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63 Publikationen

2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2659363
P. Feijão, L. S. Neiva, A. M. L. d. Azeredo-Espin, and A. C. Lessinger, “AMiGA: the arthropodan mitochondrial genomes accessible database”, Bioinformatics, 2006, 22, 902-903.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1902179
W. Gerlach, and R. Giegerich, “GUUGle: a utility for fast exact matching under RNA complementary rules including G-U base pairing.”, Bioinformatics, 2006, 22, 762-764.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1599943
M. Sammeth, T. Griebel, F. Tille, and J. Stoye, “Panta rhei (QAlign2): an open graphical environment for sequence analysis”, BIOINFORMATICS, 2006, 22, 889-890.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1600421
P. Steffen, B. Voss, M. Rehmsmeier, J. Reeder, and R. Giegerich, “RNAshapes: an integrated RNA analysis package based on abstract shapes”, Bioinformatics, 2006, 22, 500-503.
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2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631957
L. Krause, N. N. Diaz, D. Bartels, R. A. Edwards, A. Pühler, F. Rohwer, F. Meyer, and J. Stoye, “Finding novel genes in bacterial communities isolated from the environment”, BIOINFORMATICS, 2006, 22, e281-e289.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773302 OA
D. Bartels, S. Kespohl, S. Albaum, T. Drüke, A. Goesmann, J. Herold, O. Kaiser, A. Pühler, F. Pfeiffer, G. Raddatz, et al., “BACCardI - a tool for the validation of genomic assemblies, assisting genome finishing and intergenome comparison”, Bioinformatics, 2005, 21, 853-859.
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2005 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1604896
F. Zöllner, S. Neumann, F. Kummert, and G. Sagerer, “Database driven test case generation for protein-protein docking”, Bioinformatics, 2005, 21, 683-684.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607424
A. C. McHardy, A. Goesmann, A. Pühler, and F. Meyer, “Development of joint application strategies for two microbial gene finders”, BIOINFORMATICS, 2004, 20, 1622-1631.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1606822
J. V. Choudhuri, C. Schleiermacher, S. Kurtz, and R. Giegerich, “GenAlyzer: interactive visualization of sequence similarities between entire genomes”, BIOINFORMATICS, 2004, 20, 1964-1965.
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2004 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1607419
B. Voss, C. Meyer, and R. Giegerich, “Evaluating the predictability of conformational switching in RNA”, Bioinformatics, 2004, 20, 1573-1582.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610687
Y. Li, M. G. Rosso, N. Strizhov, P. Viehöver, and B. Weisshaar, “GABI-Kat SimpleSearch: a flanking sequence tag (FST) database for the identification of T-DNA insertion mutants in Arabidopsis thaliana”, Bioinformatics, 2003, 19, 1441-1442.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1609403 OA
M. Sammeth, B. Morgenstern, and J. Stoye, “Divide-and-conquer multiple alignment with segment-based constraints”, BIOINFORMATICS, 2003, 19, ii189-ii195.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610503 OA
M. Sammeth, J. Rothgänger, W. Esser, J. Albert, J. Stoye, and D. Harmsen, “QAlign: quality-based multiple alignments with dynamic phylogenetic analysis”, BIOINFORMATICS, 2003, 19, 1592-1593.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1612470
B. Morgenstern, S. Goel, A. Sczyrba, and A. Dress, “AltAVisT: Comparing alternative multiple sequence alignments”, BIOINFORMATICS, 2003, 19, 425-426.
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2003 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1610494
L. Taher, O. Rinner, S. Garg, A. Sczyrba, M. Brudno, S. Batzoglou, and B. Morgenstern, “AGenDA: homology-based gene prediction”, BIOINFORMATICS, 2003, 19, 1575-1577.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615366
A. Goesmann, M. Haubrock, F. Meyer, J. Kalinowski, and R. Giegerich, “PathFinder: reconstruction and dynamic visualization of metabolic pathways”, BIOINFORMATICS, 2002, 18, 124-129.
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2002 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773329 OA
A. Bergeron, S. Heber, and J. Stoye, “Common intervals and sorting by reversals: a marriage of necessity”, Bioinformatics, 2002, 18, S54-S63.
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2001 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1615572
G. Fuellen, J. W. Wägele, and R. Giegerich, “Minimum conflict: a divide-and-conquer approach to phylogeny estimation”, BIOINFORMATICS, 2001, 17, 1168-1178.
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2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1618574
R. Giegerich, “A systematic approach to dynamic programming in bioinformatics”, BIOINFORMATICS, 2000, 16, 665-677.
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2000 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1773341 OA
K. Reinert, J. Stoye, and T. Will, “An iterative method for faster sum-of-pairs multiple sequence alignment”, Bioinformatics, 2000, 16, 808-814.
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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