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56 Publikationen

2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2919297
Schillingmann, L.; Ernst, J.; Keite, V.; Wrede, B.; Meyer, A. S.; Belke, E. (2018): AlignTool: The automatic temporal alignment of spoken utterances in German, Dutch, and British English for psycholinguistic purposes BEHAVIOR RESEARCH METHODS,50:(2): 466-489.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901460
Löwes, B.; Chauve, C.; Ponty, Y.; Giegerich, R. (2017): The BRaliBase Dent – a Tale of Benchmark Design and Interpretation Briefings in Bioinformatics,18:(2): 306-311.
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2016 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2904509
Paaßen, B.; Jensen, J.; Hammer, B. (2016): Execution Traces as a Powerful Data Representation for Intelligent Tutoring Systems for Programming. In: Tiffany Barnes; Min Chi; Mingyu Feng (Hrsg.): Proceedings of the 9th International Conference on Educational Data Mining. Raleigh, North Carolina, USA: International Educational Datamining Society. S. 183-190.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2900648
Lewinski, M.; Hallmann, A.; Staiger, D. (2016): Genome-wide identification and phylogenetic analysis of plant RNA binding proteins comprising both RNA recognition motifs and contiguous glycine residues Molecular Genetics and Genomics,291:(2): 763-773.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2909091
Trapphoff, T.; Heiligentag, M.; Simon, J.; Staubach, N.; Seidel, T.; Otte, K.; Froehlich, T.; Arnold, G. J.; Eichenlaub-Ritter, U. (2016): Improved cryotolerance and developmental potential of in vitro and in vivo matured mouse oocytes by supplementing with a glutathione donor prior to vitrification MOLECULAR HUMAN REPRODUCTION,22:(12): 867-881.
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2015 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2724156
Paaßen, B.; Mokbel, B.; Hammer, B. (2015): Adaptive structure metrics for automated feedback provision in Java programming. In: Michel Verleysen (Hrsg.): Proceedings of the ESANN, 23rd European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning. S. 307-312.
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2015 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2762087
Paaßen, B.; Mokbel, B.; Hammer, B. (2015): A Toolbox for Adaptive Sequence Dissimilarity Measures for Intelligent Tutoring Systems. In: Olga Christina Santos; Jesus Gonzalez Boticario; Cristobal Romero; Mykola Pechenizkiy; Agathe Merceron; Piotr Mitros; Jose Maria Luna; Christian Mihaescu; Pablo Moreno; Arnon Hershkovitz; Sebastian Ventura; Michel Desmarais (Hrsg.): Proceedings of the 8th International Conference on Educational Data Mining. International Educational Datamining Society. S. 632-632.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2730760
Vollmer, A. - L.; Rohlfing, K.; Wrede, B.; Cangelosi, A. (2015): Alignment to the Actions of a Robot International Journal of Social Robotics,7:(2): 241-252.
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2015 | Bielefelder Masterarbeit | PUB-ID: 2736686
Paaßen, B. (2015): Adaptive Affine Sequence Alignment Using Algebraic Dynamic Programming. Bielefeld: Bielefeld University.
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2015 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2784346
Malchus, K. (2015): Evaluation emotionaler und kommunikativer Verhaltensweisen in Mensch-Roboter Interaktionen in therapierelevanten Szenarien zur Entwicklung eines Modells für die roboterunterstützte Therapie bei Sprach- und Kommunikationsstörungen. Bielefeld: Universität Bielefeld.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905757
Giegerich, R.; Touzet, H. (2014): Modeling Dynamic Programming Problems over Sequences and Trees with Inverse Coupled Rewrite Systems Algorithms,7:(1): 62-144.
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2014 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2677466
Hoffmann, N. (2014): Computational methods for high-throughput metabolomics. Bielefeld: Universität Bielefeld.
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2014 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2673554
Mokbel, B.; Paaßen, B.; Hammer, B. (2014): Adaptive distance measures for sequential data. In: Michel Verleysen (Hrsg.): ESANN, 22nd European Symposium on Artificial Neural Networks, Computational Intelligence and Machine Learning. Bruges, Belgium: i6doc.com. S. 265-270.
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2014 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2710067
Mokbel, B.; Paaßen, B.; Hammer, B. (2014): Efficient Adaptation of Structure Metrics in Prototype-Based Classification. In: Stefan Wermter; Cornelius Weber; Włodzisław Duch; Timo Honkela; Petia Koprinkova-Hristova; Sven Magg; Günther Palm; Allessandro Villa (Hrsg.): Artificial Neural Networks and Machine Learning - ICANN 2014 - 24th International Conference on Artificial Neural Networks, Hamburg, Germany, September 15-19, 2014. Proceedings. Springer. (Lecture Notes in Computer Science, 8681). S. 571-578.
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2013 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901275
Löwes, B.; Giegerich, R. (2013): Avoiding Ambiguity and Assessing Uniqueness in Minisatellite Alignment. In: Tim Beißbarth; Martin Kollmar; Andreas Leha; Burkhard Morgenstern; Anne-Kathrin Schultz; Stephan Waack; Edgar Wingender (Hrsg.): German Conference on Bioinformatics 2013. Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik. (OpenAccess Series in Informatics (OASIcs), 34). S. 110-124.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2607289
Schirmer, S.; Giegerich, R. (2013): Forest alignment with affine gaps and anchors, applied in RNA structure comparison Theoretical Computer Science,483: 51-67.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2522299
Lücking, A.; Bergmann, K.; Hahn, F.; Kopp, S.; Rieser, H. (2013): Data-based analysis of speech and gesture: the Bielefeld Speech and Gesture Alignment corpus (SaGA) and its applications Journal on Multimodal User Interfaces,7:(1-2): 5-18.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2553484
