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50 Publikationen

2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2316624
Gurtowski, J., Cancio, A., Shah, H., Levovitz, C., George, A., Homann, R., Sachidanandam, R.: Geoseq: a tool for dissecting deep-sequencing datasets. BMC Bioinformatics. 11, 506 (2010).
PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785512
Bremges, A., Schirmer, S., Giegerich, R.: Fine-tuning structural RNA alignments in the twilight zone. BMC Bioinformatics. 11, 222 (2010).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2603504
Corinna, K., Klinger, R., Hofmann-Apitius, M.: Identification of Histone Modifications in Biomedical Text for Supporting Epigenomic Research. BMC Bioinformatics. 10, S28 (2009).
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783187
Blom, J., Albaum, S., Doppmeier, D., Pühler, A., Vorhölter, F.-J., Zakrzewski, M., Goesmann, A.: EDGAR: a software framework for the comparative analysis of prokaryotic genomes. BMC Bioinformatics. 10, : 154 (2009).
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635314
Diaz, N.N., Krause, L., Goesmann, A., Niehaus, K., Nattkemper, T.W.: TACOA - Taxonomic classification of environmental genomic fragments using a kernelized nearest neighbor approach. BMC Bioinformatics. 10, 56 (2009).
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
Dondrup, M., Albaum, S., Griebel, T., Henckel, K., Jünemann, S., Kahlke, T., Kleindt, C.K., Kuester, H., Linke, B., Mertens, D., Mittard-Runte, V., Neuweger, H., Runte, K.J., Tauch, A., Tille, F., Pühler, A., Goesmann, A.: EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data. BMC Bioinformatics. 10, : 50 (2009).
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098
Gerlach, W., Jünemann, S., Tille, F., Goesmann, A., Stoye, J.: WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads. BMC Bioinformatics. 10, 430 (2009).
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784020
Lamprecht, A.-L., Margaria, T., Steffen, B., Sczyrba, A., Hartmeier, S., Giegerich, R.: GeneFisher-P: variations of GeneFisher as processes in Bio-jETI. BMC Bioinformatics. 9, S13 (2008).
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784025
Herold, J., Kurtz, S., Giegerich, R.: Efficient computation of absent words in genomic sequences. BMC Bioinformatics. 9, 167 (2008).
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783280
Tscherepanow, M., Jensen, N., Kummert, F.: An incremental approach to automated protein localisation. BMC Bioinformatics. 9, 445 (2008).
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636280
Timm, W., Scherbart, A., Boecker, S., Kohlbacher, O., Nattkemper, T.W.: Peak intensity prediction in MALDI-TOF mass spectrometry: A machine learning study to support quantitative proteomics. BMC Bioinformatics. 9, 443 (2008).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585611
Wei, N., Flaschel, E., Friehs, K., Nattkemper, T.W.: A machine vision system for automated non-invasive assessment of cell viability via dark field microscopy, wavelet feature selection and classification. BMC Bioinformatics. 9, 449 (2008).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893917
Janssen, S., Reeder, J., Giegerich, R.: Shape based indexing for faster search of RNA family databases. BMC Bioinformatics. 9, 131 (2008).
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499132
Baumbach, J.: CoryneRegNet 4.0 – A reference database for corynebacterial gene regulatory networks. BMC Bioinformatics. 8, 429 (2007).
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783712
Kaltenbach, H.-M., Wilke, A., Böcker, S.: SAMPI: protein identification with mass spectra alignments. BMC Bioinformatics. 8, 102 (2007).
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783743
Baumbach, J.: CoryneRegNet 4.0: a reference database for corynebacterial gene regulatory networks. BMC Bioinformatics. 8, 429 (2007).
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784011
Wittkop, T., Baumbach, J., Lobo, F.P., Rahmann, S.: Large scale clustering of protein sequences with FORCE - a layout based heuristic for weighted cluster editing. BMC Bioinformatics. 8, 396 (2007).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773701
Köhler, J., Munn, K., Rüegg, A., Skusa, A., Smith, B.: Quality control for terms and definitions in ontologies and taxonomies. BMC Bioinformatics. 7, 212 (2006).
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773864
Beckstette, M., Homann, R., Giegerich, R., Kurtz, S.: Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices. BMC Bioinformatics. 7, 389 (2006).
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773871
Seibel, P.N., Krüger, J., Hartmeier, S., Schwarzer, K., Löwenthal, K., Mersch, H., Dandekar, T., Giegerich, R.: XML schemas for common bioinformatic data types and their application in workflow systems. BMC Bioinformatics. 7, 490 (2006).
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