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50 Publikationen

2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2316624
Gurtowski, J., Cancio, A., Shah, H., Levovitz, C., George, A., Homann, R., & Sachidanandam, R. (2010). Geoseq: a tool for dissecting deep-sequencing datasets. BMC Bioinformatics, 11(1), 506. doi:10.1186/1471-2105-11-506
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785512
Bremges, A., Schirmer, S., & Giegerich, R. (2010). Fine-tuning structural RNA alignments in the twilight zone. BMC Bioinformatics, 11(1), 222. doi:10.1186/1471-2105-11-222
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2603504
Corinna, K., Klinger, R., & Hofmann-Apitius, M. (2009). Identification of Histone Modifications in Biomedical Text for Supporting Epigenomic Research. BMC Bioinformatics, 10(Suppl 1), S28. doi:10.1186/1471-2105-10-S1-S28
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783187
Blom, J., Albaum, S., Doppmeier, D., Pühler, A., Vorhölter, F. - J., Zakrzewski, M., & Goesmann, A. (2009). EDGAR: a software framework for the comparative analysis of prokaryotic genomes. BMC Bioinformatics, 10(1), 154. doi:10.1186/1471-2105-10-154
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635314
Diaz, N. N., Krause, L., Goesmann, A., Niehaus, K., & Nattkemper, T. W. (2009). TACOA - Taxonomic classification of environmental genomic fragments using a kernelized nearest neighbor approach. BMC Bioinformatics, 10(1), 56. doi:10.1186/1471-2105-10-56
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
Dondrup, M., Albaum, S., Griebel, T., Henckel, K., Jünemann, S., Kahlke, T., Kleindt, C. K., et al. (2009). EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data. BMC Bioinformatics, 10(1), 50. doi:10.1186/1471-2105-10-50
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098
Gerlach, W., Jünemann, S., Tille, F., Goesmann, A., & Stoye, J. (2009). WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads. BMC Bioinformatics, 10(1), 430. doi:10.1186/1471-2105-10-430
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784020
Lamprecht, A. - L., Margaria, T., Steffen, B., Sczyrba, A., Hartmeier, S., & Giegerich, R. (2008). GeneFisher-P: variations of GeneFisher as processes in Bio-jETI. BMC Bioinformatics, 9(Suppl 4), S13. doi:10.1186/1471-2105-9-S4-S13
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784025
Herold, J., Kurtz, S., & Giegerich, R. (2008). Efficient computation of absent words in genomic sequences. BMC Bioinformatics, 9(1), 167. doi:10.1186/1471-2105-9-167
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783280
Tscherepanow, M., Jensen, N., & Kummert, F. (2008). An incremental approach to automated protein localisation. BMC Bioinformatics, 9(1), 445. doi:10.1186/1471-2105-9-445
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636280
Timm, W., Scherbart, A., Boecker, S., Kohlbacher, O., & Nattkemper, T. W. (2008). Peak intensity prediction in MALDI-TOF mass spectrometry: A machine learning study to support quantitative proteomics. BMC Bioinformatics, 9(1), 443. doi:10.1186/1471-2105-9-443
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585611
Wei, N., Flaschel, E., Friehs, K., & Nattkemper, T. W. (2008). A machine vision system for automated non-invasive assessment of cell viability via dark field microscopy, wavelet feature selection and classification. BMC Bioinformatics, 9(1), 449. doi:10.1186/1471-2105-9-449
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893917
Janssen, S., Reeder, J., & Giegerich, R. (2008). Shape based indexing for faster search of RNA family databases. BMC Bioinformatics, 9(1), 131. doi:10.1186/1471-2105-9-131
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499132
Baumbach, J. (2007). CoryneRegNet 4.0 – A reference database for corynebacterial gene regulatory networks. BMC Bioinformatics, 8(1), 429. doi:10.1186/1471-2105-8-429
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783712
Kaltenbach, H. - M., Wilke, A., & Böcker, S. (2007). SAMPI: protein identification with mass spectra alignments. BMC Bioinformatics, 8(1), 102. doi:10.1186/1471-2105-8-102
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783743
Baumbach, J. (2007). CoryneRegNet 4.0: a reference database for corynebacterial gene regulatory networks. BMC Bioinformatics, 8(1), 429. doi:10.1186/1471-2105-8-429
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784011
Wittkop, T., Baumbach, J., Lobo, F. P., & Rahmann, S. (2007). Large scale clustering of protein sequences with FORCE - a layout based heuristic for weighted cluster editing. BMC Bioinformatics, 8(1), 396. doi:10.1186/1471-2105-8-396
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773701
Köhler, J., Munn, K., Rüegg, A., Skusa, A., & Smith, B. (2006). Quality control for terms and definitions in ontologies and taxonomies. BMC Bioinformatics, 7(1), 212. doi:10.1186/1471-2105-7-212
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773864
Beckstette, M., Homann, R., Giegerich, R., & Kurtz, S. (2006). Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices. BMC Bioinformatics, 7(1), 389. doi:10.1186/1471-2105-7-389
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773871
Seibel, P. N., Krüger, J., Hartmeier, S., Schwarzer, K., Löwenthal, K., Mersch, H., Dandekar, T., et al. (2006). XML schemas for common bioinformatic data types and their application in workflow systems. BMC Bioinformatics, 7(1), 490. doi:10.1186/1471-2105-7-490
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