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143 Publikationen

2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941669 OA
High Contiguity De Novo Genome Sequence Assembly of Trifoliate Yam (Dioscorea dumetorum) Using Long Read Sequencing
Siadjeu C, Pucker B, Viehöver P, Albach DC, Weisshaar B (2020)
Genes 11(3): 274.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | bioRxiv | EBI - ENA Project | GenBank
 
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2942459 OA
Genome Sequences of Both Organelles of the Grapevine Rootstock Cultivar ‘Börner’
Frommer B, Holtgräwe D, Hausmann L, Viehöver P, Huettel B, Töpfer R, Weisshaar B (2020)
Microbiology Resource Announcements 9(15): e01471-19.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC | bioRxiv | EBI - ENA Project | GenBank
 
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941655 OA
A Partially Phase-Separated Genome Sequence Assembly of the Vitis Rootstock ‘Börner’ (Vitis riparia × Vitis cinerea) and Its Exploitation for Marker Development and Targeted Mapping
Holtgräwe D, Rosleff Soerensen T, Hausmann L, Pucker B, Viehöver P, Töpfer R, Weisshaar B (2020)
Frontiers in Plant Science 11: 156.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | bioRxiv | EBI - ENA Project | GenBank
 
2020 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2938807
Genome Sequencing of Musa acuminata Dwarf Cavendish Reveals a Duplication of a Large Segment of Chromosome 2
Busche M, Pucker B, Viehöver P, Weisshaar B, Stracke R (2020)
G3: Genes|Genomes|Genetics 10(1): 37-42.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC | bioRxiv | EBI - ENA Project
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935698 OA
A chromosome-level sequence assembly reveals the structure of the Arabidopsis thaliana Nd-1 genome and its gene set
Pucker B, Holtgräwe D, Stadermann KB, Frey K, Huettel B, Reinhardt R, Weisshaar B (2019)
PLOS ONE 14(5): e0216233.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC | bioRxiv | GenBank
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2937135 OA
Twenty-Five Years of Propagation in Suspension Cell Culture Results in Substantial Alterations of the Arabidopsis Thaliana Genome
Pucker B, Rückert C, Stracke R, Viehöver P, Kalinowski J, Weisshaar B (2019)
Genes 10(9): 671.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | bioRxiv | EBI - ENA Project
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936315 OA
Characterization of genes and alleles involved in the control of flowering time in grapevine.
Kamal N, Ochßner I, Schwandner A, Viehöver P, Hausmann L, Töpfer R, Weisshaar B, Holtgräwe D (2019)
PLoS One 14(7): e0214703.
PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC | bioRxiv | NCBI BioProject
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2911903
Crop wild relative populations of Beta vulgaris allow direct mapping of agronomically important genes
Capistrano-Gossmann GG, Ries D, Holtgräwe D, Minoche A, Kraft T, Frerichmann SLM, Rosleff Sörensen T, Dohm JC, González I, Schilhabel M, Varrelmann M, et al. (2017)
Nature Communications 8(1): 15708.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915524 OA PUB | PDF | DOI | Download (ext.) | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2907696 OA
Enhancing the GABI-Kat Arabidopsis thaliana T-DNA insertion mutant database by incorporating Araport11 annotation
Kleinbölting N, Huep G, Weisshaar B (2017)
Plant and Cell Physiology 58(1): e7.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909139
The AtMYB12 activation domain maps to a short C-terminal region of the transcription factor
Stracke R, Turgut-Kara N, Weisshaar B (2017)
Zeitschrift für Naturforschung C 72(7-8): 251-257.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903501 OA
Repeat Composition of CenH3-chromatin and H3K9me2-marked heterochromatin in Sugar Beet (Beta vulgaris)
Kowar T, Zakrzewski F, Macas J, Kobližková A, Viehöver P, Weisshaar B, Schmidt T (2016)
BMC Plant Biology 16(1): 120.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905170 OA
ReadXplorer 2 - detailed read mapping analysis and visualization from one single source
Hilker R, Stadermann KB, Schwengers O, Anisiforov E, Jaenicke S, Weisshaar B, Zimmermann T, Goesmann A (2016)
Bioinformatics 32(24): 3702-3708.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905177 OA PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905844 OA
A de novo Genome Sequence Assembly of the Arabidopsis thaliana Accession Niederzenz-1 Displays Presence/Absence Variation and Strong Synteny
Pucker B, Holtgräwe D, Rosleff Sörensen T, Stracke R, Viehöver P, Weisshaar B (2016)
PLoS ONE 11(10): e0164321.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901603 OA
Rapid gene identification in sugar beet using deep sequencing of DNA from phenotypic pools selected from breeding panels
Ries D, Holtgräwe D, Viehöver P, Weisshaar B (2016)
BMC Genomics 17(1): 236.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | EBI - ENA Project
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2903490
Evolution of tonoplast P-ATPase transporters involved in vacuolar acidification
Li Y, Provenzano S, Bliek M, Spelt C, Appelhagen I, Machado de Faria L, Verweij W, Schubert A, Sagasser M, Seidel T, Weisshaar B, et al. (2016)
New Phytologist 211(3): 1092-1107.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900211
Natural variation in flavonol accumulation in Arabidopsis is determined by the flavonol glucosyltransferase BGLU6.
