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79 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941754
Baaijens, J. A., Van der Roest, B., Köster, J., Stougie, L., & Schönhuth, A. (2019). Full-length de novo viral quasispecies assembly through variation graph construction. Bioinformatics, 35(24), 5086-5094. doi:10.1093/bioinformatics/btz443
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941756
Yin, B., Balvert, M., van der Spek, R. A. A., Dutilh, B. E., Bohté, S., Veldink, J., & Schönhuth, A. (2019). Using the structure of genome data in the design of deep neural networks for predicting amyotrophic lateral sclerosis from genotype. Bioinformatics, 35(14), i538-i547. doi:10.1093/bioinformatics/btz369
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941761
Baaijens, J. A., & Schönhuth, A. (2019). Overlap graph-based generation of haplotigs for diploids and polyploids. Bioinformatics, 35(21), 4281-4289. doi:10.1093/bioinformatics/btz255
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935891
Müller, R., & Chauve, C. (2019). HyAsP, a greedy tool for plasmids identification. Bioinformatics, 35(21), 4436 – 4439. doi:10.1093/bioinformatics/btz413
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936939
Sharifi-Noghabi, H., Zolotareva, O., Collins, C. C., & Ester, M. (2019). MOLI: multi-omics late integration with deep neural networks for drug response prediction. Bioinformatics, 35(14), I501-I509. doi:10.1093/bioinformatics/btz318
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935584
Theorell, A., Seiffarth, J., Grünberger, A., & Noeh, K. (2019). When a single lineage is not enough: Uncertainty-Aware Tracking for spatio-temporal live-cell image analysis. BIOINFORMATICS, 35(7), 1221-1228. doi:10.1093/bioinformatics/bty776
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2915890
Huang, L., Krüger, J., & Sczyrba, A. (2018). Analyzing large scale genomic data on the cloud with Sparkhit. Bioinformatics, 34(9), 1457-1465. doi:10.1093/bioinformatics/btx808
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2940797
Brink, B., Meskas, J., & Brinkman, R. R. (2018). ddPCRclust: an R package and Shiny app for automated analysis of multiplexed ddPCR data. Bioinformatics, 34(15), 2687-2689. doi:10.1093/bioinformatics/bty136
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2018 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2917896
Lux, M., Brinkman, R. R., Chauve, C., Laing, A., Lorenc, A., Abeler-Dörner, L., & Hammer, B. (2018). flowLearn: Fast and precise identification and quality checking of cell populations in flow cytometry. Bioinformatics, 34(13), 2245-2253. doi:10.1093/bioinformatics/bty082
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941786
Ebler, J., Schönhuth, A., & Marschall, T. (2017). Genotyping inversions and tandem duplications. Bioinformatics, 33(24), 4015-4023. doi:10.1093/bioinformatics/btx020
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 2918897
Thijssen, B., Dijkstra, T. M. H., Heskes, T., & Wessels, L. F. A. (2017). Bayesian data integration for quantifying the contribution of diverse measurements to parameter estimates. Bioinformatics, 34(5), 803-811. doi:10.1093/bioinformatics/btx666
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933892
Dirmeier, S., Fuchs, C., Mueller, N. S., & Theis, F. J. (2017). netReg: network-regularized linear models for biological association studies. Bioinformatics, 34(5), 896-898. doi:10.1093/bioinformatics/btx677
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2918707
Beier, S., Thiel, T., Münch, T., Scholz, U., & Mascher, M. (2017). MISA-web: a web server for microsatellite prediction. Bioinformatics, 33(16), 2583-2585. doi:10.1093/bioinformatics/btx198
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941793
Gregor, I., Schönhuth, A., & McHardy, A. C. (2016). Snowball: strain aware gene assembly of metagenomes. Bioinformatics, 32(17), i649-i657. doi:10.1093/bioinformatics/btw426
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2905170 OA
Hilker, R., Stadermann, K. B., Schwengers, O., Anisiforov, E., Jaenicke, S., Weisshaar, B., Zimmermann, T., et al. (2016). ReadXplorer 2 - detailed read mapping analysis and visualization from one single source. Bioinformatics, 32(24), 3702-3708. doi:10.1093/bioinformatics/btw541
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC | NCBI BioProject
 
2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2901729
Bremges, A., Singer, E., Woyke, T., & Sczyrba, A. (2016). MeCorS: Metagenome-enabled error correction of single cell sequencing reads. Bioinformatics, 32(14), 2199-2201. doi:10.1093/bioinformatics/btw144
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912555
Helfrich, S., Azzouzi, C. E., Probst, C., Seiffarth, J., Grünberger, A., Wiechert, W., Kohlheyer, D., et al. (2015). Vizardous: interactive analysis of microbial populations with single cell resolution. Bioinformatics, 31(23), 3875-3877., btv468. doi:10.1093/bioinformatics/btv468
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2764612 OA
Wittler, R., Marschall, T., Schönhuth, A., & Makinen, V. (2015). Repeat- and error-aware comparison of deletions. Bioinformatics, 31(18), 2947-2954. doi:10.1093/bioinformatics/btv304
PUB | PDF | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
Hilker, R., Stadermann, K. B., Doppmeier, D., Kalinowski, J., Stoye, J., Straube, J., Winnebald, J., et al. (2014). ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences. Bioinformatics, 30(16), 2247-2254. doi:10.1093/bioinformatics/btu205
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643941
Hoffmann, N., Wilhelm, M., Doebbe, A., Niehaus, K., & Stoye, J. (2014). BiPACE 2D – Graph-based multiple alignment for comprehensive two-dimensional gas chromatography–mass spectrometry. Bioinformatics, 30(7), 988-995. doi:10.1093/bioinformatics/btt738
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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