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67 Publikationen

2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941754
Baaijens, J. A.; Van der Roest, B.; Köster, J.; Stougie, L.; Schönhuth, A. (2019): Full-length de novo viral quasispecies assembly through variation graph construction Bioinformatics,35:(24): 5086-5094.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941756
Yin, B.; Balvert, M.; van der Spek, R. A. A.; Dutilh, B. E.; Bohté, S.; Veldink, J.; Schönhuth, A. (2019): Using the structure of genome data in the design of deep neural networks for predicting amyotrophic lateral sclerosis from genotype Bioinformatics,35:(14): i538-i547.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941761
Baaijens, J. A.; Schönhuth, A. (2019): Overlap graph-based generation of haplotigs for diploids and polyploids Bioinformatics,35:(21): 4281-4289.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Konferenzbeitrag | Veröffentlicht | PUB-ID: 2936939
Sharifi-Noghabi, H.; Zolotareva, O.; Collins, C. C.; Ester, M. (2019): MOLI: multi-omics late integration with deep neural networks for drug response prediction Bioinformatics,35:(14): I501-I509.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2019 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2935584
Theorell, A.; Seiffarth, J.; Grünberger, A.; Noeh, K. (2019): When a single lineage is not enough: Uncertainty-Aware Tracking for spatio-temporal live-cell image analysis BIOINFORMATICS,35:(7): 1221-1228.
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2018 | Zeitschriftenaufsatz | E-Veröff. vor dem Druck | PUB-ID: 2917896 OA
Lux, M.; Brinkman, R. R.; Chauve, C.; Laing, A.; Lorenc, A.; Abeler-Dörner, L.; Hammer, B. (2018): flowLearn: Fast and precise identification and quality checking of cell populations in flow cytometry Bioinformatics,34:(13): 2245-2253.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941786
Ebler, J.; Schönhuth, A.; Marschall, T. (2017): Genotyping inversions and tandem duplications Bioinformatics,33:(24): 4015-4023.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2017 | Zeitschriftenaufsatz | PUB-ID: 2918897
Thijssen, B.; Dijkstra, T. M. H.; Heskes, T.; Wessels, L. F. A. (2017): Bayesian data integration for quantifying the contribution of diverse measurements to parameter estimates Bioinformatics,34:(5): 803-811.
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2017 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2933892
Dirmeier, S.; Fuchs, C.; Mueller, N. S.; Theis, F. J. (2017): netReg: network-regularized linear models for biological association studies Bioinformatics,34:(5): 896-898.
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2016 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941793
Gregor, I.; Schönhuth, A.; McHardy, A. C. (2016): Snowball: strain aware gene assembly of metagenomes Bioinformatics,32:(17): i649-i657.
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2015 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2912555
Helfrich, S.; Azzouzi, C. E.; Probst, C.; Seiffarth, J.; Grünberger, A.; Wiechert, W.; Kohlheyer, D.; Nöh, K. (2015): Vizardous: interactive analysis of microbial populations with single cell resolution Bioinformatics,31:(23): 3875-3877.:btv468
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2674387
Hilker, R.; Stadermann, K. B.; Doppmeier, D.; Kalinowski, J.; Stoye, J.; Straube, J.; Winnebald, J.; Goesmann, A. (2014): ReadXplorer - Visualization and Analysis of Mapped Sequences Bioinformatics,30:(16): 2247-2254.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2643941
Hoffmann, N.; Wilhelm, M.; Doebbe, A.; Niehaus, K.; Stoye, J. (2014): BiPACE 2D – Graph-based multiple alignment for comprehensive two-dimensional gas chromatography–mass spectrometry Bioinformatics,30:(7): 988-995.
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2014 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2700599
Janssen, S.; Giegerich, R. (2014): The RNA shapes studio Bioinformatics,31:(3): 423-425.
PUB | DOI | Download (ext.) | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941836
Marschall, T.; Hajirasouliha, I.; Schönhuth, A. (2013): MATE-CLEVER: Mendelian-inheritance-aware discovery and genotyping of midsize and long indels Bioinformatics,29:(24): 3143-3150.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2551798
Sauthoff, G.; Mohl, M.; Janssen, S.; Giegerich, R. (2013): Bellman's GAP -- a Language and Compiler for Dynamic Programming in Sequence Analysis Bioinformatics,29:(5): 551-560.
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2013 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2610129
Kessler, N.; Bonte, A.; Langenkämper, G.; Niehaus, K.; Goesmann, A.; Nattkemper, T. W. (2013): MeltDB 2.0 - Advances of the metabolomics software system Bioinformatics,29:(19): 2452-2459.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941839
Marschall, T.; Costa, I. G.; Canzar, S.; Bauer, M.; Klau, G. W.; Schliep, A.; Schönhuth, A. (2012): CLEVER: clique-enumerating variant finder Bioinformatics,28:(22): 2875-2882.
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2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2941840
Hajirasouliha, I.; Schönhuth, A.; de Juan, D.; Valencia, A.; Sahinalp, S. C. (2012): Mirroring co-evolving trees in the light of their topologies Bioinformatics,28:(9): 1202-1208.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 
2012 | Zeitschriftenaufsatz | Veröffentlicht | PUB-ID: 2510984
Hilker, R.; Sickinger, C.; Pedersen, C. N. S.; Stoye, J. (2012): UniMoG - A unifying framework for genomic distance calculation and sorting based on DCJ Bioinformatics,28:(19): 2509-2511.
PUB | DOI | WoS | PubMed | Europe PMC
 

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