Marschall, T.; Herms, I.; Kaltenbach, H. - M.; Rahmann, S. (2012): Probabilistic Arithmetic Automata and Their Applications Ieee/Acm Transactions On Computational Biology And Bioinformatics,9:(6): 1737-1750.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2502563
Mehler, A.; Lücking, A.; Menke, P. (2012): Assessing cognitive alignment in different types of dialog by means of a network model Neural Networks,32: 159-164.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2536055
Ayllon Clemente, I.; Heckmann, M.; Wrede, B. (2012): Incremental word learning: Efficient HMM initialization and large margin discriminative adaptation Speech Communication,54:(9): 1029-1048.
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2012 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2047086
Pietsch, C.; Buch, A.; Kopp, S.; de Ruiter, J. (2012): Measuring Syntactic Priming in Dialogue Corpora. In: Britta Stolterfoht; Sam Featherston (Hrsg.): Empirical Approaches to Linguistic Theory: Studies in Meaning and Structure. Berlin: Mouton de Gruyter. (Studies in Generative Grammar [SGG], 111). S. 29-42.
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2011 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 2634598
Nam, J.; Bergmann, K.; Waltinger, U.; Kopp, S.; Wachsmuth, I.; Zhang, B. - T. (2011): Deciphering the communicative code in speech and gesture dialogues by autoencoding hypernetworks.
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2011 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2472968
Venkatesh, A. (2011): Novel platform for DNA alignment and studying DNA-protein interaction in realtime. Bielefeld: Universität.
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2011 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2474238
Schirmer, S. (2011): Comparing forests. Bielefeld: Bielefeld University.
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2011 | Bielefelder Masterarbeit | PUB-ID: 2519405
Neumann, A. (2011): Design and implementation of multi-modal AR-based interaction for cooperative planning tasks. Bielefeld: Bielefeld University.
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2011 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2305344
Swadzba, A. (2011): The robot's vista space : a computational 3D scene analysis. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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2011 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2034628
Damm, O.; Dreier, K.; Hegel, F.; Jaecks, P.; Stenneken, P.; Wrede, B.; Hielscher-Fastabend, M. (2011): Communicating emotions in robotics: Towards a model of emotional alignment. In: HRI2011-Workshop: The role of expectations in intuitive human-robot interaction.
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2010 | Sammelwerksbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893922
Buschmeier, H.; Bergmann, K.; Kopp, S. (2010): Modelling and Evaluation of Lexical and Syntactic Alignment with a Priming-Based Microplanner. In: Emiel Krahmer; Mariët Theune (Hrsg.): Empiricial Methods in Natural Language Generation. Berlin/Heidelberg, Germany: Springer. (Lecture Notes in Computer Science, 5790). S. 85-104.
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2010 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1901698
Buschmeier, H.; Bergmann, K.; Kopp, S. (2010): Adaptive Expressiveness – Virtual Conversational Agents That Can Align to Their Interaction Partner. In: Wiebe van der Hoek; Gal A. Kaminka; Michael Luck; Sandip Sen (Hrsg.): Proceedings of the 9th International Conference on Autonomous Agents and Multiagent Systems. International Foundation for Autonomous Agents and Multiagent Systems. S. 91-98.
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1948769
Mehler, A.; Lücking, A.; Weiß, P. (2010): A network model of interpersonal alignment in dialog Entropy,12:(6): 1440-1483.
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2009 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301318
Neuweger, H. (2009): MeltDB : a software platform for the analysis and integration of metabolomics experiment data. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1998826
Pfeiffer-Leßmann, N.; Wachsmuth, I. (2009): Formalizing joint attention in cooperative interaction with a virtual human. In: Bärbel Mertsching; Marcus Hund; Zaheer Aziz (Hrsg.): KI 2009: Advances in Artificial Intelligence. Berlin: Springer. (LNAI 5803). S. 540-547.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1857963
Buschmeier, H.; Bergmann, K.; Kopp, S. (2009): An Alignment-capable Microplanner for Natural Language Generation. In: Proceedings of the 12th European Workshop on Natural Language Generation. Association for Computational Linguistics. S. 82-89.
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2009 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1987346
Dierker, A.; Bovermann, T.; Hanheide, M.; Hermann, T.; Sagerer, G. (2009): A Multimodal Augmented Reality System for Alignment Research. In: Proceedings of the 13th International Conference on Human-Computer Interaction. New York, Heidelberg: Springer. S. 422-426.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2549797
Alphey, M. S.; König, J.; Fairlamb, A. H. (2008): Structural and mechanistic insights into type II trypanosomatid tryparedoxin-dependent peroxidases The Biochemical Journal,414:(3): 375-381.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Bielefelder Masterarbeit | PUB-ID: 2302036
Mertes, C. (01T00:00:00Z.01.1970): Multimodal augmented reality to enhance human communication. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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2008 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2305571
Bannert, C. (2008): Flexible protein annotation with sequence- and secondary structure information. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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2008 | Kurzbeitrag Konferenz / Poster | Veröffentlicht | PUB-ID: 1998607
Koesling, H. (2008): Co-spot the difference - multi-modal alignment in joint tasks. In: 9. Fachtagung der Gesellschaft für Kognitionswissenschaft (KogWis). Dresden: C. Hille. S. 43.
PUB
 
