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63 Publikationen

2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2094556
Genetic algorithm for shift-uncertainty correction in 1-D NMR-based metabolite identifications and quantifications
Schleif F-M, Riemer T, Boerner U, Schnapka-Hille L, Cross M (2011)
Bioinformatics 27(4): 524-533.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093578
Conveyor: a workflow engine for bioinformatic analyses
Linke B, Giegerich R, Goesmann A (2011)
Bioinformatics 27(7): 903-911.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893946 OA
Faster computation of exact RNA shape probabilities
Janssen S, Giegerich R (2010)
Bioinformatics 26(5): 632-639.
PUB | Datei | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588556
r2cat: Synteny Plots and Comparative Assembly
Husemann P, Stoye J (2010)
Bioinformatics 26(4): 570-571.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2426487
SIRIUS: decomposing isotope patterns for metabolite identification
Böcker S, Lipták Z, Pervukhin A, Letzel MC (2009)
Bioinformatics 25(2): 218-224.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589531
Qupe-a Rich Internet Application to take a step forward in the analysis of mass spectrometry-based quantitative proteomics experiments
Albaum S, Neuweger H, Fraenzel B, Lange S, Mertens D, Troetschel C, Wolters D, Kalinowski J, Nattkemper TW, Goesmann A (2009)
Bioinformatics 25(23): 3128-3134.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1590204
A report on the 2009 SIG on short read sequencing and algorithms (Short-SIG)
Brudno M, Medvedev P, Stoye J, De La Vega FM (2009)
BIOINFORMATICS 25(21): 2863-2864.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1589458
Significant speedup of database searches with HMMs by search space reduction with PSSM family models
Beckstette M, Homann R, Giegerich R, Kurtz S (2009)
Bioinformatics 25(24): 3251-3258.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1590210
Increasing the coverage of a metapopulation consensus genome by iterative read mapping and assembly
Dutilh BE, Huynen MA, Strous M (2009)
BIOINFORMATICS 25(21): 2878-2881.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1591319
ChromA: signal-based retention time alignment for chromatography-mass spectrometry data
Hoffmann N, Stoye J (2009)
Bioinformatics 25(16): 2080-2081.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2009 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1634374
mkESA: enhanced suffix array construction tool
Homann R, Fleer D, Giegerich R, Rehmsmeier M (2009)
Bioinformatics 25(8): 1084-1085.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2603465
Detection of IUPAC and IUPAC-like Chemical Names
Klinger R, Kolarik C, Fluck J, Hofmann-Apitius M, Friedrich CM (2008)
Bioinformatics 24(13): i268-i276.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1636699
MeltDB: a software platform for the analysis and integration of metabolomics experiment data
Neuweger H, Albaum S, Dondrup M, Persicke M, Watt T, Niehaus K, Stoye J, Goesmann A (2008)
Bioinformatics 24(23): 2726-2732.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587304
An overview of the wcd EST clustering tool
Hazelhurst S, Hide W, Lipták Z, Nogueira R, Starfield R (2008)
BIOINFORMATICS 24(13): 1542-1546.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1592737
DECOMP - from interpreting mass spectrometry peaks to solving the money changing problem
Boecker S, Lipták Z, Martin M, Pervukhin A, Sudek H (2008)
BIOINFORMATICS 24(4): 591-593.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2008 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1587052
Hyperbolic SOM-based clustering of DNA fragment features for taxonomic visualization and classification
Martin C, Diaz NN, Ontrup J, Nattkemper TW (2008)
Bioinformatics 24(14): 1568-1574.
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2007 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1594917
Compressed suffix tree - a basis for genome-scale sequence analysis
Välimäki N, Gerlach W, Dixit K, Mäkinen V (2007)
BIOINFORMATICS 23(5): 629-630.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2007 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1593132
Locomotif: from graphical motif description to RNA motif search
Reeder J, Reeder J, Giegerich R (2007)
Bioinformatics 23(13): I392-I400.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 1631967 PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2006 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2499691
Graph-based analysis and visualization of experimental results with ONDEX
Köhler J, Baumbach J, Taubert J, Specht M, Skusa A, Rüegg A, Rawlings C, Verrier P, Philippi S (2006)
Bioinformatics 22(11): 1383-1390.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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