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50 Publikationen

2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2316624
Gurtowski, J., Cancio, A., Shah, H., Levovitz, C., George, A., Homann, R., and Sachidanandam, R. (2010). Geoseq: a tool for dissecting deep-sequencing datasets. BMC Bioinformatics 11, 506.
PUB | PDF | DOI | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1785512
Bremges, A., Schirmer, S., and Giegerich, R. (2010). Fine-tuning structural RNA alignments in the twilight zone. BMC Bioinformatics 11, 222.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2603504
Corinna, K., Klinger, R., and Hofmann-Apitius, M. (2009). Identification of Histone Modifications in Biomedical Text for Supporting Epigenomic Research. BMC Bioinformatics 10, S28.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783187
Blom, J., Albaum, S., Doppmeier, D., Pühler, A., Vorhölter, F. - J., Zakrzewski, M., and Goesmann, A. (2009). EDGAR: a software framework for the comparative analysis of prokaryotic genomes. BMC Bioinformatics 10:154.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635314
Diaz, N. N., Krause, L., Goesmann, A., Niehaus, K., and Nattkemper, T. W. (2009). TACOA - Taxonomic classification of environmental genomic fragments using a kernelized nearest neighbor approach. BMC Bioinformatics 10, 56.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1635321
Dondrup, M., Albaum, S., Griebel, T., Henckel, K., Jünemann, S., Kahlke, T., Kleindt, C. K., Kuester, H., Linke, B., Mertens, D., et al. (2009). EMMA 2-A MAGE-compliant system for the collaborative analysis and integration of microarray data. BMC Bioinformatics 10:50.
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2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589098
Gerlach, W., Jünemann, S., Tille, F., Goesmann, A., and Stoye, J. (2009). WebCARMA: a web application for the functional and taxonomic classification of unassembled metagenomic reads. BMC Bioinformatics 10, 430.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784020
Lamprecht, A. - L., Margaria, T., Steffen, B., Sczyrba, A., Hartmeier, S., and Giegerich, R. (2008). GeneFisher-P: variations of GeneFisher as processes in Bio-jETI. BMC Bioinformatics 9, S13.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784025
Herold, J., Kurtz, S., and Giegerich, R. (2008). Efficient computation of absent words in genomic sequences. BMC Bioinformatics 9, 167.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783280
Tscherepanow, M., Jensen, N., and Kummert, F. (2008). An incremental approach to automated protein localisation. BMC Bioinformatics 9, 445.
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2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636280
Timm, W., Scherbart, A., Boecker, S., Kohlbacher, O., and Nattkemper, T. W. (2008). Peak intensity prediction in MALDI-TOF mass spectrometry: A machine learning study to support quantitative proteomics. BMC Bioinformatics 9, 443.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1585611
Wei, N., Flaschel, E., Friehs, K., and Nattkemper, T. W. (2008). A machine vision system for automated non-invasive assessment of cell viability via dark field microscopy, wavelet feature selection and classification. BMC Bioinformatics 9, 449.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893917
Janssen, S., Reeder, J., and Giegerich, R. (2008). Shape based indexing for faster search of RNA family databases. BMC Bioinformatics 9, 131.
PUB | Dateien verfügbar | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499132
Baumbach, J. (2007). CoryneRegNet 4.0 – A reference database for corynebacterial gene regulatory networks. BMC Bioinformatics 8, 429.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783712
Kaltenbach, H. - M., Wilke, A., and Böcker, S. (2007). SAMPI: protein identification with mass spectra alignments. BMC Bioinformatics 8, 102.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1783743
Baumbach, J. (2007). CoryneRegNet 4.0: a reference database for corynebacterial gene regulatory networks. BMC Bioinformatics 8, 429.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1784011
Wittkop, T., Baumbach, J., Lobo, F. P., and Rahmann, S. (2007). Large scale clustering of protein sequences with FORCE - a layout based heuristic for weighted cluster editing. BMC Bioinformatics 8, 396.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773701
Köhler, J., Munn, K., Rüegg, A., Skusa, A., and Smith, B. (2006). Quality control for terms and definitions in ontologies and taxonomies. BMC Bioinformatics 7, 212.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773864
Beckstette, M., Homann, R., Giegerich, R., and Kurtz, S. (2006). Fast index based algorithms and software for matching position specific scoring matrices. BMC Bioinformatics 7, 389.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773871
Seibel, P. N., Krüger, J., Hartmeier, S., Schwarzer, K., Löwenthal, K., Mersch, H., Dandekar, T., and Giegerich, R. (2006). XML schemas for common bioinformatic data types and their application in workflow systems. BMC Bioinformatics 7, 490.
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