2007 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304243
Abdurrouf, A. (01T00:00:00Z.01.1970): Intense-field theory of high harmonic generation from freely rotating molecules. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631458
Kabachnik, N. M.; Fritzsche, S.; Grum-Grzhimailo, A. N.; Meyer, M.; Ueda, K. (2007): Coherence and correlations in photoinduced auger and fluorescence cascades in atoms Physics Reports,451:(5-6): 155-233.
PUB | DOI | WoS
 
2007 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301459
Teserra, S. A. (01T00:00:00Z.01.1970): Bilingual word and chunk alignment : a hybrid system for Amharic and English. Bielefeld: Bielefeld University.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599570
Rasmussen, K. R.; Stoye, J.; Myers, E. W. (2006): Efficient q-gram filters for finding all epsilon-matches over a given length JOURNAL OF COMPUTATIONAL BIOLOGY,13:(2): 296-308.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1927900
Niemann, H.; Schmoldt, H. U.; Wentzel, A.; Kolmar, H.; Heinz, D. W. (2006): Barnase fusion as a tool to determine the crystal structure of the small disulfide-rich protein McoEeTI J Mol Biol,356:(1): 1-8.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1597213
Sammeth, M.; Stoye, J. (2006): Comparing tandem repeats with duplications and excisions of variable degree IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics,3:(4): 395-407.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2005 | Report | PUB-ID: 1970470
Sammeth, M.; Stoye, J. (2005): Alignment of Tandem Repeats with Excision, Duplication, Substitution and Indels (EDSI). Bielefeld: Technische Fakultät der Universität Bielefeld.
PUB | PDF | DOI
 
2005 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2301827
Sammeth, M. (2005): Integrated multiple sequence alignment. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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2004 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606286
Michael, M.; Dieterich, C.; Stoye, J. (2004): Suboptimal Local Alignments across Multiple Scoring Schemes. In: Proc. of WABI 2004. SPRINGER-VERLAG BERLIN. (LNBI, 3240). S. 99-110.
PUB | DOI | WoS
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607400
Taher, L.; Rinner, O.; Garg, S.; Sczyrba, A.; Morgenstern, B. (2004): AGenDA: gene prediction by cross-species sequence comparison Nucleic Acids Research,32:(Web Server): W305-W308.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600293
Höchsmann, M.; Voss, B.; Giegerich, R. (2004): Pure multiple RNA secondary structure alignments: A progressive profile approach IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATIOCS,1:(1): 53-62.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1996206
Grasser, K. D.; Grill, S.; Duroux, M.; Launholt, D.; Thomsen, M. S.; Nielsen, B. V.; Nielsen, H. K.; Merkle, T. (2004): HMGB6 from Arabidopsis thaliana specifies a novel type of plant chromosomal HMGB protein Biochemistry,43:(5): 1309-1314.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610941
König, J.; Lotte, K.; Plessow, R.; Brockhinke, A.; Baier, M.; Dietz, K. - J. (2003): Reaction mechanism of plant 2-Cys peroxiredoxin - Role of the C terminus and the quaternary structure JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY,278:(27): 24409-24420.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2577014
Dichtl, B.; Blank, D.; Sadowski, M.; Hübner, W.; Weiser, S.; Keller, W. (2002): Yhh1p/Cft1p directly links poly(A) site recognition and RNA polymerase II transcription termination The EMBO journal,21:(15): 4125-4135.
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2001 | Bielefelder E-Dissertation | PUB-ID: 2304844
Büschking, C. (01T00:00:00Z.01.1970): Incorporation of structural information in RNA sequence alignment. Bielefeld (Germany): Bielefeld University.
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1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773355
Stoye, J.; Perrey, S. W.; Dress, A. (1997): Improving the divide-and-conquer approach to sum-of-pairs multiple sequence alignment Applied mathematics letters,10:(2): 67-73.
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1997 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773358
Brinkmann, G.; Dress, A.; Perrey, S. W.; Stoye, J. (1997): Two applications of the Divide & Conquer principle in the molecular sciences Mathematical programming,79:(1-3): 71-97.
PUB | DOI | WoS
 
1996 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773351
Tönges, U.; Perrey, S. W.; Stoye, J.; Dress, A. (1996): A general method for fast multiple sequence alignment Gene,172:(1): GC33-GC41.
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