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63 Publikationen

2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2659363
Feijão, P., Neiva, L.S., Azeredo-Espin, A.M.L. d. & Lessinger, A.C. (2006). AMiGA: the arthropodan mitochondrial genomes accessible database. Bioinformatics, 22(7), 902-903. doi:10.1093/bioinformatics/btl021.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1902179
Gerlach, W. & Giegerich, R. (2006). GUUGle: a utility for fast exact matching under RNA complementary rules including G-U base pairing. Bioinformatics, 22(6), 762-764. doi:10.1093/bioinformatics/btk041.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599943
Sammeth, M., Griebel, T., Tille, F. & Stoye, J. (2006). Panta rhei (QAlign2): an open graphical environment for sequence analysis. BIOINFORMATICS, 22(7), 889-890. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/btl007.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
Steffen, P., Voss, B., Rehmsmeier, M., Reeder, J. & Giegerich, R. (2006). RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes. Bioinformatics, 22(4), 500-503. Oxford Univ. Press. doi:10.1093/bioinformatics/btk010.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631957
Krause, L., Diaz, N.N., Bartels, D., Edwards, R.A., Pühler, A., Rohwer, F., Meyer, F. & Stoye, J. (2006). Finding novel genes in bacterial communities isolated from the environment. BIOINFORMATICS, 22(14), e281-e289. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/btl247.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773302 OA
Bartels, D., Kespohl, S., Albaum, S., Drüke, T., Goesmann, A., Herold, J., Kaiser, O., Pühler, A., Pfeiffer, F., Raddatz, G., Stoye, J., Meyer, F. & Schuster, S.C. (2005). BACCardI - a tool for the validation of genomic assemblies, assisting genome finishing and intergenome comparison. Bioinformatics, 21(7), 853-859. Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/bti091.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604896
Zöllner, F., Neumann, S., Kummert, F. & Sagerer, G. (2005). Database driven test case generation for protein-protein docking. Bioinformatics, 21(5), 683-684. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/bti061.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607424
McHardy, A.C., Goesmann, A., Pühler, A. & Meyer, F. (2004). Development of joint application strategies for two microbial gene finders. BIOINFORMATICS, 20(10), 1622-1631. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/bth137.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606822
Choudhuri, J.V., Schleiermacher, C., Kurtz, S. & Giegerich, R. (2004). GenAlyzer: interactive visualization of sequence similarities between entire genomes. BIOINFORMATICS, 20(12), 1964-1965. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/bth161.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607419
Voss, B., Meyer, C. & Giegerich, R. (2004). Evaluating the predictability of conformational switching in RNA. Bioinformatics, 20(10), 1573-1582. Oxford Univ. Press. doi:10.1093/bioinformatics/bth129.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610687
Li, Y., Rosso, M.G., Strizhov, N., Viehöver, P. & Weisshaar, B. (2003). GABI-Kat SimpleSearch: a flanking sequence tag (FST) database for the identification of T-DNA insertion mutants in Arabidopsis thaliana. Bioinformatics, 19(11), 1441-1442. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/btg170.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609403 OA
Sammeth, M., Morgenstern, B. & Stoye, J. (2003). Divide-and-conquer multiple alignment with segment-based constraints. BIOINFORMATICS, 19(Suppl 2), ii189-ii195. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/btg1077.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610503 OA
Sammeth, M., Rothgänger, J., Esser, W., Albert, J., Stoye, J. & Harmsen, D. (2003). QAlign: quality-based multiple alignments with dynamic phylogenetic analysis. BIOINFORMATICS, 19(12), 1592-1593. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/btg197.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612470
Morgenstern, B., Goel, S., Sczyrba, A. & Dress, A. (2003). AltAVisT: Comparing alternative multiple sequence alignments. BIOINFORMATICS, 19(3), 425-426. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/btf882.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610494
Taher, L., Rinner, O., Garg, S., Sczyrba, A., Brudno, M., Batzoglou, S. & Morgenstern, B. (2003). AGenDA: homology-based gene prediction. BIOINFORMATICS, 19(12), 1575-1577. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/btg181.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615366
Goesmann, A., Haubrock, M., Meyer, F., Kalinowski, J. & Giegerich, R. (2002). PathFinder: reconstruction and dynamic visualization of metabolic pathways. BIOINFORMATICS, 18(1), 124-129. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/18.1.124.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773329 OA
Bergeron, A., Heber, S. & Stoye, J. (2002). Common intervals and sorting by reversals: a marriage of necessity. Bioinformatics, 18(Suppl 2), S54-S63. doi:10.1093/bioinformatics/18.suppl_2.S54.
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2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615572
Fuellen, G., Wägele, J.W. & Giegerich, R. (2001). Minimum conflict: a divide-and-conquer approach to phylogeny estimation. BIOINFORMATICS, 17(12), 1168-1178. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/17.12.1168.
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2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1618574
Giegerich, R. (2000). A systematic approach to dynamic programming in bioinformatics. BIOINFORMATICS, 16(8), 665-677. OXFORD UNIV PRESS. doi:10.1093/bioinformatics/16.8.665.
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2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773341 OA
Reinert, K., Stoye, J. & Will, T. (2000). An iterative method for faster sum-of-pairs multiple sequence alignment. Bioinformatics, 16(9), 808-814. Oxford University Press. doi:10.1093/bioinformatics/16.9.808.
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