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79 Publikationen

2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700599
Janssen, S., & Giegerich, R. (2014). The RNA shapes studio. Bioinformatics, 31(3), 423-425. doi:10.1093/bioinformatics/btu649
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941836
Marschall, T., Hajirasouliha, I., & Schönhuth, A. (2013). MATE-CLEVER: Mendelian-inheritance-aware discovery and genotyping of midsize and long indels. Bioinformatics, 29(24), 3143-3150. doi:10.1093/bioinformatics/btt556
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551798
Sauthoff, G., Mohl, M., Janssen, S., & Giegerich, R. (2013). Bellman's GAP -- a Language and Compiler for Dynamic Programming in Sequence Analysis. Bioinformatics, 29(5), 551-560. doi:10.1093/bioinformatics/btt022
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610129
Kessler, N., Bonte, A., Langenkämper, G., Niehaus, K., Goesmann, A., & Nattkemper, T. W. (2013). MeltDB 2.0 - Advances of the metabolomics software system. Bioinformatics, 29(19), 2452-2459. doi:10.1093/bioinformatics/btt414
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941839
Marschall, T., Costa, I. G., Canzar, S., Bauer, M., Klau, G. W., Schliep, A., & Schönhuth, A. (2012). CLEVER: clique-enumerating variant finder. Bioinformatics, 28(22), 2875-2882. doi:10.1093/bioinformatics/bts566
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941840
Hajirasouliha, I., Schönhuth, A., de Juan, D., Valencia, A., & Sahinalp, S. C. (2012). Mirroring co-evolving trees in the light of their topologies. Bioinformatics, 28(9), 1202-1208. doi:10.1093/bioinformatics/bts109
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 2910009
M. Reidys, C., W. D. Huang, F., E. Andersen, J., C. Penner, R., F. Stadler, P., & Nebel, M. (2012). Addendum: topology and prediction of RNA pseudoknots. Bioinformatics, 28(2), 300. doi:10.1093/bioinformatics/btr643
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2510984
Hilker, R., Sickinger, C., Pedersen, C. N. S., & Stoye, J. (2012). UniMoG - A unifying framework for genomic distance calculation and sorting based on DCJ. Bioinformatics, 28(19), 2509-2511. doi:10.1093/bioinformatics/bts440
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2496829
Cox, A. J., Bauer, M. J., Jakobi, T., & Rosone, G. (2012). Large-scale compression of genomic sequence databases with the Burrows-Wheeler transform. Bioinformatics, 28(11), 1415-1419. doi:10.1093/bioinformatics/bts173
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | arXiv
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2481783 OA
Kölling, J., Langenkämper, D., Sylvie, A., Michale, K., & Nattkemper, T. W. (2012). WHIDE - A web tool for visual data mining colocation patterns in multivariate bioimages. Bioinformatics, 28(8), 1143-1150. doi:10.1093/bioinformatics/bts104
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941842
Hafemeister, C., Costa, I. G., Schönhuth, A., & Schliep, A. (2011). Classifying short gene expression time-courses with Bayesian estimation of piecewise constant functions. Bioinformatics, 27(7), 946-952. doi:10.1093/bioinformatics/btr037
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 2910018
M. Reidys, C., W. D. Huang, F., E. Andersen, J., C. Penner, R., F. Stadler, P., & Nebel, M. (2011). Topology and prediction of RNA pseudoknots. Bioinformatics, 27(8), 1076--1085. doi:10.1093/bioinformatics/btr090
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2401665
Hazelhurst, S., & Lipták, Z. (2011). KABOOM! A new suffix-array based algorithm for clustering expression data. Bioinformatics, 27(24), 3348-3355. doi:10.1093/bioinformatics/btr560
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2408590
Huang, D., Huang, Y., Bai, Y., Chen, D., Hofestädt, R., Klukas, C., & Chen, M. (2011). MyBioNet: interactively visualize, edit and merge biological networks on the Web. Bioinformatics, 27(23), 3321-3322. doi:10.1093/bioinformatics/btr557
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2289952
Blom, J., Jakobi, T., Doppmeier, D., Jaenicke, S., Kalinowski, J., Stoye, J., & Goesmann, A. (2011). Exact and complete short-read alignment to microbial genomes using Graphics Processing Unit programming. Bioinformatics, 27(10), 1351-1358. doi:10.1093/bioinformatics/btr151
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2307115
Dutilh, B. E., Jurgelenaite, R., Szklarczyk, R., van Hijum, S. A. F. T., Harhangi, H. R., Schmid, M., de Wild, B., et al. (2011). FACIL: Fast and Accurate Genetic Code Inference and Logo. Bioinformatics, 27(14), 1929-1933. doi:10.1093/bioinformatics/btr316
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2094556
Schleif, F. - M., Riemer, T., Boerner, U., Schnapka-Hille, L., & Cross, M. (2011). Genetic algorithm for shift-uncertainty correction in 1-D NMR-based metabolite identifications and quantifications. Bioinformatics, 27(4), 524-533. doi:10.1093/bioinformatics/btq661
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2011 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2093578
Linke, B., Giegerich, R., & Goesmann, A. (2011). Conveyor: a workflow engine for bioinformatic analyses. Bioinformatics, 27(7), 903-911. doi:10.1093/bioinformatics/btr040
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2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1893946 OA
Janssen, S., & Giegerich, R. (2010). Faster computation of exact RNA shape probabilities. Bioinformatics, 26(5), 632-639. doi:10.1093/bioinformatics/btq014
PUB | Datei | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2010 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 1588556
Husemann, P., & Stoye, J. (2010). r2cat: Synteny Plots and Comparative Assembly. Bioinformatics, 26(4), 570-571. doi:10.1093/bioinformatics/btp690
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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