Ishihara H, Tohge T, Viehöver P, Fernie AR, Weisshaar B, Stracke R (2016)
Journal of Experimental Botany 67(5): 1505-1517.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2787257
Diversification, Evolution and Methylation of Short Interspersed Nuclear Element families in sugar beet and related Amaranthaceae species
Schwichtenberg K, Wenke T, Zakrzewski F, Seibt K, Minoche A, Dohm J, Weisshaar B, Himmelbauer H, Schmidt T (2016)
The Plant Journal 85(2): 229-244.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2775617 OA
SMRT sequencing only de novo assembly of the sugar beet (Beta vulgaris) chloroplast genome
Stadermann KB, Weisshaar B, Holtgräwe D (2015)
BMC Bioinformatics 16(1): 295.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2717880 OA
Fast forward genetics to identify mutations causing a high light tolerant phenotype in Chlamydomonas reinhardtii by whole-genome-sequencing
Schierenbeck L, Ries D, Rogge K, Grewe S, Weisshaar B, Kruse O (2015)
BMC Genomics 16(1): 57.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764063 OA
Exploiting single-molecule transcript sequencing for eukaryotic gene prediction
Minoche AE, Dohm JC, Schneider J, Holtgräwe D, Viehöver P, Montfort M, Rosleff Sörensen T, Weisshaar B, Himmelbauer H (2015)
Genome Biology 16(1): 184.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2770216
The structural features of thousands of T-DNA insertion sites are consistent with a double-strand break repair based insertion mechanism
Kleinbölting N, Huep G, Appelhagen I, Viehöver P, Li Y, Weisshaar B (2015)
Molecular Plant 8(11): 1651-1664.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2732031
Transparent Testa 13 is a tonoplast P3A-ATPase required for vacuolar deposition of proanthocyanidins in Arabidopsis thaliana seeds
Appelhagen I, Nordholt N, Seidel T, Spelt K, Koes R, Quattrochio F, Sagasser M, Weisshaar B (2015)
The Plant Journal 82(5): 840-849.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2696778 OA
Genome-wide identification and characterisation of R2R3-MYB genes in sugar beet ( Beta vulgaris )
Stracke R, Holtgräwe D, Schneider J, Pucker B, Rosleff Sörensen T, Weisshaar B (2014)
BMC Plant Biology 14(1): 249.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2699085 OA
Reliable In Silico Identification of Sequence Polymorphisms and Their Application for Extending the Genetic Map of Sugar Beet (Beta vulgaris)
Holtgräwe D, Rosleff Sörensen T, Viehöver P, Schneider J, Schulz B, Borchardt D, Kraft T, Himmelbauer H, Weisshaar B (2014)
PLoS ONE 9(10): e110113.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674171
Integrating bioinformatic resources to predict transcription factors interacting with cis-sequences conserved in co-regulated genes
Dubos C, Kelemen Z, Sebastian A, Bülow L, Huep G, Xu W, Grain D, Salsac F, Brousse C, Lepiniec L, Weisshaar B, et al. (2014)
BMC genomics 15(1): 317.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700166 OA PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2678005
Profiling of extensively diversified plant LINEs reveals distinct plant-specific subclades
Heitkam T, Holtgräwe D, Dohm JC, Minoche AE, Himmelbauer H, Weisshaar B, Schmidt T (2014)
The Plant Journal 79(3): 385-397.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643981
Plant genome sequencing — applications for crop improvement
Bolger ME, Weisshaar B, Scholz U, Stein N, Usadel B, Mayer KFX (2014)
Current Opinion in Biotechnology 26(4): 31-37.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643946
The genome of the recently domesticated crop plant sugar beet (Beta vulgaris)
Dohm JC, Minoche AE, Holtgräwe D, Capella-Gutiérrez S, Zakrzewski F, Tafer H, Rupp O, Rosleff Sörensen T, Stracke R, Reinhardt R, Goesmann A, et al. (2014)
Nature 505(7484): 546-549.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2689802
QTL analysis of flowering time and ripening traits suggests an impact of a genomic region on linkage group 1 in Vitis.
