Alamitos, Calif.: IEEE Computer Society.

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• [4]
  

  2002 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2376867

  Freier, A., Hofestädt, R. & Töpel, T. (2002). Invastigating the Effective Range of Agents by Using Integrative Modelling. In J. Borlak (Hrsg.), Handbook of Toxicogenomics: Strategies and Applications (1. Edition., S. 233-252). Weinheim: Wiley-VCH.

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  2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394818

  Töpel, T. & Hofestädt, R. (2002). Architecture for Information Retrieval and Analysis of Integrated Molecular Data. Medizinische Genetik, 14(3), 315. Springer.

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• [2]
  

  2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394918

  Hofestädt, R., Kauert, R., Töpel, T. & Scholz, U. (2001). Information System for the Support of Research, Diagnosis and Therapy of Inborn Metabolic Diseases (Studies in health technology and informatics). In V.L. Patel (Hrsg.), Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (S. 353-356). Gehalten auf der 10th World Congress on Health and Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.

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  2001 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2394974

  Hofestädt, R., Mischke, U., Scholz, U., Töpel, T., Scheible, D. & Trefz, F.K. (2001). RAMEDIS - Rare Metabolic Diseases Publishing Tool for Genotype-Phenotype Correlation (Studies in health technology and informatics). In V.L. Patel (Hrsg.), Proceedings of the 10th World Congress on Medical Informatics (S. 970-974). Gehalten auf der 10th World Congress on Health and Medical Informatics, Amsterdam: IOS Press.

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