Fechter I, Hausmann L, Zyprian E, Daum M, Holtgräwe D, Weisshaar B, Töpfer R (2014)
Theoretical and Applied Genetics 127(9): 1857-1872.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2679186
Update on transparent testa mutants from Arabidopsis thaliana: characterisation of new alleles from an isogenic collection
Appelhagen I, Thiedig K, Nordholt N, Schmidt N, Huep G, Sagasser M, Weisshaar B (2014)
Planta 240(5): 955-970.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2668850
The CHH motif in sugar beet satellite DNA: a modulator for cytosine methylation
Zakrzewski F, Schubert V, Viehöver P, Minoche AE, Dohm JC, Himmelbauer H, Weisshaar B, Schmidt T (2014)
The Plant Journal 78(6): 937-950.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2562610
Highly diverse chromoviruses of Beta vulgaris are classified by chromodomains and chromosomal integration
Weber B, Heitkam T, Holtgräwe D, Weisshaar B, Minoche AE, Dohm JC, Himmelbauer H, Schmidt T (2013)
Mobile DNA 4(1): 8.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2579749
GABI-DUPLO: a collection of double mutants to overcome genetic redundancy in Arabidopsis thaliana
Bolle C, Huep G, Kleinbölting N, Haberer G, Mayer K, Leister D, Weisshaar B (2013)
The Plant Journal 75(1): 157-171.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2448791 OA
GABI-Kat SimpleSearch: new features of the Arabidopsis thaliana T-DNA mutant database
Kleinbölting N, Huep G, Klotgen A, Viehöver P, Weisshaar B (2012)
Nucleic Acids Research 40(D1): D1211-D1215.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2486155
Elongation-related functions of LEAFY COTYLEDON1 during the development of Arabidopsis thaliana
Junker A, Mönke G, Rutten T, Keilwagen J, Seifert M, Thi TMN, Renou J-P, Balzergue S, Viehöver P, Hähnel U, Ludwig-Müller J, et al. (2012)
The Plant Journal 71(3): 427-442.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2460882
Candidate genes within a 143 kb region of the flower sex locus in Vitis
Fechter I, Hausmann L, Daum M, Rosleff Sörensen T, Viehöver P, Weisshaar B, Töpfer R (2012)
Molecular Genetics and Genomics 287(3): 247-259.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2454417
Palaeohexaploid Ancestry for Caryophyllales Inferred from Extensive Gene-Based Physical and Genetic Mapping of the Sugar Beet Genome (Beta vulgaris)
Dohm JC, Lange C, Holtgräwe D, Rosleff Sörensen T, Borchardt D, Schulz B, Lehrach H, Weisshaar B, Himmelbauer H (2012)
The Plant Journal 70(3): 528-540.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2532965
Evolutionary reshuffling in the Errantivirus lineage Elbe within the Beta vulgaris genome
Wollrab C, Heitkam T, Holtgräwe D, Weisshaar B, Minoche AE, Dohm JC, Himmelbauer H, Schmidt T (2012)
The Plant Journal 72(4): 636-651.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2498922
The Role of a Pseudo-Response Regulator Gene in Life Cycle Adaptation and Domestication of Beet
Pin PA, Zhang W, Vogt SH, Dally N, Büttner B, Schulze-Buxloh G, Jelly NS, Chia TYP, Mutasa-Göttgens ES, Dohm JC, Himmelbauer H, et al. (2012)
Current Biology 22(12): 1095-1101.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | GenBank
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2457584
Survey of sugar beet (Beta vulgaris L.) hAT transposons and MITE-like hATpin derivatives
Menzel G, Krebs C, Diez M, Holtgräwe D, Weisshaar B, Minoche AE, Dohm JC, Himmelbauer H, Schmidt T (2012)
Plant Molecular Biology 78(4-5): 393-405.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2528126
Toward the identification and regulation of the Arabidopsis thaliana ABI3 regulon
Mönke G, Seifert M, Keilwagen J, Mohr M, Grosse I, Hähnel U, Junker A, Weisshaar B, Conrad U, Bäumlein H, Altschmied L (2012)
Nucleic Acids Research 40(17): 8240-8254.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2353318
The genome of the mesopolyploid crop species Brassica rapa
Wang X, Wang H, Wang J, Sun R, Wu J, Liu S, Bai Y, Mun J-H, Bancroft I, Cheng F, Huang S, et al. (2011)
Nature Genetics 43(10): 1035-1039.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2411320
Targeted identification of short interspersed nuclear element families shows their widespread existence and extreme heterogeneity in plant genomes
Wenke T, Dobel T, Rosleff Sörensen T, Junghans H, Weisshaar B, Schmidt T (2011)
The Plant Cell 23(9): 3117-3128.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317352
Epigenetic profiling of heterochromatic satellite DNA
Zakrzewski F, Weisshaar B, Fuchs J, Bannack E, Minoche AE, Dohm JC, Himmelbauer H, Schmidt T (2011)
Chromosoma 120(4): 409-422.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2286819
TRANSPARENT TESTA1 interacts with R2R3-MYB factors and affects early and late steps of flavonoid biosynthesis in the endothelium of Arabidopsis thaliana seeds
Appelhagen I, Lu G-H, Huep G, Schmelzer E, Weisshaar B, Sagasser M (2011)
The Plant Journal 67(3): 406-419.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2317309
Leucoanthocyanidin Dioxygenase in Arabidopsis thaliana: Characterization of mutant alleles and regulation by MYB-BHLH-TTG1 transcription factor complexes
Appelhagen I, Jahns O, Bartelniewoehner L, Sagasser M, Weisshaar B, Stracke R (2011)
Gene 484(1-2): 61-68.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1896541
Two differentially expressed MATE factor genes from apple complement the Arabidopsis transparent testa12 mutant
Frank S, Keck M, Sagasser M, Niehaus K, Weisshaar B, Stracke R (2011)
Plant Biology 13(1): 42-50.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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